MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis CDC1551 chromosome

Total Repeats: 11314

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002755	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	15839373
2	NC_002755	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	15839373
3	NC_002755	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	15839373
4	NC_002755	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	15839373
5	NC_002755	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	15839373
6	NC_002755	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_002755	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	15839374
8	NC_002755	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	15839374
9	NC_002755	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	15839374
10	NC_002755	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	15839374
11	NC_002755	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	15839374
12	NC_002755	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	15839374
13	NC_002755	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	15839375
14	NC_002755	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	15839375
15	NC_002755	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	15839375
16	NC_002755	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	15839375
17	NC_002755	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	15839377
18	NC_002755	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	15839377
19	NC_002755	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	15839377
20	NC_002755	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	15839377
21	NC_002755	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	15839377
22	NC_002755	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	15839378
23	NC_002755	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	15839378
24	NC_002755	CGAG	2	8	8456	8463	25 %	0 %	50 %	25 %	15839378
25	NC_002755	CCAC	2	8	8986	8993	25 %	0 %	0 %	75 %	15839378
26	NC_002755	CGAC	2	8	9355	9362	25 %	0 %	25 %	50 %	15839378
27	NC_002755	GGTT	2	8	9583	9590	0 %	50 %	50 %	0 %	15839378
28	NC_002755	CCCG	2	8	10132	10139	0 %	0 %	25 %	75 %	15839379
29	NC_002755	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	15839380
30	NC_002755	GAGC	2	8	12092	12099	25 %	0 %	50 %	25 %	15839381
31	NC_002755	CTCA	2	8	12303	12310	25 %	25 %	0 %	50 %	15839381
32	NC_002755	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_002755	AACC	2	8	13338	13345	50 %	0 %	0 %	50 %	15839384
34	NC_002755	CCCG	2	8	13447	13454	0 %	0 %	25 %	75 %	15839384
35	NC_002755	ATTC	2	8	13691	13698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_002755	ACCC	2	8	14098	14105	25 %	0 %	0 %	75 %	15839386
37	NC_002755	TGAT	2	8	14135	14142	25 %	50 %	25 %	0 %	15839386
38	NC_002755	TGCT	2	8	14182	14189	0 %	50 %	25 %	25 %	15839386
39	NC_002755	GCCC	2	8	14669	14676	0 %	0 %	25 %	75 %	15839386
40	NC_002755	GGGC	2	8	15450	15457	0 %	0 %	75 %	25 %	15839387
41	NC_002755	CTGA	2	8	15905	15912	25 %	25 %	25 %	25 %	15839388
42	NC_002755	TGGC	2	8	16048	16055	0 %	25 %	50 %	25 %	15839388
43	NC_002755	GCTT	2	8	16107	16114	0 %	50 %	25 %	25 %	15839388
44	NC_002755	CAGT	2	8	16135	16142	25 %	25 %	25 %	25 %	15839388
