MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Dehalococcoides ethenogenes 195

Total Repeats: 926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002936	ACTTT	2	10	3494	3503	20 %	60 %	0 %	20 %	57233677
2	NC_002936	CGGAA	2	10	4921	4930	40 %	0 %	40 %	20 %	57233676
3	NC_002936	ATTTC	2	10	5811	5820	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_002936	GCATG	2	10	8600	8609	20 %	20 %	40 %	20 %	57233674
5	NC_002936	CGCAG	2	10	8988	8997	20 %	0 %	40 %	40 %	57233674
6	NC_002936	GCTCA	2	10	9423	9432	20 %	20 %	20 %	40 %	57233674
7	NC_002936	GCTGT	2	10	9496	9505	0 %	40 %	40 %	20 %	57233674
8	NC_002936	TATGG	2	10	10454	10463	20 %	40 %	40 %	0 %	57233673
9	NC_002936	CGCAG	2	10	13714	13723	20 %	0 %	40 %	40 %	57233659
10	NC_002936	GGGGT	2	10	13781	13790	0 %	20 %	80 %	0 %	57233659
11	NC_002936	TACCG	2	10	16623	16632	20 %	20 %	20 %	40 %	57233655
12	NC_002936	GCTGG	2	10	19548	19557	0 %	20 %	60 %	20 %	57233642
13	NC_002936	GGCAG	2	10	22074	22083	20 %	0 %	60 %	20 %	57233639
14	NC_002936	CCAGG	2	10	22084	22093	20 %	0 %	40 %	40 %	57233639
15	NC_002936	GGCAT	2	10	22484	22493	20 %	20 %	40 %	20 %	57233639
16	NC_002936	CCCAG	2	10	22644	22653	20 %	0 %	20 %	60 %	57233639
17	NC_002936	CGGGG	2	10	24190	24199	0 %	0 %	80 %	20 %	57233637
18	NC_002936	CTGGC	2	10	26215	26224	0 %	20 %	40 %	40 %	57233628
19	NC_002936	ACCGC	2	10	32136	32145	20 %	0 %	20 %	60 %	57233614
20	NC_002936	CGGGA	2	10	33640	33649	20 %	0 %	60 %	20 %	57233612
21	NC_002936	CCGGC	2	10	33890	33899	0 %	0 %	40 %	60 %	57233612
22	NC_002936	TTTCA	2	10	36006	36015	20 %	60 %	0 %	20 %	57233609
23	NC_002936	GACCA	2	10	36387	36396	40 %	0 %	20 %	40 %	57233599
24	NC_002936	TATGG	2	10	36912	36921	20 %	40 %	40 %	0 %	57233598
25	NC_002936	GGCGG	2	10	37359	37368	0 %	0 %	80 %	20 %	57233597
26	NC_002936	GCGGG	2	10	41230	41239	0 %	0 %	80 %	20 %	57233593
27	NC_002936	TATCT	2	10	41924	41933	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_002936	GGCGG	2	10	42835	42844	0 %	0 %	80 %	20 %	57233592
29	NC_002936	GTGAA	2	10	48494	48503	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002936	TCCCG	2	10	50802	50811	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_002936	GCTTT	2	10	50890	50899	0 %	60 %	20 %	20 %	57233579
32	NC_002936	GGGGC	2	10	51277	51286	0 %	0 %	80 %	20 %	57233578
33	NC_002936	CCATC	2	10	52678	52687	20 %	20 %	0 %	60 %	57233578
34	NC_002936	TGAAA	2	10	54550	54559	60 %	20 %	20 %	0 %	57233577
35	NC_002936	TCGGC	2	10	54627	54636	0 %	20 %	40 %	40 %	57233577
36	NC_002936	GCCAT	2	10	56415	56424	20 %	20 %	20 %	40 %	57233567
37	NC_002936	AAGGT	2	10	59900	59909	40 %	20 %	40 %	0 %	57233566
38	NC_002936	ATTTT	2	10	64329	64338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002936	GCAGC	2	10	64618	64627	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_002936	CTTGC	2	10	65125	65134	0 %	40 %	20 %	40 %	57233561
41	NC_002936	TAACT	2	10	73619	73628	40 %	40 %	0 %	20 %	57233559
