MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Sulfolobus solfataricus P2 chromosome

Total Repeats: 1161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002754	TAAAAT	2	12	855	866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896973
2	NC_002754	AAGGAT	2	12	2041	2052	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15896974
3	NC_002754	ACTTTT	2	12	6498	6509	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15896980
4	NC_002754	TGTAGT	2	12	7914	7925	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15896981
5	NC_002754	AGTTGA	2	12	18145	18156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896990
6	NC_002754	AGGAAA	2	12	18231	18242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896990
7	NC_002754	GTAGAT	2	12	24093	24104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896997
8	NC_002754	AATGCA	2	12	24826	24837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15896998
9	NC_002754	AAACTT	2	12	24886	24897	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15896998
10	NC_002754	ATACTT	2	12	30087	30098	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897003
11	NC_002754	CTTTCA	2	12	35238	35249	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15897009
12	NC_002754	AAGAGG	2	12	35930	35941	50 %	0 %	50 %	0 %	15897011
13	NC_002754	AATATT	2	12	36544	36555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002754	CACGGC	2	12	37000	37011	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15897012
15	NC_002754	CACGTT	2	12	37560	37571	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15897013
16	NC_002754	TTGGAT	2	12	40184	40195	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15897014
17	NC_002754	TATAAT	2	12	41233	41244	50 %	50 %	0 %	0 %	15897015
18	NC_002754	ATTTCT	2	12	41851	41862	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15897017
19	NC_002754	GGTGCA	2	12	44037	44048	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15897020
20	NC_002754	CCTTAA	2	12	44621	44632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897021
21	NC_002754	ATAAGG	2	12	66749	66760	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897047
22	NC_002754	TCTAGT	2	12	68144	68155	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15897049
23	NC_002754	AGATGA	2	12	70599	70610	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897052
24	NC_002754	CACTAT	2	12	70878	70889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897052
25	NC_002754	AAACAT	2	12	73851	73862	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15897054
26	NC_002754	CAAATC	2	12	74370	74381	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15897055
27	NC_002754	AGTCTT	2	12	75017	75028	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15897055
28	NC_002754	TGGATC	2	12	75262	75273	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15897055
29	NC_002754	TATTTT	2	12	76867	76878	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15897057
30	NC_002754	GAATTG	2	12	82403	82414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897061
31	NC_002754	GAGAAA	2	12	82883	82894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15897062
32	NC_002754	GAGAAT	2	12	83411	83422	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897062
33	NC_002754	TATTAC	2	12	88305	88316	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897068
34	NC_002754	AAATGA	2	12	90158	90169	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15897070
35	NC_002754	TTTTCA	2	12	92295	92306	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15897072
36	NC_002754	CATCTA	2	12	94191	94202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897073
37	NC_002754	TTAACG	2	12	96396	96407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15897077
38	NC_002754	TAAAAT	2	12	101556	101567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897081
39	NC_002754	TAAAGG	2	12	104004	104015	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897083
40	NC_002754	ATCTTA	2	12	107647	107658	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897086
41	NC_002754	AGTCCT	2	12	112996	113007	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15897093
42	NC_002754	CACATC	2	12	113218	113229	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15897093
43	NC_002754	CAGCTG	2	12	115214	115225	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_002754	TTTCTC	2	12	119495	119506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897097
45	NC_002754	GCAGAG	2	12	124416	124427	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_002754	AATGAG	2	12	129114	129125	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897104
47	NC_002754	AGAGGA	2	12	129327	129338	50 %	0 %	50 %	0 %	15897104
48	NC_002754	AATTCC	2	12	129940	129951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897105
49	NC_002754	TGCAAC	2	12	130531	130542	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15897106
50	NC_002754	AGGAGA	2	12	134714	134725	50 %	0 %	50 %	0 %	15897112
51	NC_002754	TCCATT	2	12	137112	137123	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_002754	AAACTC	2	12	138261	138272	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_002754	GCATAA	2	12	142203	142214	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15897120
54	NC_002754	TAATGT	2	12	145152	145163	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15897124
55	NC_002754	ATTGAT	2	12	147445	147456	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15897129
56	NC_002754	GAAATA	2	12	148402	148413	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15897129
57	NC_002754	GTGAAA	2	12	148964	148975	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897129
58	NC_002754	GAGGCT	2	12	150362	150373	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15897130
59	NC_002754	AAGCTG	2	12	153324	153335	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15897132
60	NC_002754	ATGTGA	2	12	159770	159781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897137
61	NC_002754	CTTTCT	2	12	162916	162927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897140
62	NC_002754	TATAGC	2	12	165700	165711	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15897143
63	NC_002754	AAACAT	2	12	166224	166235	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15897143
64	NC_002754	GAACTT	2	12	172617	172628	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15897149
65	NC_002754	AGTTGA	2	12	174244	174255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897151
66	NC_002754	CTATGC	2	12	174531	174542	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15897152
67	NC_002754	CTAAAT	2	12	175711	175722	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15897152
68	NC_002754	AGCTAG	2	12	178548	178559	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15897157
69	NC_002754	CTATAA	2	12	179699	179710	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15897158
70	NC_002754	CTCAAC	2	12	182759	182770	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15897161
71	NC_002754	CTTAAA	2	12	183694	183705	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15897162
