MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlorobium tepidum TLS chromosome

Total Repeats: 484

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002932	TA	3	6	1147	1152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002932	GT	3	6	1271	1276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002932	AG	3	6	11500	11505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002932	TC	3	6	22769	22774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_002932	GC	3	6	25380	25385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_002932	CT	3	6	26727	26732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_002932	CT	3	6	52203	52208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_002932	CT	3	6	54156	54161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_002932	GA	3	6	64205	64210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002932	CG	3	6	64469	64474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_002932	CT	3	6	64522	64527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_002932	TG	3	6	67857	67862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002932	TG	3	6	67882	67887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002932	TA	3	6	67921	67926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002932	CA	3	6	91929	91934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_002932	CG	3	6	111968	111973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_002932	CT	3	6	114452	114457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_002932	CG	3	6	116791	116796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_002932	AT	3	6	123287	123292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002932	GT	3	6	139147	139152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002932	AG	3	6	140639	140644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002932	CA	3	6	140691	140696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_002932	AC	3	6	140858	140863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_002932	CG	3	6	140905	140910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_002932	TG	3	6	141878	141883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002932	CT	3	6	141916	141921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_002932	GT	3	6	142085	142090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002932	CT	3	6	143089	143094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_002932	TC	3	6	143277	143282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_002932	GC	3	6	143489	143494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_002932	CA	3	6	144608	144613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_002932	AG	3	6	153257	153262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002932	GA	3	6	155037	155042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002932	GA	3	6	164328	164333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002932	AG	4	8	164577	164584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002932	AG	3	6	164848	164853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002932	AT	3	6	180377	180382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002932	TA	3	6	182571	182576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002932	AG	3	6	203692	203697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002932	TG	3	6	204891	204896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002932	CA	3	6	227964	227969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_002932	CG	3	6	238330	238335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_002932	GC	3	6	238596	238601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_002932	CG	3	6	241882	241887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_002932	GC	3	6	243411	243416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_002932	GT	3	6	245073	245078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002932	AT	3	6	249768	249773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002932	CA	3	6	250456	250461	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_002932	GA	3	6	263418	263423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002932	AC	3	6	275988	275993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_002932	GC	3	6	280436	280441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_002932	AG	3	6	288424	288429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002932	TC	3	6	295651	295656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_002932	TC	4	8	301504	301511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_002932	TG	3	6	302773	302778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002932	GT	3	6	303433	303438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002932	GT	3	6	303446	303451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002932	CT	3	6	307044	307049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_002932	TG	3	6	307457	307462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002932	CT	3	6	311896	311901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_002932	CT	3	6	311969	311974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002932	AT	3	6	311997	312002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002932	CG	3	6	319274	319279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_002932	TA	4	8	319294	319301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002932	AT	3	6	330407	330412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002932	AC	3	6	330459	330464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_002932	GT	3	6	333165	333170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002932	CT	3	6	335643	335648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_002932	TA	3	6	345585	345590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002932	TC	3	6	345603	345608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_002932	AG	3	6	349004	349009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002932	TC	3	6	349357	349362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_002932	GA	3	6	355275	355280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002932	GT	3	6	366256	366261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002932	GT	3	6	366320	366325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002932	TC	3	6	379987	379992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_002932	TG	3	6	392574	392579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002932	GT	3	6	392804	392809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002932	CG	3	6	396782	396787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_002932	GA	3	6	412540	412545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002932	TG	3	6	420055	420060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002932	TC	4	8	422550	422557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002932	CT	4	8	436851	436858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_002932	CT	3	6	440068	440073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_002932	AG	3	6	443977	443982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002932	AC	3	6	446708	446713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_002932	GT	3	6	446791	446796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002932	GT	3	6	446821	446826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002932	TA	3	6	446831	446836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002932	GT	3	6	448093	448098	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002932	GT	3	6	448123	448128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002932	TA	3	6	448133	448138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002932	AG	3	6	461177	461182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002932	AC	3	6	462464	462469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_002932	GT	3	6	466142	466147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002932	CG	3	6	467116	467121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_002932	AC	3	6	467421	467426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_002932	GT	3	6	467629	467634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002932	AT	3	6	467736	467741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002932	GC	3	6	483870	483875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_002932	TC	3	6	483897	483902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_002932	GA	3	6	498004	498009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002932	CT	3	6	498062	498067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_002932	TC	4	8	501179	501186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_002932	TA	3	6	504415	504420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002932	GT	3	6	519293	519298	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002932	GA	3	6	522568	522573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002932	GC	3	6	523397	523402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_002932	AG	3	6	526473	526478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002932	TG	3	6	526643	526648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002932	GA	3	6	526773	526778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002932	AT	3	6	532270	532275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002932	AT	3	6	549685	549690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002932	AC	3	6	550236	550241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_002932	AG	4	8	558387	558394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002932	AG	3	6	558528	558533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002932	TG	3	6	569642	569647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002932	CG	3	6	577282	577287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_002932	GA	3	6	581036	581041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002932	GA	3	6	581994	581999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002932	CG	3	6	584071	584076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_002932	CG	3	6	584260	584265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_002932	TA	3	6	588896	588901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002932	CG	3	6	590772	590777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002932	AG	3	6	592485	592490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002932	GT	3	6	611539	611544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002932	AT	3	6	616392	616397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002932	GT	3	6	623043	623048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002932	AC	3	6	623437	623442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_002932	GC	3	6	627001	627006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_002932	AC	3	6	627269	627274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_002932	GT	3	6	627317	627322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002932	GA	3	6	627831	627836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002932	GT	3	6	631555	631560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002932	AG	3	6	637401	637406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002932	GA	3	6	637775	637780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002932	GA	3	6	639294	639299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002932	TG	4	8	639879	639886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002932	AT	3	6	643871	643876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002932	TG	3	6	643933	643938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002932	AT	3	6	644935	644940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002932	CT	3	6	665445	665450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_002932	GC	3	6	669665	669670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_002932	CG	3	6	670087	670092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_002932	CG	3	6	689461	689466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_002932	GA	3	6	691014	691019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002932	TC	3	6	694467	694472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_002932	GC	3	6	697524	697529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_002932	CT	3	6	701138	701143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_002932	AG	3	6	706048	706053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002932	AG	4	8	717349	717356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002932	CT	3	6	717452	717457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_002932	TC	3	6	720125	720130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.