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Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 2305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002928	TATG	2	8	8025	8032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002928	ACTG	2	8	20070	20077	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_002928	TTCG	2	8	22209	22216	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_002928	CACG	2	8	22322	22329	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_002928	CGGA	2	8	22352	22359	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_002928	GCCG	2	8	23063	23070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_002928	CGCC	2	8	23576	23583	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_002928	GGCC	2	8	23709	23716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_002928	GCTG	2	8	24169	24176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_002928	GCCG	2	8	24177	24184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_002928	GCCA	2	8	24302	24309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_002928	CGGG	2	8	24314	24321	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_002928	GGCC	2	8	27302	27309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_002928	AGCC	2	8	28790	28797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_002928	ATCG	2	8	28894	28901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_002928	AACG	2	8	28975	28982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_002928	CTAC	2	8	30124	30131	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_002928	CGTC	2	8	39436	39443	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_002928	GCCG	2	8	39790	39797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_002928	GCAG	2	8	39994	40001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_002928	GGCC	2	8	40042	40049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_002928	TTGG	2	8	42103	42110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002928	CAGG	2	8	42182	42189	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_002928	CAGG	2	8	42199	42206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_002928	TCGT	2	8	42319	42326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_002928	GGTT	2	8	57126	57133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002928	GGCA	2	8	57277	57284	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_002928	GTGC	2	8	69153	69160	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_002928	CGGC	2	8	69550	69557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_002928	GGCC	2	8	69652	69659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_002928	GCCA	2	8	69747	69754	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_002928	CGGC	2	8	72820	72827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_002928	ACCG	2	8	74187	74194	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_002928	CGGG	2	8	74269	74276	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_002928	CAGG	2	8	74822	74829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_002928	AGCC	2	8	79095	79102	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002928	GCAC	2	8	82865	82872	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_002928	GTAG	2	8	85485	85492	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002928	GGCC	2	8	87584	87591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_002928	TACT	2	8	87612	87619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_002928	GGCA	2	8	92764	92771	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_002928	GGCG	2	8	93646	93653	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_002928	CCGG	2	8	95881	95888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_002928	AATC	2	8	98067	98074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_002928	GGGC	2	8	98150	98157	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_002928	CGGG	2	8	98822	98829	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_002928	ACGG	2	8	99789	99796	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_002928	CGGC	2	8	99824	99831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_002928	GCCG	2	8	99836	99843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_002928	GCGT	2	8	101805	101812	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002928	CCCT	2	8	101920	101927	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_002928	GCCT	2	8	109092	109099	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002928	CCCG	2	8	109159	109166	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_002928	CGCC	2	8	116008	116015	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_002928	GCAC	2	8	125383	125390	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_002928	GCCG	2	8	125439	125446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_002928	GCAG	2	8	125645	125652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_002928	CGAA	2	8	125720	125727	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_002928	CTCG	2	8	125763	125770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_002928	GGCC	2	8	125876	125883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_002928	GCCG	2	8	126094	126101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002928	GCCG	2	8	126412	126419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_002928	CGCC	2	8	126568	126575	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_002928	GTAT	2	8	127381	127388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002928	CGAA	2	8	131778	131785	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_002928	TGCC	2	8	146543	146550	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_002928	GTCC	2	8	151709	151716	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_002928	GCTT	2	8	153099	153106	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_002928	ACCG	2	8	154220	154227	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_002928	GACG	2	8	160420	160427	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_002928	GCGT	2	8	163581	163588	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_002928	CAGC	2	8	174334	174341	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_002928	AGGT	2	8	174488	174495	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002928	GCCA	2	8	174623	174630	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_002928	ACGG	2	8	174872	174879	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_002928	CCGC	2	8	175001	175008	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_002928	CAGC	2	8	175096	175103	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_002928	CGGC	2	8	182697	182704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002928	GGCG	2	8	182706	182713	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_002928	CGGC	2	8	187368	187375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_002928	GCCG	2	8	187378	187385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_002928	GGCG	2	8	188700	188707	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_002928	GGTC	2	8	190059	190066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_002928	TTCC	2	8	190621	190628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_002928	CTGG	2	8	191279	191286	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_002928	ATTG	2	8	193371	193378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002928	CGGC	2	8	196155	196162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_002928	TATT	3	12	213759	213770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002928	GGCC	2	8	213835	213842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_002928	CGGC	2	8	213905	213912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_002928	GGTT	2	8	219170	219177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002928	CTTC	2	8	223462	223469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_002928	GGCG	2	8	233340	233347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_002928	CGGG	2	8	234957	234964	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_002928	GGAC	2	8	235936	235943	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_002928	CCTT	2	8	236580	236587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_002928	TTCT	2	8	236687	236694	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_002928	GGCG	2	8	237109	237116	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_002928	CGGC	2	8	247190	247197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_002928	GAAA	2	8	252524	252531	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002928	CGGA	2	8	252570	252577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_002928	CATA	2	8	254562	254569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_002928	GGGC	2	8	260830	260837	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_002928	GCGG	2	8	266427	266434	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_002928	GCGT	2	8	280213	280220	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_002928	AGTA	2	8	286478	286485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002928	GGCC	2	8	286560	286567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_002928	TACT	2	8	286733	286740	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_002928	CGGC	2	8	286865	286872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002928	CGGC	2	8	292565	292572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_002928	GCCG	2	8	292857	292864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_002928	GCTC	2	8	292922	292929	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_002928	GCCG	2	8	293385	293392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_002928	TGAA	2	8	303981	303988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002928	GGGC	2	8	304798	304805	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_002928	GCGG	2	8	311757	311764	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_002928	GGAT	2	8	