MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 80871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002928	TCG	2	6	29	34	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594724
2	NC_002928	TGG	2	6	36	41	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594724
3	NC_002928	TGC	2	6	98	103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594724
4	NC_002928	GCG	2	6	200	205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594724
5	NC_002928	CGA	2	6	222	227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594724
6	NC_002928	CAG	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594724
7	NC_002928	GGT	2	6	402	407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594724
8	NC_002928	GTG	2	6	451	456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594724
9	NC_002928	GCC	2	6	584	589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594724
10	NC_002928	CGC	3	9	602	610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594724
11	NC_002928	AGC	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594724
12	NC_002928	ATC	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594724
13	NC_002928	CCA	2	6	941	946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594724
14	NC_002928	TTC	2	6	1099	1104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33594724
15	NC_002928	GGC	3	9	1140	1148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594724
16	NC_002928	CTG	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594724
17	NC_002928	GCC	2	6	1174	1179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594724
18	NC_002928	GCC	2	6	1358	1363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594724
19	NC_002928	TGG	2	6	1373	1378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594724
20	NC_002928	ACG	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594724
21	NC_002928	GCC	2	6	1483	1488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594724
22	NC_002928	CTG	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594724
23	NC_002928	CGA	2	6	1587	1592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594724
24	NC_002928	AGC	3	9	1721	1729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594724
25	NC_002928	ACG	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594724
26	NC_002928	CGG	2	6	1940	1945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594725
27	NC_002928	CAG	3	9	2004	2012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594725
28	NC_002928	GCT	2	6	2015	2020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594725
29	NC_002928	GCA	2	6	2099	2104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594725
30	NC_002928	CGC	2	6	2153	2158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594725
31	NC_002928	CGG	3	9	2198	2206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594725
32	NC_002928	GTG	2	6	2217	2222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594725
33	NC_002928	CAT	2	6	2228	2233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594725
34	NC_002928	GAA	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594725
35	NC_002928	GTG	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594725
36	NC_002928	GGT	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594725
37	NC_002928	TCG	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594725
38	NC_002928	TGG	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594725
39	NC_002928	GCG	2	6	2664	2669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594726
40	NC_002928	ACC	3	9	2678	2686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594726
41	NC_002928	AGC	2	6	2721	2726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594726
42	NC_002928	TGC	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594726
43	NC_002928	CCA	2	6	2763	2768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594726
44	NC_002928	CGG	2	6	2866	2871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594726
45	NC_002928	ACG	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594726
46	NC_002928	GCC	2	6	2957	2962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594726
47	NC_002928	GCT	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594726
48	NC_002928	TCA	2	6	3060	3065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594726
49	NC_002928	CAA	2	6	3145	3150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594726
50	NC_002928	TTG	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33594726
51	NC_002928	GCA	3	9	3205	3213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594726
52	NC_002928	CAC	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594726
53	NC_002928	GGT	2	6	3262	3267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594726
54	NC_002928	GTG	2	6	3317	3322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594726
55	NC_002928	GCC	2	6	3434	3439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594727
56	NC_002928	GGC	2	6	3484	3489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594727
57	NC_002928	CCA	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594727
58	NC_002928	TCG	2	6	3729	3734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594727
59	NC_002928	GGC	2	6	3757	3762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594727
60	NC_002928	CGT	2	6	3766	3771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594727
61	NC_002928	ACG	2	6	3861	3866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594727
62	NC_002928	GGC	2	6	3901	3906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594727
63	NC_002928	GCT	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594727
64	NC_002928	GCG	2	6	3945	3950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594727
65	NC_002928	GGC	2	6	3970	3975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594727
66	NC_002928	CGC	2	6	4017	4022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594727
67	NC_002928	GCG	2	6	4024	4029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594727
68	NC_002928	GCG	2	6	4041	4046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594727
69	NC_002928	CGG	2	6	4047	4052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594727
70	NC_002928	GCC	2	6	4130	4135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594727
