MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haemophilus ducreyi 35000HP chromosome

Total Repeats: 1352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002940	TCTTT	2	10	252	261	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_002940	GCGAG	2	10	2173	2182	20 %	0 %	60 %	20 %	33151283
3	NC_002940	TATTG	2	10	3028	3037	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002940	TTTAA	2	10	3052	3061	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002940	TTTTG	2	10	3122	3131	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002940	CTTTT	2	10	3716	3725	0 %	80 %	0 %	20 %	33151286
7	NC_002940	ACTTT	2	10	4475	4484	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_002940	ACTTA	2	10	6064	6073	40 %	40 %	0 %	20 %	33151290
9	NC_002940	TATTT	2	10	6744	6753	20 %	80 %	0 %	0 %	33151290
10	NC_002940	ATTCA	2	10	7356	7365	40 %	40 %	0 %	20 %	33151290
11	NC_002940	AATGA	2	10	7900	7909	60 %	20 %	20 %	0 %	33151291
12	NC_002940	TTAAT	2	10	10551	10560	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002940	TAAGT	2	10	10578	10587	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002940	AGAGA	2	10	10591	10600	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002940	CTAAG	2	10	10607	10616	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_002940	ACTAA	2	10	13107	13116	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_002940	AGTCG	2	10	13851	13860	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_002940	AGGTT	2	10	14178	14187	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002940	TAGAT	2	10	16665	16674	40 %	40 %	20 %	0 %	33151294
20	NC_002940	TAGCG	2	10	17960	17969	20 %	20 %	40 %	20 %	33151295
21	NC_002940	TAAAT	2	10	19792	19801	60 %	40 %	0 %	0 %	33151296
22	NC_002940	GATAA	2	10	20255	20264	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002940	TGTGC	2	10	21519	21528	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_002940	TTTAC	2	10	22609	22618	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_002940	TTGCA	2	10	25965	25974	20 %	40 %	20 %	20 %	33151301
26	NC_002940	TAATT	2	10	26168	26177	40 %	60 %	0 %	0 %	33151301
27	NC_002940	GGCAA	2	10	27099	27108	40 %	0 %	40 %	20 %	33151302
28	NC_002940	TTTTA	2	10	30116	30125	20 %	80 %	0 %	0 %	33151304
29	NC_002940	TTATG	2	10	30852	30861	20 %	60 %	20 %	0 %	33151305
30	NC_002940	ATCAA	2	10	32210	32219	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_002940	TTGCT	2	10	36839	36848	0 %	60 %	20 %	20 %	33151312
32	NC_002940	TCATC	2	10	38527	38536	20 %	40 %	0 %	40 %	33151313
33	NC_002940	AAAAG	2	10	39258	39267	80 %	0 %	20 %	0 %	33151314
34	NC_002940	AATTC	2	10	39710	39719	40 %	40 %	0 %	20 %	33151315
35	NC_002940	AAAAT	2	10	40510	40519	80 %	20 %	0 %	0 %	33151318
36	NC_002940	CAATT	2	10	41732	41741	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_002940	AGTAA	2	10	43565	43574	60 %	20 %	20 %	0 %	33151322
38	NC_002940	TTAAT	2	10	46244	46253	40 %	60 %	0 %	0 %	33151324
39	NC_002940	CAAGC	2	10	47747	47756	40 %	0 %	20 %	40 %	33151326
40	NC_002940	TAAAA	2	10	47896	47905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002940	TTAAC	2	10	53937	53946	40 %	40 %	0 %	20 %	33151333
42	NC_002940	CGTAA	2	10	55811	55820	40 %	20 %	20 %	20 %	33151336
43	NC_002940	AATAA	2	10	59411	59420	80 %	20 %	0 %	0 %	33151338
44	NC_002940	AAAAC	2	10	60917	60926	80 %	0 %	0 %	20 %	33151340
45	NC_002940	TACGT	2	10	64531	64540	20 %	40 %	20 %	20 %	33151343