313784	313791	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002928	GCCG	2	8	314639	314646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_002928	CGGC	2	8	314655	314662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_002928	CAGG	2	8	318501	318508	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_002928	GTTG	2	8	319975	319982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002928	GGCG	2	8	322380	322387	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_002928	TGCG	2	8	324728	324735	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_002928	CCCG	2	8	327161	327168	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_002928	CTGG	2	8	327190	327197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_002928	CACG	2	8	327252	327259	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_002928	CGGC	2	8	327351	327358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_002928	CGGC	2	8	327394	327401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_002928	TCGA	2	8	328252	328259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_002928	GGGC	2	8	328500	328507	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_002928	GGCG	2	8	328737	328744	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_002928	CTGG	2	8	328929	328936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_002928	GGCC	2	8	328983	328990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_002928	ATAC	2	8	331150	331157	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_002928	TTAT	2	8	335881	335888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002928	AGAA	2	8	335919	335926	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002928	TGGC	2	8	346721	346728	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_002928	TGTA	2	8	347147	347154	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002928	CGGC	2	8	347238	347245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_002928	CTCG	2	8	356598	356605	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_002928	TGGG	2	8	359616	359623	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002928	TTGC	2	8	359624	359631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_002928	GCCC	2	8	366065	366072	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_002928	CTGG	2	8	366319	366326	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_002928	CGGC	2	8	366460	366467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_002928	CGGC	2	8	366615	366622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_002928	GGGC	2	8	366758	366765	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_002928	GGCG	2	8	367182	367189	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_002928	GGCA	2	8	367304	367311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_002928	GAGG	2	8	367771	367778	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002928	GCGG	2	8	367882	367889	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
152	NC_002928	GCCC	2	8	367905	367912	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
153	NC_002928	CGGC	2	8	368928	368935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_002928	GGCG	2	8	369931	369938	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
155	NC_002928	GTAC	2	8	375339	375346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_002928	AGGC	2	8	375365	375372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
157	NC_002928	GAAC	2	8	375413	375420	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_002928	TGCG	2	8	375470	375477	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
159	NC_002928	GCCC	2	8	383726	383733	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
160	NC_002928	CGCC	2	8	388315	388322	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
161	NC_002928	GCCG	2	8	389434	389441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_002928	CGCC	2	8	391542	391549	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
163	NC_002928	CATT	2	8	392458	392465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_002928	GCGG	2	8	399110	399117	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_002928	CCGC	2	8	400500	400507	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
167	NC_002928	CCGC	2	8	404915	404922	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
168	NC_002928	AATT	2	8	405035	405042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_002928	TCGA	2	8	408693	408700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
172	NC_002928	GTGG	2	8	409370	409377	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
173	NC_002928	CCGG	2	8	413698	413705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
174	NC_002928	CTCC	2	8	420514	420521	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
175	NC_002928	TATT	2	8	421540	421547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_002928	GCCG	2	8	425170	425177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
177	NC_002928	GCCG	2	8	425688	425695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
178	NC_002928	CCGG	2	8	430216	430223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
179	NC_002928	ATTT	2	8	434421	434428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_002928	GCGG	2	8	434525	434532	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
181	NC_002928	GGCG	2	8	434635	434642	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
182	NC_002928	GGCG	2	8	434658	434665	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
183	NC_002928	CGGG	2	8	437469	437476	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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186	NC_002928	GGGC	2	8	447798	447805	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
187	NC_002928	GGTA	2	8	449772	449779	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
188	NC_002928	CGGC	2	8	454017	454024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
189	NC_002928	GCCG	2	8	461363	461370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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191	NC_002928	TGGC	2	8	461473	461480	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
192	NC_002928	TGTT	2	8	461490	461497	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
193	NC_002928	ACGC	2	8	464792	464799	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
194	NC_002928	GGCG	2	8	466561	466568	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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196	NC_002928	GTGG	2	8	468516	468523	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
197	NC_002928	GGCG	2	8	468995	469002	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
198	NC_002928	GGAT	2	8	470165	470172	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_002928	CACG	2	8	477894	477901	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
202	NC_002928	TGCG	2	8	478016	478023	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
203	NC_002928	TGCG	2	8	484150	484157	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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231	NC_002928	GATT	2	8	510583	510590	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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234	NC_002928	ACGT	2	8	511717	511724	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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263	NC_002928	GGCC	2	8	568230	568237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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270	NC_002928	CGGC	3	12	585624	585635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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272	NC_002928	GGCC	2	8	595460	595467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
273	NC_002928	CCGG	2	8	603642	603649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
274	NC_002928	CATT	3	12	603719	603730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
275	NC_002928	GCGG	2	8	604706	604713	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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278	NC_002928	CGCC	2	8	616903	616910	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
279	NC_002928	ACTA	2	8	616982	616989	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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283	NC_002928	GCGG	2	8	631813	631820	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
284	NC_002928	CCGC	2	8	632050	632057	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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292	NC_002928	CCTG	2	8	643262	643269	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
293	NC_002928	GATC	2	8	651294	651301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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297	NC_002928	GGCG	2	8	671097	671104	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
298	NC_002928	CTGC	2	8	681747	681754	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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483	NC_002928	GCAG	2	8	1061858	1061865	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
484	NC_002928	ATAC	2	8	1066930	1066937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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489	NC_002928	CCCG	2	8	1071344	1071351	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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496	NC_002928	CGGC	2	8	1093237	1093244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
497	NC_002928	GAGG	2	8	1093408	1093415	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
498	NC_002928	CCTG	2	8	1093981	1093988	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_002928	GGGC	2	8	1097324	1097331	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
500	NC_002928	GGTG	2	8	1097332	1097339	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

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