MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus ducreyi 35000HP chromosome

Total Repeats: 19562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002940	GCG	2	6	356	361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33151283
2	NC_002940	ATT	2	6	391	396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151283
3	NC_002940	TGG	2	6	448	453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151283
4	NC_002940	GGT	2	6	494	499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151283
5	NC_002940	AAG	2	6	663	668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151283
6	NC_002940	ATC	2	6	690	695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151283
7	NC_002940	GTG	2	6	702	707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151283
8	NC_002940	GCG	2	6	830	835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33151283
9	NC_002940	ACC	2	6	898	903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33151283
10	NC_002940	AAC	2	6	945	950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151283
11	NC_002940	ATC	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151283
12	NC_002940	ATT	2	6	1055	1060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151283
13	NC_002940	ATT	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151283
14	NC_002940	ATT	2	6	1301	1306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151283
15	NC_002940	GAA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151283
16	NC_002940	TTA	2	6	1448	1453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151283
17	NC_002940	GAC	2	6	1538	1543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151283
18	NC_002940	GCT	2	6	1874	1879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151283
19	NC_002940	TAA	2	6	2023	2028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151283
20	NC_002940	AAC	2	6	2357	2362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151284
21	NC_002940	AGA	2	6	2430	2435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151284
22	NC_002940	GTC	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151284
23	NC_002940	GAT	2	6	2722	2727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151284
24	NC_002940	ATT	2	6	3251	3256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151285
25	NC_002940	AGG	2	6	3345	3350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33151285
26	NC_002940	GTG	2	6	3446	3451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151285
27	NC_002940	TTA	2	6	3478	3483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151285
28	NC_002940	AGC	2	6	3489	3494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151285
29	NC_002940	GTT	2	6	3552	3557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151285
30	NC_002940	CAA	2	6	3561	3566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151285
31	NC_002940	CAC	2	6	3659	3664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33151286
32	NC_002940	TTG	2	6	3729	3734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151286
33	NC_002940	TGG	2	6	3822	3827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151286
34	NC_002940	TAT	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151286
35	NC_002940	ATG	2	6	4364	4369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151286
36	NC_002940	TAA	2	6	4399	4404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151286
37	NC_002940	CAA	2	6	4557	4562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151287
38	NC_002940	TAT	2	6	4578	4583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151287
39	NC_002940	TGC	2	6	4591	4596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151287
40	NC_002940	GGT	2	6	4628	4633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151287
41	NC_002940	ATC	3	9	4645	4653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151287
42	NC_002940	TAG	2	6	4672	4677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151287
43	NC_002940	TTG	2	6	4895	4900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151288
44	NC_002940	TTA	2	6	4931	4936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151288
45	NC_002940	ATC	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151288
46	NC_002940	AGA	2	6	5052	5057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151288
47	NC_002940	CAA	2	6	5081	5086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151288
48	NC_002940	CGT	2	6	5089	5094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151288
49	NC_002940	AAG	2	6	5195	5200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151288
50	NC_002940	GCA	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151288
51	NC_002940	TTG	2	6	5249	5254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151288
52	NC_002940	GCA	2	6	5272	5277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151288
53	NC_002940	AAT	2	6	5278	5283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151288
54	NC_002940	AGC	2	6	5368	5373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151289
55	NC_002940	AGT	2	6	5458	5463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151289
56	NC_002940	TTC	2	6	5511	5516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33151289
57	NC_002940	TGA	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151289
58	NC_002940	AAG	2	6	5691	5696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151289
59	NC_002940	AAC	2	6	5746	5751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151289
60	NC_002940	TAT	3	9	5779	5787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151289
61	NC_002940	ATG	2	6	5793	5798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151289
62	NC_002940	TAT	2	6	5986	5991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151290
63	NC_002940	TTA	2	6	6182	6187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151290
64	NC_002940	ATG	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151290
65	NC_002940	CAT	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151290
66	NC_002940	AGA	2	6	6511	6516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151290
67	NC_002940	GTG	2	6	6630	6635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151290