71	NC_002928	AAG	2	6	4269	4274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594728
72	NC_002928	ACA	2	6	4333	4338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594728
73	NC_002928	CCG	2	6	4371	4376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594728
74	NC_002928	CAT	2	6	4481	4486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594728
75	NC_002928	ATC	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594728
76	NC_002928	AAG	2	6	4588	4593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594728
77	NC_002928	CGA	2	6	4619	4624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594728
78	NC_002928	CGC	2	6	4628	4633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594728
79	NC_002928	CGC	2	6	4701	4706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594728
80	NC_002928	CGA	2	6	4712	4717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594728
81	NC_002928	GCC	2	6	4740	4745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594728
82	NC_002928	CCA	2	6	4771	4776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594728
83	NC_002928	CTG	2	6	4782	4787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594728
84	NC_002928	TGC	2	6	4822	4827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594728
85	NC_002928	GCC	2	6	4878	4883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594728
86	NC_002928	CGC	2	6	4976	4981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594728
87	NC_002928	AAG	2	6	4989	4994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594728
88	NC_002928	ATC	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594728
89	NC_002928	GCT	2	6	5135	5140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594728
90	NC_002928	CGG	2	6	5211	5216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594729
91	NC_002928	GCG	2	6	5249	5254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594729
92	NC_002928	GGC	2	6	5292	5297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594729
93	NC_002928	GGC	2	6	5381	5386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594729
94	NC_002928	CGC	3	9	5400	5408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594729
95	NC_002928	CGA	2	6	5415	5420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594729
96	NC_002928	GGT	2	6	5514	5519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594729
97	NC_002928	GCT	2	6	5520	5525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594729
98	NC_002928	TGA	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594729
99	NC_002928	GCC	2	6	5680	5685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594729
100	NC_002928	CGC	2	6	5694	5699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594729
101	NC_002928	GCC	2	6	5779	5784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594729
102	NC_002928	GCT	2	6	5790	5795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594729
103	NC_002928	GCA	2	6	5814	5819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594729
104	NC_002928	GGT	2	6	5988	5993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594729
105	NC_002928	CGA	3	9	6042	6050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594729
106	NC_002928	GCC	2	6	6067	6072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594729
107	NC_002928	TGC	2	6	6101	6106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594729
108	NC_002928	ACG	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594730
109	NC_002928	CGG	2	6	6852	6857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594730
110	NC_002928	ACG	2	6	6863	6868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594730
111	NC_002928	CGG	2	6	6886	6891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594730
112	NC_002928	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594730
113	NC_002928	TGC	2	6	7051	7056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594730
114	NC_002928	TGG	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594730
115	NC_002928	CAT	2	6	7156	7161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594730
116	NC_002928	TGA	2	6	7189	7194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594730
117	NC_002928	GCT	2	6	7201	7206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594730
118	NC_002928	TGG	2	6	7212	7217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594730
119	NC_002928	CTG	2	6	7235	7240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594730
120	NC_002928	GGT	2	6	7450	7455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594730
121	NC_002928	GCG	2	6	7473	7478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594730
122	NC_002928	GAC	2	6	7531	7536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594730
123	NC_002928	GCT	2	6	7564	7569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594730
124	NC_002928	TGC	2	6	7605	7610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594730
125	NC_002928	GGC	2	6	7721	7726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594730
126	NC_002928	TTC	2	6	7739	7744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33594730
127	NC_002928	ACG	2	6	7775	7780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594730
128	NC_002928	CGG	2	6	7806	7811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594730
129	NC_002928	TGC	2	6	7824	7829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594730
130	NC_002928	GCT	2	6	7858	7863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594730
131	NC_002928	GAA	2	6	7880	7885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594730
132	NC_002928	CGT	2	6	7933	7938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594730
133	NC_002928	ATC	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594730
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164	NC_002928	CGC	2	6	9871	9876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594734
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256	NC_002928	CAA	2	6	15279	15284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594737
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499	NC_002928	CAT	2	6	32701	32706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594749
500	NC_002928	TGA	2	6	32734	32739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594749

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