MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 4930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002928	GGCAA	2	10	1501	1510	40 %	0 %	40 %	20 %	33594724
2	NC_002928	CTGGC	2	10	2703	2712	0 %	20 %	40 %	40 %	33594726
3	NC_002928	GGGAG	2	10	3457	3466	20 %	0 %	80 %	0 %	33594727
4	NC_002928	TTCGC	2	10	5701	5710	0 %	40 %	20 %	40 %	33594729
5	NC_002928	GGCCG	2	10	5719	5728	0 %	0 %	60 %	40 %	33594729
6	NC_002928	GCTGG	2	10	8561	8570	0 %	20 %	60 %	20 %	33594731
7	NC_002928	TCGCC	2	10	9960	9969	0 %	20 %	20 %	60 %	33594734
8	NC_002928	TACCG	2	10	10103	10112	20 %	20 %	20 %	40 %	33594734
9	NC_002928	GACCA	2	10	13270	13279	40 %	0 %	20 %	40 %	33594737
10	NC_002928	TGCCT	2	10	13793	13802	0 %	40 %	20 %	40 %	33594737
11	NC_002928	CTGGG	2	10	15112	15121	0 %	20 %	60 %	20 %	33594737
12	NC_002928	AAGGC	2	10	17146	17155	40 %	0 %	40 %	20 %	33594738
13	NC_002928	CGGCC	2	10	19451	19460	0 %	0 %	40 %	60 %	33594738
14	NC_002928	CTGGC	2	10	19897	19906	0 %	20 %	40 %	40 %	33594738
15	NC_002928	GCGCC	2	10	20863	20872	0 %	0 %	40 %	60 %	33594740
16	NC_002928	GCGCC	2	10	21664	21673	0 %	0 %	40 %	60 %	33594740
17	NC_002928	CGGCC	2	10	22142	22151	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_002928	GGCGC	2	10	23000	23009	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_002928	GCGTC	2	10	23087	23096	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_002928	GCAGC	2	10	23483	23492	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_002928	CGGCG	2	10	24770	24779	0 %	0 %	60 %	40 %	33594741
22	NC_002928	GGGCT	2	10	25385	25394	0 %	20 %	60 %	20 %	33594741
23	NC_002928	GGCGC	2	10	26924	26933	0 %	0 %	60 %	40 %	33594743
24	NC_002928	GTCAG	2	10	28316	28325	20 %	20 %	40 %	20 %	33594745
25	NC_002928	AGCGC	2	10	31049	31058	20 %	0 %	40 %	40 %	33594748
26	NC_002928	CAAGT	2	10	34367	34376	40 %	20 %	20 %	20 %	161610405
27	NC_002928	TGACG	2	10	34591	34600	20 %	20 %	40 %	20 %	161610405
28	NC_002928	CGCTG	2	10	35923	35932	0 %	20 %	40 %	40 %	33594754
29	NC_002928	CGCGC	2	10	36148	36157	0 %	0 %	40 %	60 %	33594754
30	NC_002928	CCGCG	2	10	37970	37979	0 %	0 %	40 %	60 %	33594757
31	NC_002928	GCGTG	2	10	38943	38952	0 %	20 %	60 %	20 %	33594760
32	NC_002928	TATCG	2	10	39825	39834	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_002928	AAACG	2	10	42137	42146	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_002928	GTTCC	2	10	43085	43094	0 %	40 %	20 %	40 %	33594763
35	NC_002928	GGCGG	2	10	49773	49782	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
36	NC_002928	CCGGC	2	10	51514	51523	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_002928	AGGTC	2	10	51646	51655	20 %	20 %	40 %	20 %	33594780
38	NC_002928	GACGT	2	10	51678	51687	20 %	20 %	40 %	20 %	33594780
39	NC_002928	GCCGC	2	10	52514	52523	0 %	0 %	40 %	60 %	33594782
40	NC_002928	CTGGC	2	10	53297	53306	0 %	20 %	40 %	40 %	33594782
41	NC_002928	GCCGC	2	10	53515	53524	0 %	0 %	40 %	60 %	33594782
42	NC_002928	GCTGG	2	10	53760	53769	0 %	20 %	60 %	20 %	33594782
43	NC_002928	GCCGA	2	10	55829	55838	20 %	0 %	40 %	40 %	33594784
44	NC_002928	CTGGC	2	10	60466	60475	0 %	20 %	40 %	40 %	33594788
45	NC_002928	GCCGC	2	10	61594	61603	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NC_002928	GCGCG	2	10	62575	62584	0 %	0 %	60 %	40 %	33594789
47	NC_002928	AGCGC	2	10	62803	62812	20 %	0 %	40 %	40 %	33594789
