MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sulfolobus solfataricus P2 chromosome

Total Repeats: 42088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002754	CTT	2	6	8	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002754	GCA	2	6	28	33	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002754	ATT	2	6	63	68	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002754	TAA	2	6	182	187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002754	AAG	2	6	216	221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002754	GAT	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896973
7	NC_002754	AGA	2	6	281	286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896973
8	NC_002754	AGA	2	6	348	353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896973
9	NC_002754	AAT	2	6	548	553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896973
10	NC_002754	TCA	2	6	626	631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896973
11	NC_002754	CAA	2	6	745	750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15896973
12	NC_002754	AAT	2	6	773	778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896973
13	NC_002754	AGT	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896974
14	NC_002754	GGA	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15896974
15	NC_002754	ACA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15896974
16	NC_002754	ATA	2	6	1000	1005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896974
17	NC_002754	ATT	2	6	1230	1235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896974
18	NC_002754	AGG	2	6	1277	1282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15896974
19	NC_002754	ATA	2	6	1285	1290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896974
20	NC_002754	ATA	2	6	1318	1323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896974
21	NC_002754	GAT	2	6	1348	1353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896974
22	NC_002754	TGT	2	6	1395	1400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15896974
23	NC_002754	GAA	2	6	1444	1449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896974
24	NC_002754	TAA	2	6	1562	1567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896974
25	NC_002754	AGG	3	9	1614	1622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15896974
26	NC_002754	AAG	2	6	1673	1678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896974
27	NC_002754	GAA	2	6	1679	1684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896974
28	NC_002754	ATG	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896974
29	NC_002754	GGA	2	6	1810	1815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15896974
30	NC_002754	TAA	2	6	1817	1822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896974
31	NC_002754	TAA	2	6	1860	1865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896974
32	NC_002754	ATT	2	6	1923	1928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896974
33	NC_002754	TAC	2	6	2009	2014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896974
34	NC_002754	ATA	2	6	2018	2023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896974
35	NC_002754	TAA	2	6	2057	2062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896974
36	NC_002754	GTA	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896975
37	NC_002754	TAA	2	6	2135	2140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896975
38	NC_002754	TGA	2	6	2171	2176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896975
39	NC_002754	AAT	2	6	2249	2254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896975
40	NC_002754	GAT	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896975
41	NC_002754	GAA	2	6	2389	2394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896975
42	NC_002754	TTG	2	6	2401	2406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15896975
43	NC_002754	AGA	2	6	2435	2440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896975
44	NC_002754	ATA	2	6	2449	2454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896975
45	NC_002754	ATT	2	6	2471	2476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896975
46	NC_002754	GCA	2	6	2514	2519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15896975
47	NC_002754	TAG	2	6	2590	2595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896975
48	NC_002754	GGT	2	6	2933	2938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15896975
49	NC_002754	GAA	2	6	2949	2954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896975
50	NC_002754	AGA	2	6	2988	2993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002754	CTT	2	6	3144	3149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15896976
52	NC_002754	AGA	2	6	3179	3184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896976
53	NC_002754	TTA	2	6	3211	3216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896976
54	NC_002754	ATA	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896976
55	NC_002754	TAT	2	6	3484	3489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896976
56	NC_002754	AAC	2	6	3563	3568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15896976
57	NC_002754	GTA	2	6	3583	3588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896976
58	NC_002754	GAA	2	6	3672	3677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896976
59	NC_002754	TAA	2	6	3682	3687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896976
60	NC_002754	TAA	3	9	3695	3703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896976
61	NC_002754	TAA	2	6	3797	3802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896977
62	NC_002754	TAT	2	6	3901	3906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896977
63	NC_002754	AGA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896977
64	NC_002754	TAG	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896977
65	NC_002754	AGA	2	6	4155	4160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896977
66	NC_002754	TTA	2	6	4263	4268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896977
67	NC_002754	AAG	2	6	4273	4278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896977
68	NC_002754	ATT	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896977
69	NC_002754	ATA	2	6	4310	4315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896977
70	NC_002754	TCA	2	6	4387	4392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896977
71	NC_002754	TAT	2	6	4443	4448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896977
72	NC_002754	GGA	2	6	4674	4679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15896978
73	NC_002754	ATG	2	6	4720	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896978
74	NC_002754	TAG	2	6	4795	4800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896978
75	NC_002754	TAA	2	6	4885	4890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896978
76	NC_002754	TTG	2	6	4894	4899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15896978
77	NC_002754	TGA	2	6	4937	4942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896978
78	NC_002754	ATT	2	6	4992	4997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896978
79	NC_002754	AGA	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896978
80	NC_002754	ATT	2	6	5031	5036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896978
81	NC_002754	AGT	2	6	5075	5080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896978
82	NC_002754	GAA	2	6	5164	5169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896978
83	NC_002754	GCA	2	6	5307	5312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15896978
84	NC_002754	TTA	2	6	5333	5338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896978
85	NC_002754	AAT	2	6	5362	5367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896979
86	NC_002754	TTC	2	6	5379	5384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15896979
87	NC_002754	TTA	2	6	5494	5499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896979
88	NC_002754	TTA	2	6	5547	5552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896979
89	NC_002754	CAG	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15896979
90	NC_002754	CTG	2	6	5650	5655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15896979
91	NC_002754	AGG	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15896979
92	NC_002754	ATC	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896979
93	NC_002754	AAT	2	6	5897	5902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896979