72	NC_002754	ACTTAT	2	12	183765	183776	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897162
73	NC_002754	CTCTTT	2	12	186695	186706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897164
74	NC_002754	CTATTA	2	12	186863	186874	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897164
75	NC_002754	ATTACA	2	12	188098	188109	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_002754	TAATTG	2	12	192532	192543	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15897171
77	NC_002754	TATTCT	2	12	193344	193355	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15897172
78	NC_002754	TCTTAC	2	12	193969	193980	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15897172
79	NC_002754	TAATCT	2	12	195537	195548	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897173
80	NC_002754	TTTCTC	2	12	196334	196345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897173
81	NC_002754	GGATTA	2	12	198987	198998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897175
82	NC_002754	GTAAGG	2	12	199785	199796	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15897178
83	NC_002754	GTTCAT	2	12	200619	200630	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_002754	TCCAGA	2	12	201401	201412	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15897180
85	NC_002754	TACATA	2	12	204080	204091	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15897183
86	NC_002754	AGAAAA	2	12	208216	208227	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15897186
87	NC_002754	GCTCCT	2	12	214718	214729	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15897192
88	NC_002754	TCGTAA	2	12	220999	221010	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15897200
89	NC_002754	TTTATT	2	12	222709	222720	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002754	CTAGTG	2	12	223858	223869	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15897202
91	NC_002754	ACTTCA	2	12	226107	226118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897205
92	NC_002754	TTAATA	2	12	229772	229783	50 %	50 %	0 %	0 %	15897211
93	NC_002754	AAATTG	2	12	231777	231788	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15897214
94	NC_002754	GAAAAT	2	12	232642	232653	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15897214
95	NC_002754	CTTTTT	2	12	235584	235595	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15897219
96	NC_002754	TAGAGA	2	12	240612	240623	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897225
97	NC_002754	ATGAGA	2	12	240780	240791	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897225
98	NC_002754	ATTGGA	2	12	242105	242116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897226
99	NC_002754	ATCGTT	2	12	243101	243112	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15897228
100	NC_002754	CCTAAA	2	12	251016	251027	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15897238
101	NC_002754	TAAGAG	2	12	251919	251930	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897239
102	NC_002754	TCCTAA	2	12	255167	255178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897242
103	NC_002754	CATCCA	2	12	258935	258946	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15897246
104	NC_002754	TAGTAT	2	12	260534	260545	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15897248
105	NC_002754	AAGAGA	2	12	264152	264163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15897252
106	NC_002754	TGACAT	2	12	264783	264794	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15897253
107	NC_002754	CAAAAA	2	12	264862	264873	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	15897253
108	NC_002754	GTATTC	2	12	268785	268796	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15897256
109	NC_002754	ACATTT	2	12	269146	269157	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897256
110	NC_002754	TATTAG	2	12	269820	269831	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15897256
111	NC_002754	ATTGCT	2	12	274610	274621	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15897261
112	NC_002754	GAGTAG	2	12	274630	274641	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15897261
113	NC_002754	AAATGA	2	12	275197	275208	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15897261
114	NC_002754	TTAGCT	2	12	278516	278527	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15897265
115	NC_002754	TATAGG	2	12	279594	279605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002754	CATTTC	2	12	283868	283879	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15897269
117	NC_002754	ACTTAC	2	12	287665	287676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897272
118	NC_002754	TATACT	2	12	290077	290088	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897274
119	NC_002754	TCAGTA	2	12	290708	290719	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_002754	AAGGTT	2	12	290851	290862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002754	TAGCAT	2	12	293334	293345	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15897276
122	NC_002754	GGCTCT	2	12	295031	295042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15897278
123	NC_002754	TCTATA	2	12	295705	295716	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897278
124	NC_002754	CTTGAG	2	12	297226	297237	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15897281
125	NC_002754	TCTTTC	2	12	300505	300516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897287
126	NC_002754	TAGGTG	2	12	304723	304734	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15897293
127	NC_002754	TGGAGT	2	12	309276	309287	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15897298
128	NC_002754	CTGGTA	2	12	312260	312271	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15897301
129	NC_002754	CAACTG	2	12	314737	314748	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15897304
130	NC_002754	CGGTGT	2	12	315322	315333	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15897305
131	NC_002754	TTTGGT	2	12	324559	324570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15897314
132	NC_002754	TTACCT	2	12	327715	327726	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15897316
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134	NC_002754	CTATAA	2	12	328300	328311	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15897317
135	NC_002754	AAGATG	2	12	330863	330874	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002754	CCTTAG	2	12	332483	332494	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15897320
137	NC_002754	ACTGTA	2	12	335379	335390	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15897321
138	NC_002754	CTTTTT	2	12	338693	338704	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_002754	AGGGGT	2	12	339690	339701	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	15897323
140	NC_002754	GTGATT	2	12	340761	340772	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15897323
141	NC_002754	GGCTTC	2	12	342088	342099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15897324
142	NC_002754	CTTTTA	2	12	343786	343797	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15897327
