MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae NCTC 13129 chromosome

Total Repeats: 1243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002935	CGGTG	2	10	2363	2372	0 %	20 %	60 %	20 %	161598680
2	NC_002935	CCACC	2	10	6221	6230	20 %	0 %	0 %	80 %	38232647
3	NC_002935	GCCTA	2	10	8484	8493	20 %	20 %	20 %	40 %	38232650
4	NC_002935	CGAGT	2	10	14093	14102	20 %	20 %	40 %	20 %	38232654
5	NC_002935	CAGGG	2	10	16562	16571	20 %	0 %	60 %	20 %	38232656
6	NC_002935	GATTC	2	10	23147	23156	20 %	40 %	20 %	20 %	38232664
7	NC_002935	TGCGC	2	10	23461	23470	0 %	20 %	40 %	40 %	38232665
8	NC_002935	AGCGC	2	10	30242	30251	20 %	0 %	40 %	40 %	38232673
9	NC_002935	TGGGG	2	10	32226	32235	0 %	20 %	80 %	0 %	38232676
10	NC_002935	CACCT	2	10	33037	33046	20 %	20 %	0 %	60 %	38232676
11	NC_002935	AATTG	2	10	34741	34750	40 %	40 %	20 %	0 %	38232678
12	NC_002935	AGAAA	2	10	37342	37351	80 %	0 %	20 %	0 %	38232678
13	NC_002935	CATCA	2	10	37810	37819	40 %	20 %	0 %	40 %	38232679
14	NC_002935	CGGCA	2	10	38007	38016	20 %	0 %	40 %	40 %	38232679
15	NC_002935	GGTGT	2	10	38657	38666	0 %	40 %	60 %	0 %	38232680
16	NC_002935	ATTCC	2	10	39513	39522	20 %	40 %	0 %	40 %	38232682
17	NC_002935	GTGCT	2	10	43697	43706	0 %	40 %	40 %	20 %	38232689
18	NC_002935	GTTGC	2	10	44381	44390	0 %	40 %	40 %	20 %	38232689
19	NC_002935	GGGTT	2	10	44445	44454	0 %	40 %	60 %	0 %	38232689
20	NC_002935	TGGCG	2	10	46175	46184	0 %	20 %	60 %	20 %	38232690
21	NC_002935	GCGCA	2	10	46438	46447	20 %	0 %	40 %	40 %	38232690
22	NC_002935	CGCAG	2	10	48955	48964	20 %	0 %	40 %	40 %	38232692
23	NC_002935	GCCAC	2	10	49114	49123	20 %	0 %	20 %	60 %	38232692
24	NC_002935	TGAGG	2	10	51404	51413	20 %	20 %	60 %	0 %	38232693
25	NC_002935	TACGA	2	10	52005	52014	40 %	20 %	20 %	20 %	38232695
26	NC_002935	ACGGC	2	10	54013	54022	20 %	0 %	40 %	40 %	38232696
27	NC_002935	CACCG	2	10	54449	54458	20 %	0 %	20 %	60 %	38232696
28	NC_002935	GACGG	2	10	55253	55262	20 %	0 %	60 %	20 %	38232696
29	NC_002935	CGGGG	2	10	55997	56006	0 %	0 %	80 %	20 %	38232696
30	NC_002935	CACGC	2	10	57688	57697	20 %	0 %	20 %	60 %	38232699
31	NC_002935	GGTGG	2	10	57977	57986	0 %	20 %	80 %	0 %	38232699
32	NC_002935	GACGG	2	10	58871	58880	20 %	0 %	60 %	20 %	38232700
33	NC_002935	TGGCC	2	10	58909	58918	0 %	20 %	40 %	40 %	38232700
34	NC_002935	TGGCA	2	10	59766	59775	20 %	20 %	40 %	20 %	38232701
35	NC_002935	GATGT	2	10	60150	60159	20 %	40 %	40 %	0 %	38232701
36	NC_002935	CCCAT	2	10	60721	60730	20 %	20 %	0 %	60 %	38232701
