MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus ducreyi 35000HP chromosome

Total Repeats: 915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002940	GATT	2	8	68	75	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002940	TTAT	2	8	76	83	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002940	ATCG	2	8	196	203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_002940	TTGC	2	8	2213	2220	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_002940	TTAC	2	8	2972	2979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_002940	CATA	2	8	3159	3166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_002940	TTAA	2	8	10180	10187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002940	ATAC	2	8	10225	10232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002940	TGAA	2	8	11046	11053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002940	ATTG	2	8	11115	11122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002940	AGGG	2	8	11304	11311	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002940	GCCT	2	8	12395	12402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_002940	TAAA	2	8	12518	12525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002940	TATT	2	8	12897	12904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002940	GCGA	2	8	12997	13004	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_002940	GTAC	2	8	13271	13278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_002940	GGTG	2	8	13694	13701	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002940	AAAG	2	8	13829	13836	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002940	GCTG	2	8	14506	14513	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_002940	TGCC	2	8	14573	14580	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_002940	AAGC	2	8	15078	15085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_002940	AGGA	2	8	15695	15702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002940	CAAT	2	8	15803	15810	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_002940	TCAA	2	8	15828	15835	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_002940	ACAA	2	8	15847	15854	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_002940	ATCC	2	8	15912	15919	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_002940	ATTA	2	8	15996	16003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002940	CCTG	2	8	16207	16214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_002940	CCGT	2	8	16242	16249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_002940	ATTT	2	8	16256	16263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002940	TTTA	2	8	18752	18759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002940	AAGT	2	8	21269	21276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002940	TTGC	2	8	21621	21628	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_002940	ATCG	2	8	21737	21744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_002940	CGCC	2	8	21926	21933	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_002940	ATCA	2	8	22060	22067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_002940	TGAG	2	8	22103	22110	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002940	ACAG	2	8	22182	22189	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_002940	CTTG	2	8	22222	22229	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_002940	TATG	2	8	22232	22239	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002940	GCCA	2	8	22249	22256	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_002940	ATCT	2	8	23002	23009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_002940	AATA	2	8	26287	26294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002940	GATT	2	8	31963	31970	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002940	TAGC	2	8	36083	36090	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_002940	TTTA	2	8	40078	40085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002940	TCTT	2	8	40172	40179	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_002940	TAAA	2	8	41640	41647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002940	GAAT	2	8	41716	41723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002940	TATC	2	8	43141	43148	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002940	TATC	2	8	46520	46527	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_002940	TAAA	2	8	49120	49127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002940	CTAC	2	8	49600	49607	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_002940	GCAA	2	8	49633	49640	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_002940	GGGT	2	8	51782	51789	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002940	TTTG	2	8	51941	51948	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002940	TGCT	2	8	52220	52227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_002940	GGCA	2	8	52247	52254	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_002940	AGTA	2	8	52513	52520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002940	AAAT	2	8	57110	57117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002940	AATT	2	8	60384	60391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002940	TTTA	2	8	60755	60762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002940	ATAA	2	8	61400	61407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002940	ATTA	2	8	69376	69383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002940	TTTA	2	8	69392	69399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002940	GACA	2	8	70732	70739	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_002940	GTTT	2	8	70928	70935	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002940	AAGC	2	8	75583	75590	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_002940	AAAG	2	8	75710	75717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002940	ACGC	2	8	84021	84028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_002940	AAAG	2	8	88658	88665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002940	AGCG	2	8	88943	88950	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_002940	AAGA	2	8	89189	89196	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002940	GAAA	2	8	89244	89251	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002940	TTGA	2	8	90277	90284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002940	CAAG	2	8	90300	90307	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_002940	GGAC	2	8	90458	90465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_002940	TAAC	2	8	90566	90573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_002940	AGCA	2	8	90725	90732	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_002940	ACAA	2	8	106092	106099	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_002940	ATGT	2	8	107031	107038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002940	ATTA	2	8	107443	107450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002940	TTAT	2	8	