MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 plasmid VRSAp

Total Repeats: 314

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002774	TAT	2	6	311	316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141824
2	NC_002774	TTA	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141824
3	NC_002774	ATA	3	9	493	501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
4	NC_002774	TAA	2	6	518	523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
5	NC_002774	TAA	2	6	583	588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
6	NC_002774	TAA	2	6	623	628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
7	NC_002774	ACT	2	6	889	894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141824
8	NC_002774	ATG	2	6	907	912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141824
9	NC_002774	GAA	2	6	936	941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141824
10	NC_002774	TTA	2	6	997	1002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141824
11	NC_002774	TTA	2	6	1011	1016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141824
12	NC_002774	CAA	2	6	1034	1039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14141824
13	NC_002774	ATT	2	6	1054	1059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141824
14	NC_002774	AGA	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141824
15	NC_002774	TAA	2	6	1202	1207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
16	NC_002774	ACG	2	6	1208	1213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14141824
17	NC_002774	CTT	2	6	1231	1236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141824
18	NC_002774	AAT	2	6	1246	1251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
19	NC_002774	TCT	2	6	1744	1749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141825
20	NC_002774	TGC	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14141825
21	NC_002774	TTA	2	6	1795	1800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141825
22	NC_002774	TCA	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141825
23	NC_002774	ACC	2	6	1884	1889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14141825
24	NC_002774	TTA	2	6	1894	1899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141825
25	NC_002774	GTT	2	6	1904	1909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141825
26	NC_002774	CTT	2	6	1910	1915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141825
27	NC_002774	CAA	2	6	2255	2260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14141826
28	NC_002774	TGA	2	6	2292	2297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
29	NC_002774	CTC	2	6	2375	2380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14141826
30	NC_002774	AAT	2	6	2446	2451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141826
31	NC_002774	TTA	2	6	2488	2493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141826
32	NC_002774	GAT	2	6	2602	2607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
33	NC_002774	AAC	2	6	2611	2616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14141826
34	NC_002774	ATG	2	6	2699	2704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
35	NC_002774	TAA	2	6	2736	2741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141826
36	NC_002774	AAG	2	6	2780	2785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
37	NC_002774	AGA	2	6	2910	2915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
38	NC_002774	TTA	2	6	2982	2987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141826
39	NC_002774	AGA	2	6	3010	3015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
40	NC_002774	ATT	2	6	3039	3044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141826
41	NC_002774	ATT	2	6	3084	3089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141826
42	NC_002774	ATG	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
43	NC_002774	CAA	2	6	3349	3354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14141826
44	NC_002774	GAA	2	6	3402	3407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
45	NC_002774	TCA	3	9	3522	3530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141826
46	NC_002774	ATG	2	6	3539	3544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
47	NC_002774	TTG	2	6	3557	3562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141826
48	NC_002774	ATG	2	6	3638	3643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
49	NC_002774	AGA	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
50	NC_002774	TGA	3	9	3798	3806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
51	NC_002774	AAG	3	9	3914	3922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
52	NC_002774	ATC	2	6	4079	4084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141826
53	NC_002774	AGA	3	9	4091	4099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
54	NC_002774	ATT	2	6	4566	4571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141827
55	NC_002774	TAA	2	6	4620	4625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141827
56	NC_002774	AGG	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14141827
57	NC_002774	CTT	2	6	4705	4710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141827
58	NC_002774	TTG	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141827
59	NC_002774	AGA	2	6	4933	4938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141828
60	NC_002774	TGG	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14141828
61	NC_002774	TGA	2	6	5065	5070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141828
62	NC_002774	ACT	2	6	5176	5181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141829
63	NC_002774	TAT	2	6	5182	5187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141829
64	NC_002774	ATT	2	6	5336	5341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141829
65	NC_002774	CCA	2	6	5388	5393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14141829
66	NC_002774	ATT	2	6	5579	5584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141829
67	NC_002774	TTG	2	6	5612	5617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141829
68	NC_002774	CTT	2	6	5618	5623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141829