48	NC_002928	GCCGG	2	10	63511	63520	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_002928	CCCGG	2	10	63532	63541	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_002928	CCACG	2	10	64023	64032	20 %	0 %	20 %	60 %	33594791
51	NC_002928	GCCAG	2	10	65847	65856	20 %	0 %	40 %	40 %	33594791
52	NC_002928	CGACG	2	10	66838	66847	20 %	0 %	40 %	40 %	33594793
53	NC_002928	AGGCC	2	10	67753	67762	20 %	0 %	40 %	40 %	33594793
54	NC_002928	GGACG	2	10	67827	67836	20 %	0 %	60 %	20 %	33594794
55	NC_002928	GCGCC	2	10	68557	68566	0 %	0 %	40 %	60 %	33594794
56	NC_002928	GCACG	2	10	70416	70425	20 %	0 %	40 %	40 %	33594795
57	NC_002928	TGCGC	2	10	71327	71336	0 %	20 %	40 %	40 %	33594795
58	NC_002928	GCGCC	2	10	72916	72925	0 %	0 %	40 %	60 %	33594796
59	NC_002928	CGCTG	2	10	74052	74061	0 %	20 %	40 %	40 %	33594796
60	NC_002928	GGCAT	2	10	74292	74301	20 %	20 %	40 %	20 %	33594797
61	NC_002928	GATCG	2	10	75529	75538	20 %	20 %	40 %	20 %	33594798
62	NC_002928	GGCAT	2	10	78585	78594	20 %	20 %	40 %	20 %	33594800
63	NC_002928	CCGGC	2	10	78856	78865	0 %	0 %	40 %	60 %	33594800
64	NC_002928	GGGCC	2	10	79051	79060	0 %	0 %	60 %	40 %	33594800
65	NC_002928	CGGGC	2	10	82783	82792	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_002928	GCGCG	2	10	82807	82816	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_002928	TGACC	2	10	84084	84093	20 %	20 %	20 %	40 %	33594805
68	NC_002928	GCCGG	2	10	84490	84499	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_002928	AATGA	2	10	84516	84525	60 %	20 %	20 %	0 %	33594806
70	NC_002928	CCAGG	2	10	85699	85708	20 %	0 %	40 %	40 %	33594807
71	NC_002928	ACCGC	2	10	85960	85969	20 %	0 %	20 %	60 %	33594807
72	NC_002928	GCGTG	2	10	86011	86020	0 %	20 %	60 %	20 %	33594807
73	NC_002928	CTGGT	2	10	88082	88091	0 %	40 %	40 %	20 %	33594809
74	NC_002928	CTGGG	2	10	88421	88430	0 %	20 %	60 %	20 %	33594809
75	NC_002928	CCGCG	2	10	90227	90236	0 %	0 %	40 %	60 %	33594811
76	NC_002928	GACTG	2	10	91677	91686	20 %	20 %	40 %	20 %	33594813
77	NC_002928	GCGCG	2	10	91783	91792	0 %	0 %	60 %	40 %	33594813
78	NC_002928	GGCGT	2	10	91814	91823	0 %	20 %	60 %	20 %	33594813
79	NC_002928	GCGCG	2	10	93178	93187	0 %	0 %	60 %	40 %	33594815
80	NC_002928	GCGCG	2	10	95695	95704	0 %	0 %	60 %	40 %	33594816
81	NC_002928	CGGCA	2	10	97398	97407	20 %	0 %	40 %	40 %	33594818
82	NC_002928	CAGGT	2	10	97474	97483	20 %	20 %	40 %	20 %	33594818
83	NC_002928	AGCGC	2	10	97487	97496	20 %	0 %	40 %	40 %	33594818
84	NC_002928	GCCAG	2	10	98967	98976	20 %	0 %	40 %	40 %	33594820
85	NC_002928	CCCAG	2	10	99012	99021	20 %	0 %	20 %	60 %	33594820
86	NC_002928	GCGCG	2	10	100293	100302	0 %	0 %	60 %	40 %	33594821
87	NC_002928	GCGTA	2	10	100417	100426	20 %	20 %	40 %	20 %	33594821
88	NC_002928	GCCGC	2	10	102377	102386	0 %	0 %	40 %	60 %	33594823
89	NC_002928	CGCAC	2	10	102949	102958	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_002928	TTCGG	2	10	103061	103070	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_002928	GACGG	2	10	104479	104488	20 %	0 %	60 %	20 %	33594824
92	NC_002928	CGCGC	2	10	105124	105133	0 %	0 %	40 %	60 %	33594824
93	NC_002928	TGCGG	2	10	105522	105531	0 %	20 %	60 %	20 %	33594824
94	NC_002928	GACCG	2	10	106234	106243	20 %	0 %	40 %	40 %	33594824
95	NC_002928	GGACC	2	10	106767	106776	20 %	0 %	40 %	40 %	33594824
96	NC_002928	TGCGG	2	10	107130	107139	0 %	20 %	60 %	20 %	33594824
97	NC_002928	GACCG	2	10	107842	107851	20 %	0 %	40 %	40 %	33594824
