MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 3125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002929	GGCAA	2	10	1501	1510	40 %	0 %	40 %	20 %	33591276
2	NC_002929	CTGGC	2	10	2703	2712	0 %	20 %	40 %	40 %	33591278
3	NC_002929	GGGAG	2	10	3457	3466	20 %	0 %	80 %	0 %	33591279
4	NC_002929	GCTGG	2	10	8516	8525	0 %	20 %	60 %	20 %	33591282
5	NC_002929	TCGCC	2	10	9915	9924	0 %	20 %	20 %	60 %	33591285
6	NC_002929	TACCG	2	10	10058	10067	20 %	20 %	20 %	40 %	33591285
7	NC_002929	GACCA	2	10	13225	13234	40 %	0 %	20 %	40 %	33591288
8	NC_002929	TGCCT	2	10	13748	13757	0 %	40 %	20 %	40 %	33591288
9	NC_002929	CTGGG	2	10	15067	15076	0 %	20 %	60 %	20 %	33591288
10	NC_002929	TCGCC	2	10	15844	15853	0 %	20 %	20 %	60 %	33591289
11	NC_002929	AAGGC	2	10	17101	17110	40 %	0 %	40 %	20 %	33591289
12	NC_002929	CGGCC	2	10	19406	19415	0 %	0 %	40 %	60 %	33591289
13	NC_002929	CTGGC	2	10	19852	19861	0 %	20 %	40 %	40 %	33591289
14	NC_002929	GCGCC	2	10	20818	20827	0 %	0 %	40 %	60 %	33591291
15	NC_002929	GGGCT	2	10	25385	25394	0 %	20 %	60 %	20 %	33591292
16	NC_002929	GGCGC	2	10	26926	26935	0 %	0 %	60 %	40 %	33591293
17	NC_002929	CAGGG	2	10	29916	29925	20 %	0 %	60 %	20 %	33591296
18	NC_002929	TGGAT	2	10	30274	30283	20 %	40 %	40 %	0 %	33591296
19	NC_002929	ACTCC	2	10	30437	30446	20 %	20 %	0 %	60 %	33591297
20	NC_002929	ACGGC	2	10	32546	32555	20 %	0 %	40 %	40 %	33591299
21	NC_002929	GCGCC	2	10	36289	36298	0 %	0 %	40 %	60 %	33591302
22	NC_002929	CCGCG	2	10	39131	39140	0 %	0 %	40 %	60 %	33591304
23	NC_002929	GCGCC	2	10	39410	39419	0 %	0 %	40 %	60 %	33591304
24	NC_002929	GCCGC	2	10	42829	42838	0 %	0 %	40 %	60 %	33591309
25	NC_002929	GTTTC	2	10	45215	45224	0 %	60 %	20 %	20 %	33591311
26	NC_002929	TCCTG	2	10	48156	48165	0 %	40 %	20 %	40 %	33591314
27	NC_002929	GCGCA	2	10	48340	48349	20 %	0 %	40 %	40 %	33591314
28	NC_002929	GGCGC	2	10	48789	48798	0 %	0 %	60 %	40 %	33591314
29	NC_002929	GCACG	2	10	48843	48852	20 %	0 %	40 %	40 %	33591314
30	NC_002929	CGGCG	2	10	51761	51770	0 %	0 %	60 %	40 %	33591317
31	NC_002929	GGCCG	2	10	52244	52253	0 %	0 %	60 %	40 %	33591317
32	NC_002929	CCAGC	2	10	53641	53650	20 %	0 %	20 %	60 %	33591318
33	NC_002929	GTTGC	2	10	54993	55002	0 %	40 %	40 %	20 %	33591319
34	NC_002929	ACGGC	2	10	56452	56461	20 %	0 %	40 %	40 %	33591320
35	NC_002929	TGTCC	2	10	60801	60810	0 %	40 %	20 %	40 %	33591324
36	NC_002929	GAACG	2	10	61609	61618	40 %	0 %	40 %	20 %	33591325
37	NC_002929	TTTTG	2	10	62972	62981	0 %	80 %	20 %	0 %	33591327
38	NC_002929	TTTTC	2	10	64313	64322	0 %	80 %	0 %	20 %	33591329
39	NC_002929	CCTGT	2	10	64681	64690	0 %	40 %	20 %	40 %	33591330
40	NC_002929	CATCT	2	10	65574	65583	20 %	40 %	0 %	40 %	33591331
41	NC_002929	GGCAC	2	10	66588	66597	20 %	0 %	40 %	40 %	33591331
42	NC_002929	ATGGG	2	10	67998	68007	20 %	20 %	60 %	0 %	33591332
43	NC_002929	CGATT	2	10	68204	68213	20 %	40 %	20 %	20 %	33591332
44	NC_002929	GGCGA	2	10	70376	70385	20 %	0 %	60 %	20 %	33591334
45	NC_002929	GGGGT	2	10	72024	72033	0 %	20 %	80 %	0 %	33591335
46	NC_002929	GCGCA	2	10	75128	75137	20 %	0 %	40 %	40 %	33591338
