MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae NCTC 13129 chromosome

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002935	TAATCC	2	12	12958	12969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002935	GGGGAT	2	12	20167	20178	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002935	CGCAGG	2	12	62436	62447	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_002935	AACAGG	2	12	121055	121066	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_002935	CACTTC	2	12	151860	151871	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_002935	ACACCG	2	12	166642	166653	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_002935	GCAGAA	2	12	167695	167706	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_002935	AAAACA	2	12	219088	219099	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_002935	ACCTAT	2	12	262055	262066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_002935	GCGTTG	2	12	346250	346261	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_002935	CGGCCA	2	12	347934	347945	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_002935	GGGTGT	2	12	348229	348240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002935	TTATGG	2	12	367012	367023	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002935	AAGCGC	2	12	422480	422491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_002935	CTTCTG	2	12	424070	424081	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_002935	TGTTCA	2	12	424547	424558	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_002935	ACAAGG	2	12	448063	448074	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_002935	CGCTAT	2	12	497041	497052	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_002935	GCACCT	2	12	516092	516103	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_002935	GGGGCA	2	12	600454	600465	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_002935	TAAGCG	2	12	627157	627168	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_002935	AACAAA	2	12	710946	710957	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_002935	TTGTGG	2	12	712395	712406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002935	GTTTGG	2	12	714983	714994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002935	CAAGCG	2	12	737156	737167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_002935	AGCGAA	2	12	745946	745957	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_002935	GCGTAG	2	12	748659	748670	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_002935	TGGGTG	2	12	748852	748863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002935	CTTCCG	2	12	819189	819200	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_002935	ATGTGG	2	12	993477	993488	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002935	ATGGAT	2	12	1125576	1125587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002935	AGCGAA	2	12	1172906	1172917	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_002935	GACAGT	2	12	1203384	1203395	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_002935	TTGAGG	2	12	1207860	1207871	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002935	AAAAAC	2	12	1259750	1259761	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_002935	TCGCCC	2	12	1452407	1452418	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_002935	TCAATG	2	12	1453499	1453510	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_002935	CTGCAT	2	12	1495857	1495868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_002935	TGCAGC	2	12	1502643	1502654	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_002935	GACGGT	2	12	1553788	1553799	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_002935	AAACCA	2	12	1693795	1693806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_002935	GCTGTG	2	12	1800097	1800108	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_002935	CCCCCT	2	12	1869206	1869217	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
44	NC_002935	CGCAGA	2	12	1869341	1869352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002935	CACACC	2	12	1931226	1931237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_002935	TTCGCT	2	12	1933960	1933971	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_002935	TAACCC	2	12	1950079	1950090	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_002935	AACAAG	2	12	1982271	1982282	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_002935	AAGGAT	2	12	2008998	2009009	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002935	ACATTT	2	12	2071714	2071725	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_002935	GTTCGC	2	12	2135130	2135141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_002935	GCCTAC	2	12	2184595	2184606	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002935	TTCGCT	2	12	2187314	2187325	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_002935	GGGTTT	2	12	2209428	2209439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002935	GTCATC	2	12	2263931	2263942	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_002935	CAGCAA	2	12	2264986	2264997	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_002935	CTCAAA	2	12	2265422	2265433	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_002935	AAACCA	2	12	2278242	2278253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_002935	AAAGGA	2	12	2289462	2289473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002935	CAACAC	2	12	2310864	2310875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_002935	GCCTAC	2	12	2369433	2369444	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002935	TTCGCT	2	12	2372147	2372158	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_002935	ATTGTT	2	12	2381060	2381071	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.