MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 plasmid VRSAp

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002774	TG	3	6	529	534	0 %	50 %	50 %	0 %	14141824
2	NC_002774	TA	3	6	2303	2308	50 %	50 %	0 %	0 %	14141826
3	NC_002774	AG	3	6	2515	2520	50 %	0 %	50 %	0 %	14141826
4	NC_002774	AG	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	14141826
5	NC_002774	AG	3	6	4104	4109	50 %	0 %	50 %	0 %	14141826
6	NC_002774	AT	3	6	6106	6111	50 %	50 %	0 %	0 %	14141830
7	NC_002774	AC	3	6	6214	6219	50 %	0 %	0 %	50 %	14141830
8	NC_002774	TC	3	6	6407	6412	0 %	50 %	0 %	50 %	14141830
9	NC_002774	TC	3	6	6619	6624	0 %	50 %	0 %	50 %	14141830
10	NC_002774	GA	3	6	7822	7827	50 %	0 %	50 %	0 %	14141833
11	NC_002774	TA	3	6	7991	7996	50 %	50 %	0 %	0 %	14141833
12	NC_002774	TA	3	6	8528	8533	50 %	50 %	0 %	0 %	14141835
13	NC_002774	TC	3	6	8609	8614	0 %	50 %	0 %	50 %	14141835
14	NC_002774	TA	3	6	8882	8887	50 %	50 %	0 %	0 %	14141837
15	NC_002774	AT	3	6	9389	9394	50 %	50 %	0 %	0 %	14141837
16	NC_002774	AT	3	6	9623	9628	50 %	50 %	0 %	0 %	14141838
17	NC_002774	AT	3	6	12497	12502	50 %	50 %	0 %	0 %	14141841
18	NC_002774	AT	5	10	12531	12540	50 %	50 %	0 %	0 %	14141841
19	NC_002774	AT	4	8	12805	12812	50 %	50 %	0 %	0 %	14141842
20	NC_002774	AT	4	8	12932	12939	50 %	50 %	0 %	0 %	14141842
21	NC_002774	AT	3	6	13317	13322	50 %	50 %	0 %	0 %	14141842
22	NC_002774	AT	3	6	13967	13972	50 %	50 %	0 %	0 %	14141844
23	NC_002774	TA	3	6	14114	14119	50 %	50 %	0 %	0 %	14141845
24	NC_002774	AT	3	6	14214	14219	50 %	50 %	0 %	0 %	14141845
25	NC_002774	TA	3	6	14855	14860	50 %	50 %	0 %	0 %	14141846
26	NC_002774	CG	3	6	15180	15185	0 %	0 %	50 %	50 %	14141846
27	NC_002774	AT	3	6	15217	15222	50 %	50 %	0 %	0 %	14141846
28	NC_002774	AT	3	6	15362	15367	50 %	50 %	0 %	0 %	14141846
29	NC_002774	AT	3	6	16074	16079	50 %	50 %	0 %	0 %	14141847
30	NC_002774	AT	3	6	16219	16224	50 %	50 %	0 %	0 %	14141847
31	NC_002774	CG	3	6	16256	16261	0 %	0 %	50 %	50 %	14141847
32	NC_002774	TA	3	6	16581	16586	50 %	50 %	0 %	0 %	14141847
33	NC_002774	AT	3	6	17388	17393	50 %	50 %	0 %	0 %	14141849
34	NC_002774	TA	3	6	17611	17616	50 %	50 %	0 %	0 %	14141849
35	NC_002774	TA	3	6	17665	17670	50 %	50 %	0 %	0 %	14141849
36	NC_002774	TA	3	6	17931	17936	50 %	50 %	0 %	0 %	14141849
37	NC_002774	AT	3	6	18314	18319	50 %	50 %	0 %	0 %	14141849
38	NC_002774	TA	3	6	18414	18419	50 %	50 %	0 %	0 %	14141849
39	NC_002774	TA	3	6	18435	18440	50 %	50 %	0 %	0 %	14141849
40	NC_002774	TA	3	6	19622	19627	50 %	50 %	0 %	0 %	14141852
41	NC_002774	AT	3	6	20129	20134	50 %	50 %	0 %	0 %	14141852
42	NC_002774	AC	3	6	20571	20576	50 %	0 %	0 %	50 %	14141853
43	NC_002774	GA	3	6	20878	20883	50 %	0 %	50 %	0 %	14141854
44	NC_002774	TA	3	6	21044	21049	50 %	50 %	0 %	0 %	14141854
45	NC_002774	TA	3	6	21169	21174	50 %	50 %	0 %	0 %	14141854
46	NC_002774	AG	3	6	21731	21736	50 %	0 %	50 %	0 %	14141855
47	NC_002774	AT	3	6	21774	21779	50 %	50 %	0 %	0 %	14141855
48	NC_002774	CT	3	6	21781	21786	0 %	50 %	0 %	50 %	14141855
49	NC_002774	GA	3	6	23592	23597	50 %	0 %	50 %	0 %	14141856
50	NC_002774	AT	3	6	24642	24647	50 %	50 %	0 %	0 %	14141857
51	NC_002774	TA	3	6	24746	24751	50 %	50 %	0 %	0 %	14141857
52	NC_002774	AT	3	6	24901	24906	50 %	50 %	0 %	0 %	14141857

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.