MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Geobacter sulfurreducens PCA chromosome

Total Repeats: 2758

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002939	CAATC	2	10	54	63	40 %	20 %	0 %	40 %	47525234
2	NC_002939	GATCG	2	10	1711	1720	20 %	20 %	40 %	20 %	39995112
3	NC_002939	CGGGA	2	10	4315	4324	20 %	0 %	60 %	20 %	39995114
4	NC_002939	GAAAG	2	10	5247	5256	60 %	0 %	40 %	0 %	39995114
5	NC_002939	GGCCG	2	10	5977	5986	0 %	0 %	60 %	40 %	39995114
6	NC_002939	ACCGG	2	10	7113	7122	20 %	0 %	40 %	40 %	39995115
7	NC_002939	CGGGA	2	10	7307	7316	20 %	0 %	60 %	20 %	39995115
8	NC_002939	GGCGG	2	10	7429	7438	0 %	0 %	80 %	20 %	39995115
9	NC_002939	GCGCC	2	10	10368	10377	0 %	0 %	40 %	60 %	400756306
10	NC_002939	CTGAT	2	10	10411	10420	20 %	40 %	20 %	20 %	400756306
11	NC_002939	CGGGA	2	10	14162	14171	20 %	0 %	60 %	20 %	39995119
12	NC_002939	GCCTT	2	10	15480	15489	0 %	40 %	20 %	40 %	39995119
13	NC_002939	TCTCC	2	10	17974	17983	0 %	40 %	0 %	60 %	39995121
14	NC_002939	TCTCC	2	10	18661	18670	0 %	40 %	0 %	60 %	39995121
15	NC_002939	CCCGT	2	10	18708	18717	0 %	20 %	20 %	60 %	39995121
16	NC_002939	CGATA	2	10	20958	20967	40 %	20 %	20 %	20 %	39995123
17	NC_002939	TGGAC	2	10	26308	26317	20 %	20 %	40 %	20 %	39995128
18	NC_002939	TCGGG	2	10	29120	29129	0 %	20 %	60 %	20 %	39995129
19	NC_002939	CGGCT	2	10	30082	30091	0 %	20 %	40 %	40 %	39995129
20	NC_002939	GCTCC	2	10	30587	30596	0 %	20 %	20 %	60 %	39995130
21	NC_002939	CCGCG	2	10	30906	30915	0 %	0 %	40 %	60 %	39995130
22	NC_002939	GGCGA	2	10	32256	32265	20 %	0 %	60 %	20 %	39995132
23	NC_002939	TGGGC	2	10	35003	35012	0 %	20 %	60 %	20 %	39995135
24	NC_002939	TTCCG	2	10	35868	35877	0 %	40 %	20 %	40 %	39995136
25	NC_002939	CGGCC	2	10	36904	36913	0 %	0 %	40 %	60 %	400756307
26	NC_002939	CGTTG	2	10	36973	36982	0 %	40 %	40 %	20 %	400756307
27	NC_002939	TGGCT	2	10	37087	37096	0 %	40 %	40 %	20 %	400756307
28	NC_002939	GCGCA	2	10	38086	38095	20 %	0 %	40 %	40 %	39995139
29	NC_002939	GCCGA	2	10	38878	38887	20 %	0 %	40 %	40 %	39995140
30	NC_002939	TCCCC	2	10	39582	39591	0 %	20 %	0 %	80 %	39995141
31	NC_002939	TCCGC	2	10	39764	39773	0 %	20 %	20 %	60 %	39995141
32	NC_002939	CGGGG	2	10	44722	44731	0 %	0 %	80 %	20 %	39995145
33	NC_002939	TCCCC	2	10	45683	45692	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
34	NC_002939	CTGGA	2	10	45824	45833	20 %	20 %	40 %	20 %	39995146
35	NC_002939	GCGCG	2	10	46671	46680	0 %	0 %	60 %	40 %	39995147
36	NC_002939	GGTGC	2	10	46769	46778	0 %	20 %	60 %	20 %	39995147
37	NC_002939	CATCA	2	10	47209	47218	40 %	20 %	0 %	40 %	39995147
38	NC_002939	AGCAC	2	10	49033	49042	40 %	0 %	20 %	40 %	39995149
39	NC_002939	GAGCT	2	10	49170	49179	20 %	20 %	40 %	20 %	39995149
40	NC_002939	GGACG	2	10	49240	49249	20 %	0 %	60 %	20 %	39995149
41	NC_002939	CCGGG	2	10	51393	51402	0 %	0 %	60 %	40 %	39995152
42	NC_002939	TCAAA	2	10	53573	53582	60 %	20 %	0 %	20 %	400756308
43	NC_002939	TGTTA	2	10	54440	54449	20 %	60 %	20 %	0 %	39995155
44	NC_002939	GGTCG	2	10	56501	56510	0 %	20 %	60 %	20 %	39995155
45	NC_002939	GGAGG	2	10	59261	59270	20 %	0 %	80 %	0 %	39995155
46	NC_002939	CGATT	2	10	59885	59894	20 %	40 %	20 %	20 %	39995155
47	NC_002939	AGCGA	2	10	61391	61400	40 %	0 %	40 %	20 %	39995157