46	NC_002940	ATTTG	2	10	65796	65805	20 %	60 %	20 %	0 %	33151344
47	NC_002940	AATTT	2	10	66154	66163	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002940	TTCCA	2	10	67417	67426	20 %	40 %	0 %	40 %	33151347
49	NC_002940	AAAGT	2	10	68810	68819	60 %	20 %	20 %	0 %	33151348
50	NC_002940	ATTAT	2	10	69237	69246	40 %	60 %	0 %	0 %	33151349
51	NC_002940	AATTG	2	10	69611	69620	40 %	40 %	20 %	0 %	33151350
52	NC_002940	AGAAA	2	10	70482	70491	80 %	0 %	20 %	0 %	33151350
53	NC_002940	TGGTT	2	10	71063	71072	0 %	60 %	40 %	0 %	33151351
54	NC_002940	TTTGT	2	10	72233	72242	0 %	80 %	20 %	0 %	33151353
55	NC_002940	GCGTA	2	10	73377	73386	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_002940	CAAGC	2	10	74894	74903	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_002940	GAAAT	2	10	77839	77848	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002940	AAACG	2	10	78454	78463	60 %	0 %	20 %	20 %	33151363
59	NC_002940	AAATG	2	10	80319	80328	60 %	20 %	20 %	0 %	33151368
60	NC_002940	CGCGC	2	10	80844	80853	0 %	0 %	40 %	60 %	33151369
61	NC_002940	AGATA	2	10	89229	89238	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002940	AAAAC	2	10	89353	89362	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_002940	TGGGT	2	10	89568	89577	0 %	40 %	60 %	0 %	33151384
64	NC_002940	CAAAT	2	10	90013	90022	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_002940	AAAAG	2	10	91165	91174	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002940	AACAA	2	10	92208	92217	80 %	0 %	0 %	20 %	33151387
67	NC_002940	CGGCG	2	10	95460	95469	0 %	0 %	60 %	40 %	33151393
68	NC_002940	GGCGT	2	10	100251	100260	0 %	20 %	60 %	20 %	33151399
69	NC_002940	CGGCG	2	10	101290	101299	0 %	0 %	60 %	40 %	33151401
70	NC_002940	TTTGT	2	10	101522	101531	0 %	80 %	20 %	0 %	33151401
71	NC_002940	TGACG	2	10	101620	101629	20 %	20 %	40 %	20 %	33151401
72	NC_002940	AGCCA	2	10	102896	102905	40 %	0 %	20 %	40 %	33151404
73	NC_002940	GCGGT	2	10	103607	103616	0 %	20 %	60 %	20 %	33151406
74	NC_002940	ATATT	2	10	105985	105994	40 %	60 %	0 %	0 %	33151408
75	NC_002940	CCGCA	2	10	107072	107081	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_002940	CAACA	2	10	107596	107605	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_002940	GGCAA	2	10	108457	108466	40 %	0 %	40 %	20 %	33151412
78	NC_002940	GAAAT	2	10	109002	109011	60 %	20 %	20 %	0 %	33151414
79	NC_002940	CCTTT	2	10	110391	110400	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_002940	TTTAT	2	10	110806	110815	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002940	TGTTA	2	10	110915	110924	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002940	GGTGC	2	10	112952	112961	0 %	20 %	60 %	20 %	33151417
83	NC_002940	GCTTT	2	10	116662	116671	0 %	60 %	20 %	20 %	33151425
84	NC_002940	GTTTC	2	10	117209	117218	0 %	60 %	20 %	20 %	33151425
85	NC_002940	TCAAG	2	10	121684	121693	40 %	20 %	20 %	20 %	33151432
86	NC_002940	TCATT	2	10	122343	122352	20 %	60 %	0 %	20 %	33151433
87	NC_002940	TCCTA	2	10	122355	122364	20 %	40 %	0 %	40 %	33151433
88	NC_002940	AAAGA	2	10	124036	124045	80 %	0 %	20 %	0 %	33151435
89	NC_002940	TATTT	2	10	124203	124212	20 %	80 %	0 %	0 %	33151436
90	NC_002940	AGCAA	2	10	124597	124606	60 %	0 %	20 %	20 %	33151437
91	NC_002940	CTTAA	2	10	125892	125901	40 %	40 %	0 %	20 %	33151437
92	NC_002940	GGTAA	2	10	126474	126483	40 %	20 %	40 %	0 %	33151437
