MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalococcoides ethenogenes 195

Total Repeats: 409

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002936	CTTG	2	8	118	125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_002936	GGGA	2	8	248	255	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002936	CTAA	2	8	8277	8284	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_002936	AATC	2	8	15570	15577	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_002936	TTTA	2	8	18291	18298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002936	GTTT	2	8	18419	18426	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002936	AGGC	2	8	18516	18523	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_002936	CGGG	2	8	21029	21036	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002936	CTTT	2	8	35057	35064	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_002936	GTTT	2	8	35136	35143	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002936	GCAG	2	8	36653	36660	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_002936	GCGA	2	8	47960	47967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_002936	TTCT	2	8	48154	48161	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_002936	TGGA	2	8	50068	50075	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002936	GGTC	2	8	50369	50376	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_002936	GTAC	2	8	61844	61851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_002936	GTTT	2	8	64449	64456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002936	TTCT	2	8	65409	65416	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_002936	TTTA	2	8	66091	66098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002936	ATTG	2	8	66121	66128	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002936	TTCG	2	8	67733	67740	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_002936	ATGG	2	8	67783	67790	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002936	AGTA	2	8	70342	70349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002936	TTTC	2	8	70464	70471	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_002936	CGGG	2	8	70929	70936	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_002936	TCCT	2	8	74848	74855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_002936	GATA	2	8	76820	76827	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002936	AGTT	2	8	79136	79143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002936	GGGA	2	8	79157	79164	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002936	CTGT	2	8	81405	81412	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_002936	TTTC	2	8	81497	81504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_002936	TCGG	2	8	81667	81674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_002936	TTAT	2	8	82721	82728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002936	ATTT	2	8	86327	86334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002936	ATAA	2	8	89595	89602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002936	GATA	2	8	101036	101043	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002936	TATT	2	8	101335	101342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002936	TAAA	2	8	101399	101406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002936	AATA	2	8	102628	102635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002936	CTGC	2	8	102894	102901	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_002936	GCCC	2	8	107391	107398	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_002936	CTTT	2	8	111602	111609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_002936	AGGC	2	8	111650	111657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_002936	TCCG	2	8	114327	114334	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_002936	TCCG	2	8	114469	114476	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_002936	GGTG	2	8	115769	115776	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002936	CCTT	2	8	120378	120385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_002936	TATT	2	8	125013	125020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002936	GATT	2	8	129819	129826	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002936	ATTT	2	8	131143	131150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002936	AGGT	2	8	132275	132282	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002936	AATA	2	8	135953	135960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002936	GAAG	2	8	135967	135974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002936	CTTT	2	8	141190	141197	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_002936	GGGT	2	8	146701	146708	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002936	TTAA	2	8	151709	151716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002936	CAAT	2	8	151893	151900	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_002936	TAAG	2	8	153163	153170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002936	ATCG	2	8	156858	156865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_002936	CGAT	2	8	156866	156873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_002936	GATA	2	8	157126	157133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002936	TAAC	2	8	157605	157612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_002936	CGAT	2	8	157630	157637	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_002936	TTCA	2	8	157642	157649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_002936	GTTG	2	8	157886	157893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002936	GATT	2	8	158026	158033	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002936	AGAA	2	8	162314	162321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002936	TTCT	2	8	164626	164633	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_002936	AGGA	2	8	167846	167853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002936	TGGT	2	8	169641	169648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002936	TAGG	2	8	173195	173202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002936	TTAG	2	8	175092	175099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002936	CTTT	2	8	175136	175143	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_002936	CCTT	2	8	178375	178382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_002936	CCCT	2	8	180584	180591	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_002936	CCCG	2	8	183894	183901	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_002936	AATT	2	8	185054	185061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002936	TAAA	2	8	185423	185430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002936	GCCT	2	8	202590	202597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_002936	AGGA	2	8	212746	212753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002936	TTTC	2	8	216425	216432	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_002936	GCTT	2	8	225962	225969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_002936	AAAC	2	8	244964	244971	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_002936	TTCA	2	8	246450	246457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_002936	GGAC	2	8	247247	247254	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_002936	CGGG	2	8	247255	247262	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_002936	TTTG	2	8	261795	261802	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002936	TTCT	2	8	262009	262016	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002936	AAAC	2	8	267322	267329	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_002936	TTCA	2	8	268808	268815	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_002936	GGAC	2	8	269605	269612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_002936	CGGG	2	8	269613	269620	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_002936	TTTG	2	8	284153	284160	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002936	TTCT	2	8	284367	284374	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_002936	TGGT	2	8	289880	289887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002936	TAAA	2	8	289960	289967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002936	GACT	2	8	298639	298646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_002936	GAAA	2	8	300638	300645	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002936	TATT	2	8	301623	301630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002936	TAGT	2	8	301648	301655	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002936	TTAT	2	8	301709	301716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002936	AAAT	2	8	301837	301844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002936	ATGA	2	8	307849	307856	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002936	GGAG	2	8	326194	326201	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002936	ATCT	2	8	328709	328716	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_002936	CAGC	2	8	329400	329407	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_002936	TATC	2	8	337045	337052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_002936	TTGA	2	8	339775	339782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002936	TAGT	2	8	359340	359347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002936	TATT	2	8	359467	359474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002936	ATTT	2	8	364762	364769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002936	CAGG	2	8	371082	371089	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_002936	TTTG	2	8	377739	377746	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002936	TAAA	2	8	377821	377828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002936	TCTT	2	8	385159	385166	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_002936	TTTG	2	8	385486	385493	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002936	CCTG	2	8	387631	387638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_002936	ATTT	2	8	392069	392076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002936	AGCT	2	8	392135	392142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_002936	ATAA	2	8	413461	413468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002936	ATTG	2	8	442327	442334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002936	CGGG	2	8	480764	480771	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_002936	TTAA	2	8	487544	487551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002936	GTTT	2	8	522555	522562	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002936	AATA	2	8	528015	528022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002936	GTTT	2	8	532029	532036	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002936	GCCT	2	8	535057	535064	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_002936	ATGT	2	8	564091	564098	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002936	TGTA	2	8	567905	567912	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002936	GCAG	2	8	580531	580538	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_002936	TAAA	2	8	584786	584793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002936	GGGA	2	8	588268	588275	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002936	TCCC	2	8	590963	590970	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_002936	TCCT	2	8	592932	592939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_002936	ATTG	2	8	598289	598296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002936	AATG	2	8	599592	599599	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002936	TGAC	2	8	605383	605390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_002936	CAGG	2	8	608249	608256	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_002936	CGGG	2	8	615534	615541	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_002936	AACA	2	8	622965	622972	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_002936	TCCT	2	8	623943	623950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_002936	ATTG	2	8	629300	629307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002936	AATG	2	8	630603	630610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002936	TGAC	2	8	636394	636401	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_002936	CAGG	2	8	639260	639267	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_002936	TACC	2	8	640412	640419	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_002936	TGGA	2	8	640432	640439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002936	CCAG	2	8	641124	641131	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_002936	CGGG	2	8	646546	646553	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_002936	AACA	2	8	653977	653984	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_002936	TTTC	2	8	657862	657869	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_002936	GCAA	2	8	666548	666555	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.