MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 chromosome

Total Repeats: 2502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002745	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	15925706
2	NC_002745	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	15925707
3	NC_002745	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	15925707
4	NC_002745	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	15925707
5	NC_002745	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	15925710
6	NC_002745	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_002745	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	15925711
8	NC_002745	ATCGC	2	10	10192	10201	20 %	20 %	20 %	40 %	15925712
9	NC_002745	CGTTG	2	10	11735	11744	0 %	40 %	40 %	20 %	161376701
10	NC_002745	GTAGG	2	10	14408	14417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002745	TTATT	2	10	15450	15459	20 %	80 %	0 %	0 %	15925716
12	NC_002745	GCAAG	2	10	16624	16633	40 %	0 %	40 %	20 %	15925717
13	NC_002745	TTTGA	2	10	16783	16792	20 %	60 %	20 %	0 %	15925717
14	NC_002745	TCAAT	2	10	18920	18929	40 %	40 %	0 %	20 %	15925719
15	NC_002745	AGTTA	2	10	22098	22107	40 %	40 %	20 %	0 %	15925721
16	NC_002745	ATGTA	2	10	23656	23665	40 %	40 %	20 %	0 %	15925722
17	NC_002745	TCGAT	2	10	23820	23829	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_002745	ATATT	2	10	24357	24366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002745	ACCAA	2	10	26266	26275	60 %	0 %	0 %	40 %	15925724
20	NC_002745	ATCAA	2	10	26978	26987	60 %	20 %	0 %	20 %	15925724
21	NC_002745	GAAAC	2	10	27599	27608	60 %	0 %	20 %	20 %	15925725
22	NC_002745	GAAGT	2	10	27749	27758	40 %	20 %	40 %	0 %	15925725
23	NC_002745	ATTAT	2	10	29392	29401	40 %	60 %	0 %	0 %	15925726
24	NC_002745	AACGA	2	10	29465	29474	60 %	0 %	20 %	20 %	15925726
25	NC_002745	AAACG	2	10	31311	31320	60 %	0 %	20 %	20 %	15925728
26	NC_002745	AAGGT	2	10	32483	32492	40 %	20 %	40 %	0 %	15925728
27	NC_002745	TATGA	2	10	32680	32689	40 %	40 %	20 %	0 %	15925728
28	NC_002745	CATTA	2	10	33910	33919	40 %	40 %	0 %	20 %	15925729
29	NC_002745	TTTCA	2	10	34313	34322	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_002745	AAATG	2	10	35554	35563	60 %	20 %	20 %	0 %	15925730
31	NC_002745	ATTTT	2	10	35635	35644	20 %	80 %	0 %	0 %	15925730
32	NC_002745	TAAAA	2	10	35766	35775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002745	AGATA	2	10	35924	35933	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002745	TTCTT	2	10	37417	37426	0 %	80 %	0 %	20 %	15925734
35	NC_002745	TTTTC	2	10	38087	38096	0 %	80 %	0 %	20 %	15925734
36	NC_002745	TTGTC	2	10	38123	38132	0 %	60 %	20 %	20 %	15925734
37	NC_002745	TAAAA	2	10	38331	38340	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002745	CAAAC	2	10	38947	38956	60 %	0 %	0 %	40 %	15925736
39	NC_002745	AAGTA	2	10	39758	39767	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002745	TGACA	2	10	41406	41415	40 %	20 %	20 %	20 %	15925740
41	NC_002745	ATGAG	2	10	43564	43573	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002745	TGAAT	2	10	43911	43920	40 %	40 %	20 %	0 %	29165616
43	NC_002745	TTGGT	2	10	43953	43962	0 %	60 %	40 %	0 %	29165616
44	NC_002745	AATAT	2	10	44021	44030	60 %	40 %	0 %	0 %	29165616
45	NC_002745	TTCGT	2	10	44232	44241	0 %	60 %	20 %	20 %	29165616
46	NC_002745	CAAAA	2	10	44592	44601	80 %	0 %	0 %	20 %	15925744
47	NC_002745	AAATT	2	10	46691	46700	60 %	40 %	0 %	0 %	15925745