93	NC_002940	AAATG	2	10	129277	129286	60 %	20 %	20 %	0 %	33151438
94	NC_002940	CTATT	2	10	129364	129373	20 %	60 %	0 %	20 %	33151438
95	NC_002940	CGTAA	2	10	131693	131702	40 %	20 %	20 %	20 %	33151439
96	NC_002940	ATTGG	2	10	135705	135714	20 %	40 %	40 %	0 %	33151441
97	NC_002940	TACAG	2	10	136404	136413	40 %	20 %	20 %	20 %	33151441
98	NC_002940	CGGTT	2	10	138504	138513	0 %	40 %	40 %	20 %	33151445
99	NC_002940	GTTTG	2	10	138547	138556	0 %	60 %	40 %	0 %	33151445
100	NC_002940	TTTGG	2	10	138643	138652	0 %	60 %	40 %	0 %	33151445
101	NC_002940	CGATT	2	10	139578	139587	20 %	40 %	20 %	20 %	33151445
102	NC_002940	GCCGT	2	10	140196	140205	0 %	20 %	40 %	40 %	33151445
103	NC_002940	AACAG	2	10	141041	141050	60 %	0 %	20 %	20 %	33151446
104	NC_002940	CCATT	2	10	142662	142671	20 %	40 %	0 %	40 %	33151448
105	NC_002940	AATGG	2	10	146432	146441	40 %	20 %	40 %	0 %	33151451
106	NC_002940	AAAAT	2	10	148220	148229	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002940	TTTAT	2	10	149042	149051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002940	GTGTT	2	10	149428	149437	0 %	60 %	40 %	0 %	33151455
109	NC_002940	GTTCA	2	10	149630	149639	20 %	40 %	20 %	20 %	33151455
110	NC_002940	TTGGT	2	10	150118	150127	0 %	60 %	40 %	0 %	33151456
111	NC_002940	ATGAA	2	10	152887	152896	60 %	20 %	20 %	0 %	33151459
112	NC_002940	AAGCG	2	10	153109	153118	40 %	0 %	40 %	20 %	33151459
113	NC_002940	AATCA	2	10	153659	153668	60 %	20 %	0 %	20 %	33151460
114	NC_002940	TGCAA	2	10	154062	154071	40 %	20 %	20 %	20 %	33151461
115	NC_002940	TGCCG	2	10	154240	154249	0 %	20 %	40 %	40 %	33151461
116	NC_002940	TACGT	2	10	154596	154605	20 %	40 %	20 %	20 %	33151461
117	NC_002940	TCGTA	2	10	155355	155364	20 %	40 %	20 %	20 %	33151462
118	NC_002940	GTGTC	2	10	156844	156853	0 %	40 %	40 %	20 %	33151463
119	NC_002940	ATCGT	2	10	160434	160443	20 %	40 %	20 %	20 %	33151467
120	NC_002940	CTTGT	2	10	161996	162005	0 %	60 %	20 %	20 %	33151469
121	NC_002940	GTTGC	2	10	162334	162343	0 %	40 %	40 %	20 %	33151470
122	NC_002940	TAAAA	2	10	165516	165525	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002940	TTAGT	2	10	166255	166264	20 %	60 %	20 %	0 %	33151473
124	NC_002940	ATGTG	2	10	167410	167419	20 %	40 %	40 %	0 %	33151473
125	NC_002940	GCTTG	2	10	168666	168675	0 %	40 %	40 %	20 %	33151475
126	NC_002940	TCAGC	2	10	169552	169561	20 %	20 %	20 %	40 %	33151475
127	NC_002940	TGTGC	2	10	172402	172411	0 %	40 %	40 %	20 %	33151478
128	NC_002940	ATTTG	2	10	176294	176303	20 %	60 %	20 %	0 %	33151479
129	NC_002940	ATGGT	2	10	180514	180523	20 %	40 %	40 %	0 %	33151485
130	NC_002940	GTTTG	2	10	184771	184780	0 %	60 %	40 %	0 %	33151488
131	NC_002940	CATTA	2	10	185796	185805	40 %	40 %	0 %	20 %	33151488
132	NC_002940	TTGGT	2	10	187328	187337	0 %	60 %	40 %	0 %	33151490
133	NC_002940	GTAGT	2	10	187782	187791	20 %	40 %	40 %	0 %	33151490
134	NC_002940	TTGCC	2	10	190143	190152	0 %	40 %	20 %	40 %	33151493
135	NC_002940	AATGC	2	10	190215	190224	40 %	20 %	20 %	20 %	33151493
136	NC_002940	AATAA	2	10	190623	190632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002940	GATCC	2	10	191757	191766	20 %	20 %	20 %	40 %	33151494
138	NC_002940	CATAT	2	10	193791	193800	40 %	40 %	0 %	20 %	33151497
139	NC_002940	TAAAA	2	10	194928	194937	80 %	20 %	0 %	0 %	33151499
140	NC_002940	TGGCT	2	10	194984	194993	0 %	40 %	40 %	20 %	33151499
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