45	NC_002755	CGGT	2	8	16506	16513	0 %	25 %	50 %	25 %	15839388
46	NC_002755	GCCG	2	8	16565	16572	0 %	0 %	50 %	50 %	15839388
47	NC_002755	CGGG	2	8	17800	17807	0 %	0 %	75 %	25 %	15839389
48	NC_002755	CTGG	2	8	17908	17915	0 %	25 %	50 %	25 %	15839389
49	NC_002755	GTGC	2	8	18408	18415	0 %	25 %	50 %	25 %	15839389
50	NC_002755	GCCG	2	8	18426	18433	0 %	0 %	50 %	50 %	15839389
51	NC_002755	CCGC	2	8	18791	18798	0 %	0 %	25 %	75 %	15839390
52	NC_002755	GCCG	2	8	20255	20262	0 %	0 %	50 %	50 %	15839391
53	NC_002755	CCAG	2	8	20743	20750	25 %	0 %	25 %	50 %	15839391
54	NC_002755	CACC	2	8	20926	20933	25 %	0 %	0 %	75 %	15839391
55	NC_002755	CGGG	2	8	21882	21889	0 %	0 %	75 %	25 %	15839392
56	NC_002755	GCCG	2	8	21973	21980	0 %	0 %	50 %	50 %	15839392
57	NC_002755	GCTG	2	8	22353	22360	0 %	25 %	50 %	25 %	15839392
58	NC_002755	CGGC	2	8	22373	22380	0 %	0 %	50 %	50 %	15839392
59	NC_002755	GCCG	2	8	23044	23051	0 %	0 %	50 %	50 %	15839392
60	NC_002755	CCCA	2	8	23056	23063	25 %	0 %	0 %	75 %	15839392
61	NC_002755	GCTG	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	15839394
62	NC_002755	CGGC	2	8	24243	24250	0 %	0 %	50 %	50 %	15839394
63	NC_002755	GCCG	2	8	24343	24350	0 %	0 %	50 %	50 %	15839394
64	NC_002755	CGGG	2	8	24418	24425	0 %	0 %	75 %	25 %	15839394
65	NC_002755	TCAA	2	8	25496	25503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_002755	GAGC	2	8	25524	25531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_002755	GGCC	2	8	25538	25545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_002755	GCTC	2	8	26487	26494	0 %	25 %	25 %	50 %	15839395
69	NC_002755	CCAA	2	8	26704	26711	50 %	0 %	0 %	50 %	15839395
70	NC_002755	CAGC	2	8	26770	26777	25 %	0 %	25 %	50 %	15839395
71	NC_002755	CGGC	2	8	27590	27597	0 %	0 %	50 %	50 %	15839397
72	NC_002755	CCGG	2	8	28076	28083	0 %	0 %	50 %	50 %	15839397
73	NC_002755	GCTC	2	8	28632	28639	0 %	25 %	25 %	50 %	15839398
74	NC_002755	TGCG	2	8	28771	28778	0 %	25 %	50 %	25 %	15839398
75	NC_002755	CCGG	2	8	29036	29043	0 %	0 %	50 %	50 %	15839398
76	NC_002755	CGTC	2	8	29367	29374	0 %	25 %	25 %	50 %	15839399
77	NC_002755	CACG	2	8	29726	29733	25 %	0 %	25 %	50 %	15839400
78	NC_002755	ACCG	2	8	29807	29814	25 %	0 %	25 %	50 %	15839400
79	NC_002755	CCGG	2	8	30126	30133	0 %	0 %	50 %	50 %	15839400
80	NC_002755	GTCG	2	8	30302	30309	0 %	25 %	50 %	25 %	15839400
81	NC_002755	ACCA	2	8	31105	31112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_002755	CGAG	2	8	31436	31443	25 %	0 %	50 %	25 %	15839401
83	NC_002755	CGAC	2	8	31733	31740	25 %	0 %	25 %	50 %	15839402
84	NC_002755	GCCG	2	8	32423	32430	0 %	0 %	50 %	50 %	15839404
85	NC_002755	CCGA	2	8	33412	33419	25 %	0 %	25 %	50 %	15839406
86	NC_002755	GCTA	2	8	33799	33806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_002755	GGCC	2	8	34547	34554	0 %	0 %	50 %	50 %	15839409
88	NC_002755	ATCG	2	8	35040	35047	25 %	25 %	25 %	25 %	15839409
89	NC_002755	GATC	2	8	35378	35385	25 %	25 %	25 %	25 %	15839409
90	NC_002755	CCAC	2	8	36199	36206	25 %	0 %	0 %	75 %	15839409
91	NC_002755	ACCG	2	8	36593	36600	25 %	0 %	25 %	50 %	15839410
92	NC_002755	CTGG	2	8	36937	36944	0 %	25 %	50 %	25 %	15839411
93	NC_002755	GCAT	2	8	37332	37339	25 %	25 %	25 %	25 %	15839412
94	NC_002755	GCTG	2	8	37846	37853	0 %	25 %	50 %	25 %	15839412