37	NC_002935	TCGCT	2	10	60900	60909	0 %	40 %	20 %	40 %	38232701
38	NC_002935	GCTGG	2	10	65017	65026	0 %	20 %	60 %	20 %	38232707
39	NC_002935	TCGTG	2	10	67733	67742	0 %	40 %	40 %	20 %	38232710
40	NC_002935	GCTGA	2	10	68049	68058	20 %	20 %	40 %	20 %	38232710
41	NC_002935	AACTA	2	10	70431	70440	60 %	20 %	0 %	20 %	38232713
42	NC_002935	TCGTG	2	10	70722	70731	0 %	40 %	40 %	20 %	38232714
43	NC_002935	GACTA	2	10	72238	72247	40 %	20 %	20 %	20 %	38232717
44	NC_002935	TTTGA	2	10	72343	72352	20 %	60 %	20 %	0 %	38232717
45	NC_002935	TCACC	2	10	75598	75607	20 %	20 %	0 %	60 %	38232720
46	NC_002935	AGGAG	2	10	79061	79070	40 %	0 %	60 %	0 %	38232725
47	NC_002935	ACCAA	2	10	79074	79083	60 %	0 %	0 %	40 %	38232725
48	NC_002935	CGGTG	2	10	80278	80287	0 %	20 %	60 %	20 %	38232727
49	NC_002935	GACTG	2	10	82898	82907	20 %	20 %	40 %	20 %	38232731
50	NC_002935	GCGCT	2	10	89464	89473	0 %	20 %	40 %	40 %	38232738
51	NC_002935	CGTTC	2	10	90215	90224	0 %	40 %	20 %	40 %	38232738
52	NC_002935	CCAAG	2	10	92150	92159	40 %	0 %	20 %	40 %	38232740
53	NC_002935	CTCAA	2	10	94506	94515	40 %	20 %	0 %	40 %	38232743
54	NC_002935	GCCCA	2	10	94707	94716	20 %	0 %	20 %	60 %	38232743
55	NC_002935	GAGCT	2	10	98598	98607	20 %	20 %	40 %	20 %	38232748
56	NC_002935	CATGA	2	10	100133	100142	40 %	20 %	20 %	20 %	38232748
57	NC_002935	GGCCA	2	10	107226	107235	20 %	0 %	40 %	40 %	38232754
58	NC_002935	TCCAC	2	10	107396	107405	20 %	20 %	0 %	60 %	38232755
59	NC_002935	TCCGC	2	10	110001	110010	0 %	20 %	20 %	60 %	38232758
60	NC_002935	GTGGG	2	10	113452	113461	0 %	20 %	80 %	0 %	38232761
61	NC_002935	GGCAC	2	10	113813	113822	20 %	0 %	40 %	40 %	38232761
62	NC_002935	ACACC	2	10	115524	115533	40 %	0 %	0 %	60 %	38232764
63	NC_002935	GAGCG	2	10	116610	116619	20 %	0 %	60 %	20 %	38232765
64	NC_002935	GAAAC	2	10	117102	117111	60 %	0 %	20 %	20 %	38232767
65	NC_002935	TGACC	2	10	121763	121772	20 %	20 %	20 %	40 %	38232775
66	NC_002935	CTGGG	2	10	121815	121824	0 %	20 %	60 %	20 %	38232775
67	NC_002935	GGCGG	2	10	123443	123452	0 %	0 %	80 %	20 %	38232777
68	NC_002935	CCACG	2	10	126426	126435	20 %	0 %	20 %	60 %	38232779
69	NC_002935	TGGGA	2	10	127532	127541	20 %	20 %	60 %	0 %	38232781
70	NC_002935	CCAGT	2	10	130090	130099	20 %	20 %	20 %	40 %	38232784
71	NC_002935	TGCCT	2	10	130318	130327	0 %	40 %	20 %	40 %	38232784
72	NC_002935	ACCAG	2	10	132381	132390	40 %	0 %	20 %	40 %	38232784
73	NC_002935	AGCAC	2	10	134029	134038	40 %	0 %	20 %	40 %	38232785
