MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 plasmid VRSAp

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002774	TA	3	6	86	91	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002774	AT	3	6	194	199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002774	AT	4	8	218	225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002774	TG	3	6	529	534	0 %	50 %	50 %	0 %	14141824
5	NC_002774	TA	3	6	2023	2028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002774	AG	3	6	2192	2197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002774	TA	3	6	2303	2308	50 %	50 %	0 %	0 %	14141826
8	NC_002774	AG	3	6	2515	2520	50 %	0 %	50 %	0 %	14141826
9	NC_002774	AG	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	14141826
10	NC_002774	AG	3	6	4104	4109	50 %	0 %	50 %	0 %	14141826
11	NC_002774	TA	3	6	4221	4226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002774	AT	3	6	4375	4380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002774	AT	3	6	5975	5980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002774	AT	3	6	6106	6111	50 %	50 %	0 %	0 %	14141830
15	NC_002774	AC	3	6	6214	6219	50 %	0 %	0 %	50 %	14141830
16	NC_002774	TC	3	6	6407	6412	0 %	50 %	0 %	50 %	14141830
17	NC_002774	TC	3	6	6619	6624	0 %	50 %	0 %	50 %	14141830
18	NC_002774	GA	3	6	7822	7827	50 %	0 %	50 %	0 %	14141833
19	NC_002774	TA	3	6	7991	7996	50 %	50 %	0 %	0 %	14141833
20	NC_002774	TA	3	6	8528	8533	50 %	50 %	0 %	0 %	14141835
21	NC_002774	TC	3	6	8609	8614	0 %	50 %	0 %	50 %	14141835
22	NC_002774	TA	3	6	8882	8887	50 %	50 %	0 %	0 %	14141837
23	NC_002774	AT	3	6	9389	9394	50 %	50 %	0 %	0 %	14141837
24	NC_002774	AT	3	6	9623	9628	50 %	50 %	0 %	0 %	14141838
25	NC_002774	AT	3	6	12497	12502	50 %	50 %	0 %	0 %	14141841
26	NC_002774	AT	5	10	12531	12540	50 %	50 %	0 %	0 %	14141841
27	NC_002774	AT	4	8	12805	12812	50 %	50 %	0 %	0 %	14141842
28	NC_002774	AT	4	8	12932	12939	50 %	50 %	0 %	0 %	14141842
29	NC_002774	AT	3	6	13317	13322	50 %	50 %	0 %	0 %	14141842
30	NC_002774	AT	3	6	13967	13972	50 %	50 %	0 %	0 %	14141844
31	NC_002774	TA	3	6	14114	14119	50 %	50 %	0 %	0 %	14141845
32	NC_002774	AT	3	6	14214	14219	50 %	50 %	0 %	0 %	14141845
33	NC_002774	TA	3	6	14855	14860	50 %	50 %	0 %	0 %	14141846
34	NC_002774	CG	3	6	15180	15185	0 %	0 %	50 %	50 %	14141846
35	NC_002774	AT	3	6	15217	15222	50 %	50 %	0 %	0 %	14141846
36	NC_002774	AT	3	6	15362	15367	50 %	50 %	0 %	0 %	14141846
37	NC_002774	CT	3	6	15835	15840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_002774	GA	3	6	15859	15864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002774	AT	3	6	16074	16079	50 %	50 %	0 %	0 %	14141847
40	NC_002774	AT	3	6	16219	16224	50 %	50 %	0 %	0 %	14141847
41	NC_002774	CG	3	6	16256	16261	0 %	0 %	50 %	50 %	14141847
42	NC_002774	TA	3	6	16581	16586	50 %	50 %	0 %	0 %	14141847
43	NC_002774	AT	3	6	17211	17216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002774	TA	3	6	17217	17222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002774	AT	3	6	17388	17393	50 %	50 %	0 %	0 %	14141849
46	NC_002774	TA	3	6	17611	17616	50 %	50 %	0 %	0 %	14141849
47	NC_002774	TA	3	6	17665	17670	50 %	50 %	0 %	0 %	14141849
48	NC_002774	TA	3	6	17931	17936	50 %	50 %	0 %	0 %	14141849
49	NC_002774	AT	3	6	18314	18319	50 %	50 %	0 %	0 %	14141849
50	NC_002774	TA	3	6	18414	18419	50 %	50 %	0 %	0 %	14141849
51	NC_002774	TA	3	6	18435	18440	50 %	50 %	0 %	0 %	14141849
52	NC_002774	TA	3	6	19622	19627	50 %	50 %	0 %	0 %	14141852
53	NC_002774	AT	3	6	20129	20134	50 %	50 %	0 %	0 %	14141852
54	NC_002774	AC	3	6	20571	20576	50 %	0 %	0 %	50 %	14141853
55	NC_002774	AT	5	10	20837	20846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002774	GA	3	6	20878	20883	50 %	0 %	50 %	0 %	14141854
57	NC_002774	TA	3	6	21044	21049	50 %	50 %	0 %	0 %	14141854
58	NC_002774	TA	3	6	21169	21174	50 %	50 %	0 %	0 %	14141854
59	NC_002774	AG	3	6	21731	21736	50 %	0 %	50 %	0 %	14141855
60	NC_002774	AT	3	6	21774	21779	50 %	50 %	0 %	0 %	14141855
61	NC_002774	CT	3	6	21781	21786	0 %	50 %	0 %	50 %	14141855
62	NC_002774	AT	3	6	23146	23151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002774	GA	3	6	23592	23597	50 %	0 %	50 %	0 %	14141856
64	NC_002774	TA	3	6	23913	23918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002774	TG	3	6	24200	24205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002774	AT	3	6	24642	24647	50 %	50 %	0 %	0 %	14141857
67	NC_002774	TA	3	6	24746	24751	50 %	50 %	0 %	0 %	14141857
68	NC_002774	AT	3	6	24901	24906	50 %	50 %	0 %	0 %	14141857

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.