MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 chromosome

Total Repeats: 1313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002745	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15925707
2	NC_002745	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15925711
3	NC_002745	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15925711
4	NC_002745	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15925711
5	NC_002745	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15925711
6	NC_002745	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15925711
7	NC_002745	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	161376701
8	NC_002745	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161376701
9	NC_002745	GCTTTA	2	12	17450	17461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15925718
10	NC_002745	TTTGAA	2	12	18271	18282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925718
11	NC_002745	TTGGTG	2	12	19115	19126	0 %	50 %	50 %	0 %	15925719
12	NC_002745	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15925720
13	NC_002745	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15925720
14	NC_002745	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15925721
15	NC_002745	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15925721
16	NC_002745	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15925722
17	NC_002745	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925723
18	NC_002745	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15925725
19	NC_002745	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15925728
20	NC_002745	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15925729
21	NC_002745	ACATCT	2	12	35510	35521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15925730
22	NC_002745	GTTTAA	2	12	36653	36664	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925732
23	NC_002745	ATTTAT	2	12	37499	37510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15925734
24	NC_002745	GTTTAA	2	12	41999	42010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925741
25	NC_002745	AATGAA	2	12	44926	44937	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15925744
26	NC_002745	ACAACT	2	12	46991	47002	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15925745
27	NC_002745	TTTTCT	2	12	57850	57861	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15925757
28	NC_002745	AATTAA	2	12	58040	58051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15925757
29	NC_002745	GGCATG	2	12	58671	58682	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15925758
30	NC_002745	TAAAAA	2	12	59833	59844	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15925758
31	NC_002745	CATTAA	2	12	60469	60480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15925759
32	NC_002745	AAATAA	2	12	74240	74251	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15925774
33	NC_002745	TTTAAT	2	12	85307	85318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15925784
34	NC_002745	ACAAAT	2	12	87722	87733	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15925786
35	NC_002745	AATTAA	2	12	87813	87824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15925786
36	NC_002745	TTAATG	2	12	90758	90769	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925788
37	NC_002745	AAGTCA	2	12	91963	91974	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15925790
38	NC_002745	AAAAAG	2	12	92077	92088	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15925790
39	NC_002745	GAAAAA	2	12	92390	92401	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15925790
40	NC_002745	AATTAT	2	12	94629	94640	50 %	50 %	0 %	0 %	15925792
41	NC_002745	ACCCTT	2	12	96468	96479	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15925793
42	NC_002745	TTTAGC	2	12	98377	98388	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15925796
43	NC_002745	AAATAA	2	12	98428	98439	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15925796
44	NC_002745	GTTAGA	2	12	100551	100562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15925797
45	NC_002745	AAAAGA	2	12	100605	100616	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15925797
46	NC_002745	GCTAAA	2	12	103393	103404	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15925799
47	NC_002745	TAAAGA	2	12	107541	107552	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15925804
48	NC_002745	AACCAC	2	12	111413	111424	50 %	0 %	0 %	50 %	15925806
49	NC_002745	AACCGA	2	12	114724	114735	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15925808
50	NC_002745	ATAGAT	2	12	119624	119635	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15925812
51	NC_002745	TATCAT	2	12	120391	120402	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15925813
52	NC_002745	TTTATT	2	12	120799	120810	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15925814
53	NC_002745	TATTTG	2	12	120885	120896	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15925814
54	NC_002745	TAAATA	2	12	122318	122329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15925814
55	NC_002745	TTTTTC	2	12	123988	123999	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15925815
56	NC_002745	TAAGCC	2	12	125849	125860	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15925817
57	NC_002745	ATCGCA	2	12	127064	127075	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15925818
58	NC_002745	TTTGAA	2	12	128095	128106	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925819
59	NC_002745	CAATGG	2	12	137053	137064	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15925825
60	NC_002745	TGAAGA	2	12	137887	137898	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15925826
61	NC_002745	TTTCAT	2	12	138568	138579	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15925827
62	NC_002745	TGTATA	2	12	142788	142799	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925832
63	NC_002745	TCGAAA	2	12	144289	144300	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15925834
64	NC_002745	CTATTG	2	12	146875	146886	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15925836
65	NC_002745	CATATG	2	12	148078	148089	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15925837
66	NC_002745	GGTATG	2	12	151121	151132	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15925840
67	NC_002745	CAGATT	2	12	153719	153730	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15925842
68	NC_002745	AGATAT	2	12	161097	161108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15925849
69	NC_002745	ATGCCT	2	12	162236	162247	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15925850
70	NC_002745	TGAAAG	2	12	162876	162887	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15925850
71	NC_002745	GATATG	2	12	170376	170387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15925856
72	NC_002745	ATTTGA	2	12	174282	174293	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925859
73	NC_002745	GATTTT	2	12	178793	178804	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15925864