48	NC_002745	TTTAA	2	10	49650	49659	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002745	AAAAT	2	10	49742	49751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002745	TTATT	2	10	49970	49979	20 %	80 %	0 %	0 %	15925748
51	NC_002745	GAATT	2	10	50945	50954	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002745	TGGTG	2	10	51597	51606	0 %	40 %	60 %	0 %	15925750
53	NC_002745	CTTTT	2	10	52861	52870	0 %	80 %	0 %	20 %	15925751
54	NC_002745	ATAGC	2	10	54364	54373	40 %	20 %	20 %	20 %	15925753
55	NC_002745	ATATA	2	10	54497	54506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002745	ATTAC	2	10	57088	57097	40 %	40 %	0 %	20 %	15925756
57	NC_002745	GATTC	2	10	57967	57976	20 %	40 %	20 %	20 %	15925757
58	NC_002745	CATCC	2	10	60196	60205	20 %	20 %	0 %	60 %	15925759
59	NC_002745	TGCGT	2	10	60219	60228	0 %	40 %	40 %	20 %	15925759
60	NC_002745	ATAAA	2	10	63341	63350	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002745	TTTGA	2	10	64921	64930	20 %	60 %	20 %	0 %	15925764
62	NC_002745	GTTTT	2	10	65004	65013	0 %	80 %	20 %	0 %	15925764
63	NC_002745	TTGCT	2	10	65962	65971	0 %	60 %	20 %	20 %	15925765
64	NC_002745	CTAGT	2	10	70083	70092	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_002745	GATTT	2	10	70524	70533	20 %	60 %	20 %	0 %	15925769
66	NC_002745	GTTTT	2	10	70933	70942	0 %	80 %	20 %	0 %	29165617
67	NC_002745	TTTCA	2	10	71297	71306	20 %	60 %	0 %	20 %	29165618
68	NC_002745	TAATA	2	10	72878	72887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002745	TATAA	2	10	73007	73016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002745	ATTTT	2	10	74448	74457	20 %	80 %	0 %	0 %	15925774
71	NC_002745	ATTTT	2	10	77051	77060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002745	AAACT	2	10	77927	77936	60 %	20 %	0 %	20 %	29165619
73	NC_002745	TTGGT	2	10	79412	79421	0 %	60 %	40 %	0 %	15925777
74	NC_002745	GTGAG	2	10	81418	81427	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002745	AGGGT	2	10	84043	84052	20 %	20 %	60 %	0 %	15925782
76	NC_002745	TCAAT	2	10	84359	84368	40 %	40 %	0 %	20 %	15925782
77	NC_002745	AAAAT	2	10	86294	86303	80 %	20 %	0 %	0 %	15925785
78	NC_002745	TTTAG	2	10	86497	86506	20 %	60 %	20 %	0 %	15925785
79	NC_002745	AAATG	2	10	86619	86628	60 %	20 %	20 %	0 %	15925785
80	NC_002745	TAGTA	2	10	89212	89221	40 %	40 %	20 %	0 %	15925786
81	NC_002745	TTTTA	2	10	89428	89437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002745	TACTA	2	10	90573	90582	40 %	40 %	0 %	20 %	15925788
83	NC_002745	ATCAA	2	10	93323	93332	60 %	20 %	0 %	20 %	15925791
84	NC_002745	TAATA	2	10	95155	95164	60 %	40 %	0 %	0 %	15925792
85	NC_002745	GTGTT	2	10	95238	95247	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002745	ATTCA	2	10	97830	97839	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_002745	TATAT	2	10	98091	98100	40 %	60 %	0 %	0 %	15925796
88	NC_002745	CTAAA	2	10	99731	99740	60 %	20 %	0 %	20 %	15925797
89	NC_002745	CAAAA	2	10	99762	99771	80 %	0 %	0 %	20 %	15925797
90	NC_002745	GATAT	2	10	104454	104463	40 %	40 %	20 %	0 %	15925800
91	NC_002745	ATATA	2	10	105277	105286	60 %	40 %	0 %	0 %	15925801
92	NC_002745	GATAT	2	10	106111	106120	40 %	40 %	20 %	0 %	15925802
93	NC_002745	AATAA	2	10	106741	106750	80 %	20 %	0 %	0 %	15925803
94	NC_002745	ATTGC	2	10	108721	108730	20 %	40 %	20 %	20 %	15925805
95	NC_002745	TCATT	2	10	108909	108918	20 %	60 %	0 %	20 %	15925805
