MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 1520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002932	GAAGA	2	10	3314	3323	60 %	0 %	40 %	0 %	21672844
2	NC_002932	CCGGC	2	10	7205	7214	0 %	0 %	40 %	60 %	21672849
3	NC_002932	TTGTC	2	10	9086	9095	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_002932	CGGGC	2	10	9892	9901	0 %	0 %	60 %	40 %	21672852
5	NC_002932	GGCCG	2	10	13545	13554	0 %	0 %	60 %	40 %	21672856
6	NC_002932	ATCTG	2	10	15181	15190	20 %	40 %	20 %	20 %	21672857
7	NC_002932	CGCGG	2	10	15816	15825	0 %	0 %	60 %	40 %	21672858
8	NC_002932	CCGGG	2	10	21878	21887	0 %	0 %	60 %	40 %	21672867
9	NC_002932	GCGCC	2	10	24253	24262	0 %	0 %	40 %	60 %	21672870
10	NC_002932	GCGTC	2	10	24619	24628	0 %	20 %	40 %	40 %	21672870
11	NC_002932	GATCG	2	10	27657	27666	20 %	20 %	40 %	20 %	21672872
12	NC_002932	GGCCA	2	10	29588	29597	20 %	0 %	40 %	40 %	21672874
13	NC_002932	TTCGA	2	10	31625	31634	20 %	40 %	20 %	20 %	21672876
14	NC_002932	AGCTC	2	10	32082	32091	20 %	20 %	20 %	40 %	21672876
15	NC_002932	ACGAG	2	10	32109	32118	40 %	0 %	40 %	20 %	21672876
16	NC_002932	GGATC	2	10	33545	33554	20 %	20 %	40 %	20 %	21672877
17	NC_002932	TCATT	2	10	36797	36806	20 %	60 %	0 %	20 %	21672880
18	NC_002932	GTGGC	2	10	39021	39030	0 %	20 %	60 %	20 %	21672881
19	NC_002932	GAGTC	2	10	40340	40349	20 %	20 %	40 %	20 %	21672882
20	NC_002932	ATCCT	2	10	40980	40989	20 %	40 %	0 %	40 %	21672883
21	NC_002932	GCTTG	2	10	44001	44010	0 %	40 %	40 %	20 %	21672887
22	NC_002932	TTGTT	2	10	44366	44375	0 %	80 %	20 %	0 %	21672887
23	NC_002932	CCGTC	2	10	47937	47946	0 %	20 %	20 %	60 %	21672890
24	NC_002932	TGCCG	2	10	48602	48611	0 %	20 %	40 %	40 %	21672891
25	NC_002932	CACGG	2	10	48620	48629	20 %	0 %	40 %	40 %	21672891
26	NC_002932	CGCTC	2	10	49986	49995	0 %	20 %	20 %	60 %	21672892
27	NC_002932	GAAAA	2	10	52192	52201	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002932	GGCTG	2	10	56562	56571	0 %	20 %	60 %	20 %	21672896
29	NC_002932	CGCGC	2	10	58286	58295	0 %	0 %	40 %	60 %	21672897
30	NC_002932	GGCGC	2	10	63343	63352	0 %	0 %	60 %	40 %	21672904
31	NC_002932	CGGTC	2	10	64598	64607	0 %	20 %	40 %	40 %	21672905
32	NC_002932	GCTTT	2	10	64800	64809	0 %	60 %	20 %	20 %	21672905
33	NC_002932	GCCTG	2	10	64817	64826	0 %	20 %	40 %	40 %	21672905
34	NC_002932	CGGCA	2	10	65422	65431	20 %	0 %	40 %	40 %	21672905
35	NC_002932	GGTCA	2	10	70211	70220	20 %	20 %	40 %	20 %	21672912
36	NC_002932	TGCGA	2	10	70336	70345	20 %	20 %	40 %	20 %	21672912
37	NC_002932	GCCCA	2	10	70507	70516	20 %	0 %	20 %	60 %	21672912
38	NC_002932	CGTTT	2	10	72995	73004	0 %	60 %	20 %	20 %	21672916
39	NC_002932	TGCAC	2	10	73868	73877	20 %	20 %	20 %	40 %	21672918
40	NC_002932	CGGCG	2	10	74375	74384	0 %	0 %	60 %	40 %	21672918
41	NC_002932	ACTTC	2	10	76361	76370	20 %	40 %	0 %	40 %	21672920
42	NC_002932	AGGTG	2	10	77006	77015	20 %	20 %	60 %	0 %	21672921
43	NC_002932	GTTTA	2	10	77187	77196	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002932	CCGGG	2	10	77669	77678	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_002932	TTCAG	2	10	77735	77744	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_002932	AGGAG	2	10	79775	79784	40 %	0 %	60 %	0 %	21672925
47	NC_002932	CCACA	2	10	80544	80553	40 %	0 %	0 %	60 %	21672926