47	NC_002929	GGGCG	3	15	75162	75176	0 %	0 %	80 %	20 %	33591338
48	NC_002929	CAGCG	2	10	75363	75372	20 %	0 %	40 %	40 %	33591339
49	NC_002929	GACGG	2	10	80945	80954	20 %	0 %	60 %	20 %	33591342
50	NC_002929	GCGCG	2	10	84368	84377	0 %	0 %	60 %	40 %	33591344
51	NC_002929	CGATG	2	10	85506	85515	20 %	20 %	40 %	20 %	33591346
52	NC_002929	GGGCA	2	10	86640	86649	20 %	0 %	60 %	20 %	33591346
53	NC_002929	AGGGC	2	10	87445	87454	20 %	0 %	60 %	20 %	33591347
54	NC_002929	CTTCG	2	10	89858	89867	0 %	40 %	20 %	40 %	33591349
55	NC_002929	CAGCG	2	10	91161	91170	20 %	0 %	40 %	40 %	33591351
56	NC_002929	GGCCG	2	10	92481	92490	0 %	0 %	60 %	40 %	33591352
57	NC_002929	GGCCT	2	10	93856	93865	0 %	20 %	40 %	40 %	33591353
58	NC_002929	CAGCG	2	10	96064	96073	20 %	0 %	40 %	40 %	33591356
59	NC_002929	GCCGC	2	10	99181	99190	0 %	0 %	40 %	60 %	33591359
60	NC_002929	GCCCA	2	10	102131	102140	20 %	0 %	20 %	60 %	33591362
61	NC_002929	GCGCC	2	10	103349	103358	0 %	0 %	40 %	60 %	33591364
62	NC_002929	GCGCG	2	10	106179	106188	0 %	0 %	60 %	40 %	33591367
63	NC_002929	GGCCG	2	10	106513	106522	0 %	0 %	60 %	40 %	33591368
64	NC_002929	GGCCT	2	10	110156	110165	0 %	20 %	40 %	40 %	33591370
65	NC_002929	CGAAT	2	10	110730	110739	40 %	20 %	20 %	20 %	33591371
66	NC_002929	CGTCC	2	10	111699	111708	0 %	20 %	20 %	60 %	33591372
67	NC_002929	TCCGG	2	10	111942	111951	0 %	20 %	40 %	40 %	33591373
68	NC_002929	CGGCG	2	10	112359	112368	0 %	0 %	60 %	40 %	33591373
69	NC_002929	AGGCC	2	10	112842	112851	20 %	0 %	40 %	40 %	33591373
70	NC_002929	GCGCG	2	10	113269	113278	0 %	0 %	60 %	40 %	33591373
71	NC_002929	CATTC	2	10	113917	113926	20 %	40 %	0 %	40 %	33591374
72	NC_002929	GACCT	2	10	114222	114231	20 %	20 %	20 %	40 %	33591374
73	NC_002929	GCGCT	2	10	115260	115269	0 %	20 %	40 %	40 %	33591376
74	NC_002929	ACGCG	2	10	115380	115389	20 %	0 %	40 %	40 %	33591376
75	NC_002929	CGGCG	2	10	116667	116676	0 %	0 %	60 %	40 %	33591377
76	NC_002929	GCCAG	2	10	119102	119111	20 %	0 %	40 %	40 %	33591380
77	NC_002929	GGTGC	2	10	120426	120435	0 %	20 %	60 %	20 %	33591381
78	NC_002929	GGCGT	2	10	129465	129474	0 %	20 %	60 %	20 %	33591386
79	NC_002929	CCGCG	2	10	131524	131533	0 %	0 %	40 %	60 %	33591388
80	NC_002929	GGCCG	2	10	131926	131935	0 %	0 %	60 %	40 %	33591388
81	NC_002929	ATGCG	2	10	133249	133258	20 %	20 %	40 %	20 %	33591390
82	NC_002929	TCGGG	2	10	133339	133348	0 %	20 %	60 %	20 %	33591390
83	NC_002929	GGTGC	2	10	133784	133793	0 %	20 %	60 %	20 %	33591390
84	NC_002929	CGGCT	2	10	136893	136902	0 %	20 %	40 %	40 %	33591392
85	NC_002929	GCCGT	2	10	137338	137347	0 %	20 %	40 %	40 %	33591392
86	NC_002929	CAGCC	2	10	137761	137770	20 %	0 %	20 %	60 %	33591392
87	NC_002929	CCGCG	2	10	139148	139157	0 %	0 %	40 %	60 %	33591393
88	NC_002929	CCTGG	2	10	139750	139759	0 %	20 %	40 %	40 %	33591393
89	NC_002929	AGGCC	2	10	142525	142534	20 %	0 %	40 %	40 %	33591393
90	NC_002929	GCGCC	2	10	142702	142711	0 %	0 %	40 %	60 %	33591393
91	NC_002929	GCGGG	2	10	143045	143054	0 %	0 %	80 %	20 %	33591394
92	NC_002929	CGGCG	2	10	143456	143465	0 %	0 %	60 %	40 %	33591394
