MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes SF370 chromosome

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002737	AGTGTA	2	12	21881	21892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002737	ACTAAT	2	12	21909	21920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_002737	AGTGTA	2	12	27882	27893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002737	ACTAAT	2	12	27910	27921	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_002737	ACATCG	2	12	43882	43893	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_002737	TATTTT	2	12	64133	64144	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002737	AGTGTA	2	12	84101	84112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002737	ACTAAT	2	12	84129	84140	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_002737	TTCGGG	2	12	85071	85082	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_002737	ATAAAA	2	12	112228	112239	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002737	GATAAG	2	12	119043	119054	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002737	CTTATT	2	12	119174	119185	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_002737	AGATAA	2	12	134267	134278	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002737	CTTTAT	2	12	159899	159910	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_002737	CTCTTT	2	12	161763	161774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_002737	TGACAC	2	12	188623	188634	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_002737	CAGTTC	2	12	193262	193273	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_002737	TTTAAA	2	12	195111	195122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002737	ACTTAT	2	12	257188	257199	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_002737	AAAAGC	2	12	258141	258152	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_002737	GAAACA	2	12	258322	258333	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_002737	AGTGTA	2	12	269169	269180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002737	ACTAAT	2	12	269197	269208	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_002737	TTAAAA	2	12	290940	290951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002737	TTTAAT	2	12	308018	308029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002737	TTTTAG	2	12	320687	320698	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002737	AAGACC	2	12	335831	335842	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_002737	GCTTTG	2	12	349490	349501	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_002737	ATTTAA	2	12	370635	370646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002737	GTTAAA	2	12	394646	394657	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002737	AGAAAT	2	12	403854	403865	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002737	ATTTTA	2	12	435139	435150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002737	GAGTAA	2	12	440928	440939	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002737	AATTCT	2	12	453337	453348	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_002737	TAAAAA	2	12	456845	456856	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002737	AGGACT	2	12	461968	461979	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_002737	TAAAAA	2	12	481377	481388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002737	AAAAGA	2	12	481560	481571	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002737	GAAAAA	2	12	509885	509896	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002737	CAAAGA	2	12	546306	546317	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_002737	TCAGGT	2	12	589799	589810	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_002737	CCTTGT	2	12	598585	598596	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_002737	TAAATA	2	12	712523	712534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002737	AGGTAA	2	12	723324	723335	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002737	TTCGGG	2	12	758398	758409	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_002737	GAAAAA	2	12	854644	854655	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002737	TTATCA	2	12	888845	888856	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_002737	ATGTTA	2	12	925742	925753	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002737	TTAAAA	2	12	929449	929460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002737	TAACAA	2	12	981818	981829	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_002737	TCCCAA	2	12	1040140	1040151	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_002737	TTTAAA	2	12	1043686	1043697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002737	AGTCTT	2	12	1046547	1046558	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_002737	TTGTTT	2	12	1073109	1073120	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002737	ATATGA	2	12	1106669	1106680	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002737	AGTCTT	2	12	1122714	1122725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_002737	TCTTTT	2	12	1149983	1149994	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_002737	CCTTGG	2	12	1181985	1181996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_002737	TGACTT	2	12	1238639	1238650	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_002737	ATGATA	2	12	1245146	1245157	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002737	TAGAAT	2	12	1254990	1255001	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002737	TAAGAC	2	12	1279118	1279129	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_002737	AGCTGA	2	12	1279426	1279437	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_002737	AGCAGA	2	12	1283617	1283628	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_002737	TCCTTC	2	12	1325857	1325868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_002737	AATGTT	2	12	1329536	1329547	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002737	TATTAG	2	12	1331333	1331344	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002737	TACACT	2	12	1331362	1331373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_002737	GAAAAA	2	12	1336803	1336814	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002737	TTCCTG	2	12	1342183	1342194	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_002737	CAATTC	2	12	1355891	1355902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_002737	TATTTT	2	12	1356965	1356976	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002737	AATACC	2	12	1365983	1365994	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_002737	CTTTTC	2	12	1416355	1416366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_002737	ATTCCA	2	12	1467389	1467400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_002737	CTAGTC	2	12	1518649	1518660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_002737	AATATT	2	12	1537157	1537168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002737	TTTGCT	2	12	1552903	1552914	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_002737	TAACAA	2	12	1566850	1566861	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_002737	TTTTTC	2	12	1569236	1569247	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_002737	AGAAAA	2	12	1571932	1571943	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002737	TATTAG	2	12	1578262	1578273	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002737	TACACT	2	12	1578291	1578302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_002737	GTTAAA	2	12	1593435	1593446	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002737	TTTTAT	2	12	1605626	1605637	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002737	ATGTTT	2	12	1605832	1605843	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002737	TTTTCA	2	12	1625131	1625142	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_002737	CCTTTA	2	12	1713094	1713105	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_002737	TTAATA	2	12	1755853	1755864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002737	ATTTTA	2	12	1766277	1766288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002737	ACATTC	2	12	1783490	1783501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_002737	TTTTCA	2	12	1787000	1787011	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_002737	TAAAAA	2	12	1798980	1798991	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002737	AATTTA	3	18	1810451	1810468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002737	GAAAAA	2	12	1848201	1848212	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.