MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 plasmid VRSAp

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002774	ATTT	2	8	382	389	25 %	75 %	0 %	0 %	14141824
2	NC_002774	TATG	2	8	431	438	25 %	50 %	25 %	0 %	14141824
3	NC_002774	AATG	2	8	474	481	50 %	25 %	25 %	0 %	14141824
4	NC_002774	TTTA	2	8	1869	1876	25 %	75 %	0 %	0 %	14141825
5	NC_002774	TGTT	2	8	1980	1987	0 %	75 %	25 %	0 %	14141825
6	NC_002774	TACT	2	8	2633	2640	25 %	50 %	0 %	25 %	14141826
7	NC_002774	TAAA	2	8	2723	2730	75 %	25 %	0 %	0 %	14141826
8	NC_002774	GAAA	2	8	2935	2942	75 %	0 %	25 %	0 %	14141826
9	NC_002774	AGAA	2	8	3056	3063	75 %	0 %	25 %	0 %	14141826
10	NC_002774	AAGT	2	8	3110	3117	50 %	25 %	25 %	0 %	14141826
11	NC_002774	GATA	2	8	3148	3155	50 %	25 %	25 %	0 %	14141826
12	NC_002774	GAAA	2	8	3183	3190	75 %	0 %	25 %	0 %	14141826
13	NC_002774	ACTA	2	8	3376	3383	50 %	25 %	0 %	25 %	14141826
14	NC_002774	ATCA	2	8	3446	3453	50 %	25 %	0 %	25 %	14141826
15	NC_002774	CAAA	2	8	3615	3622	75 %	0 %	0 %	25 %	14141826
16	NC_002774	TAGA	2	8	3947	3954	50 %	25 %	25 %	0 %	14141826
17	NC_002774	CGAA	2	8	4049	4056	50 %	0 %	25 %	25 %	14141826
18	NC_002774	AAGT	2	8	4523	4530	50 %	25 %	25 %	0 %	14141827
19	NC_002774	AATT	2	8	4589	4596	50 %	50 %	0 %	0 %	14141827
20	NC_002774	AAAT	2	8	4808	4815	75 %	25 %	0 %	0 %	14141827
21	NC_002774	TTTC	2	8	5563	5570	0 %	75 %	0 %	25 %	14141829
22	NC_002774	TGAT	2	8	6437	6444	25 %	50 %	25 %	0 %	14141830
23	NC_002774	GGGA	2	8	6549	6556	25 %	0 %	75 %	0 %	14141830
24	NC_002774	AGAA	2	8	7541	7548	75 %	0 %	25 %	0 %	14141833
25	NC_002774	TTCA	2	8	7721	7728	25 %	50 %	0 %	25 %	14141833
26	NC_002774	ACTC	2	8	8544	8551	25 %	25 %	0 %	50 %	14141835
27	NC_002774	TGTT	2	8	8553	8560	0 %	75 %	25 %	0 %	14141835
28	NC_002774	GTTC	2	8	8689	8696	0 %	50 %	25 %	25 %	14141835
29	NC_002774	TCTT	2	8	8951	8958	0 %	75 %	0 %	25 %	14141837
30	NC_002774	ATGT	2	8	9185	9192	25 %	50 %	25 %	0 %	14141837
31	NC_002774	TCAT	2	8	10100	10107	25 %	50 %	0 %	25 %	14141838
32	NC_002774	TAGT	2	8	10417	10424	25 %	50 %	25 %	0 %	14141839
33	NC_002774	TGTT	2	8	10440	10447	0 %	75 %	25 %	0 %	14141839
34	NC_002774	ATTT	2	8	10490	10497	25 %	75 %	0 %	0 %	14141839
35	NC_002774	ATTT	2	8	10597	10604	25 %	75 %	0 %	0 %	14141839
36	NC_002774	CTTA	2	8	10724	10731	25 %	50 %	0 %	25 %	14141839
37	NC_002774	TATT	2	8	10944	10951	25 %	75 %	0 %	0 %	14141839
38	NC_002774	ATCT	2	8	11748	11755	25 %	50 %	0 %	25 %	14141840
39	NC_002774	AGTA	2	8	12474	12481	50 %	25 %	25 %	0 %	14141841
40	NC_002774	TCTT	2	8	12946	12953	0 %	75 %	0 %	25 %	14141842
41	NC_002774	TATT	2	8	13106	13113	25 %	75 %	0 %	0 %	14141842
42	NC_002774	AATG	2	8	14287	14294	50 %	25 %	25 %	0 %	14141845
43	NC_002774	TCTT	2	8	14924	14931	0 %	75 %	0 %	25 %	14141846
44	NC_002774	ATGT	2	8	15158	15165	25 %	50 %	25 %	0 %	14141846
45	NC_002774	ACAT	2	8	16276	16283	50 %	25 %	0 %	25 %	14141847
46	NC_002774	GATT	2	8	16808	16815	25 %	50 %	25 %	0 %	14141848
47	NC_002774	AAGT	2	8	17434	17441	50 %	25 %	25 %	0 %	14141849
48	NC_002774	TTTC	2	8	18278	18285	0 %	75 %	0 %	25 %	14141849
49	NC_002774	ATTT	2	8	18662	18669	25 %	75 %	0 %	0 %	14141849
50	NC_002774	TAAA	2	8	18886	18893	75 %	25 %	0 %	0 %	14141850
51	NC_002774	AATC	2	8	19392	19399	50 %	25 %	0 %	25 %	14141851
52	NC_002774	TCTT	2	8	19691	19698	0 %	75 %	0 %	25 %	14141852
53	NC_002774	ATGT	2	8	19925	19932	25 %	50 %	25 %	0 %	14141852
54	NC_002774	AATT	2	8	20374	20381	50 %	50 %	0 %	0 %	14141853
55	NC_002774	ATAA	2	8	21369	21376	75 %	25 %	0 %	0 %	14141854
56	NC_002774	GTTT	2	8	21672	21679	0 %	75 %	25 %	0 %	14141855
57	NC_002774	ATTA	2	8	21703	21710	50 %	50 %	0 %	0 %	14141855
58	NC_002774	AAAG	2	8	22010	22017	75 %	0 %	25 %	0 %	14141855
59	NC_002774	TAAT	2	8	22125	22132	50 %	50 %	0 %	0 %	14141855
60	NC_002774	TATG	2	8	22816	22823	25 %	50 %	25 %	0 %	14141855
61	NC_002774	AATT	2	8	23457	23464	50 %	50 %	0 %	0 %	14141856
62	NC_002774	GGTT	2	8	24383	24390	0 %	50 %	50 %	0 %	14141857
63	NC_002774	TCTT	2	8	24503	24510	0 %	75 %	0 %	25 %	14141857
64	NC_002774	TTTA	2	8	24584	24591	25 %	75 %	0 %	0 %	14141857
65	NC_002774	TTAG	2	8	24627	24634	25 %	50 %	25 %	0 %	14141857
66	NC_002774	TCTT	2	8	24822	24829	0 %	75 %	0 %	25 %	14141857
67	NC_002774	TAAT	2	8	24873	24880	50 %	50 %	0 %	0 %	14141857
68	NC_002774	GTTT	2	8	24933	24940	0 %	75 %	25 %	0 %	14141857

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.