48	NC_002932	AAGGC	2	10	83613	83622	40 %	0 %	40 %	20 %	21672929
49	NC_002932	AGCAA	2	10	86183	86192	60 %	0 %	20 %	20 %	21672931
50	NC_002932	ACGCC	2	10	86322	86331	20 %	0 %	20 %	60 %	21672932
51	NC_002932	GCGGG	2	10	86939	86948	0 %	0 %	80 %	20 %	21672933
52	NC_002932	ACCGT	2	10	89003	89012	20 %	20 %	20 %	40 %	21672935
53	NC_002932	GCGCC	2	10	89241	89250	0 %	0 %	40 %	60 %	21672935
54	NC_002932	GCCCC	2	10	92870	92879	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
55	NC_002932	TCGGT	2	10	93475	93484	0 %	40 %	40 %	20 %	21672940
56	NC_002932	CGCGC	2	10	94634	94643	0 %	0 %	40 %	60 %	21672941
57	NC_002932	GCCGC	2	10	96075	96084	0 %	0 %	40 %	60 %	21672943
58	NC_002932	CGGCG	2	10	96254	96263	0 %	0 %	60 %	40 %	21672943
59	NC_002932	GCTTG	2	10	96557	96566	0 %	40 %	40 %	20 %	21672943
60	NC_002932	GCCGC	2	10	98558	98567	0 %	0 %	40 %	60 %	21672945
61	NC_002932	CGAGC	2	10	100179	100188	20 %	0 %	40 %	40 %	21672947
62	NC_002932	CGCGC	2	10	103148	103157	0 %	0 %	40 %	60 %	21672949
63	NC_002932	CGGGG	2	10	104122	104131	0 %	0 %	80 %	20 %	21672949
64	NC_002932	GGTTT	2	10	107070	107079	0 %	60 %	40 %	0 %	21672953
65	NC_002932	CGCGG	2	10	108739	108748	0 %	0 %	60 %	40 %	21672955
66	NC_002932	CCGAA	2	10	109419	109428	40 %	0 %	20 %	40 %	21672955
67	NC_002932	GCGGA	2	10	110171	110180	20 %	0 %	60 %	20 %	21672955
68	NC_002932	CCTGC	2	10	115334	115343	0 %	20 %	20 %	60 %	21672962
69	NC_002932	TCAGG	2	10	120743	120752	20 %	20 %	40 %	20 %	21672967
70	NC_002932	TTTTC	2	10	121812	121821	0 %	80 %	0 %	20 %	21672968
71	NC_002932	CTTCG	2	10	122530	122539	0 %	40 %	20 %	40 %	21672968
72	NC_002932	GGTGC	2	10	124830	124839	0 %	20 %	60 %	20 %	21672971
73	NC_002932	TTGGT	2	10	127226	127235	0 %	60 %	40 %	0 %	21672972
74	NC_002932	TCGCG	2	10	128883	128892	0 %	20 %	40 %	40 %	21672974
75	NC_002932	GAAAA	2	10	129956	129965	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002932	TTTTC	2	10	129993	130002	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_002932	AGAGC	2	10	131291	131300	40 %	0 %	40 %	20 %	21672977
78	NC_002932	GAACG	2	10	132007	132016	40 %	0 %	40 %	20 %	21672978
79	NC_002932	CAGAA	2	10	132110	132119	60 %	0 %	20 %	20 %	21672978
80	NC_002932	CGTTC	2	10	132670	132679	0 %	40 %	20 %	40 %	21672978
81	NC_002932	GGCGA	2	10	132712	132721	20 %	0 %	60 %	20 %	21672978
82	NC_002932	TTCGC	2	10	133140	133149	0 %	40 %	20 %	40 %	21672979
83	NC_002932	TGTTT	2	10	133967	133976	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002932	GCGCG	2	10	136791	136800	0 %	0 %	60 %	40 %	21672982
85	NC_002932	CTTCC	2	10	137662	137671	0 %	40 %	0 %	60 %	21672983
86	NC_002932	ACCTT	2	10	137729	137738	20 %	40 %	0 %	40 %	21672983
87	NC_002932	TCGTG	2	10	140536	140545	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_002932	TTGTA	2	10	141079	141088	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002932	CCGTA	2	10	143112	143121	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_002932	GTCAT	2	10	147791	147800	20 %	40 %	20 %	20 %	21672986
91	NC_002932	GAAAA	2	10	147841	147850	80 %	0 %	20 %	0 %	21672986
92	NC_002932	ATGGC	2	10	147953	147962	20 %	20 %	40 %	20 %	21672986
93	NC_002932	TCGCT	2	10	151453	151462	0 %	40 %	20 %	40 %	21672989
94	NC_002932	CTGAA	2	10	156968	156977	40 %	20 %	20 %	20 %	21672996
95	NC_002932	CTGAT	2	10	157274	157283	20 %	40 %	20 %	20 %	21672996