96	NC_002745	CATGG	2	10	110125	110134	20 %	20 %	40 %	20 %	15925805
97	NC_002745	TGAAA	2	10	110793	110802	60 %	20 %	20 %	0 %	15925806
98	NC_002745	TCAAT	2	10	111165	111174	40 %	40 %	0 %	20 %	15925806
99	NC_002745	GTATT	2	10	111654	111663	20 %	60 %	20 %	0 %	15925807
100	NC_002745	ATTAA	2	10	114396	114405	60 %	40 %	0 %	0 %	15925808
101	NC_002745	AGATA	2	10	117515	117524	60 %	20 %	20 %	0 %	15925811
102	NC_002745	TAAAA	2	10	118075	118084	80 %	20 %	0 %	0 %	15925811
103	NC_002745	ATACA	2	10	118505	118514	60 %	20 %	0 %	20 %	15925812
104	NC_002745	AAAGA	2	10	119708	119717	80 %	0 %	20 %	0 %	15925812
105	NC_002745	GTAAT	2	10	119927	119936	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002745	ATGTT	2	10	121193	121202	20 %	60 %	20 %	0 %	15925814
107	NC_002745	TTGCG	2	10	121764	121773	0 %	40 %	40 %	20 %	15925814
108	NC_002745	AGATG	2	10	126499	126508	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002745	GGTGA	2	10	127095	127104	20 %	20 %	60 %	0 %	15925818
110	NC_002745	GAAAA	2	10	130532	130541	80 %	0 %	20 %	0 %	15925821
111	NC_002745	TTATT	2	10	130699	130708	20 %	80 %	0 %	0 %	15925821
112	NC_002745	AATCA	2	10	133721	133730	60 %	20 %	0 %	20 %	15925823
113	NC_002745	ATTTT	2	10	134419	134428	20 %	80 %	0 %	0 %	15925824
114	NC_002745	ATCAA	2	10	134446	134455	60 %	20 %	0 %	20 %	15925824
115	NC_002745	ATCAC	2	10	135679	135688	40 %	20 %	0 %	40 %	15925825
116	NC_002745	AACGA	2	10	136356	136365	60 %	0 %	20 %	20 %	15925825
117	NC_002745	ACACA	2	10	138412	138421	60 %	0 %	0 %	40 %	15925827
118	NC_002745	GACAA	2	10	139563	139572	60 %	0 %	20 %	20 %	15925828
119	NC_002745	ATTAC	2	10	141747	141756	40 %	40 %	0 %	20 %	15925830
120	NC_002745	ATTTT	2	10	142051	142060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002745	TATCT	2	10	142407	142416	20 %	60 %	0 %	20 %	15925832
122	NC_002745	ATACG	2	10	144840	144849	40 %	20 %	20 %	20 %	15925834
123	NC_002745	TTATA	2	10	145498	145507	40 %	60 %	0 %	0 %	15925835
124	NC_002745	TTTTA	2	10	146296	146305	20 %	80 %	0 %	0 %	15925835
125	NC_002745	GTATT	2	10	146809	146818	20 %	60 %	20 %	0 %	15925836
126	NC_002745	AATAA	2	10	147402	147411	80 %	20 %	0 %	0 %	15925836
127	NC_002745	TACGC	2	10	147669	147678	20 %	20 %	20 %	40 %	15925836
128	NC_002745	TCCCT	2	10	150475	150484	0 %	40 %	0 %	60 %	15925839
129	NC_002745	GCTTT	2	10	152709	152718	0 %	60 %	20 %	20 %	15925841
130	NC_002745	TAATT	2	10	152794	152803	40 %	60 %	0 %	0 %	15925841
131	NC_002745	ATACT	2	10	153975	153984	40 %	40 %	0 %	20 %	15925843
132	NC_002745	TAATA	2	10	155139	155148	60 %	40 %	0 %	0 %	15925844
133	NC_002745	ATTTT	2	10	156130	156139	20 %	80 %	0 %	0 %	15925845
134	NC_002745	TTGTA	2	10	158335	158344	20 %	60 %	20 %	0 %	15925847
135	NC_002745	TGCAA	2	10	159340	159349	40 %	20 %	20 %	20 %	15925848
136	NC_002745	ATATG	2	10	161358	161367	40 %	40 %	20 %	0 %	15925849
137	NC_002745	TATGA	2	10	163038	163047	40 %	40 %	20 %	0 %	15925851
138	NC_002745	AATAT	2	10	164044	164053	60 %	40 %	0 %	0 %	15925851
139	NC_002745	TGGTA	2	10	165941	165950	20 %	40 %	40 %	0 %	15925852
140	NC_002745	CGAAC	2	10	166031	166040	40 %	0 %	20 %	40 %	15925852
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263	NC_002745	TGGCA	2	10	314916	314925	20 %	20 %	40 %	20 %	15925973
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272	NC_002745	TTAAT	2	10	325927	325936	40 %	60 %	0 %	0 %	15925983
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