MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 plasmid VRSAp

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002774	AATTT	2	10	589	598	40 %	60 %	0 %	0 %	14141824
2	NC_002774	CTTTT	2	10	1370	1379	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_002774	TATAA	2	10	2069	2078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002774	ACTGC	2	10	2093	2102	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_002774	TATTT	2	10	3138	3147	20 %	80 %	0 %	0 %	14141826
6	NC_002774	AGAAA	2	10	3319	3328	80 %	0 %	20 %	0 %	14141826
7	NC_002774	AATAA	2	10	5981	5990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002774	ATATA	2	10	6833	6842	60 %	40 %	0 %	0 %	14141831
9	NC_002774	CTATA	2	10	7145	7154	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_002774	ATTTC	2	10	7552	7561	20 %	60 %	0 %	20 %	14141833
11	NC_002774	AGTTA	2	10	9556	9565	40 %	40 %	20 %	0 %	14141838
12	NC_002774	AGTTA	2	10	9931	9940	40 %	40 %	20 %	0 %	14141838
13	NC_002774	AATTT	2	10	10555	10564	40 %	60 %	0 %	0 %	14141839
14	NC_002774	TTCTT	2	10	11335	11344	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_002774	TTATA	2	10	11347	11356	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002774	AGTTC	2	10	11810	11819	20 %	40 %	20 %	20 %	14141840
17	NC_002774	TTTAC	2	10	11822	11831	20 %	60 %	0 %	20 %	14141840
18	NC_002774	AAAAT	2	10	12416	12425	80 %	20 %	0 %	0 %	14141841
19	NC_002774	TGAAT	2	10	13384	13393	40 %	40 %	20 %	0 %	14141842
20	NC_002774	ATTGT	2	10	13706	13715	20 %	60 %	20 %	0 %	14141843
21	NC_002774	CTTTT	2	10	14079	14088	0 %	80 %	0 %	20 %	14141845
22	NC_002774	TATAT	2	10	15876	15885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002774	TTTCT	2	10	17250	17259	0 %	80 %	0 %	20 %	14141849
24	NC_002774	CCATA	2	10	18369	18378	40 %	20 %	0 %	40 %	14141849
25	NC_002774	TTAAG	2	10	20770	20779	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002774	ATTTG	2	10	21202	21211	20 %	60 %	20 %	0 %	14141854
27	NC_002774	AAAAG	2	10	22195	22204	80 %	0 %	20 %	0 %	14141855
28	NC_002774	TTATT	2	10	23526	23535	20 %	80 %	0 %	0 %	14141856

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.