MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Sulfolobus solfataricus P2 chromosome

Total Repeats: 988

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002754	TAAAAT	2	12	855	866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896973
2	NC_002754	AAGGAT	2	12	2041	2052	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15896974
3	NC_002754	ACTTTT	2	12	6498	6509	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15896980
4	NC_002754	TGTAGT	2	12	7914	7925	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15896981
5	NC_002754	AGTTGA	2	12	18145	18156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896990
6	NC_002754	AGGAAA	2	12	18231	18242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896990
7	NC_002754	GTAGAT	2	12	24093	24104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896997
8	NC_002754	AATGCA	2	12	24826	24837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15896998
9	NC_002754	AAACTT	2	12	24886	24897	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15896998
10	NC_002754	ATACTT	2	12	30087	30098	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897003
11	NC_002754	CTTTCA	2	12	35238	35249	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15897009
12	NC_002754	AAGAGG	2	12	35930	35941	50 %	0 %	50 %	0 %	15897011
13	NC_002754	CACGGC	2	12	37000	37011	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15897012
14	NC_002754	CACGTT	2	12	37560	37571	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15897013
15	NC_002754	TTGGAT	2	12	40184	40195	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15897014
16	NC_002754	TATAAT	2	12	41233	41244	50 %	50 %	0 %	0 %	15897015
17	NC_002754	ATTTCT	2	12	41851	41862	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15897017
18	NC_002754	GGTGCA	2	12	44037	44048	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15897020
19	NC_002754	CCTTAA	2	12	44621	44632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897021
20	NC_002754	ATAAGG	2	12	66749	66760	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897047
21	NC_002754	TCTAGT	2	12	68144	68155	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15897049
22	NC_002754	AGATGA	2	12	70599	70610	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897052
23	NC_002754	CACTAT	2	12	70878	70889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897052
24	NC_002754	AAACAT	2	12	73851	73862	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15897054
25	NC_002754	CAAATC	2	12	74370	74381	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15897055
26	NC_002754	AGTCTT	2	12	75017	75028	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15897055
27	NC_002754	TGGATC	2	12	75262	75273	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15897055
28	NC_002754	TATTTT	2	12	76867	76878	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15897057
29	NC_002754	GAATTG	2	12	82403	82414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897061
30	NC_002754	GAGAAA	2	12	82883	82894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15897062
31	NC_002754	GAGAAT	2	12	83411	83422	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897062
32	NC_002754	TATTAC	2	12	88305	88316	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897068
33	NC_002754	AAATGA	2	12	90158	90169	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15897070
34	NC_002754	TTTTCA	2	12	92295	92306	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15897072
35	NC_002754	CATCTA	2	12	94191	94202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897073
36	NC_002754	TTAACG	2	12	96396	96407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15897077
37	NC_002754	TAAAAT	2	12	101556	101567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897081
38	NC_002754	TAAAGG	2	12	104004	104015	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897083
39	NC_002754	ATCTTA	2	12	107647	107658	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897086
40	NC_002754	AGTCCT	2	12	112996	113007	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15897093
41	NC_002754	CACATC	2	12	113218	113229	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15897093
42	NC_002754	TTTCTC	2	12	119495	119506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897097
43	NC_002754	AATGAG	2	12	129114	129125	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897104
44	NC_002754	AGAGGA	2	12	129327	129338	50 %	0 %	50 %	0 %	15897104
45	NC_002754	AATTCC	2	12	129940	129951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897105
46	NC_002754	TGCAAC	2	12	130531	130542	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15897106
47	NC_002754	AGGAGA	2	12	134714	134725	50 %	0 %	50 %	0 %	15897112
48	NC_002754	GCATAA	2	12	142203	142214	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15897120
49	NC_002754	TAATGT	2	12	145152	145163	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15897124
50	NC_002754	ATTGAT	2	12	147445	147456	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15897129
51	NC_002754	GAAATA	2	12	148402	148413	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15897129
52	NC_002754	GTGAAA	2	12	148964	148975	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897129
53	NC_002754	GAGGCT	2	12	150362	150373	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15897130
54	NC_002754	AAGCTG	2	12	153324	153335	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15897132
55	NC_002754	ATGTGA	2	12	159770	159781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897137
56	NC_002754	CTTTCT	2	12	162916	162927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897140
57	NC_002754	TATAGC	2	12	165700	165711	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15897143
58	NC_002754	AAACAT	2	12	166224	166235	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15897143
59	NC_002754	GAACTT	2	12	172617	172628	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15897149
