MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 chromosome

Total Repeats: 1545

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002745	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15925707
2	NC_002745	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002745	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002745	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15925711
5	NC_002745	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15925711
6	NC_002745	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15925711
7	NC_002745	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15925711
8	NC_002745	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15925711
9	NC_002745	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	161376701
10	NC_002745	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161376701
11	NC_002745	TAAATC	2	12	17172	17183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_002745	GCTTTA	2	12	17450	17461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15925718
13	NC_002745	TTTGAA	2	12	18271	18282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925718
14	NC_002745	TTGGTG	2	12	19115	19126	0 %	50 %	50 %	0 %	15925719
15	NC_002745	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15925720
16	NC_002745	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15925720
17	NC_002745	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15925721
18	NC_002745	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15925721
19	NC_002745	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15925722
20	NC_002745	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925723
21	NC_002745	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15925725
22	NC_002745	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15925728
23	NC_002745	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15925729
24	NC_002745	ACATCT	2	12	35510	35521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15925730
25	NC_002745	GTTTAA	2	12	36653	36664	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925732
26	NC_002745	ATTTAT	2	12	37499	37510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15925734
27	NC_002745	GTTTAA	2	12	41999	42010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925741
28	NC_002745	AAAAAT	2	12	43690	43701	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002745	AATGAA	2	12	44926	44937	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15925744
30	NC_002745	ACAACT	2	12	46991	47002	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15925745
31	NC_002745	TTTTCT	2	12	57850	57861	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15925757
32	NC_002745	AATTAA	2	12	58040	58051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15925757
33	NC_002745	GGCATG	2	12	58671	58682	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15925758
34	NC_002745	TAAAAA	2	12	59833	59844	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15925758
35	NC_002745	CATTAA	2	12	60469	60480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15925759
36	NC_002745	ATTTTT	2	12	70119	70130	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002745	ATAAGA	2	12	72575	72586	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002745	AAATAA	2	12	74240	74251	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15925774
39	NC_002745	TTTAAT	2	12	85307	85318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15925784
40	NC_002745	ACAAAT	2	12	87722	87733	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15925786
41	NC_002745	AATTAA	2	12	87813	87824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15925786
42	NC_002745	ATTTAT	2	12	90234	90245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002745	TTAATG	2	12	90758	90769	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925788
44	NC_002745	AAGTCA	2	12	91963	91974	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15925790
45	NC_002745	AAAAAG	2	12	92077	92088	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15925790
46	NC_002745	GAAAAA	2	12	92390	92401	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15925790
47	NC_002745	AATTAT	2	12	94629	94640	50 %	50 %	0 %	0 %	15925792
48	NC_002745	ACCCTT	2	12	96468	96479	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15925793
49	NC_002745	TTTAGC	2	12	98377	98388	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15925796
50	NC_002745	AAATAA	2	12	98428	98439	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15925796
51	NC_002745	GTTAGA	2	12	100551	100562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15925797
52	NC_002745	AAAAGA	2	12	100605	100616	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15925797
53	NC_002745	GCTAAA	2	12	103393	103404	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15925799
54	NC_002745	AACAAA	2	12	103814	103825	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_002745	TAAAGA	2	12	107541	107552	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15925804
56	NC_002745	AACCAC	2	12	111413	111424	50 %	0 %	0 %	50 %	15925806
57	NC_002745	AATATA	2	12	113115	113126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002745	AACCGA	2	12	114724	114735	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15925808
59	NC_002745	ATAGAT	2	12	119624	119635	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15925812
60	NC_002745	TATCAT	2	12	120391	120402	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15925813
61	NC_002745	TTTATT	2	12	120799	120810	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15925814
62	NC_002745	TATTTG	2	12	120885	120896	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15925814
63	NC_002745	TAAATA	2	12	122318	122329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15925814
64	NC_002745	TTTTTC	2	12	123988	123999	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15925815
65	NC_002745	TTAAAT	2	12	124083	124094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002745	TAACAA	2	12	125440	125451	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_002745	TAAGCC	2	12	125849	125860	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15925817
68	NC_002745	ATCGCA	2	12	127064	127075	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15925818
69	NC_002745	TTTGAA	2	12	128095	128106	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925819
70	NC_002745	CAATGG	2	12	137053	137064	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15925825
71	NC_002745	TGAAGA	2	12	137887	137898	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15925826
72	NC_002745	TTTCAT	2	12	138568	138579	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15925827
73	NC_002745	TGTATA	2	12	142788	142799	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925832
74	NC_002745	TCGAAA	2	12	144289	144300	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15925834
75	NC_002745	CTATTG	2	12	146875	146886	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15925836
76	NC_002745	CATATG	2	12	148078	148089	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15925837
77	NC_002745	AATGTA	2	12	148979	148990	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002745	CTGTAA	2	12	150800	150811	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_002745	GGTATG	2	12	151121	151132	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15925840
80	NC_002745	CAGATT	2	12	153719	153730	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15925842
81	NC_002745	AGATAT	2	12	161097	161108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15925849
82	NC_002745	GTTTTT	2	12	162006	162017	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002745	ATGCCT	2	12	162236	162247	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15925850
