MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haemophilus ducreyi 35000HP chromosome

Total Repeats: 5023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002940	GATT	2	8	68	75	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002940	TTAT	2	8	76	83	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002940	ATCG	2	8	196	203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_002940	ACTC	2	8	397	404	25 %	25 %	0 %	50 %	33151283
5	NC_002940	AACC	2	8	1356	1363	50 %	0 %	0 %	50 %	33151283
6	NC_002940	TGAT	2	8	1665	1672	25 %	50 %	25 %	0 %	33151283
7	NC_002940	GCAA	2	8	2092	2099	50 %	0 %	25 %	25 %	33151283
8	NC_002940	TTGC	2	8	2213	2220	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002940	GCAG	2	8	2322	2329	25 %	0 %	50 %	25 %	33151284
10	NC_002940	CAAG	2	8	2607	2614	50 %	0 %	25 %	25 %	33151284
11	NC_002940	TTAC	2	8	2972	2979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_002940	CATA	2	8	3159	3166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_002940	TTGT	2	8	3379	3386	0 %	75 %	25 %	0 %	33151285
14	NC_002940	AACT	2	8	3594	3601	50 %	25 %	0 %	25 %	33151285
15	NC_002940	CATT	2	8	4770	4777	25 %	50 %	0 %	25 %	33151287
16	NC_002940	ATAG	2	8	5170	5177	50 %	25 %	25 %	0 %	33151288
17	NC_002940	AGAA	2	8	5241	5248	75 %	0 %	25 %	0 %	33151288
18	NC_002940	TTAC	2	8	5768	5775	25 %	50 %	0 %	25 %	33151289
19	NC_002940	CAAA	2	8	7019	7026	75 %	0 %	0 %	25 %	33151290
20	NC_002940	ACCG	2	8	7687	7694	25 %	0 %	25 %	50 %	33151291
21	NC_002940	TGAA	2	8	7739	7746	50 %	25 %	25 %	0 %	33151291
22	NC_002940	CAAG	2	8	8251	8258	50 %	0 %	25 %	25 %	33151291
23	NC_002940	ATGA	2	8	8941	8948	50 %	25 %	25 %	0 %	33151292
24	NC_002940	CAAC	2	8	9118	9125	50 %	0 %	0 %	50 %	33151292
25	NC_002940	AGTT	2	8	9476	9483	25 %	50 %	25 %	0 %	33151292
26	NC_002940	TTTA	2	8	9919	9926	25 %	75 %	0 %	0 %	33151293
27	NC_002940	ACAA	2	8	10060	10067	75 %	0 %	0 %	25 %	33151293
28	NC_002940	TTAA	2	8	10180	10187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002940	ATAC	2	8	10225	10232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_002940	TGAA	2	8	11046	11053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002940	ATTG	2	8	11115	11122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002940	AGGG	2	8	11304	11311	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002940	GCCT	2	8	12395	12402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_002940	TAAA	2	8	12518	12525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002940	TATT	2	8	12897	12904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002940	GCGA	2	8	12997	13004	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_002940	GTAC	2	8	13271	13278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_002940	GGTG	2	8	13694	13701	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002940	AAAG	2	8	13829	13836	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002940	GCTG	2	8	14506	14513	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_002940	TGCC	2	8	14573	14580	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_002940	AAGC	2	8	15078	15085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_002940	AGGA	2	8	15695	15702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002940	CAAT	2	8	15803	15810	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_002940	TCAA	2	8	15828	15835	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_002940	ACAA	2	8	15847	15854	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_002940	ATCC	2	8	15912	15919	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_002940	ATTA	2	8	15996	16003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002940	CCTG	2	8	16207	16214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_002940	CCGT	2	8	16242	16249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_002940	ATTT	2	8	16256	16263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002940	GATA	2	8	16950	16957	50 %	25 %	25 %	0 %	33151294
