MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 9747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002929	GGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	75 %	25 %	33591276
2	NC_002929	GACG	2	8	616	623	25 %	0 %	50 %	25 %	33591276
3	NC_002929	CGCA	2	8	751	758	25 %	0 %	25 %	50 %	33591276
4	NC_002929	CATC	2	8	836	843	25 %	25 %	0 %	50 %	33591276
5	NC_002929	GCCT	2	8	947	954	0 %	25 %	25 %	50 %	33591276
6	NC_002929	GCTG	2	8	1602	1609	0 %	25 %	50 %	25 %	33591276
7	NC_002929	GCAA	2	8	1904	1911	50 %	0 %	25 %	25 %	33591276
8	NC_002929	GCCG	2	8	1988	1995	0 %	0 %	50 %	50 %	33591277
9	NC_002929	GTCG	2	8	2120	2127	0 %	25 %	50 %	25 %	33591277
10	NC_002929	GGCC	2	8	2423	2430	0 %	0 %	50 %	50 %	33591277
11	NC_002929	CCGC	2	8	2631	2638	0 %	0 %	25 %	75 %	33591278
12	NC_002929	GCCC	2	8	3006	3013	0 %	0 %	25 %	75 %	33591278
13	NC_002929	GCTG	2	8	3040	3047	0 %	25 %	50 %	25 %	33591278
14	NC_002929	TGCT	2	8	3420	3427	0 %	50 %	25 %	25 %	33591279
15	NC_002929	GCCA	2	8	4031	4038	25 %	0 %	25 %	50 %	33591279
16	NC_002929	CCTG	2	8	4337	4344	0 %	25 %	25 %	50 %	33591280
17	NC_002929	GTGC	2	8	4455	4462	0 %	25 %	50 %	25 %	33591280
18	NC_002929	GGCC	2	8	4532	4539	0 %	0 %	50 %	50 %	33591280
19	NC_002929	GGCG	2	8	4784	4791	0 %	0 %	75 %	25 %	33591280
20	NC_002929	GGCG	2	8	7537	7544	0 %	0 %	75 %	25 %	33591281
21	NC_002929	TTGC	2	8	8316	8323	0 %	50 %	25 %	25 %	33591282
22	NC_002929	AAGG	2	8	8937	8944	50 %	0 %	50 %	0 %	33591283
23	NC_002929	CCCG	2	8	9356	9363	0 %	0 %	25 %	75 %	33591284
24	NC_002929	CCTA	2	8	11762	11769	25 %	25 %	0 %	50 %	33591288
25	NC_002929	TCGT	2	8	12076	12083	0 %	50 %	25 %	25 %	33591288
26	NC_002929	GTCG	2	8	13662	13669	0 %	25 %	50 %	25 %	33591288
27	NC_002929	TCGC	2	8	14195	14202	0 %	25 %	25 %	50 %	33591288
28	NC_002929	GGCC	2	8	14916	14923	0 %	0 %	50 %	50 %	33591288
29	NC_002929	TCGC	2	8	15735	15742	0 %	25 %	25 %	50 %	33591288
30	NC_002929	CAAG	2	8	15797	15804	50 %	0 %	25 %	25 %	33591289
31	NC_002929	ATGG	2	8	16478	16485	25 %	25 %	50 %	0 %	33591289
32	NC_002929	AAGG	2	8	17721	17728	50 %	0 %	50 %	0 %	33591289
33	NC_002929	ATCG	2	8	18536	18543	25 %	25 %	25 %	25 %	33591289
34	NC_002929	GGTG	2	8	19079	19086	0 %	25 %	75 %	0 %	33591289
35	NC_002929	CCTG	2	8	21093	21100	0 %	25 %	25 %	50 %	33591291
36	NC_002929	GCCC	2	8	21856	21863	0 %	0 %	25 %	75 %	33591291
37	NC_002929	TGCT	2	8	25315	25322	0 %	50 %	25 %	25 %	33591292
38	NC_002929	GCCG	2	8	26540	26547	0 %	0 %	50 %	50 %	33591293
39	NC_002929	TGAG	2	8	26703	26710	25 %	25 %	50 %	0 %	33591293
40	NC_002929	CGCC	2	8	26836	26843	0 %	0 %	25 %	75 %	33591293
41	NC_002929	CTGC	2	8	26848	26855	0 %	25 %	25 %	50 %	33591293
42	NC_002929	GCCG	2	8	26884	26891	0 %	0 %	50 %	50 %	33591293
43	NC_002929	CGGC	2	8	27096	27103	0 %	0 %	50 %	50 %	33591293
44	NC_002929	GCTG	2	8	27136	27143	0 %	25 %	50 %	25 %	33591293
45	NC_002929	CGGC	2	8	27870	27877	0 %	0 %	50 %	50 %	33591294
46	NC_002929	GCTG	2	8	27931	27938	0 %	25 %	50 %	25 %	33591294
47	NC_002929	CGAA	2	8	28727	28734	50 %	0 %	25 %	25 %	33591295
