MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 30114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002932	TTG	2	6	6	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672842
2	NC_002932	CTC	2	6	53	58	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672842
3	NC_002932	AAC	2	6	72	77	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672842
4	NC_002932	GCT	2	6	92	97	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672842
5	NC_002932	GGC	2	6	137	142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672842
6	NC_002932	GCT	2	6	349	354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672842
7	NC_002932	ACG	2	6	531	536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672842
8	NC_002932	TCT	2	6	538	543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672842
9	NC_002932	CAT	2	6	650	655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672842
10	NC_002932	GTG	2	6	774	779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672842
11	NC_002932	TGC	2	6	886	891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672842
12	NC_002932	GTG	2	6	963	968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672842
13	NC_002932	TCT	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672842
14	NC_002932	CTC	2	6	1431	1436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672843
15	NC_002932	TCT	2	6	1439	1444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672843
16	NC_002932	CCG	2	6	1519	1524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672843
17	NC_002932	GTT	2	6	1691	1696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672843
18	NC_002932	GAT	2	6	1710	1715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672843
19	NC_002932	AGC	2	6	1780	1785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672843
20	NC_002932	CGC	2	6	1868	1873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672843
21	NC_002932	GAT	2	6	1893	1898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672843
22	NC_002932	GAT	2	6	2016	2021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672843
23	NC_002932	TTG	2	6	2026	2031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672843
24	NC_002932	TCC	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672843
25	NC_002932	TCT	2	6	2075	2080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672843
26	NC_002932	GTC	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672843
27	NC_002932	CAT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672843
28	NC_002932	CGC	2	6	2291	2296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672843
29	NC_002932	CGG	2	6	2465	2470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672843
30	NC_002932	CTT	2	6	2855	2860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672843
31	NC_002932	CGT	2	6	3384	3389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672844
32	NC_002932	CAG	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672844
33	NC_002932	ATC	2	6	3810	3815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672845
34	NC_002932	TCT	2	6	3907	3912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672845
35	NC_002932	GCT	2	6	4070	4075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672846
36	NC_002932	CCT	2	6	4081	4086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672846
37	NC_002932	GCA	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672846
38	NC_002932	CCT	2	6	4153	4158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672846
39	NC_002932	GGC	2	6	4203	4208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672846
40	NC_002932	TGC	2	6	4303	4308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672847
41	NC_002932	GCG	2	6	4367	4372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672847
42	NC_002932	GCG	2	6	4403	4408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672847
43	NC_002932	CGG	2	6	4425	4430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672847
44	NC_002932	GGC	2	6	4435	4440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672847
45	NC_002932	CTC	2	6	4537	4542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672847
46	NC_002932	CAG	2	6	4654	4659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672847
47	NC_002932	AAG	2	6	4667	4672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672847
48	NC_002932	ACC	2	6	4715	4720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672847
49	NC_002932	GCA	2	6	4782	4787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672847
50	NC_002932	CGG	2	6	4897	4902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672847
51	NC_002932	ACT	2	6	4908	4913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672847
52	NC_002932	TGG	2	6	4966	4971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672847
53	NC_002932	GAG	2	6	5021	5026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672847
54	NC_002932	CAT	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672847
55	NC_002932	CAC	2	6	5092	5097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672847
56	NC_002932	CAG	2	6	5186	5191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672847
57	NC_002932	ACA	2	6	5235	5240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672847
58	NC_002932	ATC	4	12	5375	5386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672847
59	NC_002932	TCA	2	6	5397	5402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672847
60	NC_002932	GAA	2	6	5446	5451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672847
61	NC_002932	TGA	2	6	5472	5477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672847
62	NC_002932	GGC	2	6	5567	5572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672847
63	NC_002932	GCT	2	6	5599	5604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672847
64	NC_002932	CTC	2	6	5629	5634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672847
65	NC_002932	CAG	2	6	5777	5782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672847
66	NC_002932	ATG	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672847
67	NC_002932	ATG	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672847
68	NC_002932	CAA	2	6	5863	5868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672847
69	NC_002932	CGG	2	6	5874	5879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672847