94	NC_002754	CTT	2	6	5924	5929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15896979
95	NC_002754	ATT	2	6	5945	5950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896979
96	NC_002754	TGA	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896979
97	NC_002754	CAC	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15896979
98	NC_002754	TCT	2	6	6129	6134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15896979
99	NC_002754	TAT	2	6	6179	6184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896979
100	NC_002754	ATC	2	6	6191	6196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896979
101	NC_002754	TCA	2	6	6312	6317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896979
102	NC_002754	TAA	2	6	6431	6436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896980
103	NC_002754	ACT	2	6	6442	6447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896980
104	NC_002754	ATT	2	6	6524	6529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896980
105	NC_002754	GAG	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15896980
106	NC_002754	GAA	2	6	6704	6709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896980
107	NC_002754	GAT	2	6	6754	6759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896980
108	NC_002754	AAC	2	6	6800	6805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15896980
109	NC_002754	ATG	2	6	7016	7021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896980
110	NC_002754	TAA	2	6	7188	7193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896980
111	NC_002754	GAT	2	6	7279	7284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896980
112	NC_002754	AGA	2	6	7356	7361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896980
113	NC_002754	AGT	3	9	7365	7373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896980
114	NC_002754	GAA	2	6	7516	7521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002754	ATA	2	6	7585	7590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896981
116	NC_002754	AGT	2	6	7675	7680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896981
117	NC_002754	TAA	2	6	7803	7808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896981
118	NC_002754	ATG	2	6	7961	7966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896981
119	NC_002754	AGT	2	6	7977	7982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896981
120	NC_002754	CAT	2	6	8009	8014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896981
121	NC_002754	AAC	2	6	8025	8030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15896981
122	NC_002754	GTA	2	6	8044	8049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896981
123	NC_002754	ACA	2	6	8063	8068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15896981
124	NC_002754	AAT	2	6	8079	8084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896981
125	NC_002754	CAG	2	6	8189	8194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15896981
126	NC_002754	ACT	2	6	8293	8298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896981
127	NC_002754	ATC	2	6	8325	8330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896981
128	NC_002754	CTA	2	6	8443	8448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896981
129	NC_002754	AGT	2	6	8550	8555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896981
130	NC_002754	CAT	2	6	8684	8689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896981
131	NC_002754	AAC	2	6	8700	8705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15896981
132	NC_002754	GTA	2	6	8719	8724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896981
133	NC_002754	ACA	2	6	8738	8743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15896981
134	NC_002754	AAT	2	6	8754	8759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896981
135	NC_002754	TAC	2	6	8932	8937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896981
136	NC_002754	CTA	2	6	9121	9126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896981
137	NC_002754	TCC	2	6	9170	9175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15896981
138	NC_002754	TAC	2	6	9268	9273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896981
139	NC_002754	TGG	2	6	9297	9302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15896981
140	NC_002754	TAC	2	6	9607	9612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896981
141	NC_002754	ATC	2	6	9638	9643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15896981
142	NC_002754	TAT	2	6	9730	9735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896981
143	NC_002754	ATT	2	6	9744	9749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896981
144	NC_002754	GGT	2	6	9772	9777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15896981
145	NC_002754	TCT	2	6	9826	9831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15896981
146	NC_002754	TTA	2	6	9887	9892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896981
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148	NC_002754	ATG	2	6	9947	9952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896981
149	NC_002754	TAG	3	9	10007	10015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896981
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152	NC_002754	CTG	2	6	10262	10267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15896981
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155	NC_002754	TAA	2	6	10415	10420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896981
156	NC_002754	TGC	2	6	10440	10445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15896981
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158	NC_002754	CTT	3	9	10589	10597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15896982
159	NC_002754	TCT	2	6	10598	10603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15896982
160	NC_002754	TTA	2	6	10610	10615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15896982
161	NC_002754	ATG	2	6	10696	10701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_002754	AAT	2	6	10725	10730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_002754	AGA	2	6	10798	10803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_002754	TAA	2	6	10809	10814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_002754	ATA	2	6	10901	10906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_002754	AGA	2	6	10968	10973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_002754	ATA	2	6	11020	11025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_002754	TAA	2	6	11217	11222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896983
169	NC_002754	TAA	2	6	11258	11263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896983
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204	NC_002754	TGA	2	6	13573	13578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896987
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232	NC_002754	TCT	3	9	15377	15385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
233	NC_002754	TCT	2	6	15452	15457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
234	NC_002754	CCA	2	6	15549	15554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
235	NC_002754	TAA	2	6	15579	15584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_002754	TGA	2	6	15708	15713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896989
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243	NC_002754	TGA	2	6	16131	16136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896989
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246	NC_002754	ATA	2	6	16291	16296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15896989
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249	NC_002754	TAG	2	6	16356	16361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896989
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256	NC_002754	GAT	2	6	16723	16728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896989
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258	NC_002754	CCT	2	6	16879	16884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15896989
259	NC_002754	AAG	2	6	17032	17037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896989
260	NC_002754	AGA	2	6	17108	17113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15896989
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262	NC_002754	ATG	2	6	17315	17320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15896989
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