42	NC_002936	GTAAA	2	10	74536	74545	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002936	GTTTT	2	10	75181	75190	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002936	ACCCT	2	10	79797	79806	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_002936	TATAT	2	10	79902	79911	40 %	60 %	0 %	0 %	57233553
46	NC_002936	AATAC	2	10	79936	79945	60 %	20 %	0 %	20 %	57233553
47	NC_002936	AATAC	2	10	81459	81468	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_002936	TCCTT	2	10	81482	81491	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_002936	AAGTA	2	10	83261	83270	60 %	20 %	20 %	0 %	57233551
50	NC_002936	ATCTA	2	10	83589	83598	40 %	40 %	0 %	20 %	57233550
51	NC_002936	TTTCC	2	10	84231	84240	0 %	60 %	0 %	40 %	57233549
52	NC_002936	GTATG	2	10	85825	85834	20 %	40 %	40 %	0 %	57233548
53	NC_002936	TGATT	2	10	88598	88607	20 %	60 %	20 %	0 %	57233545
54	NC_002936	TAACG	2	10	88753	88762	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_002936	CCAGA	2	10	90458	90467	40 %	0 %	20 %	40 %	57233540
56	NC_002936	GACCA	2	10	92347	92356	40 %	0 %	20 %	40 %	57233539
57	NC_002936	GTTTC	2	10	92606	92615	0 %	60 %	20 %	20 %	57233538
58	NC_002936	CAAGC	2	10	95963	95972	40 %	0 %	20 %	40 %	57233534
59	NC_002936	TAGGG	2	10	96892	96901	20 %	20 %	60 %	0 %	57233534
60	NC_002936	GCCTT	2	10	97545	97554	0 %	40 %	20 %	40 %	57233534
61	NC_002936	GCTGG	2	10	103682	103691	0 %	20 %	60 %	20 %	57235089
62	NC_002936	GCTGG	2	10	104877	104886	0 %	20 %	60 %	20 %	57235080
63	NC_002936	TTCAG	2	10	105528	105537	20 %	40 %	20 %	20 %	57235079
64	NC_002936	TCTGC	2	10	105745	105754	0 %	40 %	20 %	40 %	57235078
65	NC_002936	CGGGG	2	10	105839	105848	0 %	0 %	80 %	20 %	57235078
66	NC_002936	CGCGG	2	10	109857	109866	0 %	0 %	60 %	40 %	57235075
67	NC_002936	ACCGC	2	10	112990	112999	20 %	0 %	20 %	60 %	57235064
68	NC_002936	AGCCC	2	10	113539	113548	20 %	0 %	20 %	60 %	57235063
69	NC_002936	TGCCA	2	10	113648	113657	20 %	20 %	20 %	40 %	57235063
70	NC_002936	GGGCA	2	10	114023	114032	20 %	0 %	60 %	20 %	57235063
71	NC_002936	TAGCT	2	10	115142	115151	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_002936	CCCGG	2	10	116216	116225	0 %	0 %	40 %	60 %	57235061
73	NC_002936	ACTTC	2	10	116752	116761	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_002936	TGAAA	2	10	118951	118960	60 %	20 %	20 %	0 %	57235052
75	NC_002936	TACCT	2	10	119718	119727	20 %	40 %	0 %	40 %	57235052
76	NC_002936	GAAGG	2	10	121975	121984	40 %	0 %	60 %	0 %	57235049
77	NC_002936	TTTTG	2	10	122289	122298	0 %	80 %	20 %	0 %	57235049
78	NC_002936	GCAGG	2	10	123120	123129	20 %	0 %	60 %	20 %	57235047
79	NC_002936	CCGCT	2	10	125949	125958	0 %	20 %	20 %	60 %	57235045
80	NC_002936	TTCCG	2	10	125974	125983	0 %	40 %	20 %	40 %	57235045
81	NC_002936	AAAAC	2	10	128363	128372	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_002936	TGGTT	2	10	128571	128580	0 %	60 %	40 %	0 %	57235036
83	NC_002936	GTTCA	2	10	130348	130357	20 %	40 %	20 %	20 %	57235034
84	NC_002936	AAGGT	2	10	132352	132361	40 %	20 %	40 %	0 %	57235030