70	NC_002932	CTA	2	6	5890	5895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672847
71	NC_002932	CAG	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672847
72	NC_002932	CCA	2	6	5943	5948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672847
73	NC_002932	CGA	2	6	5953	5958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672847
74	NC_002932	GCC	3	9	5969	5977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672847
75	NC_002932	CGC	3	9	5986	5994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672847
76	NC_002932	GAC	2	6	6119	6124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672848
77	NC_002932	CTT	3	9	6230	6238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672848
78	NC_002932	TCT	2	6	6331	6336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672848
79	NC_002932	CCT	2	6	6366	6371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672848
80	NC_002932	CTT	2	6	6415	6420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672848
81	NC_002932	GGC	2	6	6533	6538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672848
82	NC_002932	GCG	2	6	6560	6565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672848
83	NC_002932	GTG	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672848
84	NC_002932	CGG	2	6	6663	6668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672849
85	NC_002932	TCG	2	6	6782	6787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672849
86	NC_002932	TCA	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672849
87	NC_002932	GGT	2	6	6948	6953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672849
88	NC_002932	ACG	2	6	6962	6967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672849
89	NC_002932	CGA	2	6	7011	7016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672849
90	NC_002932	ATC	2	6	7096	7101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672849
91	NC_002932	GTC	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672849
92	NC_002932	CGC	2	6	7269	7274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672849
93	NC_002932	TCA	2	6	7379	7384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672849
94	NC_002932	CGG	3	9	7386	7394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672849
95	NC_002932	GCC	2	6	7444	7449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672849
96	NC_002932	GCC	2	6	7485	7490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672849
97	NC_002932	GCA	2	6	7522	7527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672849
98	NC_002932	GCC	2	6	7539	7544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672849
99	NC_002932	AAC	2	6	7609	7614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672850
100	NC_002932	CAT	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672850
101	NC_002932	ACC	2	6	7695	7700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672850
102	NC_002932	GCG	2	6	7861	7866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672850
103	NC_002932	CGG	2	6	7946	7951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672850
104	NC_002932	CAA	2	6	8009	8014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672850
105	NC_002932	CGC	2	6	8231	8236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672850
106	NC_002932	CAG	2	6	8382	8387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672850
107	NC_002932	GCT	2	6	8393	8398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672850
108	NC_002932	CAA	2	6	8399	8404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672850
109	NC_002932	CAC	2	6	8408	8413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672850
110	NC_002932	TCA	2	6	8452	8457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672850
111	NC_002932	GCG	2	6	8458	8463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672850
112	NC_002932	ATC	2	6	8565	8570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672850
113	NC_002932	CGG	2	6	8576	8581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672850
114	NC_002932	GGA	2	6	8591	8596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672850
115	NC_002932	GGT	2	6	8678	8683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672850
116	NC_002932	TCT	2	6	8743	8748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672850
117	NC_002932	AGG	2	6	8782	8787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672850
118	NC_002932	ATT	2	6	8814	8819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672850
119	NC_002932	TCA	2	6	9179	9184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672851
120	NC_002932	GGT	2	6	9230	9235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672851
121	NC_002932	TGA	2	6	9248	9253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672851
122	NC_002932	TGG	2	6	9266	9271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672851
123	NC_002932	ACG	2	6	9301	9306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672851
124	NC_002932	CGA	2	6	9329	9334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672851
125	NC_002932	GTC	2	6	9411	9416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672851
126	NC_002932	CGA	2	6	9425	9430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672851
127	NC_002932	GGC	2	6	9459	9464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672851
128	NC_002932	GAC	2	6	9570	9575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672851
129	NC_002932	CTC	2	6	9600	9605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672851
130	NC_002932	ATC	2	6	9616	9621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672851
131	NC_002932	GTG	2	6	9637	9642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672851
132	NC_002932	CGA	2	6	9665	9670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672851
133	NC_002932	GGC	2	6	9792	9797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672851
134	NC_002932	TCG	2	6	9805	9810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672851
135	NC_002932	CCT	2	6	9844	9849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672852
136	NC_002932	CCT	2	6	10016	10021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672852
137	NC_002932	TCG	2	6	10054	10059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672852