96	NC_002932	GACCA	2	10	157351	157360	40 %	0 %	20 %	40 %	21672996
97	NC_002932	GGTCA	2	10	157594	157603	20 %	20 %	40 %	20 %	21672996
98	NC_002932	TCGAG	2	10	158330	158339	20 %	20 %	40 %	20 %	21672996
99	NC_002932	TGCGC	2	10	158403	158412	0 %	20 %	40 %	40 %	21672996
100	NC_002932	GGCGA	2	10	160422	160431	20 %	0 %	60 %	20 %	21672997
101	NC_002932	CGAAC	2	10	163100	163109	40 %	0 %	20 %	40 %	21672997
102	NC_002932	GATCA	2	10	166472	166481	40 %	20 %	20 %	20 %	21672999
103	NC_002932	TGATC	2	10	167067	167076	20 %	40 %	20 %	20 %	21673000
104	NC_002932	TGACT	2	10	167340	167349	20 %	40 %	20 %	20 %	21673000
105	NC_002932	GCAGA	2	10	167607	167616	40 %	0 %	40 %	20 %	21673001
106	NC_002932	AATGA	2	10	168008	168017	60 %	20 %	20 %	0 %	21673002
107	NC_002932	TGTTC	2	10	169025	169034	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_002932	TCCAG	2	10	171245	171254	20 %	20 %	20 %	40 %	21673004
109	NC_002932	GCGCC	2	10	173763	173772	0 %	0 %	40 %	60 %	21673007
110	NC_002932	CGCTG	2	10	174570	174579	0 %	20 %	40 %	40 %	21673007
111	NC_002932	GACGC	2	10	175688	175697	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_002932	ACCCG	2	10	175864	175873	20 %	0 %	20 %	60 %	21673008
113	NC_002932	CCCAT	2	10	176225	176234	20 %	20 %	0 %	60 %	21673009
114	NC_002932	TTTTC	2	10	176519	176528	0 %	80 %	0 %	20 %	21673010
115	NC_002932	ACAGG	2	10	178969	178978	40 %	0 %	40 %	20 %	21673013
116	NC_002932	TTGGC	2	10	180562	180571	0 %	40 %	40 %	20 %	21673014
117	NC_002932	TTTTG	2	10	181244	181253	0 %	80 %	20 %	0 %	21673014
118	NC_002932	CAACA	2	10	182841	182850	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_002932	CGGCA	2	10	184738	184747	20 %	0 %	40 %	40 %	21673017
120	NC_002932	TCATT	2	10	186851	186860	20 %	60 %	0 %	20 %	21673018
121	NC_002932	GGCGA	2	10	187109	187118	20 %	0 %	60 %	20 %	21673018
122	NC_002932	AGCGC	2	10	189553	189562	20 %	0 %	40 %	40 %	21673021
123	NC_002932	GGCTC	2	10	189814	189823	0 %	20 %	40 %	40 %	21673021
124	NC_002932	CGCCA	2	10	190058	190067	20 %	0 %	20 %	60 %	21673021
125	NC_002932	GCGCC	2	10	190900	190909	0 %	0 %	40 %	60 %	21673021
126	NC_002932	GCGCC	2	10	193316	193325	0 %	0 %	40 %	60 %	21673024
127	NC_002932	CGGGG	2	10	193476	193485	0 %	0 %	80 %	20 %	21673024
128	NC_002932	CAGCC	2	10	193784	193793	20 %	0 %	20 %	60 %	21673024
129	NC_002932	AGCGA	2	10	197930	197939	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_002932	ATTCG	2	10	198986	198995	20 %	40 %	20 %	20 %	21673031
131	NC_002932	CGTGA	2	10	200276	200285	20 %	20 %	40 %	20 %	21673032
132	NC_002932	TGCTT	2	10	202472	202481	0 %	60 %	20 %	20 %	21673033
133	NC_002932	TTTCA	2	10	205999	206008	20 %	60 %	0 %	20 %	21673036
134	NC_002932	CCGCG	2	10	206018	206027	0 %	0 %	40 %	60 %	21673036
135	NC_002932	ATTGC	2	10	207104	207113	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_002932	GTTTT	2	10	207664	207673	0 %	80 %	20 %	0 %	21673037
137	NC_002932	GCGCC	2	10	209149	209158	0 %	0 %	40 %	60 %	21673038
138	NC_002932	TCAAA	2	10	209244	209253	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_002932	CCGCG	2	10	209622	209631	0 %	0 %	40 %	60 %	21673039
140	NC_002932	CGGCC	2	10	209722	209731	0 %	0 %	40 %	60 %	21673039
141	NC_002932	CGGCG	2	10	210385	210394	0 %	0 %	60 %	40 %	21673039