93	NC_002929	GCACG	2	10	143919	143928	20 %	0 %	40 %	40 %	33591395
94	NC_002929	GGCTG	2	10	149346	149355	0 %	20 %	60 %	20 %	33591399
95	NC_002929	GCTCG	2	10	149719	149728	0 %	20 %	40 %	40 %	33591399
96	NC_002929	AGCGC	2	10	150704	150713	20 %	0 %	40 %	40 %	33591400
97	NC_002929	GGCCG	2	10	151235	151244	0 %	0 %	60 %	40 %	33591400
98	NC_002929	GGCGC	2	10	151775	151784	0 %	0 %	60 %	40 %	33591401
99	NC_002929	CCGGG	2	10	152059	152068	0 %	0 %	60 %	40 %	33591401
100	NC_002929	GCGCC	2	10	154207	154216	0 %	0 %	40 %	60 %	33591404
101	NC_002929	CGCGC	2	10	154295	154304	0 %	0 %	40 %	60 %	33591404
102	NC_002929	GAACA	2	10	154946	154955	60 %	0 %	20 %	20 %	33591404
103	NC_002929	GGCCG	2	10	155152	155161	0 %	0 %	60 %	40 %	33591405
104	NC_002929	GGCGT	2	10	156737	156746	0 %	20 %	60 %	20 %	33591406
105	NC_002929	GCGCC	2	10	158030	158039	0 %	0 %	40 %	60 %	33591408
106	NC_002929	GCGCC	2	10	158311	158320	0 %	0 %	40 %	60 %	33591408
107	NC_002929	GCGCC	2	10	158698	158707	0 %	0 %	40 %	60 %	33591408
108	NC_002929	GGCTG	2	10	160715	160724	0 %	20 %	60 %	20 %	33591410
109	NC_002929	CGGCG	2	10	161361	161370	0 %	0 %	60 %	40 %	33591411
110	NC_002929	GCGCC	2	10	164240	164249	0 %	0 %	40 %	60 %	33591413
111	NC_002929	CGGCG	2	10	168649	168658	0 %	0 %	60 %	40 %	33591416
112	NC_002929	CGGCG	2	10	170116	170125	0 %	0 %	60 %	40 %	33591417
113	NC_002929	GCGCC	2	10	170314	170323	0 %	0 %	40 %	60 %	33591417
114	NC_002929	GCGCT	2	10	177454	177463	0 %	20 %	40 %	40 %	33591424
115	NC_002929	CGTCG	2	10	177540	177549	0 %	20 %	40 %	40 %	33591424
116	NC_002929	CGGGC	2	10	177575	177584	0 %	0 %	60 %	40 %	33591424
117	NC_002929	CGGCG	2	10	180173	180182	0 %	0 %	60 %	40 %	33591426
118	NC_002929	AGGGC	2	10	180676	180685	20 %	0 %	60 %	20 %	33591426
119	NC_002929	GACGC	2	10	182632	182641	20 %	0 %	40 %	40 %	33591429
120	NC_002929	GGCCT	2	10	183262	183271	0 %	20 %	40 %	40 %	33591429
121	NC_002929	CTGGT	2	10	184359	184368	0 %	40 %	40 %	20 %	33591430
122	NC_002929	CGTGG	2	10	184589	184598	0 %	20 %	60 %	20 %	33591430
123	NC_002929	GCGCC	2	10	185805	185814	0 %	0 %	40 %	60 %	33591430
124	NC_002929	GGCGC	2	10	186440	186449	0 %	0 %	60 %	40 %	33591430
125	NC_002929	ACGCC	2	10	186520	186529	20 %	0 %	20 %	60 %	33591430
126	NC_002929	TGCGC	2	10	188221	188230	0 %	20 %	40 %	40 %	33591431
127	NC_002929	GGCCG	2	10	188950	188959	0 %	0 %	60 %	40 %	33591432
128	NC_002929	CGGGG	2	10	190285	190294	0 %	0 %	80 %	20 %	33591434
129	NC_002929	CCGGC	2	10	193288	193297	0 %	0 %	40 %	60 %	33591436
130	NC_002929	TGCCG	2	10	193498	193507	0 %	20 %	40 %	40 %	33591436
131	NC_002929	GGGCA	2	10	193776	193785	20 %	0 %	60 %	20 %	33591436
132	NC_002929	GCGCG	2	10	196662	196671	0 %	0 %	60 %	40 %	33591439
133	NC_002929	CGCGC	2	10	197824	197833	0 %	0 %	40 %	60 %	33591440
134	NC_002929	TGCGC	2	10	198303	198312	0 %	20 %	40 %	40 %	33591440
135	NC_002929	GCGCC	2	10	201333	201342	0 %	0 %	40 %	60 %	33591442
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137	NC_002929	GGCCG	2	10	202911	202920	0 %	0 %	60 %	40 %	33591444
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