MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacter sulfurreducens PCA chromosome

Total Repeats: 312

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002939	TCCCC	2	10	45683	45692	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_002939	GAAAT	2	10	81159	81168	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002939	ATGAA	2	10	81257	81266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002939	CGGCC	2	10	99029	99038	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_002939	CGAAC	2	10	106752	106761	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_002939	CCATA	2	10	121604	121613	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_002939	GATTT	2	10	144268	144277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002939	GCTCT	2	10	147254	147263	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_002939	TCGCG	2	10	175215	175224	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_002939	GGGGA	2	10	175235	175244	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002939	GGATT	2	10	191276	191285	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002939	ACGTC	2	10	193012	193021	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_002939	GGGAA	2	10	194362	194371	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002939	CGGAG	2	10	196006	196015	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_002939	ATCGA	2	10	212828	212837	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_002939	GGGGC	2	10	225630	225639	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17	NC_002939	ATTTT	2	10	226107	226116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002939	GGCCC	2	10	274366	274375	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_002939	GTCGG	2	10	285007	285016	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_002939	CCGGC	2	10	289946	289955	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_002939	TTTTA	2	10	307824	307833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002939	TGTTT	2	10	347885	347894	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002939	GGAAA	2	10	392745	392754	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002939	AGGAA	2	10	416218	416227	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002939	GTTTC	2	10	422295	422304	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_002939	AAGGA	2	10	429844	429853	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002939	ACGGC	2	10	437078	437087	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_002939	AAGGA	2	10	448239	448248	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002939	CCATT	2	10	456993	457002	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_002939	GTCTG	2	10	478845	478854	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_002939	TGTCC	2	10	525982	525991	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_002939	GCTCC	2	10	528454	528463	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_002939	CCTCG	2	10	536110	536119	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_002939	ACAAA	2	10	544269	544278	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_002939	GCCGG	2	10	544456	544465	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_002939	GACCG	2	10	564909	564918	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_002939	TAGAA	2	10	592410	592419	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002939	TTTTG	2	10	592696	592705	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002939	TGGAG	2	10	594993	595002	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002939	AATTG	2	10	605726	605735	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002939	ATAAG	2	10	613561	613570	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002939	AATTA	3	15	648450	648464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002939	GGAGG	2	10	680748	680757	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002939	GAGAG	2	10	685359	685368	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002939	TCGTG	2	10	685770	685779	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_002939	TTTTG	2	10	686580	686589	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002939	GAAAA	2	10	686912	686921	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002939	ACCGT	2	10	688347	688356	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_002939	GGCAC	2	10	697836	697845	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_002939	TAACG	2	10	698953	698962	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_002939	TGCCG	2	10	703659	703668	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_002939	GGGAG	2	10	718879	718888	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002939	TGAAT	2	10	818209	818218	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002939	CCCTG	2	10	818349	818358	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_002939	AGTCA	2	10	820523	820532	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_002939	TTTCA	2	10	823014	823023	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_002939	GACTT	2	10	826349	826358	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_002939	CAAGA	2	10	834767	834776	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_002939	CAATG	2	10	860302	860311	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_002939	TACGG	2	10	879082	879091	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_002939	GCATT	2	10	901439	901448	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_002939	ACAGG	2	10	901526	901535	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_002939	CTCAC	2	10	907945	907954	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_002939	CCGCC	2	10	915619	915628	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
65	NC_002939	TCCCC	2	10	917562	917571	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
66	NC_002939	CGGCC	2	10	924273	924282	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_002939	GGTCC	2	10	934650	934659	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_002939	ACCGA	2	10	947103	947112	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_002939	TCAAT	2	10	949422	949431	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_002939	CGTGG	2	10	951772	951781	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_002939	CGCGG	2	10	968324	968333	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
72	NC_002939	ATCAG	2	10	980092	980101	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_002939	CTTTT	2	10	1011287	1011296	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_002939	GAATC	2	10	1014221	1014230	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_002939	CTCTC	2	10	1019327	1019336	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_002939	TCTTT	2	10	1028590	1028599	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_002939	CGGAC	2	10	1040045	1040054	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_002939	TCCCC	2	10	1044834	1044843	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
79	NC_002939	CTCTG	2	10	1044854	1044863	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_002939	CGCGG	2	10	1055401	1055410	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
81	NC_002939	GCCGA	2	10	1088580	1088589	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_002939	AACCC	2	10	1093648	1093657	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_002939	TGGTT	2	10	1098722	1098731	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002939	GCTCC	2	10	1109611	1109620	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_002939	GCACC	2	10	1113772	1113781	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_002939	GGCGC	2	10	1132096	1132105	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_002939	TCCGC	2	10	1136238	1136247	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_002939	TTTAC	2	10	1138878	1138887	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_002939	AGGGG	2	10	1148409	1148418	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002939	TTCCC	2	10	1158764	1158773	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
