MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalococcoides ethenogenes 195

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002936	TCCTTA	2	12	1626	1637	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002936	AGTTAA	2	12	1859	1870	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002936	GCTTTG	2	12	29773	29784	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_002936	TATATT	2	12	37163	37174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002936	TGGCAA	2	12	38972	38983	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_002936	AAGCGA	2	12	48417	48428	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_002936	CCATGT	2	12	64641	64652	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_002936	CTTCGA	2	12	70396	70407	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002936	TATTTA	2	12	82144	82155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002936	CGGCTG	2	12	152645	152656	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_002936	GCTTTT	2	12	211707	211718	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_002936	AATAAA	2	12	286522	286533	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002936	TGGTTT	2	12	599569	599580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002936	TGGTTT	2	12	630580	630591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002936	GATTTA	2	12	698628	698639	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002936	TCTTTA	2	12	708433	708444	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_002936	CTTTCA	2	12	743327	743338	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_002936	AGCCGG	2	12	837844	837855	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_002936	AAAATC	2	12	872562	872573	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_002936	TATAAA	2	12	895460	895471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002936	TAACAC	2	12	928300	928311	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_002936	TCAGTG	2	12	929177	929188	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_002936	TTTTAA	2	12	930936	930947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002936	GTCCAT	2	12	984018	984029	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_002936	TTGATC	2	12	991737	991748	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_002936	TTGTCC	2	12	998491	998502	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_002936	GACTGC	2	12	1003902	1003913	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_002936	ATTTTC	2	12	1047444	1047455	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_002936	GCCAAT	2	12	1047705	1047716	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_002936	CCTCGG	2	12	1048580	1048591	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_002936	GTCTAC	2	12	1048842	1048853	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_002936	AATATC	2	12	1070502	1070513	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_002936	AGGTGA	2	12	1091027	1091038	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002936	CAGCCG	2	12	1136394	1136405	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_002936	TAAAGA	2	12	1201272	1201283	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002936	AAGCTA	2	12	1214928	1214939	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_002936	TTTACC	2	12	1250187	1250198	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002936	CTGCCC	2	12	1250566	1250577	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_002936	GGAGGG	2	12	1254887	1254898	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002936	ATTTAT	2	12	1278370	1278381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002936	ACCAGA	2	12	1297686	1297697	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_002936	TTGCAG	2	12	1297929	1297940	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_002936	ACCCCC	2	12	1309404	1309415	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
44	NC_002936	AAAAAC	2	12	1324626	1324637	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_002936	ATTTTT	2	12	1385646	1385657	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002936	ATACTG	2	12	1409368	1409379	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.