48	NC_002929	GGCC	2	8	28963	28970	0 %	0 %	50 %	50 %	33591295
49	NC_002929	CAGC	2	8	29177	29184	25 %	0 %	25 %	50 %	33591296
50	NC_002929	AGCC	2	8	29320	29327	25 %	0 %	25 %	50 %	33591296
51	NC_002929	GGCG	2	8	29513	29520	0 %	0 %	75 %	25 %	33591296
52	NC_002929	CGTG	2	8	29612	29619	0 %	25 %	50 %	25 %	33591296
53	NC_002929	GGCC	2	8	30044	30051	0 %	0 %	50 %	50 %	33591296
54	NC_002929	AATC	2	8	30635	30642	50 %	25 %	0 %	25 %	33591297
55	NC_002929	AGCA	2	8	31239	31246	50 %	0 %	25 %	25 %	33591298
56	NC_002929	TCGC	2	8	32791	32798	0 %	25 %	25 %	50 %	33591299
57	NC_002929	AAGG	2	8	32941	32948	50 %	0 %	50 %	0 %	33591299
58	NC_002929	CCCG	2	8	33075	33082	0 %	0 %	25 %	75 %	33591300
59	NC_002929	GCAC	2	8	33911	33918	25 %	0 %	25 %	50 %	33591300
60	NC_002929	CACC	2	8	34037	34044	25 %	0 %	0 %	75 %	33591300
61	NC_002929	CAGC	2	8	34921	34928	25 %	0 %	25 %	50 %	33591301
62	NC_002929	GCCG	2	8	34982	34989	0 %	0 %	50 %	50 %	33591301
63	NC_002929	CCAC	2	8	35920	35927	25 %	0 %	0 %	75 %	33591302
64	NC_002929	TGCC	2	8	35953	35960	0 %	25 %	25 %	50 %	33591302
65	NC_002929	GGCC	2	8	36223	36230	0 %	0 %	50 %	50 %	33591302
66	NC_002929	CAAG	2	8	37060	37067	50 %	0 %	25 %	25 %	33591303
67	NC_002929	GCTC	2	8	37296	37303	0 %	25 %	25 %	50 %	33591303
68	NC_002929	GCCG	2	8	37892	37899	0 %	0 %	50 %	50 %	33591303
69	NC_002929	GGCC	2	8	38501	38508	0 %	0 %	50 %	50 %	33591304
70	NC_002929	GACC	2	8	38975	38982	25 %	0 %	25 %	50 %	33591304
71	NC_002929	GGCG	2	8	39881	39888	0 %	0 %	75 %	25 %	33591304
72	NC_002929	GCAG	2	8	40465	40472	25 %	0 %	50 %	25 %	33591305
73	NC_002929	AAGA	2	8	40898	40905	75 %	0 %	25 %	0 %	33591306
74	NC_002929	ATCG	2	8	40961	40968	25 %	25 %	25 %	25 %	33591306
75	NC_002929	CGGC	2	8	41409	41416	0 %	0 %	50 %	50 %	33591307
76	NC_002929	GCCG	2	8	41426	41433	0 %	0 %	50 %	50 %	33591307
77	NC_002929	TGGC	2	8	41826	41833	0 %	25 %	50 %	25 %	33591307
78	NC_002929	GGCC	2	8	42579	42586	0 %	0 %	50 %	50 %	33591308
79	NC_002929	GCCG	2	8	42903	42910	0 %	0 %	50 %	50 %	33591309
80	NC_002929	CGGC	2	8	43128	43135	0 %	0 %	50 %	50 %	33591309
81	NC_002929	CAGC	2	8	43959	43966	25 %	0 %	25 %	50 %	33591310
82	NC_002929	GCCG	2	8	44020	44027	0 %	0 %	50 %	50 %	33591310
83	NC_002929	CGTG	2	8	45335	45342	0 %	25 %	50 %	25 %	33591311
84	NC_002929	CCGG	2	8	45352	45359	0 %	0 %	50 %	50 %	33591311
85	NC_002929	CGAC	2	8	45646	45653	25 %	0 %	25 %	50 %	33591311
86	NC_002929	GCGG	2	8	45871	45878	0 %	0 %	75 %	25 %	33591312
87	NC_002929	GCAG	2	8	45912	45919	25 %	0 %	50 %	25 %	33591312
88	NC_002929	CTGG	2	8	46621	46628	0 %	25 %	50 %	25 %	33591313
89	NC_002929	TGCC	2	8	48176	48183	0 %	25 %	25 %	50 %	33591314
90	NC_002929	GGCC	2	8	48530	48537	0 %	0 %	50 %	50 %	33591314
91	NC_002929	ACCT	2	8	48898	48905	25 %	25 %	0 %	50 %	33591314
92	NC_002929	GCCG	2	8	48951	48958	0 %	0 %	50 %	50 %	33591314
93	NC_002929	CGAC	2	8	49172	49179	25 %	0 %	25 %	50 %	33591314
94	NC_002929	CAGC	2	8	50437	50444	25 %	0 %	25 %	50 %	33591316
95	NC_002929	GCCG	2	8	50498	50505	0 %	0 %	50 %	50 %	33591316
