MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Caulobacter crescentus CB15 chromosome

Total Repeats: 385

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002696	GATCA	2	10	30246	30255	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_002696	CGGCC	2	10	39896	39905	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_002696	TCCCA	2	10	45774	45783	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_002696	GATCA	2	10	57256	57265	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_002696	CAGCG	2	10	60442	60451	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_002696	CTGCG	2	10	64505	64514	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_002696	CGGCC	2	10	83931	83940	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_002696	CCGAC	2	10	84730	84739	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_002696	GGCGC	2	10	86974	86983	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_002696	AACGG	2	10	96447	96456	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_002696	GGCGC	2	10	97784	97793	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_002696	CAGGC	2	10	105134	105143	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_002696	ACCTG	2	10	115177	115186	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_002696	ATGCG	2	10	127816	127825	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_002696	TGCGT	2	10	141021	141030	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_002696	CCGCA	2	10	163284	163293	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_002696	TTTTC	2	10	169326	169335	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_002696	CGGCG	2	10	177990	177999	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_002696	AAGCC	2	10	191022	191031	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_002696	GCGTC	2	10	191503	191512	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_002696	CACCC	2	10	206943	206952	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
22	NC_002696	AGGGG	2	10	206969	206978	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002696	CGCTG	2	10	208448	208457	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_002696	GCGCG	2	10	212298	212307	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_002696	AAAAG	2	10	270116	270125	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002696	CCCGG	2	10	274851	274860	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_002696	GGGCC	2	10	274864	274873	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_002696	GTTTT	2	10	274897	274906	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002696	CAGCG	2	10	276202	276211	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_002696	GTTCA	2	10	280851	280860	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_002696	TTCCC	2	10	283962	283971	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_002696	CACCC	2	10	284043	284052	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
33	NC_002696	GAGGG	2	10	284068	284077	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002696	CGTCG	2	10	285226	285235	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_002696	CGCCC	2	10	287572	287581	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
36	NC_002696	TTCGC	2	10	295063	295072	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_002696	GAGCG	2	10	326664	326673	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_002696	ACAAA	2	10	334837	334846	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_002696	GCGCG	2	10	381345	381354	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_002696	GCGCC	2	10	388734	388743	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_002696	TAGCC	2	10	419689	419698	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_002696	GGGGC	2	10	464751	464760	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
43	NC_002696	CCACC	2	10	472913	472922	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
44	NC_002696	TCGCG	2	10	473002	473011	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_002696	GGCCG	2	10	483561	483570	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_002696	CTTTT	2	10	497106	497115	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_002696	CAGGG	2	10	503120	503129	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_002696	GGGTT	2	10	510217	510226	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002696	TTGTC	2	10	515625	515634	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_002696	TTTCC	2	10	517807	517816	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_002696	GGCCC	2	10	533754	533763	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_002696	TCAGG	2	10	534877	534886	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_002696	TCGCA	2	10	536365	536374	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_002696	CGTCA	2	10	536518	536527	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_002696	TCGGA	2	10	542113	542122	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_002696	CGGCG	2	10	557598	557607	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_002696	GGCGC	2	10	570578	570587	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_002696	GATCG	2	10	578041	578050	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_002696	GCCTG	2	10	585115	585124	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_002696	ACGCC	2	10	586720	586729	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_002696	AGCGA	2	10	615006	615015	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_002696	GCCAG	2	10	626843	626852	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_002696	CGCTG	2	10	626998	627007	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_002696	CGTCC	2	10	640644	640653	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_002696	GCATG	2	10	666989	666998	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_002696	TGGGA	2	10	697427	697436	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002696	GGGGA	2	10	709131	709140	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002696	CCCTG	2	10	709254	709263	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NC_002696	AGCCG	2	10	712760	712769	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_002696	GACGG	2	10	719113	719122	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_002696	CGGGG	2	10	728335	728344	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
72	NC_002696	AGGGG	2	10	744476	744485	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002696	ACTCA	2	10	748213	748222	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_002696	CCGTC	2	10	748440	748449	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_002696	GGGGC	2	10	763283	763292	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