60	NC_002754	AGTTGA	2	12	174244	174255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897151
61	NC_002754	CTATGC	2	12	174531	174542	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15897152
62	NC_002754	CTAAAT	2	12	175711	175722	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15897152
63	NC_002754	AGCTAG	2	12	178548	178559	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15897157
64	NC_002754	CTATAA	2	12	179699	179710	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15897158
65	NC_002754	CTCAAC	2	12	182759	182770	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15897161
66	NC_002754	CTTAAA	2	12	183694	183705	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15897162
67	NC_002754	ACTTAT	2	12	183765	183776	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897162
68	NC_002754	CTCTTT	2	12	186695	186706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897164
69	NC_002754	CTATTA	2	12	186863	186874	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897164
70	NC_002754	TAATTG	2	12	192532	192543	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15897171
71	NC_002754	TATTCT	2	12	193344	193355	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15897172
72	NC_002754	TCTTAC	2	12	193969	193980	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15897172
73	NC_002754	TAATCT	2	12	195537	195548	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897173
74	NC_002754	TTTCTC	2	12	196334	196345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897173
75	NC_002754	GGATTA	2	12	198987	198998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897175
76	NC_002754	GTAAGG	2	12	199785	199796	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15897178
77	NC_002754	TCCAGA	2	12	201401	201412	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15897180
78	NC_002754	TACATA	2	12	204080	204091	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15897183
79	NC_002754	AGAAAA	2	12	208216	208227	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15897186
80	NC_002754	GCTCCT	2	12	214718	214729	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15897192
81	NC_002754	TCGTAA	2	12	220999	221010	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15897200
82	NC_002754	CTAGTG	2	12	223858	223869	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15897202
83	NC_002754	ACTTCA	2	12	226107	226118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897205
84	NC_002754	TTAATA	2	12	229772	229783	50 %	50 %	0 %	0 %	15897211
85	NC_002754	AAATTG	2	12	231777	231788	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15897214
86	NC_002754	GAAAAT	2	12	232642	232653	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15897214
87	NC_002754	CTTTTT	2	12	235584	235595	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15897219
88	NC_002754	TAGAGA	2	12	240612	240623	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897225
89	NC_002754	ATGAGA	2	12	240780	240791	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897225
90	NC_002754	ATTGGA	2	12	242105	242116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897226
91	NC_002754	ATCGTT	2	12	243101	243112	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15897228
92	NC_002754	CCTAAA	2	12	251016	251027	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15897238
93	NC_002754	TAAGAG	2	12	251919	251930	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15897239
94	NC_002754	TCCTAA	2	12	255167	255178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897242
95	NC_002754	CATCCA	2	12	258935	258946	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15897246
96	NC_002754	TAGTAT	2	12	260534	260545	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15897248
97	NC_002754	AAGAGA	2	12	264152	264163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15897252
98	NC_002754	TGACAT	2	12	264783	264794	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15897253
99	NC_002754	CAAAAA	2	12	264862	264873	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	15897253
100	NC_002754	GTATTC	2	12	268785	268796	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15897256
101	NC_002754	ACATTT	2	12	269146	269157	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897256
102	NC_002754	TATTAG	2	12	269820	269831	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15897256
103	NC_002754	ATTGCT	2	12	274610	274621	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15897261
104	NC_002754	GAGTAG	2	12	274630	274641	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15897261
105	NC_002754	AAATGA	2	12	275197	275208	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15897261
106	NC_002754	TTAGCT	2	12	278516	278527	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15897265
107	NC_002754	CATTTC	2	12	283868	283879	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15897269
108	NC_002754	ACTTAC	2	12	287665	287676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897272
109	NC_002754	TATACT	2	12	290077	290088	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897274
110	NC_002754	TAGCAT	2	12	293334	293345	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15897276
111	NC_002754	GGCTCT	2	12	295031	295042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15897278
112	NC_002754	TCTATA	2	12	295705	295716	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15897278
113	NC_002754	CTTGAG	2	12	297226	297237	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15897281
114	NC_002754	TCTTTC	2	12	300505	300516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897287
115	NC_002754	TAGGTG	2	12	304723	304734	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15897293
116	NC_002754	TGGAGT	2	12	309276	309287	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15897298
117	NC_002754	CTGGTA	2	12	312260	312271	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15897301
118	NC_002754	CAACTG	2	12	314737	314748	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15897304