96	NC_002929	GCTG	2	8	51646	51653	0 %	25 %	50 %	25 %	33591317
97	NC_002929	CGGC	2	8	51735	51742	0 %	0 %	50 %	50 %	33591317
98	NC_002929	CGCT	2	8	52008	52015	0 %	25 %	25 %	50 %	33591317
99	NC_002929	ACCT	2	8	52236	52243	25 %	25 %	0 %	50 %	33591317
100	NC_002929	TCGA	2	8	53669	53676	25 %	25 %	25 %	25 %	33591318
101	NC_002929	CAGC	2	8	55407	55414	25 %	0 %	25 %	50 %	33591319
102	NC_002929	CTGG	2	8	55970	55977	0 %	25 %	50 %	25 %	33591320
103	NC_002929	ACGT	2	8	56223	56230	25 %	25 %	25 %	25 %	33591320
104	NC_002929	TCGG	2	8	56533	56540	0 %	25 %	50 %	25 %	33591321
105	NC_002929	CAGC	2	8	56922	56929	25 %	0 %	25 %	50 %	33591321
106	NC_002929	GCCG	2	8	56943	56950	0 %	0 %	50 %	50 %	33591321
107	NC_002929	GGGC	2	8	57344	57351	0 %	0 %	75 %	25 %	33591321
108	NC_002929	CGGC	2	8	58085	58092	0 %	0 %	50 %	50 %	33591322
109	NC_002929	GCTG	2	8	58146	58153	0 %	25 %	50 %	25 %	33591322
110	NC_002929	GCCA	2	8	59506	59513	25 %	0 %	25 %	50 %	33591323
111	NC_002929	ATGT	2	8	59606	59613	25 %	50 %	25 %	0 %	33591323
112	NC_002929	CTGG	2	8	59879	59886	0 %	25 %	50 %	25 %	33591323
113	NC_002929	CCTT	2	8	60512	60519	0 %	50 %	0 %	50 %	33591324
114	NC_002929	ACGC	2	8	60822	60829	25 %	0 %	25 %	50 %	33591324
115	NC_002929	TCGC	2	8	61225	61232	0 %	25 %	25 %	50 %	33591325
116	NC_002929	AGCA	2	8	61291	61298	50 %	0 %	25 %	25 %	33591325
117	NC_002929	ACGA	2	8	61552	61559	50 %	0 %	25 %	25 %	33591325
118	NC_002929	TGCC	2	8	62889	62896	0 %	25 %	25 %	50 %	33591327
119	NC_002929	ATTA	2	8	64067	64074	50 %	50 %	0 %	0 %	33591329
120	NC_002929	CAAA	2	8	64490	64497	75 %	0 %	0 %	25 %	33591330
121	NC_002929	TCTT	2	8	64910	64917	0 %	75 %	0 %	25 %	33591330
122	NC_002929	GAAT	2	8	65025	65032	50 %	25 %	25 %	0 %	33591330
123	NC_002929	TGGA	2	8	65994	66001	25 %	25 %	50 %	0 %	33591331
124	NC_002929	TCGG	2	8	66138	66145	0 %	25 %	50 %	25 %	33591331
125	NC_002929	ACAA	2	8	66171	66178	75 %	0 %	0 %	25 %	33591331
126	NC_002929	AATA	2	8	66668	66675	75 %	25 %	0 %	0 %	33591331
127	NC_002929	ATCA	2	8	68389	68396	50 %	25 %	0 %	25 %	33591332
128	NC_002929	CAGC	2	8	69381	69388	25 %	0 %	25 %	50 %	33591333
129	NC_002929	GCCG	2	8	69442	69449	0 %	0 %	50 %	50 %	33591333
130	NC_002929	GGGT	2	8	71851	71858	0 %	25 %	75 %	0 %	33591335
131	NC_002929	GCCG	2	8	72149	72156	0 %	0 %	50 %	50 %	33591335
132	NC_002929	GAAG	2	8	72812	72819	50 %	0 %	50 %	0 %	33591335
133	NC_002929	CAGC	2	8	73811	73818	25 %	0 %	25 %	50 %	33591336
134	NC_002929	TCCA	2	8	74034	74041	25 %	25 %	0 %	50 %	33591336
135	NC_002929	GGTC	2	8	74432	74439	0 %	25 %	50 %	25 %	33591337
136	NC_002929	CTGG	2	8	74793	74800	0 %	25 %	50 %	25 %	33591337
137	NC_002929	GGGC	2	8	74851	74858	0 %	0 %	75 %	25 %	33591337
138	NC_002929	CAGC	2	8	74904	74911	25 %	0 %	25 %	50 %	33591337
139	NC_002929	GCCC	2	8	75078	75085	0 %	0 %	25 %	75 %	33591338
140	NC_002929	GCTG	2	8	75144	75151	0 %	25 %	50 %	25 %	33591338
141	NC_002929	CGGC	2	8	75625	75632	0 %	0 %	50 %	50 %	33591339
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