MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough chromosome

Total Repeats: 475

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002937	GAAAA	2	10	1589	1598	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002937	CCGGG	2	10	10971	10980	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_002937	TTTGT	2	10	23124	23133	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002937	CGGCA	2	10	24781	24790	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_002937	GGCGC	2	10	24798	24807	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_002937	CCGTG	2	10	33728	33737	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_002937	TTGCC	2	10	33860	33869	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_002937	CGGCG	2	10	36200	36209	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_002937	GGGGA	2	10	40386	40395	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002937	GGGTG	2	10	40398	40407	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002937	GGAAG	2	10	41484	41493	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002937	TATCG	2	10	42172	42181	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_002937	CGGGA	2	10	42238	42247	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_002937	ACCGT	2	10	50497	50506	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_002937	GCGTG	2	10	63783	63792	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_002937	TCCTG	2	10	76977	76986	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_002937	TGTCC	2	10	87215	87224	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_002937	GTCTC	2	10	87241	87250	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_002937	ACGCC	2	10	88727	88736	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_002937	CACAC	2	10	95808	95817	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_002937	CTGTC	2	10	105420	105429	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_002937	CTTTT	2	10	110985	110994	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_002937	CGGTG	2	10	123207	123216	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_002937	TGAAC	2	10	131229	131238	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_002937	TGCGT	2	10	144169	144178	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_002937	GGGCG	2	10	148403	148412	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
27	NC_002937	CGCTG	2	10	151794	151803	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_002937	TGCCG	2	10	166992	167001	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_002937	TGTGC	2	10	170141	170150	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_002937	CGCAA	2	10	172538	172547	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_002937	AGGAA	2	10	175577	175586	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002937	ATGCC	2	10	176240	176249	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_002937	CTGCC	2	10	176275	176284	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_002937	TCGCC	2	10	178860	178869	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_002937	CGCGT	2	10	183860	183869	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_002937	CAGAG	2	10	189598	189607	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_002937	GTGCA	2	10	189884	189893	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_002937	GGGCA	2	10	189943	189952	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_002937	AGTGC	2	10	203436	203445	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_002937	AAGAT	2	10	219190	219199	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002937	GGCAG	2	10	231176	231185	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_002937	CGGCC	2	10	265439	265448	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_002937	TGGCG	2	10	266878	266887	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_002937	GCCCG	2	10	272892	272901	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_002937	CTGCC	2	10	274703	274712	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_002937	CGGCG	2	10	275120	275129	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
47	NC_002937	GGCAG	2	10	276136	276145	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_002937	GGGCG	2	10	280585	280594	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
49	NC_002937	GTCCA	2	10	280754	280763	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_002937	GGCAG	2	10	282684	282693	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_002937	GCCGC	2	10	284553	284562	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_002937	ATGCA	2	10	284598	284607	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_002937	GCGGG	2	10	284670	284679	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
54	NC_002937	CTTTT	2	10	299981	299990	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_002937	TCCGC	2	10	319127	319136	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_002937	GACGT	2	10	324096	324105	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_002937	CATGC	2	10	331388	331397	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_002937	CGCAT	2	10	333760	333769	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_002937	GCGTG	2	10	337512	337521	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_002937	TCGCA	2	10	344310	344319	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_002937	GAGGG	2	10	349439	349448	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002937	CTCCC	2	10	362028	362037	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
63	NC_002937	ATGAC	2	10	366489	366498	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_002937	TCCCG	2	10	367815	367824	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_002937	GATGC	2	10	387336	387345	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_002937	GGCGA	2	10	389270	389279	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_002937	GCGAT	2	10	389327	389336	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_002937	TGCCC	2	10	406977	406986	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NC_002937	AGGCG	2	10	413508	413517	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_002937	GAAAA	2	10	416964	416973	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002937	TTGAT	2	10	418030	418039	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002937	CGCAA	2	10	420083	420092	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_002937	GTTCT	2	10	423283	423292	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_002937	CGGCA	2	10	434562	434571	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_002937	GCGGG	2	10	448566	448575	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
76	NC_002937	AACCA	2	10	449862	449871	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_002937	GCCCT	2	10	454588	454597	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_002937	CCCGG	2	10	470687	470696	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
79	NC_002937	ACGGG	2	10	472082	472091	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_002937	CTTGC	2	10	478431	478440	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_002937	CGGAA	2	10	479055	479064	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_002937	CTGCG	2	10	481731	481740	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_002937	TCGCC	2	10	481772	481781	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_002937	TGAAG	2	10	484254	484263	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002937	AATGT	2	10	489694	489703	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002937	CATCC	2	10	490650	490659	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
87	NC_002937	GGCAT	2	10	495935	495944	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_002937	GCGGG	2	10	499666	499675	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
89	NC_002937	GCCGC	2	10	499717	499726	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
90	NC_002937	GACGC	2	10	501059	501068	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_002937	CAGGG	2	10	508019	508028	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_002937	GACCC	2	10	526399	526408	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_002937	GACGT	2	10	527016	527025	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_002937	CTGGT	2	10	557951	557960	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_002937	AGCGC	2	10	573190	573199	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_002937	AAAAG	2	10	601590	601599	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002937	TGTAT	2	10	616746	616755	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002937	GTCAT	2	10	625095	625104	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_002937	AATGG	2	10	625561	625570	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002937	TGCCT	2	10	637684	637693	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_002937	GGCGG	2	10	637743	637752	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