119	NC_002754	CGGTGT	2	12	315322	315333	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15897305
120	NC_002754	TTTGGT	2	12	324559	324570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15897314
121	NC_002754	TTACCT	2	12	327715	327726	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15897316
122	NC_002754	CTATAA	2	12	328300	328311	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15897317
123	NC_002754	CCTTAG	2	12	332483	332494	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15897320
124	NC_002754	ACTGTA	2	12	335379	335390	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15897321
125	NC_002754	AGGGGT	2	12	339690	339701	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	15897323
126	NC_002754	GTGATT	2	12	340761	340772	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15897323
127	NC_002754	GGCTTC	2	12	342088	342099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15897324
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131	NC_002754	CTATTC	2	12	350617	350628	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15897333
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233	NC_002754	ACCCTT	2	12	612061	612072	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15897623
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235	NC_002754	CTCTTC	2	12	613784	613795	0 %	50 %	0 %	50 %	15897625
236	NC_002754	AGCTGC	2	12	617177	617188	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15897626
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351	NC_002754	TACCAA	2	12	937636	937647	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15897946
352	NC_002754	TATCAA	2	12	938487	938498	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15897946
353	NC_002754	TCACTT	2	12	940278	940289	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15897948
354	NC_002754	TACCTA	2	12	944081	944092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897953
355	NC_002754	AATAGC	2	12	944556	944567	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15897953
356	NC_002754	AGTAAA	2	12	946757	946768	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15897956
357	NC_002754	TTCATC	2	12	948186	948197	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15897958
358	NC_002754	TCTATT	2	12	949075	949086	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15897958
359	NC_002754	ACTTCC	2	12	949696	949707	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15897959
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368	NC_002754	CTGTTA	2	12	979425	979436	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15897997
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372	NC_002754	TACACT	2	12	986357	986368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15898001
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374	NC_002754	AACTTC	2	12	988996	989007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15898004
375	NC_002754	TTCTAG	2	12	1002165	1002176	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15898017
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380	NC_002754	TTAACG	2	12	1017074	1017085	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15898028
381	NC_002754	CATTAT	2	12	1020019	1020030	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15898030
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392	NC_002754	ACGTTT	2	12	1048318	1048329	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15898062
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434	NC_002754	GCAGTT	2	12	1204125	1204136	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15898208
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440	NC_002754	AGGTAG	2	12	1228978	1228989	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15898230
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449	NC_002754	TTTACG	2	12	1267111	1267122	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15898252
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453	NC_002754	GGTAAG	2	12	1278376	1278387	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15898264
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455	NC_002754	CAATGA	2	12	1287870	1287881	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15898273
456	NC_002754	AGTTCA	2	12	1290596	1290607	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15898276
457	NC_002754	CTTTTT	2	12	1291398	1291409	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15898276
458	NC_002754	GTGAAG	2	12	1296233	1296244	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15898282
459	NC_002754	TCTCTA	2	12	1296290	1296301	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15898282
460	NC_002754	CACATC	2	12	1301131	1301142	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15898284
461	NC_002754	CTTTTC	2	12	1317241	1317252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15898291
462	NC_002754	TTTCGC	2	12	1319670	1319681	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15898293
463	NC_002754	AGTTGA	2	12	1335619	1335630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15898307
464	NC_002754	CACGTT	2	12	1339409	1339420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15898311
465	NC_002754	GAACAT	2	12	1343761	1343772	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15898319
466	NC_002754	AGAAAA	2	12	1350866	1350877	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15898327
467	NC_002754	CCTTTC	2	12	1352697	1352708	0 %	50 %	0 %	50 %	15898329
468	NC_002754	CTAGAA	2	12	1354369	1354380	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15898329
469	NC_002754	TGCAGC	2	12	1361369	1361380	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15898333
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471	NC_002754	GCTGTA	2	12	1377518	1377529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15898353
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