74	NC_002935	CCTGG	2	10	135531	135540	0 %	20 %	40 %	40 %	38232786
75	NC_002935	GCTGT	2	10	139218	139227	0 %	40 %	40 %	20 %	38232791
76	NC_002935	TCTGG	2	10	139290	139299	0 %	40 %	40 %	20 %	38232791
77	NC_002935	ATGCG	2	10	139848	139857	20 %	20 %	40 %	20 %	38232792
78	NC_002935	GTCGC	2	10	140586	140595	0 %	20 %	40 %	40 %	38232793
79	NC_002935	GATGC	2	10	140932	140941	20 %	20 %	40 %	20 %	38232793
80	NC_002935	TGGTC	2	10	141896	141905	0 %	40 %	40 %	20 %	38232794
81	NC_002935	GGGTG	2	10	142998	143007	0 %	20 %	80 %	0 %	38232795
82	NC_002935	TTTGG	2	10	143387	143396	0 %	60 %	40 %	0 %	38232795
83	NC_002935	GTGAT	2	10	143528	143537	20 %	40 %	40 %	0 %	38232796
84	NC_002935	GTTCG	2	10	148582	148591	0 %	40 %	40 %	20 %	38232801
85	NC_002935	GCGTG	2	10	149403	149412	0 %	20 %	60 %	20 %	38232802
86	NC_002935	CATCG	2	10	151257	151266	20 %	20 %	20 %	40 %	38232803
87	NC_002935	GATTC	2	10	153263	153272	20 %	40 %	20 %	20 %	38232804
88	NC_002935	TTTTG	2	10	156264	156273	0 %	80 %	20 %	0 %	38232807
89	NC_002935	CGTTT	2	10	156765	156774	0 %	60 %	20 %	20 %	38232807
90	NC_002935	TCGGA	2	10	157290	157299	20 %	20 %	40 %	20 %	38232808
91	NC_002935	GCCAT	2	10	158519	158528	20 %	20 %	20 %	40 %	38232809
92	NC_002935	TTTGC	2	10	159174	159183	0 %	60 %	20 %	20 %	38232811
93	NC_002935	GAACA	2	10	163004	163013	60 %	0 %	20 %	20 %	38232820
94	NC_002935	CATGG	2	10	164150	164159	20 %	20 %	40 %	20 %	38232824
95	NC_002935	GGGAC	3	15	165258	165272	20 %	0 %	60 %	20 %	38232824
96	NC_002935	CGCAG	2	10	170818	170827	20 %	0 %	40 %	40 %	38232829
97	NC_002935	CCACA	2	10	172616	172625	40 %	0 %	0 %	60 %	38232831
98	NC_002935	ACGAA	2	10	173251	173260	60 %	0 %	20 %	20 %	38232833
99	NC_002935	AACGA	2	10	173881	173890	60 %	0 %	20 %	20 %	38232835
100	NC_002935	CAATG	2	10	173987	173996	40 %	20 %	20 %	20 %	38232835
101	NC_002935	GCGAT	2	10	175903	175912	20 %	20 %	40 %	20 %	38232838
102	NC_002935	GATGC	2	10	176349	176358	20 %	20 %	40 %	20 %	38232838
103	NC_002935	TTCCT	2	10	177064	177073	0 %	60 %	0 %	40 %	38232838
104	NC_002935	CGCTG	2	10	177194	177203	0 %	20 %	40 %	40 %	38232838
105	NC_002935	GCAAG	2	10	180260	180269	40 %	0 %	40 %	20 %	38232838
106	NC_002935	CAGGT	2	10	180403	180412	20 %	20 %	40 %	20 %	38232838
107	NC_002935	CCACG	2	10	181702	181711	20 %	0 %	20 %	60 %	38232839
108	NC_002935	TTCCC	2	10	185250	185259	0 %	40 %	0 %	60 %	38232842
109	NC_002935	CAAGC	2	10	186314	186323	40 %	0 %	20 %	40 %	38232844
110	NC_002935	AAACC	2	10	186725	186734	60 %	0 %	0 %	40 %	38232844
