MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CDC1551 chromosome

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002755	ACCGCG	2	12	31070	31081	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002755	CGTCGG	2	12	66680	66691	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002755	CAACGG	2	12	76200	76211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_002755	TCACCT	2	12	80384	80395	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_002755	GCGGTG	2	12	104732	104743	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_002755	CTCGGT	2	12	149363	149374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_002755	GCCGCG	2	12	181100	181111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_002755	CGCAGA	2	12	183800	183811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002755	GGTGCT	2	12	184301	184312	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_002755	CGGCGT	2	12	184313	184324	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_002755	GCGGTA	2	12	318462	318473	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_002755	AGATTC	2	12	330472	330483	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_002755	TGCCGC	2	12	339086	339097	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_002755	ATAGTC	2	12	544405	544416	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_002755	ACCAGT	2	12	592350	592361	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_002755	GGCCCG	2	12	684969	684980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_002755	CCGGCT	2	12	691820	691831	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_002755	TGCCGC	2	12	691848	691859	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_002755	CGAGAC	2	12	701461	701472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002755	GGCCGG	2	12	713370	713381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_002755	GTGGGT	2	12	771258	771269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002755	GGCGAA	2	12	786777	786788	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_002755	CGATGA	2	12	815144	815155	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_002755	ACCGGG	2	12	871998	872009	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_002755	ACAGCA	2	12	909388	909399	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_002755	CTGGGT	2	12	924227	924238	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_002755	ACGAAC	2	12	945806	945817	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_002755	GGCCAT	2	12	951055	951066	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_002755	TCGGGT	2	12	965559	965570	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_002755	GATCGA	2	12	1029397	1029408	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_002755	GACTGC	2	12	1033801	1033812	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_002755	CGCCGG	2	12	1052665	1052676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_002755	CTACAA	2	12	1092518	1092529	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_002755	GGCGCA	2	12	1094464	1094475	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_002755	GGCGCA	2	12	1096571	1096582	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_002755	TTGGTG	2	12	1151803	1151814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002755	TAGCCA	2	12	1196456	1196467	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002755	GCCGGT	2	12	1212521	1212532	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_002755	CCGGTG	2	12	1213881	1213892	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_002755	GCAGCC	2	12	1218777	1218788	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_002755	AGTTAC	2	12	1221462	1221473	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_002755	CGTGGT	2	12	1231212	1231223	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_002755	GTCTTC	2	12	1271943	1271954	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_002755	GTCGGC	2	12	1273108	1273119	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002755	TCGGCC	2	12	1273971	1273982	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_002755	GTTGGT	2	12	1352620	1352631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002755	CCGAGT	2	12	1419279	1419290	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_002755	CACGCG	2	12	1526190	1526201	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_002755	ATATTC	2	12	1561217	1561228	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_002755	ACCCCG	2	12	1573089	1573100	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_002755	CACCGC	2	12	1618828	1618839	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_002755	TTGGGG	2	12	1709005	1709016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002755	GGCGCC	2	12	1726508	1726519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_002755	TGGTTC	2	12	1734330	1734341	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_002755	ACATCG	2	12	1764894	1764905	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_002755	CGAGTG	2	12	1780970	1780981	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_002755	GGCGCC	2	12	1827195	1827206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_002755	CCGGCT	2	12	1839370	1839381	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_002755	CGCCGG	2	12	1987833	1987844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_002755	GCTGAA	2	12	1989631	1989642	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_002755	GGCGGT	2	12	1989823	1989834	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_002755	CGCGGC	2	12	1998076	1998087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_002755	TGGGTG	2	12	1999395	1999406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002755	TTCGGC	2	12	2053022	2053033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_002755	AGAGGG	2	12	2072986	2072997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002755	GGCGAT	2	12	2077965	2077976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_002755	TCGACG	2	12	2078225	2078236	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_002755	GCTGTA	2	12	2078788	2078799	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_002755	CACATC	2	12	2079409	2079420	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_002755	GGCCAT	2	12	2157676	2157687	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_002755	CCGGAG	2	12	2221536	2221547	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_002755	CGGTTG	2	12	2228201	2228212	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_002755	TCACGA	2	12	2348512	2348523	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_002755	ATAGAA	2	12	2367833	2367844	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002755	CAGCTG	2	12	2420717	2420728	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_002755	CCGCTG	2	12	2428793	2428804	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_002755	CGCCCG	2	12	2468655	2468666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_002755	CCGGTC	2	12	2500416	2500427	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002755	GCCGTT	2	12	2524722	2524733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_002755	CGTAGC	2	12	2538815	2538826	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_002755	CTGGAC	2	12	2600765	2600776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_002755	GCAACC	2	12	2627963	2627974	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002755	ACCAGC	2	12	2700688	2700699	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_002755	GAGGTC	2	12	2715739	2715750	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_002755	CCGGCA	2	12	2729787	2729798	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_002755	TCAAAC	2	12	2789725	2789736	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_002755	CGGAAG	2	12	2949353	2949364	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_002755	ATGCCG	2	12	2962929	2962940	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_002755	CGACTC	2	12	2976339	2976350	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_002755	CATATT	2	12	3009930	3009941	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_002755	CCGGCA	2	12	3073783	3073794	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_002755	GACATC	2	12	3116750	3116761	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_002755	ACCCTC	2	12	3131432	3131443	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_002755	AGCCGC	2	12	3177318	3177329	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_002755	CGCGCC	2	12	3284036	3284047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_002755	TCGCCG	2	12	3285652	3285663	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_002755	TCGCCG	2	12	3285709	3285720	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_002755	CGCCAC	2	12	3301729	3301740	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_002755	TCCGAA	2	12	3320277	3320288	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_002755	TCGCAC	2	12	3389104	3389115	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_002755	CGCCGG	2	12	3400885	3400896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_002755	ACCAAC	2	12	3431387	3431398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_002755	CCGTTG	2	12	3453085	3453096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_002755	TCGACG	2	12	3622983	3622994	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_002755	GAAGGC	2	12	3727270	3727281	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_002755	GGCCGC	2	12	3729056	3729067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_002755	GCGCCG	2	12	3729204	3729215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_002755	CGTTGC	2	12	3730390	3730401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_002755	CCCGAA	2	12	3737380	3737391	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002755	AGGTTG	2	12	3737510	3737521	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002755	CGTTGC	2	12	3737541	3737552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_002755	TGCCGG	2	12	3738965	3738976	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_002755	TGCCGA	2	12	3739151	3739162	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_002755	GCCCGC	2	12	3739539	3739550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_002755	GGTGTT	2	12	3740562	3740573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002755	TGCCGG	2	12	3740747	3740758	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_002755	AGGTTG	2	12	3741067	3741078	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002755	TCCCGG	2	12	3742562	3742573	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_002755	TGCCGG	2	12	3742592	3742603	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_002755	AACCCG	2	12	3743162	3743173	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_002755	CAGCGG	2	12	3743442	3743453	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_002755	GGTGTT	2	12	3744084	3744095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002755	TGCCGG	2	12	3744329	3744340	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_002755	CCCGAT	2	12	3744411	3744422	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002755	CCGAAA	2	12	3744580	3744591	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.