48	NC_002939	TCAGA	2	10	62971	62980	40 %	20 %	20 %	20 %	39995158
49	NC_002939	GGACA	2	10	66124	66133	40 %	0 %	40 %	20 %	39995162
50	NC_002939	GACCA	2	10	67294	67303	40 %	0 %	20 %	40 %	39995162
51	NC_002939	ACTGT	2	10	67439	67448	20 %	40 %	20 %	20 %	39995162
52	NC_002939	CGCAC	2	10	70663	70672	20 %	0 %	20 %	60 %	39995165
53	NC_002939	TGGCG	2	10	71769	71778	0 %	20 %	60 %	20 %	39995165
54	NC_002939	TGGAA	2	10	72169	72178	40 %	20 %	40 %	0 %	39995166
55	NC_002939	CCGAG	2	10	72205	72214	20 %	0 %	40 %	40 %	39995166
56	NC_002939	CGGGC	2	10	79551	79560	0 %	0 %	60 %	40 %	39995174
57	NC_002939	TCGTC	2	10	80344	80353	0 %	40 %	20 %	40 %	39995175
58	NC_002939	GAAAT	2	10	81159	81168	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002939	ATGAA	2	10	81257	81266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002939	GAAAG	2	10	81937	81946	60 %	0 %	40 %	0 %	39995176
61	NC_002939	GGAGG	2	10	86018	86027	20 %	0 %	80 %	0 %	39995181
62	NC_002939	TGTTC	2	10	86449	86458	0 %	60 %	20 %	20 %	39995181
63	NC_002939	GAGGT	2	10	88627	88636	20 %	20 %	60 %	0 %	39995185
64	NC_002939	GGACC	2	10	92463	92472	20 %	0 %	40 %	40 %	39995191
65	NC_002939	GGCGA	2	10	93283	93292	20 %	0 %	60 %	20 %	39995191
66	NC_002939	CATCG	2	10	94127	94136	20 %	20 %	20 %	40 %	39995193
67	NC_002939	GCGCG	2	10	94326	94335	0 %	0 %	60 %	40 %	39995193
68	NC_002939	GCGGA	2	10	95362	95371	20 %	0 %	60 %	20 %	39995194
69	NC_002939	CGGGG	2	10	95948	95957	0 %	0 %	80 %	20 %	39995195
70	NC_002939	CGCCT	2	10	96599	96608	0 %	20 %	20 %	60 %	39995195
71	NC_002939	CGCTC	2	10	97104	97113	0 %	20 %	20 %	60 %	39995196
72	NC_002939	CGGCC	2	10	99029	99038	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
73	NC_002939	TGACG	2	10	105073	105082	20 %	20 %	40 %	20 %	400756314
74	NC_002939	CGAAC	2	10	106752	106761	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_002939	CCCCG	2	10	108033	108042	0 %	0 %	20 %	80 %	39995205
76	NC_002939	ACCGT	2	10	109912	109921	20 %	20 %	20 %	40 %	39995208
77	NC_002939	TGCTC	2	10	110171	110180	0 %	40 %	20 %	40 %	39995208
78	NC_002939	GACCG	2	10	112282	112291	20 %	0 %	40 %	40 %	39995208
79	NC_002939	TTCAG	2	10	116617	116626	20 %	40 %	20 %	20 %	39995212
80	NC_002939	GCTCC	2	10	117677	117686	0 %	20 %	20 %	60 %	39995213
81	NC_002939	CTGCG	2	10	118293	118302	0 %	20 %	40 %	40 %	39995213
82	NC_002939	CCACG	2	10	119720	119729	20 %	0 %	20 %	60 %	39995214
83	NC_002939	GGTGG	2	10	120842	120851	0 %	20 %	80 %	0 %	39995215
84	NC_002939	AACCA	2	10	121542	121551	60 %	0 %	0 %	40 %	400756315
85	NC_002939	CCATA	2	10	121604	121613	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_002939	GGCTG	2	10	121928	121937	0 %	20 %	60 %	20 %	39995217
87	NC_002939	GGAAG	2	10	122595	122604	40 %	0 %	60 %	0 %	308513277
88	NC_002939	GAGAG	2	10	130577	130586	40 %	0 %	60 %	0 %	400756317
89	NC_002939	GATCG	2	10	132846	132855	20 %	20 %	40 %	20 %	39995228
90	NC_002939	GCTCC	2	10	133367	133376	0 %	20 %	20 %	60 %	39995229
91	NC_002939	GCCGT	2	10	133459	133468	0 %	20 %	40 %	40 %	39995229
92	NC_002939	AGGTA	2	10	133492	133501	40 %	20 %	40 %	0 %	39995229
93	NC_002939	GGGGA	2	10	138653	138662	20 %	0 %	80 %	0 %	39995235
94	NC_002939	CCGCT	2	10	138895	138904	0 %	20 %	20 %	60 %	39995235