143	NC_002754	CCTCTC	2	12	346001	346012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15897328
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147	NC_002754	GTTGAA	2	12	355567	355578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897339
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157	NC_002754	TGTTCT	2	12	364609	364620	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15897351
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164	NC_002754	TTCATA	2	12	379895	379906	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
165	NC_002754	CTATCC	2	12	382713	382724	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15897373
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170	NC_002754	CATTAA	2	12	389949	389960	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15897381
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194	NC_002754	AATTAG	2	12	442541	442552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15897433
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198	NC_002754	CGTATA	2	12	448857	448868	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15897443
199	NC_002754	AACGTG	2	12	451998	452009	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15897448
200	NC_002754	AATATT	2	12	452829	452840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_002754	ATCTAC	2	12	460453	460464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897455
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215	NC_002754	ATAACT	2	12	504932	504943	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15897493
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220	NC_002754	AATGGC	2	12	516346	516357	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15897507
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226	NC_002754	TTATAT	2	12	537268	537279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
227	NC_002754	GAAGTT	2	12	537883	537894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897534
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234	NC_002754	TAGAAT	2	12	556603	556614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15897554
235	NC_002754	TTACCA	2	12	566362	566373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897565
236	NC_002754	CTATCC	2	12	568981	568992	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15897568
237	NC_002754	TTCATA	2	12	577741	577752	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897579
238	NC_002754	CAATAC	2	12	578239	578250	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15897580
239	NC_002754	TCTATA	2	12	579611	579622	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897582
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241	NC_002754	CACATA	2	12	582744	582755	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15897586
242	NC_002754	CATAAA	2	12	586392	586403	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15897589
243	NC_002754	TTGGTA	2	12	589814	589825	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15897590
244	NC_002754	ATTGCC	2	12	591112	591123	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15897591
245	NC_002754	ATCGCT	2	12	591652	591663	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15897591
246	NC_002754	AGTATA	2	12	591918	591929	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15897592
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252	NC_002754	ATTAAA	2	12	598450	598461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_002754	CTCTAT	2	12	601574	601585	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15897602
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259	NC_002754	CTCTTC	2	12	613784	613795	0 %	50 %	0 %	50 %	15897625
260	NC_002754	AGCTGC	2	12	617177	617188	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15897626
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291	NC_002754	TGAATA	2	12	690773	690784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
292	NC_002754	CTTTTA	2	12	692359	692370	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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348	NC_002754	CATAGC	2	12	843526	843537	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15897864
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350	NC_002754	TATAAT	2	12	844593	844604	50 %	50 %	0 %	0 %	15897864
351	NC_002754	GGAATA	2	12	851495	851506	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897869
352	NC_002754	GGCTAT	2	12	854897	854908	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15897873
353	NC_002754	GCTTGT	2	12	856352	856363	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15897874
354	NC_002754	CAACTT	2	12	856692	856703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
355	NC_002754	CCACAA	2	12	856799	856810	50 %	0 %	0 %	50 %	15897875
356	NC_002754	ATTAGC	2	12	858920	858931	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15897876
357	NC_002754	CACTAA	2	12	859142	859153	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15897877
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359	NC_002754	AGTTGA	2	12	862613	862624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897880
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451	NC_002754	CCTCTT	2	12	1089236	1089247	0 %	50 %	0 %	50 %	15898106
452	NC_002754	CTTATC	2	12	1093983	1093994	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15898112
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454	NC_002754	ATTCCA	2	12	1096722	1096733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15898115
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456	NC_002754	ATCTGG	2	12	1104679	1104690	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15898121
457	NC_002754	AATATC	2	12	1113890	1113901	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15898131
458	NC_002754	TATACC	2	12	1115733	1115744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15898131
459	NC_002754	TCTCAC	2	12	1119621	1119632	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15898134
460	NC_002754	ATGTTA	2	12	1125579	1125590	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15898139
461	NC_002754	CAAGTT	2	12	1129353	1129364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
462	NC_002754	GAATTT	2	12	1133252	1133263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15898145
463	NC_002754	TACCAG	2	12	1143676	1143687	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15898155
464	NC_002754	TTCCGC	2	12	1146436	1146447	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
465	NC_002754	AAAATA	2	12	1153766	1153777	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_002754	AAGATG	2	12	1156326	1156337	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15898167
467	NC_002754	TTTAGA	2	12	1157307	1157318	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15898168
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469	NC_002754	TGCTTG	2	12	1168499	1168510	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15898176
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