111	NC_002935	CACAC	2	10	186861	186870	40 %	0 %	0 %	60 %	38232844
112	NC_002935	ACGGC	2	10	186951	186960	20 %	0 %	40 %	40 %	38232844
113	NC_002935	CGGAA	2	10	189407	189416	40 %	0 %	40 %	20 %	38232848
114	NC_002935	CCTTC	2	10	189464	189473	0 %	40 %	0 %	60 %	38232848
115	NC_002935	AAAAT	2	10	189733	189742	80 %	20 %	0 %	0 %	38232848
116	NC_002935	CAATT	2	10	193013	193022	40 %	40 %	0 %	20 %	38232852
117	NC_002935	GGTGG	2	10	193036	193045	0 %	20 %	80 %	0 %	38232852
118	NC_002935	AGTGC	2	10	193104	193113	20 %	20 %	40 %	20 %	38232852
119	NC_002935	TGCGG	2	10	193199	193208	0 %	20 %	60 %	20 %	38232852
120	NC_002935	ACTCC	2	10	193405	193414	20 %	20 %	0 %	60 %	38232852
121	NC_002935	TGGGG	2	10	193563	193572	0 %	20 %	80 %	0 %	38232852
122	NC_002935	GCGGG	2	10	195383	195392	0 %	0 %	80 %	20 %	38232854
123	NC_002935	TGCCC	2	10	197487	197496	0 %	20 %	20 %	60 %	38232857
124	NC_002935	GGCGG	2	10	198276	198285	0 %	0 %	80 %	20 %	38232857
125	NC_002935	CTGGG	2	10	204867	204876	0 %	20 %	60 %	20 %	38232862
126	NC_002935	AGCTG	2	10	207950	207959	20 %	20 %	40 %	20 %	38232867
127	NC_002935	AATTA	2	10	210990	210999	60 %	40 %	0 %	0 %	38232871
128	NC_002935	ATTCC	2	10	212609	212618	20 %	40 %	0 %	40 %	38232873
129	NC_002935	TGCGG	2	10	212722	212731	0 %	20 %	60 %	20 %	38232873
130	NC_002935	GCGCC	2	10	216548	216557	0 %	0 %	40 %	60 %	38232875
131	NC_002935	AGCCA	2	10	222764	222773	40 %	0 %	20 %	40 %	38232882
132	NC_002935	GCAGA	2	10	223856	223865	40 %	0 %	40 %	20 %	38232883
133	NC_002935	TTGCC	2	10	226713	226722	0 %	40 %	20 %	40 %	38232887
134	NC_002935	GTTGC	2	10	227130	227139	0 %	40 %	40 %	20 %	38232887
135	NC_002935	CCGCC	2	10	228388	228397	0 %	0 %	20 %	80 %	38232888
136	NC_002935	AGAAA	2	10	232831	232840	80 %	0 %	20 %	0 %	38232891
137	NC_002935	ACCCC	2	10	237503	237512	20 %	0 %	0 %	80 %	38232895
138	NC_002935	GGTGC	2	10	238105	238114	0 %	20 %	60 %	20 %	38232895
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150	NC_002935	AAACC	2	10	262861	262870	60 %	0 %	0 %	40 %	38232915
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155	NC_002935	GCCGA	2	10	272961	272970	20 %	0 %	40 %	40 %	38232926
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177	NC_002935	ACTGA	2	10	318688	318697	40 %	20 %	20 %	20 %	38232973
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265	NC_002935	AATGC	2	10	489251	489260	40 %	20 %	20 %	20 %	38233129
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