MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 chromosome

Total Repeats: 37846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002758	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922991
2	NC_002758	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922991
3	NC_002758	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922991
4	NC_002758	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922991
5	NC_002758	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922991
6	NC_002758	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922991
7	NC_002758	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922991
8	NC_002758	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922991
9	NC_002758	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922991
10	NC_002758	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922991
11	NC_002758	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922991
12	NC_002758	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922991
13	NC_002758	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922991
14	NC_002758	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922991
15	NC_002758	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922991
16	NC_002758	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922991
17	NC_002758	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922991
18	NC_002758	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922991
19	NC_002758	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922991
20	NC_002758	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922991
21	NC_002758	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922991
22	NC_002758	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922991
23	NC_002758	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922991
24	NC_002758	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922991
25	NC_002758	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922991
26	NC_002758	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922991
27	NC_002758	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922991
28	NC_002758	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922991
29	NC_002758	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922991
30	NC_002758	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922992
31	NC_002758	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922992
32	NC_002758	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922992
33	NC_002758	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922992
34	NC_002758	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922992
35	NC_002758	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922992
36	NC_002758	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922992
37	NC_002758	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922992
38	NC_002758	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922992
39	NC_002758	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922992
40	NC_002758	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922992
41	NC_002758	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922992
42	NC_002758	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922992
43	NC_002758	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922992
44	NC_002758	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922992
45	NC_002758	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922992
46	NC_002758	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922992
47	NC_002758	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922992
48	NC_002758	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922992
49	NC_002758	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922992
50	NC_002758	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922992
51	NC_002758	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922992
52	NC_002758	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922992
53	NC_002758	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922993
54	NC_002758	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922993
55	NC_002758	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922993
56	NC_002758	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922993
57	NC_002758	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922993
58	NC_002758	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922994
59	NC_002758	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922994
60	NC_002758	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922994
61	NC_002758	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15922994
62	NC_002758	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922994
63	NC_002758	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922994
64	NC_002758	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922994
65	NC_002758	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922994
66	NC_002758	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922994
67	NC_002758	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922994
68	NC_002758	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922994
69	NC_002758	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922994
70	NC_002758	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922994
71	NC_002758	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922994
72	NC_002758	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922994
73	NC_002758	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922994
74	NC_002758	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922995
75	NC_002758	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922995
76	NC_002758	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922995
77	NC_002758	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922995
78	NC_002758	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15922995
79	NC_002758	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922995
80	NC_002758	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922995
81	NC_002758	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922995
82	NC_002758	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922995
83	NC_002758	CAG	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922995
84	NC_002758	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922995
85	NC_002758	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922995
86	NC_002758	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922995
87	NC_002758	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922995
88	NC_002758	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922995
89	NC_002758	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922995
90	NC_002758	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922995
91	NC_002758	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922995
92	NC_002758	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922995
93	NC_002758	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15922995
94	NC_002758	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922995
95	NC_002758	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922995
96	NC_002758	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922995
97	NC_002758	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922995
98	NC_002758	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922995
99	NC_002758	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922995
100	NC_002758	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922995
101	NC_002758	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922995
102	NC_002758	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922996
103	NC_002758	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922996
104	NC_002758	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15922996
105	NC_002758	TAA	2	6	7421	7426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922996
106	NC_002758	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922996
107	NC_002758	CCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15922996
108	NC_002758	GGA	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15922996
109	NC_002758	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922996
110	NC_002758	GAA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922996
111	NC_002758	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922996
112	NC_002758	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922996
113	NC_002758	CAT	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922996
114	NC_002758	TTA	2	6	8038	8043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922996
115	NC_002758	AAG	2	6	8050	8055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922996
116	NC_002758	ATT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922996
117	NC_002758	GTT	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15922996
118	NC_002758	AGA	2	6	8094	8099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922996
119	NC_002758	ATT	2	6	8184	8189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922996
120	NC_002758	CAA	2	6	8238	8243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15922996
121	NC_002758	TTA	2	6	8346	8351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15922996
122	NC_002758	TGA	2	6	8384	8389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922996
123	NC_002758	TAC	2	6	8398	8403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15922996
124	NC_002758	TGA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922996
125	NC_002758	TCG	2	6	8453	8458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15922996
126	NC_002758	AGA	2	6	8492	8497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922996
127	NC_002758	AGA	2	6	8513	8518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922996
128	NC_002758	ATA	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15922996
129	NC_002758	GTG	2	6	8593	8598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922996
130	NC_002758	GTG	2	6	8602	8607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15922996
131	NC_002758	GAA	2	6	8628	8633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15922996
132	NC_002758	ATG	2	6	8788	8793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15922996
133	NC_002758	CTT	2	6	8843	8848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15922996
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260	NC_002758	CAT	2	6	17615	17620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15923003
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262	NC_002758	AAC	2	6	17696	17701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15923003
263	NC_002758	TAC	2	6	17740	17745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15923003
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268	NC_002758	ATT	2	6	18036	18041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15923003
269	NC_002758	TAT	2	6	18055	18060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15923003
270	NC_002758	ACT	2	6	18248	18253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15923003
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273	NC_002758	TCA	2	6	18372	18377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15923004
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280	NC_002758	TTA	2	6	18942	18947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15923004
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285	NC_002758	ACG	2	6	19471	19476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15923004
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