95	NC_002755	AACG	2	8	38601	38608	50 %	0 %	25 %	25 %	15839412
96	NC_002755	CCGA	2	8	38662	38669	25 %	0 %	25 %	50 %	15839412
97	NC_002755	CCAC	2	8	38818	38825	25 %	0 %	0 %	75 %	15839412
98	NC_002755	CAGC	2	8	39045	39052	25 %	0 %	25 %	50 %	15839413
99	NC_002755	CCGG	2	8	39541	39548	0 %	0 %	50 %	50 %	15839413
100	NC_002755	GGCC	2	8	40072	40079	0 %	0 %	50 %	50 %	15839414
101	NC_002755	CGAT	2	8	40522	40529	25 %	25 %	25 %	25 %	15839414
102	NC_002755	GCCG	2	8	40822	40829	0 %	0 %	50 %	50 %	15839414
103	NC_002755	CACC	2	8	40847	40854	25 %	0 %	0 %	75 %	15839414
104	NC_002755	ACCG	2	8	41070	41077	25 %	0 %	25 %	50 %	15839414
105	NC_002755	GCGT	2	8	41096	41103	0 %	25 %	50 %	25 %	15839414
106	NC_002755	CCAC	2	8	41825	41832	25 %	0 %	0 %	75 %	15839415
107	NC_002755	CGAT	2	8	41834	41841	25 %	25 %	25 %	25 %	15839415
108	NC_002755	GGCC	2	8	42530	42537	0 %	0 %	50 %	50 %	15839417
109	NC_002755	CCCG	2	8	43121	43128	0 %	0 %	25 %	75 %	15839417
110	NC_002755	CGGG	2	8	43150	43157	0 %	0 %	75 %	25 %	15839417
111	NC_002755	CGAC	2	8	43789	43796	25 %	0 %	25 %	50 %	15839418
112	NC_002755	GAGC	2	8	44169	44176	25 %	0 %	50 %	25 %	15839418
113	NC_002755	GGGC	2	8	45328	45335	0 %	0 %	75 %	25 %	15839418
114	NC_002755	CGGC	2	8	45423	45430	0 %	0 %	50 %	50 %	15839418
115	NC_002755	GCCG	2	8	46386	46393	0 %	0 %	50 %	50 %	15839418
116	NC_002755	TTGC	2	8	46550	46557	0 %	50 %	25 %	25 %	15839419
117	NC_002755	CCGC	2	8	46698	46705	0 %	0 %	25 %	75 %	15839419
118	NC_002755	CCGC	2	8	46731	46738	0 %	0 %	25 %	75 %	15839419
119	NC_002755	GGTC	2	8	46839	46846	0 %	25 %	50 %	25 %	15839419
120	NC_002755	CTAC	2	8	47163	47170	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_002755	CGGG	2	8	47390	47397	0 %	0 %	75 %	25 %	15839420
122	NC_002755	GCAG	2	8	47463	47470	25 %	0 %	50 %	25 %	15839420
123	NC_002755	GTGC	2	8	48363	48370	0 %	25 %	50 %	25 %	15839421
124	NC_002755	GCCG	2	8	48647	48654	0 %	0 %	50 %	50 %	15839421
125	NC_002755	CAGC	2	8	49832	49839	25 %	0 %	25 %	50 %	15839422
126	NC_002755	CGGG	2	8	50021	50028	0 %	0 %	75 %	25 %	15839423
127	NC_002755	GCCG	2	8	50121	50128	0 %	0 %	50 %	50 %	15839423
128	NC_002755	GGTG	2	8	50444	50451	0 %	25 %	75 %	0 %	15839423
129	NC_002755	CTCA	2	8	51060	51067	25 %	25 %	0 %	50 %	15839423
130	NC_002755	CGCT	2	8	51199	51206	0 %	25 %	25 %	50 %	15839424
131	NC_002755	GGTA	2	8	52065	52072	25 %	25 %	50 %	0 %	15839425
132	NC_002755	CTGG	2	8	52660	52667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_002755	GCCG	2	8	53514	53521	0 %	0 %	50 %	50 %	15839427
134	NC_002755	ACCA	2	8	53685	53692	50 %	0 %	0 %	50 %	15839427
135	NC_002755	GTGC	2	8	54570	54577	0 %	25 %	50 %	25 %	15839427
136	NC_002755	ACCG	2	8	55448	55455	25 %	0 %	25 %	50 %	15839427
137	NC_002755	CCCG	2	8	55610	55617	0 %	0 %	25 %	75 %	15839427
138	NC_002755	GGCC	2	8	56284	56291	0 %	0 %	50 %	50 %	15839428
139	NC_002755	CGCT	2	8	57011	57018	0 %	25 %	25 %	50 %	15839428
140	NC_002755	GCGG	2	8	58768	58775	0 %	0 %	75 %	25 %	15839431
141	NC_002755	GTTC	2	8	58987	58994	0 %	50 %	25 %	25 %	15839431
142	NC_002755	AGCG	2	8	59192	59199	25 %	0 %	50 %	25 %	15839432
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144	NC_002755	GCGG	2	8	59946	59953	0 %	0 %	75 %	25 %	15839434
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