102	NC_002937	GGGGC	2	10	640609	640618	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
103	NC_002937	ATGGT	2	10	663888	663897	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002937	TGCCG	2	10	671707	671716	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_002937	AGGGG	2	10	682972	682981	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002937	ATATT	2	10	684397	684406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002937	TGACG	2	10	696258	696267	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_002937	CGACC	2	10	697074	697083	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_002937	GCATG	2	10	698997	699006	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_002937	ATGTG	2	10	704391	704400	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002937	GCCTT	2	10	708884	708893	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_002937	GGCAT	2	10	721627	721636	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_002937	CCGGG	2	10	734364	734373	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
114	NC_002937	GTTGC	2	10	739716	739725	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_002937	TCTGC	2	10	743718	743727	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_002937	GTGCT	2	10	746163	746172	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_002937	TGTGC	2	10	749167	749176	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_002937	CCATG	2	10	775491	775500	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_002937	AGTAT	2	10	788765	788774	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002937	CTTGC	2	10	805006	805015	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_002937	GTCCG	2	10	816430	816439	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_002937	CCCCG	2	10	819750	819759	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
123	NC_002937	GGCAC	2	10	819827	819836	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_002937	CTTGC	2	10	821660	821669	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_002937	GGCAG	2	10	822166	822175	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_002937	ATGCG	2	10	823404	823413	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_002937	CACGG	2	10	851132	851141	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_002937	GGAAG	2	10	852405	852414	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002937	TGTGT	2	10	857759	857768	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002937	CGTTG	2	10	880089	880098	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_002937	TGGCG	2	10	904429	904438	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_002937	CATGC	2	10	908637	908646	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_002937	TGCCG	2	10	911480	911489	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_002937	ATGGC	2	10	924343	924352	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_002937	GGTGC	2	10	929042	929051	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_002937	TTTCA	2	10	941335	941344	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_002937	GGGCG	2	10	943681	943690	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
138	NC_002937	CAGCG	2	10	965060	965069	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_002937	GGGAA	2	10	969889	969898	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002937	GTGGG	2	10	971128	971137	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002937	CCCCG	2	10	971355	971364	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
142	NC_002937	CCGTC	2	10	984810	984819	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_002937	GGGGC	2	10	986134	986143	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
144	NC_002937	CCATT	2	10	1008774	1008783	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_002937	GGGCG	2	10	1017334	1017343	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
146	NC_002937	GAGAC	2	10	1017409	1017418	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_002937	ACCCT	2	10	1017509	1017518	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
148	NC_002937	TGCCG	2	10	1021921	1021930	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_002937	GCCCT	2	10	1046212	1046221	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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163	NC_002937	CGGTG	2	10	1136289	1136298	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
164	NC_002937	TCGTC	2	10	1136950	1136959	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_002937	TGCCG	2	10	1328772	1328781	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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270	NC_002937	CGCTG	2	10	2078904	2078913	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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282	NC_002937	AGCCT	2	10	2186049	2186058	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
283	NC_002937	CGTTC	2	10	2200235	2200244	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
284	NC_002937	CATGC	2	10	2207892	2207901	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
285	NC_002937	GCTAC	2	10	2211536	2211545	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
286	NC_002937	GACAC	2	10	2212360	2212369	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
287	NC_002937	CGGCA	2	10	2236233	2236242	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
288	NC_002937	CCTGC	2	10	2240401	2240410	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
289	NC_002937	ACCGC	2	10	2242938	2242947	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
290	NC_002937	GCGAC	2	10	2250049	2250058	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
291	NC_002937	GCAGC	2	10	2264257	2264266	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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294	NC_002937	CGCAC	2	10	2301307	2301316	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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302	NC_002937	TGTGT	2	10	2356313	2356322	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_002937	CACCT	2	10	2583204	2583213	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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421	NC_002937	ATGCC	2	10	3233978	3233987	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
422	NC_002937	AGGAA	3	15	3244226	3244240	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_002937	ACCCG	2	10	3245273	3245282	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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461	NC_002937	GCACA	2	10	3482384	3482393	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
462	NC_002937	CAGGG	2	10	3484291	3484300	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
463	NC_002937	CCGGC	2	10	3484817	3484826	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
464	NC_002937	GCAAC	2	10	3498429	3498438	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
465	NC_002937	GATTC	2	10	3516402	3516411	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
466	NC_002937	GGCAT	2	10	3526272	3526281	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
467	NC_002937	GCTAC	2	10	3526555	3526564	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
468	NC_002937	ACGCC	2	10	3532951	3532960	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
469	NC_002937	GCCCG	2	10	3534732	3534741	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
470	NC_002937	TCACA	2	10	3535718	3535727	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
471	NC_002937	CATGG	2	10	3551088	3551097	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
472	NC_002937	TGCCG	2	10	3551320	3551329	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
473	NC_002937	AGGGG	2	10	3551364	3551373	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
474	NC_002937	GCACG	2	10	3554098	3554107	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
475	NC_002937	GCACG	2	10	3566889	3566898	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.