138	NC_002932	CAA	2	6	10124	10129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672852
139	NC_002932	TTC	2	6	10147	10152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672852
140	NC_002932	CGC	3	9	10157	10165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672852
141	NC_002932	TGG	2	6	10270	10275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672852
142	NC_002932	CGG	2	6	10292	10297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672852
143	NC_002932	AGA	2	6	10319	10324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672852
144	NC_002932	CGA	2	6	10403	10408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672852
145	NC_002932	GAT	2	6	10452	10457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672852
146	NC_002932	GTC	2	6	10467	10472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672852
147	NC_002932	GTC	2	6	10545	10550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672852
148	NC_002932	GAA	2	6	10593	10598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672852
149	NC_002932	CGA	2	6	10607	10612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672852
150	NC_002932	TGT	2	6	10646	10651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672852
151	NC_002932	GAT	2	6	10665	10670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672852
152	NC_002932	TGA	2	6	10691	10696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672852
153	NC_002932	CGA	2	6	10751	10756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672852
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155	NC_002932	GCA	2	6	11659	11664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672854
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159	NC_002932	GTG	2	6	12023	12028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672854
160	NC_002932	CCG	2	6	12261	12266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672854
161	NC_002932	GTC	2	6	12303	12308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672854
162	NC_002932	AAG	2	6	12416	12421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672854
163	NC_002932	GCG	2	6	12428	12433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672854
164	NC_002932	CGG	2	6	12441	12446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672854
165	NC_002932	ATG	2	6	12601	12606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672854
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167	NC_002932	CCG	2	6	12755	12760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672855
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171	NC_002932	CGT	2	6	13103	13108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672855
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257	NC_002932	CAG	2	6	20056	20061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672864
258	NC_002932	TCC	2	6	20179	20184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672864
259	NC_002932	CCA	2	6	20393	20398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672865
260	NC_002932	ACG	2	6	20418	20423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672865
261	NC_002932	CGC	2	6	20531	20536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672865
262	NC_002932	ATG	2	6	20680	20685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672865
263	NC_002932	CGG	2	6	20747	20752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672865
264	NC_002932	GTA	2	6	20841	20846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672865
265	NC_002932	CTT	2	6	20856	20861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672865
266	NC_002932	GAT	2	6	20864	20869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672865
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269	NC_002932	TGT	2	6	20984	20989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672865
270	NC_002932	CTC	2	6	21000	21005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672865
271	NC_002932	GCC	2	6	21040	21045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672865
272	NC_002932	TCA	2	6	21074	21079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672865
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275	NC_002932	GCC	2	6	21237	21242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672865
276	NC_002932	CTT	2	6	21504	21509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672866
277	NC_002932	CGG	2	6	21708	21713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672867
278	NC_002932	CGT	2	6	21870	21875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672867
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280	NC_002932	TCG	2	6	21935	21940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672867
281	NC_002932	CCG	2	6	21981	21986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672867
282	NC_002932	GCG	2	6	21998	22003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672867
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284	NC_002932	GGA	2	6	22089	22094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672867
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286	NC_002932	GGC	2	6	22205	22210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672867
287	NC_002932	CGG	2	6	22226	22231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21672867
288	NC_002932	CCG	2	6	22329	22334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21672867
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290	NC_002932	GTC	2	6	22469	22474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672868
291	NC_002932	CAT	2	6	22483	22488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672868
292	NC_002932	GCT	2	6	22519	22524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672868
293	NC_002932	GCT	2	6	22549	22554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672868
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296	NC_002932	CCT	2	6	22815	22820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672869
297	NC_002932	ACT	2	6	22823	22828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672869
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380	NC_002932	CGT	2	6	28019	28024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672872
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