107556	107563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002940	CAAT	2	8	108648	108655	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_002940	ATGT	2	8	108831	108838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002940	GGTT	2	8	109480	109487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002940	TAAA	2	8	109669	109676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002940	CATT	2	8	110335	110342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002940	TATC	2	8	110513	110520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_002940	TTTC	2	8	110606	110613	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_002940	AAAT	2	8	110925	110932	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002940	AATT	2	8	111041	111048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002940	ACCG	2	8	113190	113197	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002940	TAAA	2	8	114946	114953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002940	TGAA	2	8	116522	116529	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002940	TAAA	2	8	130887	130894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002940	ATGA	2	8	130908	130915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002940	AATG	2	8	132128	132135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002940	ATTT	2	8	134326	134333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002940	AATG	2	8	134366	134373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002940	TAAG	2	8	136654	136661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002940	TGTA	2	8	137186	137193	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002940	ATAA	2	8	137196	137203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002940	ATTT	2	8	140547	140554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002940	ATAA	2	8	140696	140703	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002940	GCTT	2	8	147394	147401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_002940	CAAA	2	8	147491	147498	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_002940	AGCA	2	8	148130	148137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_002940	AAAT	2	8	148173	148180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002940	AAGA	2	8	157507	157514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002940	ATCA	2	8	160792	160799	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_002940	ACGG	2	8	161284	161291	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_002940	CAGG	2	8	161319	161326	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_002940	AATT	2	8	161397	161404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002940	AAGT	2	8	162238	162245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002940	GTTA	2	8	168509	168516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002940	CATA	2	8	168536	168543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_002940	TTGC	2	8	168546	168553	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_002940	GTTG	2	8	168620	168627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002940	GGTA	2	8	170938	170945	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002940	GGAA	2	8	190746	190753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002940	GATG	2	8	191337	191344	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002940	GGTC	2	8	191375	191382	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_002940	GAAT	2	8	196725	196732	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002940	ATAA	2	8	211150	211157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002940	TAAA	2	8	211187	211194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002940	TTAA	2	8	211242	211249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002940	GTTA	2	8	211268	211275	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002940	GATT	2	8	211915	211922	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002940	GAAG	2	8	212122	212129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002940	GTAA	2	8	214393	214400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002940	GTAA	2	8	215162	215169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002940	TATG	2	8	220713	220720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002940	ATTT	2	8	224462	224469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002940	ACAT	2	8	225908	225915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_002940	TTAT	2	8	226948	226955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002940	ACCT	2	8	226970	226977	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_002940	GTTG	2	8	226983	226990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002940	CAAT	2	8	227043	227050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_002940	ATTT	2	8	231771	231778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002940	TGAT	2	8	232889	232896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002940	ATTA	2	8	238675	238682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002940	TGAA	2	8	240559	240566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002940	ATTG	2	8	240628	240635	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002940	AGGG	2	8	240817	240824	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002940	GCCT	2	8	241908	241915	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_002940	TAAA	2	8	242031	242038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002940	TATT	2	8	242410	242417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002940	GCGA	2	8	242510	242517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_002940	GTAC	2	8	242784	242791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_002940	GGTG	2	8	243207	243214	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002940	AAAG	2	8	243342	243349	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_002940	GCTG	2	8	244019	244026	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_002940	TGCC	2	8	244086	244093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
155	NC_002940	AAGC	2	8	244591	244598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_002940	AGGA	2	8	245208	245215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_002940	TATT	2	8	279179	279186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_002940	ATTT	2	8	298379	298386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_002940	AATT	2	8	304570	304577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_002940	TATG	2	8	308190	308197	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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233	NC_002940	TAAA	2	8	415337	415344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_002940	TTTA	2	8	415345	415352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_002940	ATAA	2	8	422697	422704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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