85	NC_002936	CCCGT	2	10	133514	133523	0 %	20 %	20 %	60 %	57235029
86	NC_002936	CGGGT	2	10	136850	136859	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_002936	GTTTG	2	10	138127	138136	0 %	60 %	40 %	0 %	57235018
88	NC_002936	ACTAT	2	10	139212	139221	40 %	40 %	0 %	20 %	57235017
89	NC_002936	CAGCT	2	10	141911	141920	20 %	20 %	20 %	40 %	57235004
90	NC_002936	GGGCA	2	10	142947	142956	20 %	0 %	60 %	20 %	57235004
91	NC_002936	CTGAC	2	10	143925	143934	20 %	20 %	20 %	40 %	57235003
92	NC_002936	TAACA	2	10	147486	147495	60 %	20 %	0 %	20 %	57234991
93	NC_002936	CACAT	2	10	147997	148006	40 %	20 %	0 %	40 %	57234991
94	NC_002936	GTTAA	2	10	148472	148481	40 %	40 %	20 %	0 %	57234990
95	NC_002936	GCAAA	2	10	148831	148840	60 %	0 %	20 %	20 %	57234990
96	NC_002936	AATTC	2	10	150014	150023	40 %	40 %	0 %	20 %	57234989
97	NC_002936	GACAA	2	10	154524	154533	60 %	0 %	20 %	20 %	57234984
98	NC_002936	CGCCT	2	10	154830	154839	0 %	20 %	20 %	60 %	57234984
99	NC_002936	AAGCC	2	10	155407	155416	40 %	0 %	20 %	40 %	57234984
100	NC_002936	GCATC	2	10	155711	155720	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_002936	CGGCC	2	10	155827	155836	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
102	NC_002936	GTTTC	2	10	155842	155851	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_002936	AGATC	2	10	158188	158197	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_002936	CGCTG	2	10	159059	159068	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_002936	TGTTT	2	10	159377	159386	0 %	80 %	20 %	0 %	57235095
106	NC_002936	TAAAA	2	10	159863	159872	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002936	GAATT	2	10	161605	161614	40 %	40 %	20 %	0 %	57235104
108	NC_002936	TATTT	2	10	161873	161882	20 %	80 %	0 %	0 %	57235104
109	NC_002936	CAACG	2	10	163110	163119	40 %	0 %	20 %	40 %	57235088
110	NC_002936	TTTTC	2	10	163599	163608	0 %	80 %	0 %	20 %	57235088
111	NC_002936	AATGG	2	10	165551	165560	40 %	20 %	40 %	0 %	57235087
112	NC_002936	TGCCC	2	10	167672	167681	0 %	20 %	20 %	60 %	57235085
113	NC_002936	TGAAC	2	10	168452	168461	40 %	20 %	20 %	20 %	57235084
114	NC_002936	AATTT	2	10	169392	169401	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002936	CTGGC	2	10	169775	169784	0 %	20 %	40 %	40 %	57235082
116	NC_002936	AGGGG	2	10	169964	169973	20 %	0 %	80 %	0 %	57235081
117	NC_002936	CCCCT	2	10	169980	169989	0 %	20 %	0 %	80 %	57235081
118	NC_002936	AAGGT	2	10	171191	171200	40 %	20 %	40 %	0 %	57235072
119	NC_002936	TGGCC	2	10	175295	175304	0 %	20 %	40 %	40 %	57235068
120	NC_002936	GCCCG	2	10	177131	177140	0 %	0 %	40 %	60 %	57235067
121	NC_002936	GGGCA	2	10	178481	178490	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_002936	CCCAG	2	10	178852	178861	20 %	0 %	20 %	60 %	57235059
123	NC_002936	CGGTA	2	10	180698	180707	20 %	20 %	40 %	20 %	57235057
124	NC_002936	CTGGC	2	10	183072	183081	0 %	20 %	40 %	40 %	57235057
125	NC_002936	CAGGC	2	10	184283	184292	20 %	0 %	40 %	40 %	57235055
126	NC_002936	CATTC	2	10	187464	187473	20 %	40 %	0 %	40 %	57235042