53	NC_002940	TAAT	2	8	17243	17250	50 %	50 %	0 %	0 %	33151294
54	NC_002940	GTTT	2	8	17601	17608	0 %	75 %	25 %	0 %	33151295
55	NC_002940	TGTT	2	8	17613	17620	0 %	75 %	25 %	0 %	33151295
56	NC_002940	TTGA	2	8	18045	18052	25 %	50 %	25 %	0 %	33151295
57	NC_002940	GATG	2	8	18512	18519	25 %	25 %	50 %	0 %	33151295
58	NC_002940	TTTA	2	8	18752	18759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002940	ACTT	2	8	18795	18802	25 %	50 %	0 %	25 %	33151296
60	NC_002940	GATT	2	8	18865	18872	25 %	50 %	25 %	0 %	33151296
61	NC_002940	ATCG	2	8	18953	18960	25 %	25 %	25 %	25 %	33151296
62	NC_002940	GCAG	2	8	19048	19055	25 %	0 %	50 %	25 %	33151296
63	NC_002940	AAAC	2	8	19103	19110	75 %	0 %	0 %	25 %	33151296
64	NC_002940	GCGG	2	8	19379	19386	0 %	0 %	75 %	25 %	33151296
65	NC_002940	CTGA	2	8	19889	19896	25 %	25 %	25 %	25 %	33151296
66	NC_002940	GTTT	2	8	19993	20000	0 %	75 %	25 %	0 %	33151296
67	NC_002940	GGTC	2	8	20107	20114	0 %	25 %	50 %	25 %	33151296
68	NC_002940	ATGG	2	8	20569	20576	25 %	25 %	50 %	0 %	33151297
69	NC_002940	TTGC	2	8	20716	20723	0 %	50 %	25 %	25 %	33151297
70	NC_002940	TGAT	2	8	20760	20767	25 %	50 %	25 %	0 %	33151297
71	NC_002940	GTTA	2	8	21010	21017	25 %	50 %	25 %	0 %	33151297
72	NC_002940	AAGT	2	8	21269	21276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002940	TTGC	2	8	21621	21628	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_002940	ATCG	2	8	21737	21744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_002940	CGCC	2	8	21926	21933	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_002940	ATCA	2	8	22060	22067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_002940	TGAG	2	8	22103	22110	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002940	ACAG	2	8	22182	22189	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_002940	CTTG	2	8	22222	22229	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_002940	TATG	2	8	22232	22239	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002940	GCCA	2	8	22249	22256	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_002940	ATCT	2	8	23002	23009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_002940	ATTG	2	8	23208	23215	25 %	50 %	25 %	0 %	33151298
84	NC_002940	AAAG	2	8	23384	23391	75 %	0 %	25 %	0 %	33151299
85	NC_002940	CTTT	2	8	23539	23546	0 %	75 %	0 %	25 %	33151299
86	NC_002940	TTGT	2	8	23633	23640	0 %	75 %	25 %	0 %	33151299
87	NC_002940	TTGT	2	8	24021	24028	0 %	75 %	25 %	0 %	33151299
88	NC_002940	AAAC	2	8	24090	24097	75 %	0 %	0 %	25 %	33151299
89	NC_002940	ATTT	2	8	24343	24350	25 %	75 %	0 %	0 %	33151299
90	NC_002940	TTTG	2	8	24466	24473	0 %	75 %	25 %	0 %	33151300
91	NC_002940	AGAT	2	8	25121	25128	50 %	25 %	25 %	0 %	33151301
92	NC_002940	TGTT	2	8	25496	25503	0 %	75 %	25 %	0 %	33151301
93	NC_002940	CAAG	2	8	25609	25616	50 %	0 %	25 %	25 %	33151301
94	NC_002940	CCAC	2	8	26098	26105	25 %	0 %	0 %	75 %	33151301
95	NC_002940	AATA	2	8	26287	26294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002940	TGAT	2	8	26391	26398	25 %	50 %	25 %	0 %	33151302