74	NC_002745	ACAAAG	2	12	183313	183324	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15925868
75	NC_002745	TGTAAT	2	12	184337	184348	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925869
76	NC_002745	AAAGAT	2	12	185326	185337	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15925871
77	NC_002745	CAATAT	2	12	187798	187809	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15925872
78	NC_002745	TTGGTA	2	12	191883	191894	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15925878
79	NC_002745	GCGATT	2	12	191903	191914	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15925878
80	NC_002745	AAATTT	2	12	192001	192012	50 %	50 %	0 %	0 %	15925878
81	NC_002745	ACCTGC	2	12	194904	194915	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15925881
82	NC_002745	AAGATA	2	12	195050	195061	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15925881
83	NC_002745	CGTTAA	2	12	197984	197995	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15925883
84	NC_002745	CTATTA	2	12	199835	199846	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15925883
85	NC_002745	TATGAT	2	12	201369	201380	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925883
86	NC_002745	TTGAAA	2	12	201821	201832	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15925883
87	NC_002745	AACATT	2	12	204261	204272	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15925883
88	NC_002745	AGCAAC	2	12	207750	207761	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15925887
89	NC_002745	TGTTTG	2	12	207798	207809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15925887
90	NC_002745	CACCTT	2	12	209802	209813	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15925889
91	NC_002745	ACCTTT	2	12	210307	210318	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15925889
92	NC_002745	GTAAAT	2	12	214046	214057	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15925892
93	NC_002745	ATTTTA	2	12	215641	215652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15925893
94	NC_002745	TATCTT	2	12	220255	220266	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15925896
95	NC_002745	ATTTGG	2	12	221268	221279	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15925897
96	NC_002745	GAGTTT	2	12	224611	224622	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15925899
97	NC_002745	TATACA	2	12	228612	228623	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15925903
98	NC_002745	TTATTT	2	12	230644	230655	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15925905
99	NC_002745	ATTTAT	2	12	231223	231234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15925905
100	NC_002745	CCCTGA	2	12	233981	233992	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15925909
101	NC_002745	TCCTGA	2	12	234800	234811	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15925909
102	NC_002745	TCAATT	2	12	236951	236962	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15925911
103	NC_002745	AATATG	2	12	238251	238262	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15925912
104	NC_002745	AAAAAT	2	12	241758	241769	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15925914
105	NC_002745	AGGACA	2	12	243618	243629	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15925916
106	NC_002745	ACATTT	2	12	243954	243965	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15925916
107	NC_002745	TTCTTG	2	12	248883	248894	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15925920
108	NC_002745	GGACGT	2	12	259385	259396	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15925929
109	NC_002745	TGGTAT	2	12	288562	288573	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15925949
110	NC_002745	TATAGA	2	12	291916	291927	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15925953
111	NC_002745	ACGATG	2	12	298545	298556	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15925958
112	NC_002745	AGAATC	2	12	306103	306114	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15925963
113	NC_002745	AAGTAA	2	12	309526	309537	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15925968
114	NC_002745	ATAAAG	2	12	310507	310518	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15925969
115	NC_002745	GACATT	2	12	312198	312209	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15925970
116	NC_002745	GATTTC	2	12	314017	314028	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15925972
117	NC_002745	TTCATA	2	12	314587	314598	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15925973
118	NC_002745	GATTAT	2	12	318994	319005	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15925977
119	NC_002745	ATGGTG	2	12	319127	319138	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15925977
120	NC_002745	CAGCAA	2	12	319514	319525	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15925977
121	NC_002745	TCTTCA	2	12	325093	325104	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15925982
122	NC_002745	TTATCT	2	12	325189	325200	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15925982
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126	NC_002745	ACAAGA	2	12	331783	331794	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15925988
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129	NC_002745	TGAAGA	2	12	335272	335283	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15925989
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237	NC_002745	ACGACT	2	12	588561	588572	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15926225
238	NC_002745	AACGTG	2	12	589534	589545	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15926225
239	NC_002745	TTCGAA	2	12	590055	590066	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15926225
240	NC_002745	TACAGC	2	12	592301	592312	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15926227
241	NC_002745	TTGCTA	2	12	592582	592593	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15926227
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250	NC_002745	GACTCA	2	12	607447	607458	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15926239
251	NC_002745	GACTCA	2	12	607477	607488	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15926239
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262	NC_002745	CCAAGA	2	12	610533	610544	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15926240
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264	NC_002745	TCAGAC	2	12	611842	611853	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15926240
265	NC_002745	GATTCA	2	12	611875	611886	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15926240
266	NC_002745	GATTCA	2	12	611893	611904	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15926240
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464	NC_002745	AGTATT	2	12	957317	957328	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15926573
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