127	NC_002936	GCAGG	2	10	189641	189650	20 %	0 %	60 %	20 %	57235041
128	NC_002936	ATATG	2	10	190979	190988	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002936	ATAGT	2	10	193437	193446	40 %	40 %	20 %	0 %	57235026
130	NC_002936	TGGCT	2	10	196045	196054	0 %	40 %	40 %	20 %	57235024
131	NC_002936	CCGGC	2	10	196100	196109	0 %	0 %	40 %	60 %	57235024
132	NC_002936	TAAGG	2	10	196798	196807	40 %	20 %	40 %	0 %	57235023
133	NC_002936	ACTTC	2	10	197606	197615	20 %	40 %	0 %	40 %	57235023
134	NC_002936	TCGGG	2	10	197852	197861	0 %	20 %	60 %	20 %	57235022
135	NC_002936	AGGTG	2	10	198449	198458	20 %	20 %	60 %	0 %	57235014
136	NC_002936	CTGGC	2	10	200918	200927	0 %	20 %	40 %	40 %	57235012
137	NC_002936	CAGGG	2	10	202760	202769	20 %	0 %	60 %	20 %	57235010
138	NC_002936	CTGAA	2	10	202878	202887	40 %	20 %	20 %	20 %	57235010
139	NC_002936	GCCTG	2	10	203211	203220	0 %	20 %	40 %	40 %	57235010
140	NC_002936	AGCTG	2	10	203368	203377	20 %	20 %	40 %	20 %	57235010
141	NC_002936	GGCCG	2	10	204186	204195	0 %	0 %	60 %	40 %	57235009
142	NC_002936	CAGTT	2	10	204589	204598	20 %	40 %	20 %	20 %	57235009
143	NC_002936	AAAGC	2	10	205843	205852	60 %	0 %	20 %	20 %	57235007
144	NC_002936	CCAGC	2	10	206786	206795	20 %	0 %	20 %	60 %	57234998
145	NC_002936	GGCAG	2	10	207325	207334	20 %	0 %	60 %	20 %	57234998
146	NC_002936	GGCAG	2	10	207788	207797	20 %	0 %	60 %	20 %	57234998
147	NC_002936	CAGGC	2	10	207952	207961	20 %	0 %	40 %	40 %	57234997
148	NC_002936	CCAAG	2	10	209212	209221	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_002936	CACCC	2	10	209536	209545	20 %	0 %	0 %	80 %	57234996
150	NC_002936	AACTA	2	10	212354	212363	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_002936	TTGGG	2	10	212721	212730	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002936	GCCCC	2	10	213135	213144	0 %	0 %	20 %	80 %	57234982
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157	NC_002936	ACGGG	2	10	234292	234301	20 %	0 %	60 %	20 %	57234945
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165	NC_002936	TGGCT	2	10	249792	249801	0 %	40 %	40 %	20 %	57234951
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169	NC_002936	TACCC	2	10	254915	254924	20 %	20 %	0 %	60 %	57234934
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171	NC_002936	CCCTG	2	10	256018	256027	0 %	20 %	20 %	60 %	57234934
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173	NC_002936	ACCAG	2	10	259316	259325	40 %	0 %	20 %	40 %	57234933
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179	NC_002936	TGGCT	2	10	272150	272159	0 %	40 %	40 %	20 %	57234904
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183	NC_002936	TACCC	2	10	277273	277282	20 %	20 %	0 %	60 %	57234887
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187	NC_002936	ACCAG	2	10	281674	281683	40 %	0 %	20 %	40 %	57234886
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192	NC_002936	AATTT	2	10	289778	289787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_002936	CGGGG	2	10	290108	290117	0 %	0 %	80 %	20 %	57234868