98	NC_002928	CTGGG	2	10	109466	109475	0 %	20 %	60 %	20 %	33594825
99	NC_002928	CGATG	2	10	110956	110965	20 %	20 %	40 %	20 %	33594827
100	NC_002928	TGGCG	2	10	111858	111867	0 %	20 %	60 %	20 %	33594827
101	NC_002928	GCCGC	2	10	113016	113025	0 %	0 %	40 %	60 %	33594828
102	NC_002928	GCATC	2	10	113046	113055	20 %	20 %	20 %	40 %	33594828
103	NC_002928	GACCA	2	10	113786	113795	40 %	0 %	20 %	40 %	33594829
104	NC_002928	GCTGG	2	10	114559	114568	0 %	20 %	60 %	20 %	33594829
105	NC_002928	TCGGT	2	10	115998	116007	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_002928	CAGCG	2	10	116776	116785	20 %	0 %	40 %	40 %	33594831
107	NC_002928	CAGGG	2	10	119235	119244	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_002928	AAATG	2	10	119424	119433	60 %	20 %	20 %	0 %	33594833
109	NC_002928	TTGCC	2	10	120982	120991	0 %	40 %	20 %	40 %	33594835
110	NC_002928	GGCCT	2	10	121464	121473	0 %	20 %	40 %	40 %	33594835
111	NC_002928	CGCGC	2	10	122877	122886	0 %	0 %	40 %	60 %	33594836
112	NC_002928	CGCGC	2	10	123635	123644	0 %	0 %	40 %	60 %	33594837
113	NC_002928	GCGTG	2	10	123974	123983	0 %	20 %	60 %	20 %	33594837
114	NC_002928	GGCGT	2	10	124353	124362	0 %	20 %	60 %	20 %	33594837
115	NC_002928	GCCGC	2	10	126141	126150	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_002928	GTCGA	2	10	126531	126540	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_002928	CGATG	2	10	131293	131302	20 %	20 %	40 %	20 %	33594842
118	NC_002928	GCATC	2	10	133081	133090	20 %	20 %	20 %	40 %	33594844
119	NC_002928	GCTCG	2	10	135168	135177	0 %	20 %	40 %	40 %	33594846
120	NC_002928	GTGCT	2	10	136748	136757	0 %	40 %	40 %	20 %	33594849
121	NC_002928	GGCTG	2	10	136934	136943	0 %	20 %	60 %	20 %	33594849
122	NC_002928	TCTGG	2	10	141246	141255	0 %	40 %	40 %	20 %	33594853
123	NC_002928	CGTCG	2	10	142072	142081	0 %	20 %	40 %	40 %	33594853
124	NC_002928	GGCGC	2	10	142263	142272	0 %	0 %	60 %	40 %	33594853
125	NC_002928	ATACG	2	10	142619	142628	40 %	20 %	20 %	20 %	33594853
126	NC_002928	TACGG	2	10	142968	142977	20 %	20 %	40 %	20 %	33594853
127	NC_002928	GCATC	2	10	143729	143738	20 %	20 %	20 %	40 %	33594853
128	NC_002928	CGGAC	2	10	145869	145878	20 %	0 %	40 %	40 %	33594854
129	NC_002928	TTCGA	2	10	148043	148052	20 %	40 %	20 %	20 %	33594855
130	NC_002928	CGGCC	2	10	151523	151532	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_002928	GATTT	2	10	153865	153874	20 %	60 %	20 %	0 %	33594860
132	NC_002928	CAGCT	2	10	153898	153907	20 %	20 %	20 %	40 %	33594860
133	NC_002928	GCCGC	2	10	156559	156568	0 %	0 %	40 %	60 %	33594862
134	NC_002928	CCCGG	2	10	157958	157967	0 %	0 %	40 %	60 %	33594863
135	NC_002928	GACGG	2	10	159883	159892	20 %	0 %	60 %	20 %	33594864
136	NC_002928	GGACG	2	10	160493	160502	20 %	0 %	60 %	20 %	33594865
137	NC_002928	GCGCG	2	10	163304	163313	0 %	0 %	60 %	40 %	33594867
138	NC_002928	AGGCG	2	10	163385	163394	20 %	0 %	60 %	20 %	33594867
139	NC_002928	CGATG	2	10	164442	164451	20 %	20 %	40 %	20 %	33594869
140	NC_002928	GGGCA	2	10	165576	165585	20 %	0 %	60 %	20 %	33594869
141	NC_002928	AGGGC	2	10	166381	166390	20 %	0 %	60 %	20 %	33594870
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149	NC_002928	CGGGC	2	10	179032	179041	0 %	0 %	60 %	40 %	33594881
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269	NC_002928	CGCGG	2	10	271892	271901	0 %	0 %	60 %	40 %	33594977
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