68	NC_002940	ATG	2	6	6654	6659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151290
69	NC_002940	ATT	2	6	6860	6865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151290
70	NC_002940	CAA	2	6	6900	6905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151290
71	NC_002940	GCA	2	6	7013	7018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151290
72	NC_002940	GGT	2	6	7046	7051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151290
73	NC_002940	TGA	2	6	7114	7119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151290
74	NC_002940	TGG	2	6	7517	7522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151291
75	NC_002940	GCA	2	6	7558	7563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151291
76	NC_002940	GTC	2	6	7565	7570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151291
77	NC_002940	TAG	2	6	7790	7795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151291
78	NC_002940	TTG	2	6	7886	7891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151291
79	NC_002940	TAC	2	6	8003	8008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151291
80	NC_002940	ATG	2	6	8027	8032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151291
81	NC_002940	TAT	2	6	8084	8089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151291
82	NC_002940	TGA	2	6	8217	8222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151291
83	NC_002940	TTG	2	6	8282	8287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151291
84	NC_002940	TGC	3	9	8292	8300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151291
85	NC_002940	ATG	2	6	8402	8407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151292
86	NC_002940	CAA	3	9	8443	8451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151292
87	NC_002940	GGT	3	9	8455	8463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151292
88	NC_002940	TAT	2	6	8574	8579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151292
89	NC_002940	TGA	2	6	8601	8606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151292
90	NC_002940	GAA	2	6	8623	8628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151292
91	NC_002940	GAA	2	6	8665	8670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151292
92	NC_002940	GGT	2	6	8740	8745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151292
93	NC_002940	TGG	2	6	8760	8765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151292
94	NC_002940	ATG	2	6	8791	8796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151292
95	NC_002940	ACC	2	6	8949	8954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33151292
96	NC_002940	TGA	2	6	9009	9014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151292
97	NC_002940	TAT	2	6	9026	9031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151292
98	NC_002940	ATA	2	6	9041	9046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151292
99	NC_002940	TTA	2	6	9085	9090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151292
100	NC_002940	AGA	2	6	9132	9137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151292
101	NC_002940	GAA	2	6	9367	9372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151292
102	NC_002940	GTG	2	6	9389	9394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151292
103	NC_002940	ATT	2	6	9433	9438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151292
104	NC_002940	GAT	2	6	9469	9474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151292
105	NC_002940	TTG	2	6	9530	9535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151292
106	NC_002940	CGA	2	6	9663	9668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151292
107	NC_002940	GTG	2	6	9815	9820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151293
108	NC_002940	TTA	2	6	9859	9864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151293
109	NC_002940	ATA	2	6	9905	9910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151293
110	NC_002940	AAG	2	6	9911	9916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151293
111	NC_002940	GGT	2	6	9934	9939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151293
112	NC_002940	GTG	2	6	9992	9997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151293
113	NC_002940	CAA	2	6	10009	10014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151293
114	NC_002940	TAT	2	6	10017	10022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151293
115	NC_002940	TGC	2	6	10023	10028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151293
116	NC_002940	TAT	2	6	16503	16508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151294
117	NC_002940	TGT	2	6	16562	16567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151294
118	NC_002940	ATT	2	6	16587	16592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151294
119	NC_002940	TAG	2	6	16689	16694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151294
120	NC_002940	GTT	2	6	16712	16717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151294
121	NC_002940	GAT	2	6	16762	16767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151294
122	NC_002940	GTG	2	6	16978	16983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151294
123	NC_002940	TGT	2	6	17105	17110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151294
124	NC_002940	CTA	2	6	17303	17308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151294
125	NC_002940	ATT	2	6	17382	17387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151295
126	NC_002940	TTG	2	6	17388	17393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151295
127	NC_002940	AGA	2	6	17435	17440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151295
128	NC_002940	TTG	2	6	17481	17486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151295
129	NC_002940	TAA	2	6	17592	17597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151295
130	NC_002940	AAT	2	6	17625	17630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151295
131	NC_002940	ATA	2	6	17693	17698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151295
132	NC_002940	TTC	2	6	17773	17778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33151295
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