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199	NC_002936	CGTTA	2	10	297526	297535	20 %	40 %	20 %	20 %	57234852
200	NC_002936	CTGAA	2	10	300854	300863	40 %	20 %	20 %	20 %	57234841
201	NC_002936	AAATA	2	10	301883	301892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_002936	TGGGT	2	10	303553	303562	0 %	40 %	60 %	0 %	57234840
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213	NC_002936	CCGGC	2	10	328131	328140	0 %	0 %	40 %	60 %	57234897
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239	NC_002936	GGCAT	2	10	363207	363216	20 %	20 %	40 %	20 %	57234829
240	NC_002936	GCCAG	2	10	363993	364002	20 %	0 %	40 %	40 %	57234829
241	NC_002936	AGTCA	2	10	366837	366846	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
242	NC_002936	GGCTT	2	10	367835	367844	0 %	40 %	40 %	20 %	57234816
243	NC_002936	TGGCC	2	10	368139	368148	0 %	20 %	40 %	40 %	57234814
244	NC_002936	CCGGC	2	10	371710	371719	0 %	0 %	40 %	60 %	57234811
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246	NC_002936	AAACT	2	10	373229	373238	60 %	20 %	0 %	20 %	57234803
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248	NC_002936	CGTAC	2	10	374398	374407	20 %	20 %	20 %	40 %	57234801
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250	NC_002936	CGGTG	2	10	375392	375401	0 %	20 %	60 %	20 %	57234800
251	NC_002936	TTTGG	2	10	376995	377004	0 %	60 %	40 %	0 %	57234798
252	NC_002936	ATAAA	2	10	379560	379569	80 %	20 %	0 %	0 %	57234788
253	NC_002936	CCATA	2	10	380056	380065	40 %	20 %	0 %	40 %	57234788
254	NC_002936	TAAGC	2	10	384357	384366	40 %	20 %	20 %	20 %	57234783
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256	NC_002936	GCCGG	2	10	386462	386471	0 %	0 %	60 %	40 %	57234819
257	NC_002936	CTTCG	2	10	387294	387303	0 %	40 %	20 %	40 %	57234819
258	NC_002936	ACTGC	2	10	387736	387745	20 %	20 %	20 %	40 %	57234810
259	NC_002936	TCTGG	2	10	388205	388214	0 %	40 %	40 %	20 %	57234810
260	NC_002936	GGCCG	2	10	389860	389869	0 %	0 %	60 %	40 %	57234808
261	NC_002936	AGCTT	2	10	389937	389946	20 %	40 %	20 %	20 %	57234808
262	NC_002936	GTCAG	2	10	390929	390938	20 %	20 %	40 %	20 %	57234806
263	NC_002936	TTTTC	2	10	393372	393381	0 %	80 %	0 %	20 %	57234795
264	NC_002936	TTTGA	2	10	395129	395138	20 %	60 %	20 %	0 %	57234793
265	NC_002936	ATTAT	2	10	397045	397054	40 %	60 %	0 %	0 %	57234790
266	NC_002936	GGGCC	2	10	400318	400327	0 %	0 %	60 %	40 %	57234780
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268	NC_002936	GCTTT	2	10	402939	402948	0 %	60 %	20 %	20 %	57234778
269	NC_002936	CGGTT	2	10	404485	404494	0 %	40 %	40 %	20 %	57234777
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405	NC_002936	CATTT	2	10	642191	642200	20 %	60 %	0 %	20 %	57234510
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500	NC_002936	GGCAG	2	10	817042	817051	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

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