91	NC_002939	CTTTC	2	10	1163879	1163888	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_002939	TGCAG	2	10	1176375	1176384	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_002939	TCGCC	2	10	1176471	1176480	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_002939	AGGAT	2	10	1185714	1185723	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002939	GGAGG	2	10	1185743	1185752	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002939	TGTGT	2	10	1188557	1188566	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002939	ACTAT	2	10	1194260	1194269	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_002939	CTTTT	2	10	1204433	1204442	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_002939	GAGAG	2	10	1224810	1224819	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002939	TCGTG	2	10	1225221	1225230	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_002939	TTTTG	2	10	1226031	1226040	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002939	GAAAA	2	10	1226363	1226372	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002939	ACCGT	2	10	1227798	1227807	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_002939	CATAG	2	10	1263035	1263044	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_002939	GTATA	2	10	1290253	1290262	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002939	GAGAG	2	10	1290317	1290326	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002939	ACTAT	2	10	1292322	1292331	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_002939	GGGTT	2	10	1292384	1292393	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002939	TCCCA	2	10	1293752	1293761	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_002939	CCACA	2	10	1301194	1301203	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
111	NC_002939	TTCCG	2	10	1312956	1312965	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_002939	GTGTG	2	10	1342746	1342755	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002939	CCCTT	2	10	1384499	1384508	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
114	NC_002939	GCGGG	2	10	1384772	1384781	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
115	NC_002939	AGGGA	2	10	1400223	1400232	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002939	TTGAT	2	10	1403150	1403159	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002939	CGATA	2	10	1403181	1403190	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_002939	GGGAA	2	10	1409787	1409796	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002939	GGTAT	2	10	1426427	1426436	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002939	AGGTG	2	10	1428049	1428058	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002939	GCCCG	2	10	1430075	1430084	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_002939	TCGGA	2	10	1462979	1462988	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_002939	CTTAA	2	10	1490603	1490612	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_002939	AAATG	2	10	1503849	1503858	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002939	GGACG	2	10	1506549	1506558	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_002939	CGGGT	2	10	1507810	1507819	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_002939	TTGAT	2	10	1522923	1522932	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002939	GAACC	2	10	1523457	1523466	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_002939	CCGTG	2	10	1523671	1523680	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_002939	GGGCC	2	10	1523952	1523961	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_002939	CAAAA	2	10	1527860	1527869	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_002939	TTGCC	2	10	1530487	1530496	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_002939	ACGGG	2	10	1530569	1530578	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_002939	TGATT	2	10	1562346	1562355	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002939	TAGGT	2	10	1562565	1562574	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002939	GGTGA	2	10	1582625	1582634	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002939	GCTTG	2	10	1655466	1655475	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_002939	GGGGC	2	10	1697172	1697181	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
139	NC_002939	CCATG	2	10	1710223	1710232	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_002939	TGGTT	2	10	1728451	1728460	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002939	TAAAA	2	10	1728805	1728814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002939	CAAAC	2	10	1755691	1755700	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_002939	CGTTT	2	10	1773040	1773049	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_002939	TTTAT	2	10	1775900	1775909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_002939	CCGGG	2	10	3457806	3457815	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
278	NC_002939	CTCTC	2	10	3462284	3462293	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
279	NC_002939	ACGGC	2	10	3495514	3495523	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
280	NC_002939	TGAAA	2	10	3520026	3520035	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
281	NC_002939	GCTGG	2	10	3525482	3525491	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
282	NC_002939	TAATT	2	10	3525687	3525696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_002939	CATTA	2	10	3546439	3546448	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
284	NC_002939	AGGAA	3	15	3546711	3546725	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
285	NC_002939	TGCAA	2	10	3550335	3550344	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
286	NC_002939	GGCCG	2	10	3550898	3550907	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
287	NC_002939	TGTCG	2	10	3589502	3589511	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
288	NC_002939	TCAGT	2	10	3598029	3598038	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
289	NC_002939	AGCGG	2	10	3608951	3608960	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
290	NC_002939	GCCCG	2	10	3619176	3619185	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
291	NC_002939	GCCTT	2	10	3634053	3634062	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
292	NC_002939	CCCTT	2	10	3641364	3641373	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
293	NC_002939	TTGAC	2	10	3647030	3647039	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
294	NC_002939	ACAGC	2	10	3665211	3665220	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
295	NC_002939	CAAGA	2	10	3676856	3676865	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
296	NC_002939	CCCGG	2	10	3676935	3676944	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
297	NC_002939	GGGAT	2	10	3694436	3694445	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
298	NC_002939	CGGCC	2	10	3702038	3702047	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
299	NC_002939	GAAGG	2	10	3703622	3703631	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
300	NC_002939	GGCCG	2	10	3718638	3718647	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
301	NC_002939	TTATT	2	10	3721506	3721515	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_002939	GGAAT	2	10	3724852	3724861	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
303	NC_002939	TTTTC	2	10	3725197	3725206	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
304	NC_002939	TGCTC	2	10	3726108	3726117	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
305	NC_002939	GCCGG	2	10	3743247	3743256	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
306	NC_002939	GCCGG	2	10	3751585	3751594	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
307	NC_002939	CACAA	2	10	3757033	3757042	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
308	NC_002939	ATTTA	2	10	3757137	3757146	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_002939	GTATG	2	10	3765194	3765203	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
310	NC_002939	GGGGC	2	10	3772870	3772879	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
311	NC_002939	GAATC	2	10	3792588	3792597	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
312	NC_002939	CGGCA	2	10	3798646	3798655	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.