69	NC_002774	ATT	2	6	5633	5638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141829
70	NC_002774	TAC	2	6	5683	5688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141829
71	NC_002774	ATT	2	6	5786	5791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141829
72	NC_002774	TTA	3	9	5814	5822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141829
73	NC_002774	TAG	2	6	6077	6082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141830
74	NC_002774	ATT	2	6	6096	6101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141830
75	NC_002774	TTC	2	6	6245	6250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141830
76	NC_002774	TTC	2	6	6347	6352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141830
77	NC_002774	TTG	2	6	6398	6403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141830
78	NC_002774	ATT	2	6	6413	6418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141830
79	NC_002774	AAT	2	6	6696	6701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141830
80	NC_002774	CAT	2	6	6902	6907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141832
81	NC_002774	TAG	2	6	6919	6924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141832
82	NC_002774	TAT	2	6	6929	6934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141832
83	NC_002774	GTT	2	6	6953	6958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141832
84	NC_002774	AAT	2	6	6972	6977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141832
85	NC_002774	ATC	2	6	7175	7180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141833
86	NC_002774	GAA	2	6	7248	7253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141833
87	NC_002774	GTT	2	6	7348	7353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141833
88	NC_002774	TCT	2	6	7371	7376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141833
89	NC_002774	ATC	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141833
90	NC_002774	AGT	2	6	7424	7429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141833
91	NC_002774	AAT	2	6	7431	7436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141833
92	NC_002774	TAA	2	6	7445	7450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141833
93	NC_002774	TTA	2	6	7455	7460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141833
94	NC_002774	TAG	2	6	7507	7512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141833
95	NC_002774	ATA	3	9	7517	7525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141833
96	NC_002774	TTA	2	6	7584	7589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141833
97	NC_002774	ATC	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141833
98	NC_002774	TCA	2	6	7692	7697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141833
99	NC_002774	GTA	2	6	7755	7760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141833
100	NC_002774	TAA	2	6	7975	7980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141833
101	NC_002774	TCT	2	6	8007	8012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141833
102	NC_002774	AAT	2	6	8029	8034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141833
103	NC_002774	CAT	2	6	8047	8052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141833
104	NC_002774	TAA	2	6	8519	8524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141835
105	NC_002774	TTC	2	6	8568	8573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141835
106	NC_002774	TCA	2	6	8590	8595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141835
107	NC_002774	TAA	2	6	8700	8705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141835
108	NC_002774	TCA	2	6	8732	8737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141835
109	NC_002774	TCA	2	6	9253	9258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141837
110	NC_002774	TAA	2	6	9271	9276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141837
111	NC_002774	TTC	2	6	9292	9297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141837
112	NC_002774	ATG	2	6	9351	9356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141837
113	NC_002774	TAG	2	6	9421	9426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141837
114	NC_002774	TAA	2	6	9571	9576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141838
115	NC_002774	TAT	2	6	9582	9587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141838
116	NC_002774	TCT	2	6	9593	9598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141838
117	NC_002774	ATG	2	6	9631	9636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141838
118	NC_002774	TTG	2	6	9802	9807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141838
119	NC_002774	ATC	2	6	9814	9819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141838
120	NC_002774	TCT	2	6	9854	9859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141838
121	NC_002774	ATC	2	6	9919	9924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141838
122	NC_002774	ATC	2	6	9955	9960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141838
123	NC_002774	GTG	2	6	9975	9980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14141838
124	NC_002774	ATT	2	6	10045	10050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141838
125	NC_002774	CTA	2	6	10068	10073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141838
126	NC_002774	TTA	2	6	10079	10084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141838
127	NC_002774	ATA	2	6	10129	10134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141838
128	NC_002774	GTT	2	6	10162	10167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141838
129	NC_002774	ATT	2	6	10193	10198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141838
130	NC_002774	ATC	2	6	10544	10549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141839
131	NC_002774	AGA	2	6	10577	10582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141839
132	NC_002774	TAT	2	6	10591	10596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141839
133	NC_002774	TTG	2	6	10646	10651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141839
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.