142	NC_002932	CCGCG	2	10	212244	212253	0 %	0 %	40 %	60 %	21673041
143	NC_002932	GATCA	2	10	212761	212770	40 %	20 %	20 %	20 %	21673042
144	NC_002932	GCTCC	2	10	212925	212934	0 %	20 %	20 %	60 %	21673042
145	NC_002932	CATGA	2	10	213041	213050	40 %	20 %	20 %	20 %	21673042
146	NC_002932	GCGAG	2	10	213123	213132	20 %	0 %	60 %	20 %	21673042
147	NC_002932	GCCGA	2	10	213161	213170	20 %	0 %	40 %	40 %	21673042
148	NC_002932	GCAGG	2	10	215015	215024	20 %	0 %	60 %	20 %	21673044
149	NC_002932	GGCGA	2	10	215639	215648	20 %	0 %	60 %	20 %	21673044
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151	NC_002932	TCGAG	2	10	217184	217193	20 %	20 %	40 %	20 %	21673045
152	NC_002932	GCTGA	2	10	218492	218501	20 %	20 %	40 %	20 %	21673046
153	NC_002932	GATCG	2	10	219545	219554	20 %	20 %	40 %	20 %	21673046
154	NC_002932	CTTTT	2	10	219679	219688	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_002932	GCGCC	2	10	220880	220889	0 %	0 %	40 %	60 %	21673048
156	NC_002932	CGGCG	2	10	221023	221032	0 %	0 %	60 %	40 %	21673048
157	NC_002932	GGCGA	2	10	221281	221290	20 %	0 %	60 %	20 %	21673048
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160	NC_002932	CGGTT	2	10	224916	224925	0 %	40 %	40 %	20 %	21673049
161	NC_002932	GTTTT	2	10	229519	229528	0 %	80 %	20 %	0 %	21673054
162	NC_002932	GCTTT	2	10	231777	231786	0 %	60 %	20 %	20 %	21673056
163	NC_002932	TGTTT	2	10	232175	232184	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_002932	GTGGA	2	10	233023	233032	20 %	20 %	60 %	0 %	21673057
165	NC_002932	GCGCC	2	10	235493	235502	0 %	0 %	40 %	60 %	21673060
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169	NC_002932	AGGAG	2	10	243716	243725	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
170	NC_002932	GCCGC	2	10	244288	244297	0 %	0 %	40 %	60 %	21673069
171	NC_002932	GTTTT	2	10	247149	247158	0 %	80 %	20 %	0 %	21673073
172	NC_002932	CATGC	2	10	248899	248908	20 %	20 %	20 %	40 %	21673075
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181	NC_002932	TCCAT	2	10	272044	272053	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
182	NC_002932	GCTGT	2	10	272320	272329	0 %	40 %	40 %	20 %	21673101
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187	NC_002932	TTTCG	2	10	276660	276669	0 %	60 %	20 %	20 %	21673104
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192	NC_002932	GCTCG	2	10	285209	285218	0 %	20 %	40 %	40 %	21673112
193	NC_002932	TGGCG	2	10	285464	285473	0 %	20 %	60 %	20 %	21673112
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242	NC_002932	TTCGA	2	10	375769	375778	20 %	40 %	20 %	20 %	21673201
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267	NC_002932	TCGAC	2	10	401964	401973	20 %	20 %	20 %	40 %	21673226
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274	NC_002932	AGTTG	2	10	409264	409273	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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390	NC_002932	CCAAG	2	10	578454	578463	40 %	0 %	20 %	40 %	21673405
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399	NC_002932	AGGTT	2	10	588979	588988	20 %	40 %	40 %	0 %	21673416
400	NC_002932	TGAAT	2	10	589362	589371	40 %	40 %	20 %	0 %	21673416
401	NC_002932	GCAAG	2	10	594299	594308	40 %	0 %	40 %	20 %	21673427
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