84	NC_002745	TGAAAG	2	12	162876	162887	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15925850
85	NC_002745	GATATG	2	12	170376	170387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15925856
86	NC_002745	ATTTGA	2	12	174282	174293	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925859
87	NC_002745	GATTTT	2	12	178793	178804	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15925864
88	NC_002745	ACAAAG	2	12	183313	183324	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15925868
89	NC_002745	TGTAAT	2	12	184337	184348	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925869
90	NC_002745	AAAGAT	2	12	185326	185337	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15925871
91	NC_002745	ATTAAT	2	12	187232	187243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002745	CAATAT	2	12	187798	187809	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15925872
93	NC_002745	TCCCAC	2	12	188549	188560	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_002745	TTGGTA	2	12	191883	191894	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15925878
95	NC_002745	GCGATT	2	12	191903	191914	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15925878
96	NC_002745	AAATTT	2	12	192001	192012	50 %	50 %	0 %	0 %	15925878
97	NC_002745	ACCTGC	2	12	194904	194915	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15925881
98	NC_002745	AAGATA	2	12	195050	195061	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15925881
99	NC_002745	CGTTAA	2	12	197984	197995	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15925883
100	NC_002745	CTATTA	2	12	199835	199846	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15925883
101	NC_002745	TATGAT	2	12	201369	201380	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925883
102	NC_002745	TTGAAA	2	12	201821	201832	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15925883
103	NC_002745	AACATT	2	12	204261	204272	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15925883
104	NC_002745	AGCAAC	2	12	207750	207761	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15925887
105	NC_002745	TGTTTG	2	12	207798	207809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15925887
106	NC_002745	CACCTT	2	12	209802	209813	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15925889
107	NC_002745	ACCTTT	2	12	210307	210318	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15925889
108	NC_002745	TTTATA	2	12	210403	210414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002745	ATTAAT	2	12	210426	210437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002745	GTAAAT	2	12	214046	214057	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15925892
111	NC_002745	ATTTTA	2	12	215641	215652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15925893
112	NC_002745	TATCTT	2	12	220255	220266	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15925896
113	NC_002745	ATTTGG	2	12	221268	221279	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15925897
114	NC_002745	GAGTTT	2	12	224611	224622	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15925899
115	NC_002745	TATACA	2	12	228612	228623	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15925903
116	NC_002745	TTATTT	2	12	230644	230655	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15925905
117	NC_002745	ATTTAT	2	12	231223	231234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15925905
118	NC_002745	TTTTTA	2	12	231254	231265	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002745	CCCTGA	2	12	233981	233992	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15925909
120	NC_002745	TCCTGA	2	12	234800	234811	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15925909
121	NC_002745	TCAATT	2	12	236951	236962	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15925911
122	NC_002745	AATATG	2	12	238251	238262	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15925912
123	NC_002745	GATTTT	2	12	241407	241418	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002745	AAAAAT	2	12	241758	241769	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15925914
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126	NC_002745	ACATTT	2	12	243954	243965	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15925916
127	NC_002745	TTCTTG	2	12	248883	248894	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15925920
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129	NC_002745	ATATGA	2	12	262122	262133	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002745	GGAATA	2	12	276983	276994	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002745	TGGTAT	2	12	288562	288573	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15925949
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134	NC_002745	ACGATG	2	12	298545	298556	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15925958
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136	NC_002745	ATAATT	2	12	304475	304486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002745	AGAATC	2	12	306103	306114	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15925963
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234	NC_002745	AAAATA	2	12	497389	497400	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_002745	GTTGGT	2	12	498743	498754	0 %	50 %	50 %	0 %	15926151
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239	NC_002745	CAAGAA	2	12	504447	504458	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15926156
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348	NC_002745	TTTTGA	2	12	624267	624278	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15926250
349	NC_002745	TATATT	2	12	626424	626435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15926251
350	NC_002745	ATTGCG	2	12	627140	627151	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15926252
351	NC_002745	TATTTA	2	12	628381	628392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15926253
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353	NC_002745	TAGATG	2	12	631131	631142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_002745	GATTCA	2	12	850305	850316	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15926464
473	NC_002745	GATTCA	2	12	850323	850334	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15926464
474	NC_002745	GATTCA	2	12	850341	850352	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15926464
475	NC_002745	GATTCA	2	12	850377	850388	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15926464
476	NC_002745	GATTCA	2	12	850395	850406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15926464
477	NC_002745	GATTCA	2	12	850413	850424	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15926464
478	NC_002745	ATTCAG	2	12	850450	850461	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15926464
479	NC_002745	GATTCA	2	12	850755	850766	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15926464
480	NC_002745	GATTCA	2	12	850809	850820	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15926464
481	NC_002745	GACTCA	2	12	850863	850874	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15926464
482	NC_002745	GATTCA	2	12	850953	850964	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15926464
483	NC_002745	GACTCA	2	12	850989	851000	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15926464
484	NC_002745	GATTCA	2	12	851007	851018	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15926464
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491	NC_002745	GCTCAA	2	12	860473	860484	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15926477
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