97	NC_002940	TTAA	2	8	26612	26619	50 %	50 %	0 %	0 %	33151302
98	NC_002940	ATGT	2	8	26630	26637	25 %	50 %	25 %	0 %	33151302
99	NC_002940	AGTT	2	8	27064	27071	25 %	50 %	25 %	0 %	33151302
100	NC_002940	TAAA	2	8	27640	27647	75 %	25 %	0 %	0 %	33151303
101	NC_002940	CGGT	2	8	28192	28199	0 %	25 %	50 %	25 %	33151303
102	NC_002940	TAAA	2	8	30016	30023	75 %	25 %	0 %	0 %	33151304
103	NC_002940	CAGC	2	8	30303	30310	25 %	0 %	25 %	50 %	33151304
104	NC_002940	TGAT	2	8	30757	30764	25 %	50 %	25 %	0 %	33151305
105	NC_002940	AAAC	2	8	30792	30799	75 %	0 %	0 %	25 %	33151305
106	NC_002940	ACGA	2	8	31434	31441	50 %	0 %	25 %	25 %	33151306
107	NC_002940	GCTT	2	8	31494	31501	0 %	50 %	25 %	25 %	33151306
108	NC_002940	AACA	2	8	31538	31545	75 %	0 %	0 %	25 %	33151307
109	NC_002940	GATT	2	8	31963	31970	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002940	CGGT	2	8	32577	32584	0 %	25 %	50 %	25 %	33151309
111	NC_002940	GTCG	2	8	32605	32612	0 %	25 %	50 %	25 %	33151309
112	NC_002940	AAAT	2	8	32734	32741	75 %	25 %	0 %	0 %	33151309
113	NC_002940	CTTG	2	8	32887	32894	0 %	50 %	25 %	25 %	33151309
114	NC_002940	ATGA	2	8	33152	33159	50 %	25 %	25 %	0 %	33151309
115	NC_002940	CGGC	2	8	33167	33174	0 %	0 %	50 %	50 %	33151309
116	NC_002940	GGGA	2	8	33675	33682	25 %	0 %	75 %	0 %	33151310
117	NC_002940	ATTG	2	8	33856	33863	25 %	50 %	25 %	0 %	33151310
118	NC_002940	TTAA	2	8	33971	33978	50 %	50 %	0 %	0 %	33151310
119	NC_002940	TATT	2	8	35248	35255	25 %	75 %	0 %	0 %	33151310
120	NC_002940	AATT	2	8	35394	35401	50 %	50 %	0 %	0 %	33151310
121	NC_002940	CGCT	2	8	35699	35706	0 %	25 %	25 %	50 %	33151311
122	NC_002940	TAGC	2	8	36083	36090	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_002940	AATC	2	8	36940	36947	50 %	25 %	0 %	25 %	33151312
124	NC_002940	TAAA	2	8	36968	36975	75 %	25 %	0 %	0 %	33151312
125	NC_002940	TGAT	2	8	36993	37000	25 %	50 %	25 %	0 %	33151312
126	NC_002940	TTTC	2	8	37450	37457	0 %	75 %	0 %	25 %	33151312
127	NC_002940	CCAA	2	8	37886	37893	50 %	0 %	0 %	50 %	33151313
128	NC_002940	TTGC	2	8	38430	38437	0 %	50 %	25 %	25 %	33151313
129	NC_002940	GTTT	2	8	38555	38562	0 %	75 %	25 %	0 %	33151313
130	NC_002940	AATG	2	8	38625	38632	50 %	25 %	25 %	0 %	33151313
131	NC_002940	GCTT	2	8	38942	38949	0 %	50 %	25 %	25 %	33151313
132	NC_002940	TGCG	2	8	39080	39087	0 %	25 %	50 %	25 %	33151313
133	NC_002940	GAAA	2	8	39244	39251	75 %	0 %	25 %	0 %	33151314
134	NC_002940	GTTT	2	8	39776	39783	0 %	75 %	25 %	0 %	33151315
135	NC_002940	AATA	2	8	39880	39887	75 %	25 %	0 %	0 %	33151316
136	NC_002940	TAAT	2	8	39948	39955	50 %	50 %	0 %	0 %	33151317
137	NC_002940	GCTT	2	8	40032	40039	0 %	50 %	25 %	25 %	33151317
138	NC_002940	AATG	2	8	40060	40067	50 %	25 %	25 %	0 %	33151317
139	NC_002940	TTTA	2	8	40078	40085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002940	TCTT	2	8	40172	40179	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_002940	TTTA	2	8	40345	40352	25 %	75 %	0 %	0 %	33151318
142	NC_002940	ATTT	2	8	40778	40785	25 %	75 %	0 %	0 %	33151318
143	NC_002940	TAAA	2	8	40921	40928	75 %	25 %	0 %	0 %	33151318
144	NC_002940	ATCA	2	8	41330	41337	50 %	25 %	0 %	25 %	33151318
145	NC_002940	TAAA	2	8	41640	41647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002940	GAAT	2	8	41716	41723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002940	GGTA	2	8	42471	42478	25 %	25 %	50 %	0 %	33151319
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