MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis CDC1551 chromosome

Total Repeats: 83345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002755	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839373
2	NC_002755	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839373
3	NC_002755	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
4	NC_002755	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
5	NC_002755	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839373
6	NC_002755	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
7	NC_002755	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839373
8	NC_002755	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839373
9	NC_002755	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
10	NC_002755	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839373
11	NC_002755	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
12	NC_002755	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839373
13	NC_002755	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839373
14	NC_002755	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839373
15	NC_002755	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
16	NC_002755	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15839373
17	NC_002755	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839373
18	NC_002755	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
19	NC_002755	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839373
20	NC_002755	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
21	NC_002755	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839373
22	NC_002755	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839373
23	NC_002755	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839373
24	NC_002755	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839373
25	NC_002755	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_002755	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_002755	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_002755	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_002755	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_002755	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002755	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002755	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_002755	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_002755	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_002755	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839374
36	NC_002755	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839374
37	NC_002755	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839374
38	NC_002755	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839374
39	NC_002755	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839374
40	NC_002755	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15839374
41	NC_002755	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839374
42	NC_002755	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839374
43	NC_002755	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839374
44	NC_002755	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839374
45	NC_002755	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839374
46	NC_002755	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839374
47	NC_002755	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839374
48	NC_002755	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15839374
49	NC_002755	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839374
50	NC_002755	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839374
51	NC_002755	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839374
52	NC_002755	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839374
53	NC_002755	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839375
54	NC_002755	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839375
55	NC_002755	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839375
56	NC_002755	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839375
57	NC_002755	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839375
58	NC_002755	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839375
59	NC_002755	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839375
60	NC_002755	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839375
61	NC_002755	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839375
62	NC_002755	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839375
63	NC_002755	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15839375
64	NC_002755	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839375
65	NC_002755	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839375
66	NC_002755	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839375
67	NC_002755	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839375
68	NC_002755	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839375
69	NC_002755	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839375
70	NC_002755	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839375
71	NC_002755	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839375
72	NC_002755	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839375
73	NC_002755	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839375
74	NC_002755	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839375
75	NC_002755	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839375
76	NC_002755	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839376
77	NC_002755	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839376
78	NC_002755	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839376
79	NC_002755	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839376
80	NC_002755	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839376
81	NC_002755	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839376
82	NC_002755	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839376
83	NC_002755	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002755	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002755	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002755	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_002755	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839377
88	NC_002755	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15839377
89	NC_002755	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839377
90	NC_002755	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839377
91	NC_002755	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839377
92	NC_002755	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839377
93	NC_002755	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839377
94	NC_002755	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839377
95	NC_002755	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839377
96	NC_002755	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839377
97	NC_002755	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15839377
98	NC_002755	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839377
99	NC_002755	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839377
100	NC_002755	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839377
101	NC_002755	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839377
102	NC_002755	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839377
103	NC_002755	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839377
104	NC_002755	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839377
105	NC_002755	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839377
106	NC_002755	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839377
107	NC_002755	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839377
108	NC_002755	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839377
109	NC_002755	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839377
110	NC_002755	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839377
111	NC_002755	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839377
112	NC_002755	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839377
113	NC_002755	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15839377
114	NC_002755	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839377
115	NC_002755	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839377
116	NC_002755	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839377
117	NC_002755	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839377
118	NC_002755	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839377
119	NC_002755	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839378
120	NC_002755	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839378
121	NC_002755	CAG	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839378
122	NC_002755	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839378
123	NC_002755	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839378
124	NC_002755	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839378
125	NC_002755	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839378
126	NC_002755	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839378
127	NC_002755	ACG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839378
128	NC_002755	CTG	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839378
129	NC_002755	GGC	2	6	7836	7841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839378
130	NC_002755	CGC	2	6	7870	7875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839378
131	NC_002755	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839378
132	NC_002755	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839378
133	NC_002755	CCG	2	6	7990	7995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839378
134	NC_002755	TCG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839378
135	NC_002755	GTT	2	6	8067	8072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839378
136	NC_002755	AGA	2	6	8078	8083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15839378
137	NC_002755	TCA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839378
138	NC_002755	GGT	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839378
139	NC_002755	TCG	2	6	8344	8349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839378
140	NC_002755	ACC	2	6	8401	8406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839378
141	NC_002755	GCG	2	6	8423	8428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839378
142	NC_002755	CAC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839378
143	NC_002755	GCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839378
144	NC_002755	CGA	2	6	8582	8587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839378
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146	NC_002755	CAT	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839378
147	NC_002755	CGA	2	6	8657	8662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839378
148	NC_002755	CGA	2	6	8741	8746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839378
149	NC_002755	CGA	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839378
150	NC_002755	ATC	2	6	8793	8798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839378
151	NC_002755	CGA	2	6	8819	8824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839378
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153	NC_002755	CGG	2	6	8918	8923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839378
154	NC_002755	GAC	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839378
155	NC_002755	TCG	2	6	8962	8967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839378
156	NC_002755	CTT	2	6	8972	8977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15839378
157	NC_002755	TTC	2	6	9006	9011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15839378
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159	NC_002755	GCA	2	6	9080	9085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839378
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162	NC_002755	CTG	3	9	9312	9320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839378
163	NC_002755	CGA	2	6	9422	9427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839378
164	NC_002755	GCT	2	6	9431	9436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839378
165	NC_002755	CGT	2	6	9446	9451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839378
166	NC_002755	CTG	2	6	9468	9473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839378
167	NC_002755	CGG	2	6	9536	9541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839378
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174	NC_002755	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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248	NC_002755	CAT	2	6	14604	14609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839386
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252	NC_002755	GCT	2	6	14716	14721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839386
253	NC_002755	GAA	2	6	14788	14793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15839386
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257	NC_002755	GCC	2	6	15034	15039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839387
258	NC_002755	GCA	2	6	15133	15138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839387
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