95	NC_002939	TCCGG	2	10	139320	139329	0 %	20 %	40 %	40 %	39995236
96	NC_002939	GTCCA	2	10	139856	139865	20 %	20 %	20 %	40 %	39995236
97	NC_002939	CGGGG	2	10	140748	140757	0 %	0 %	80 %	20 %	39995237
98	NC_002939	CGATC	2	10	141773	141782	20 %	20 %	20 %	40 %	400756322
99	NC_002939	CCGCT	2	10	142083	142092	0 %	20 %	20 %	60 %	39995239
100	NC_002939	GTTCA	2	10	142530	142539	20 %	40 %	20 %	20 %	39995239
101	NC_002939	CCGGG	2	10	143822	143831	0 %	0 %	60 %	40 %	39995239
102	NC_002939	GATTT	2	10	144268	144277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002939	ACCGG	2	10	146188	146197	20 %	0 %	40 %	40 %	39995242
104	NC_002939	GCTCT	2	10	147254	147263	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_002939	GTGGG	2	10	147645	147654	0 %	20 %	80 %	0 %	39995244
106	NC_002939	GCCCG	2	10	148220	148229	0 %	0 %	40 %	60 %	39995244
107	NC_002939	TTGTA	2	10	148804	148813	20 %	60 %	20 %	0 %	39995245
108	NC_002939	AGGAG	2	10	149929	149938	40 %	0 %	60 %	0 %	39995246
109	NC_002939	CCGGC	2	10	149973	149982	0 %	0 %	40 %	60 %	39995246
110	NC_002939	GGGGC	2	10	151461	151470	0 %	0 %	80 %	20 %	39995247
111	NC_002939	CGCCA	2	10	152653	152662	20 %	0 %	20 %	60 %	39995249
112	NC_002939	GCGGA	2	10	160331	160340	20 %	0 %	60 %	20 %	39995255
113	NC_002939	GAAGG	2	10	162005	162014	40 %	0 %	60 %	0 %	39995256
114	NC_002939	CGGCT	2	10	166202	166211	0 %	20 %	40 %	40 %	39995259
115	NC_002939	GGGGC	2	10	170101	170110	0 %	0 %	80 %	20 %	39995263
116	NC_002939	GGCCC	2	10	170617	170626	0 %	0 %	40 %	60 %	39995263
117	NC_002939	GCTTC	2	10	173624	173633	0 %	40 %	20 %	40 %	39995266
118	NC_002939	GCCCA	2	10	174315	174324	20 %	0 %	20 %	60 %	39995267
119	NC_002939	TCGCG	2	10	175215	175224	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_002939	GGGGA	2	10	175235	175244	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002939	GCGCC	2	10	175724	175733	0 %	0 %	40 %	60 %	39995268
122	NC_002939	CTGGC	2	10	184494	184503	0 %	20 %	40 %	40 %	39995279
123	NC_002939	TCCGC	2	10	185509	185518	0 %	20 %	20 %	60 %	39995280
124	NC_002939	GGATT	2	10	191276	191285	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002939	CCAAC	2	10	191666	191675	40 %	0 %	0 %	60 %	39995286
126	NC_002939	CGGTT	2	10	192812	192821	0 %	40 %	40 %	20 %	39995288
127	NC_002939	ACGTC	2	10	193012	193021	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_002939	GGCGA	2	10	194076	194085	20 %	0 %	60 %	20 %	39995290
129	NC_002939	GGGAA	2	10	194362	194371	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002939	GTCCA	2	10	195024	195033	20 %	20 %	20 %	40 %	39995292
131	NC_002939	CGGAG	2	10	196006	196015	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_002939	GTCTT	2	10	196311	196320	0 %	60 %	20 %	20 %	39995293
133	NC_002939	GCTCC	2	10	196736	196745	0 %	20 %	20 %	60 %	39995294
134	NC_002939	CGGGC	2	10	198836	198845	0 %	0 %	60 %	40 %	39995295
135	NC_002939	CCCGG	2	10	199191	199200	0 %	0 %	40 %	60 %	400756327
136	NC_002939	GCCCG	2	10	199376	199385	0 %	0 %	40 %	60 %	400756327
137	NC_002939	CGACC	2	10	200592	200601	20 %	0 %	20 %	60 %	400756328
138	NC_002939	AAACC	2	10	203915	203924	60 %	0 %	0 %	40 %	39995301
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