MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 95890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002927	TCG	2	6	29	34	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598994
2	NC_002927	TGG	2	6	36	41	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33598994
3	NC_002927	TGC	2	6	98	103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598994
4	NC_002927	GCG	2	6	200	205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598994
5	NC_002927	CGA	2	6	222	227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598994
6	NC_002927	CAG	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598994
7	NC_002927	GGT	2	6	402	407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33598994
8	NC_002927	GTG	2	6	451	456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33598994
9	NC_002927	TCC	2	6	531	536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33598994
10	NC_002927	GCC	2	6	584	589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598994
11	NC_002927	CGC	3	9	602	610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598994
12	NC_002927	AGC	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598994
13	NC_002927	ATC	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33598994
14	NC_002927	CCA	2	6	941	946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33598994
15	NC_002927	TTC	2	6	1099	1104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33598994
16	NC_002927	GGC	3	9	1140	1148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598994
17	NC_002927	CTG	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598994
18	NC_002927	GCC	2	6	1174	1179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598994
19	NC_002927	GCC	2	6	1358	1363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598994
20	NC_002927	TGG	2	6	1373	1378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33598994
21	NC_002927	ACG	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598994
22	NC_002927	GCC	2	6	1483	1488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598994
23	NC_002927	CTG	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598994
24	NC_002927	CGA	2	6	1587	1592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598994
25	NC_002927	AGC	3	9	1721	1729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598994
26	NC_002927	ACG	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598994
27	NC_002927	CGG	2	6	1940	1945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598995
28	NC_002927	CAG	3	9	2004	2012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598995
29	NC_002927	GCT	2	6	2015	2020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598995
30	NC_002927	GCA	2	6	2099	2104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598995
31	NC_002927	GTG	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33598995
32	NC_002927	CAT	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33598995
33	NC_002927	GAA	2	6	2213	2218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33598995
34	NC_002927	GTG	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33598995
35	NC_002927	GGT	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33598995
36	NC_002927	TCG	2	6	2395	2400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598995
37	NC_002927	TGG	2	6	2482	2487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33598995
38	NC_002927	GCG	2	6	2604	2609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598996
39	NC_002927	ACC	3	9	2618	2626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33598996
40	NC_002927	AGC	2	6	2661	2666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598996
41	NC_002927	TGC	2	6	2670	2675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598996
42	NC_002927	CCA	2	6	2703	2708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33598996
43	NC_002927	CGG	2	6	2806	2811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598996
44	NC_002927	ACG	2	6	2814	2819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598996
45	NC_002927	GCC	2	6	2897	2902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598996
46	NC_002927	GCT	2	6	2962	2967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598996
47	NC_002927	TCA	2	6	3000	3005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33598996
48	NC_002927	CAA	2	6	3085	3090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33598996
49	NC_002927	TTG	2	6	3110	3115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33598996
50	NC_002927	GCA	3	9	3145	3153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598996
51	NC_002927	CAC	2	6	3196	3201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33598996
52	NC_002927	GGT	2	6	3202	3207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33598996
53	NC_002927	GTG	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33598996
54	NC_002927	GCC	2	6	3374	3379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598997
55	NC_002927	GGC	2	6	3424	3429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598997
56	NC_002927	CCA	2	6	3438	3443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33598997
57	NC_002927	TCG	2	6	3669	3674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598997
58	NC_002927	GGC	2	6	3697	3702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598997
59	NC_002927	CGT	2	6	3706	3711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598997
60	NC_002927	ACG	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598997
61	NC_002927	GGC	2	6	3841	3846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598997
62	NC_002927	GCT	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598997
63	NC_002927	GCG	2	6	3885	3890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598997
64	NC_002927	GGC	2	6	3910	3915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598997
65	NC_002927	CGC	2	6	3957	3962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598997
66	NC_002927	GCG	2	6	3964	3969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598997
67	NC_002927	GCG	2	6	3981	3986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598997
68	NC_002927	CGG	2	6	3987	3992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598997
69	NC_002927	GCC	2	6	4070	4075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598997
