MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 10448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002928	CTG	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002928	GCG	2	6	6178	6183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002928	CGG	2	6	6199	6204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_002928	GCC	2	6	6209	6214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_002928	GGA	2	6	6281	6286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002928	CCT	2	6	6356	6361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_002928	CCA	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_002928	AGC	2	6	6417	6422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002928	GGA	2	6	6527	6532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002928	ACG	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_002928	TTC	3	9	6723	6731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_002928	AGT	2	6	8017	8022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002928	CCG	2	6	8145	8150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_002928	CGG	2	6	8176	8181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_002928	GTT	2	6	10397	10402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002928	GAA	2	6	10479	10484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002928	CAG	2	6	11634	11639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_002928	GCT	2	6	20156	20161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_002928	ATA	2	6	20662	20667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002928	GGC	2	6	20675	20680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_002928	GAC	2	6	20716	20721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_002928	GCA	2	6	22088	22093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_002928	CGG	2	6	22106	22111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_002928	TGA	2	6	22133	22138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002928	GCC	2	6	22200	22205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_002928	CGG	2	6	22220	22225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_002928	CGT	2	6	22286	22291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_002928	CAG	2	6	22380	22385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_002928	GCA	2	6	22403	22408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_002928	GTC	2	6	22413	22418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_002928	TCG	2	6	22495	22500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_002928	GCA	2	6	22511	22516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_002928	TCG	2	6	22582	22587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_002928	CTG	2	6	22641	22646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_002928	CCA	2	6	22676	22681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_002928	GCG	2	6	22700	22705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_002928	TCG	2	6	22813	22818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002928	GCG	2	6	22910	22915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_002928	TCG	2	6	22954	22959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_002928	CGG	2	6	22982	22987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_002928	CGC	2	6	23040	23045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_002928	CAG	2	6	23199	23204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_002928	CGG	2	6	23232	23237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_002928	GCA	2	6	23279	23284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002928	CGG	2	6	23349	23354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_002928	GCC	2	6	23434	23439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_002928	CAG	3	9	23469	23477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_002928	GCA	2	6	23552	23557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_002928	GAT	2	6	23565	23570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002928	GCA	2	6	23643	23648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_002928	CGC	2	6	23757	23762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_002928	TCA	2	6	23769	23774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_002928	GCA	2	6	23835	23840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_002928	TGA	2	6	23865	23870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002928	GCG	3	9	23879	23887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_002928	GCG	2	6	23907	23912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_002928	CAC	2	6	23947	23952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_002928	GCA	2	6	23955	23960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_002928	GCG	2	6	23974	23979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_002928	GAT	2	6	24037	24042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002928	CAG	2	6	24079	24084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_002928	GTC	3	9	24136	24144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_002928	GCC	2	6	24232	24237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_002928	CAG	2	6	24247	24252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_002928	ATG	2	6	24284	24289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002928	GCG	4	12	24337	24348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_002928	GCG	2	6	26269	26274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_002928	TCG	2	6	26293	26298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_002928	GCA	2	6	28590	28595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_002928	GCC	2	6	28641	28646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_002928	CCG	2	6	28912	28917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_002928	ATT	2	6	28942	28947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002928	GCC	2	6	29033	29038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_002928	GCA	2	6	29561	29566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_002928	GTC	2	6	29575	29580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_002928	GGC	2	6	29587	29592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_002928	CGC	2	6	32244	32249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_002928	CAA	2	6	32273	32278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_002928	CGC	2	6	33532	33537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_002928	GCC	2	6	34106	34111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_002928	GCG	2	6	34142	34147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_002928	GCG	2	6	39008	39013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_002928	GGC	2	6	39089	39094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_002928	CCG	2	6	39108	39113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_002928	CTC	2	6	39121	39126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_002928	GCG	2	6	39163	39168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_002928	CAG	2	6	39303	39308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_002928	GCA	3	9	39326	39334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_002928	CGA	2	6	39404	39409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_002928	GTG	2	6	39427	39432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002928	GCG	2	6	39450	39455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_002928	GCG	2	6	39474	39479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_002928	ACC	2	6	39497	39502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_002928	GGC	2	6	39666	39671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_002928	AGC	2	6	39742	39747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_002928	GAT	2	6	39840	39845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002928	GTC	2	6	39876	39881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_002928	CGG	2	6	39937	39942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_002928	CCG	2	6	40060	40065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_002928	CGG	2	6	40071	40076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_002928	GTG	3	9	41558	41566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002928	TCG	2	6	41594	41599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_002928	ATG	2	6	41637	41642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002928	CTG	2	6	41795	41800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_002928	TGC	2	6	41888	41893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_002928	GCC	2	6	41972	41977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_002928	TTG	2	6	42080	42085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002928	CGG	2	6	42265	42270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_002928	CAG	2	6	42330	42335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_002928	TGA	2	6	43682	43687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002928	CGC	2	6	49684	49689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_002928	CGC	3	9	49691	49699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_002928	TGG	2	6	49719	49724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002928	CGG	2	6	49798	49803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_002928	CGC	2	6	50915	50920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_002928	AGA	2	6	50985	50990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002928	GCG	2	6	51493	51498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_002928	CGG	2	6	51526	51531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_002928	TTG	2	6	52018	52023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002928	GCG	2	6	52031	52036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_002928	CCG	2	6	52048	52053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_002928	GCC	2	6	52104	52109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_002928	TCG	2	6	57320	57325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_002928	TGC	2	6	62993	62998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_002928	GCG	2	6	63027	63032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_002928	GGC	2	6	63061	63066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_002928	AGC	2	6	63068	63073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_002928	CCG	2	6	63074	63079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_002928	TTG	2	6	63150	63155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002928	CTG	2	6	69098	69103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_002928	CGG	2	6	69117	69122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_002928	TCG	3	9	69169	69177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_002928	CGA	2	6	69179	69184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_002928	CGG	3	9	69269	69277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_002928	CAG	2	6	69698	69703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_002928	AGT	2	6	69775	69780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002928	TTG	2	6	69783	69788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_002928	GGC	2	6	69809	69814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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