70	NC_002927	ACA	2	6	4273	4278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33598998
71	NC_002927	CCG	2	6	4311	4316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598998
72	NC_002927	CAT	2	6	4421	4426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33598998
73	NC_002927	ATC	2	6	4479	4484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33598998
74	NC_002927	AAG	2	6	4528	4533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33598998
75	NC_002927	CGA	2	6	4559	4564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598998
76	NC_002927	CGC	2	6	4568	4573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598998
77	NC_002927	CGC	2	6	4641	4646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598998
78	NC_002927	CGA	2	6	4652	4657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598998
79	NC_002927	GCC	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598998
80	NC_002927	CCA	2	6	4711	4716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33598998
81	NC_002927	CTG	2	6	4722	4727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598998
82	NC_002927	TGC	2	6	4762	4767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598998
83	NC_002927	GCC	2	6	4818	4823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598998
84	NC_002927	CGC	2	6	4916	4921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598998
85	NC_002927	AAG	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33598998
86	NC_002927	ATC	2	6	4984	4989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33598998
87	NC_002927	GCT	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598998
88	NC_002927	CGG	2	6	5151	5156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598999
89	NC_002927	GCG	2	6	5189	5194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598999
90	NC_002927	GGC	2	6	5232	5237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598999
91	NC_002927	GGC	2	6	5321	5326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33598999
92	NC_002927	CGC	3	9	5340	5348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598999
93	NC_002927	CGA	2	6	5355	5360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598999
94	NC_002927	GGT	2	6	5454	5459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33598999
95	NC_002927	GCT	2	6	5460	5465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598999
96	NC_002927	TGA	2	6	5576	5581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33598999
97	NC_002927	GCC	2	6	5620	5625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598999
98	NC_002927	CGC	2	6	5634	5639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598999
99	NC_002927	GCC	2	6	5719	5724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598999
100	NC_002927	GCT	2	6	5730	5735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598999
101	NC_002927	GCA	2	6	5754	5759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598999
102	NC_002927	GGT	2	6	5928	5933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33598999
103	NC_002927	CGA	3	9	5982	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33598999
104	NC_002927	GCC	2	6	6007	6012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33598999
105	NC_002927	TGC	2	6	6041	6046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33598999
106	NC_002927	GTT	2	6	6093	6098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33598999
107	NC_002927	ACG	2	6	6782	6787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599000
108	NC_002927	CGG	2	6	6792	6797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599000
109	NC_002927	ACG	2	6	6803	6808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599000
110	NC_002927	CGG	2	6	6826	6831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599000
111	NC_002927	GAA	2	6	6973	6978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599000
112	NC_002927	TGC	2	6	6991	6996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599000
113	NC_002927	TGG	2	6	7017	7022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599000
114	NC_002927	CAT	2	6	7096	7101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599000
115	NC_002927	TGA	2	6	7129	7134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599000
116	NC_002927	GCT	2	6	7141	7146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599000
117	NC_002927	TGG	2	6	7152	7157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599000
118	NC_002927	CTG	2	6	7175	7180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599000
119	NC_002927	GGT	2	6	7390	7395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599000
120	NC_002927	GCG	2	6	7413	7418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599000
121	NC_002927	GAC	2	6	7471	7476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599000
122	NC_002927	GCT	2	6	7504	7509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599000
123	NC_002927	TGC	2	6	7545	7550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599000
124	NC_002927	TTC	2	6	7679	7684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33599000
125	NC_002927	ACG	2	6	7715	7720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599000
126	NC_002927	CGG	2	6	7746	7751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599000
127	NC_002927	TGC	2	6	7764	7769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599000
128	NC_002927	GCT	2	6	7798	7803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599000
129	NC_002927	GAA	2	6	7820	7825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599000
130	NC_002927	CGT	2	6	7873	7878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599000
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132	NC_002927	TCG	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599001
133	NC_002927	TGG	2	6	8254	8259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599001
134	NC_002927	CGG	2	6	8279	8284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599001
135	NC_002927	GTC	2	6	8289	8294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599001
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500	NC_002927	CTT	2	6	30581	30586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33599019

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