76	NC_002696	GGAAT	2	10	770677	770686	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002696	TGGGG	2	10	770798	770807	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002696	AGCCG	2	10	772338	772347	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_002696	TCCTC	2	10	775502	775511	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
80	NC_002696	TTTCG	2	10	779098	779107	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_002696	AAGCC	2	10	785235	785244	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_002696	GCCCG	2	10	788144	788153	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
83	NC_002696	GAGCG	2	10	799641	799650	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_002696	GGCGC	2	10	803017	803026	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
85	NC_002696	ATTCG	2	10	814675	814684	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_002696	CGCGG	2	10	815675	815684	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_002696	GATCG	2	10	831704	831713	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_002696	GAAAA	2	10	842294	842303	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002696	GCGAA	2	10	860048	860057	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_002696	ACCCG	2	10	871505	871514	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_002696	TCAGG	2	10	877077	877086	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_002696	GCGTC	2	10	894635	894644	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_002696	CCGTT	2	10	895625	895634	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_002696	CTTGT	2	10	907346	907355	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_002696	CGTAG	3	15	911542	911556	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_002696	GCGCG	2	10	928296	928305	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
97	NC_002696	ACACA	2	10	929178	929187	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_002696	TATAA	2	10	930622	930631	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002696	TGGCG	2	10	941780	941789	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_002696	TCCGC	2	10	943868	943877	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_002696	AGCTT	2	10	952200	952209	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_002696	GTCTC	2	10	970187	970196	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_002696	GCGAG	2	10	992375	992384	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_002696	TCGGC	2	10	995450	995459	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_002696	GACCG	2	10	996142	996151	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_002696	CGGCG	2	10	997058	997067	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
107	NC_002696	GCGCC	2	10	1006208	1006217	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
108	NC_002696	TCGCC	2	10	1013452	1013461	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_002696	GTTAA	2	10	1014617	1014626	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002696	GCGCG	2	10	1017985	1017994	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
111	NC_002696	GCGCG	2	10	1020010	1020019	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
112	NC_002696	CGGGT	2	10	1024753	1024762	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_002696	GCTAA	2	10	1030781	1030790	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_002696	GAGCG	2	10	1046069	1046078	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_002696	GCCTG	2	10	1056302	1056311	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_002696	CCCCT	2	10	1056788	1056797	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
117	NC_002696	GGTGC	2	10	1056893	1056902	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_002696	ACCCG	2	10	1057029	1057038	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_002696	AGCGT	2	10	1068657	1068666	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_002696	CGCTG	2	10	1072043	1072052	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_002696	AGCGG	2	10	1085603	1085612	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_002696	TTTTG	2	10	1102525	1102534	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002696	GGTGC	2	10	1102647	1102656	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_002696	AGGAG	2	10	1103104	1103113	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002696	GGCGC	2	10	1103147	1103156	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
126	NC_002696	CGCGG	2	10	1111104	1111113	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_002696	AAAAG	2	10	1111231	1111240	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002696	CTTGG	2	10	1113932	1113941	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_002696	CCCGA	2	10	1115907	1115916	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_002696	AGGGG	2	10	1127339	1127348	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002696	GATCG	2	10	1146769	1146778	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_002696	CCGCC	2	10	1150394	1150403	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
133	NC_002696	GCTCA	2	10	1154981	1154990	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_002696	GCGCG	2	10	1176101	1176110	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_002696	CGCGC	2	10	1182042	1182051	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_002696	GGCGC	2	10	1182947	1182956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_002696	GCGCC	2	10	1191466	1191475	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_002696	CGGTT	2	10	1197273	1197282	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_002696	TCTGA	2	10	1198178	1198187	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_002696	GCCTC	2	10	1200118	1200127	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_002696	CCGCT	2	10	1203339	1203348	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
142	NC_002696	GGGTG	2	10	1205312	1205321	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002696	GCGCG	2	10	1212978	1212987	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
144	NC_002696	TTGCA	2	10	1231888	1231897	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_002696	GGAAA	2	10	1246522	1246531	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002696	CCATG	2	10	1254126	1254135	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_002696	GCGCG	2	10	1269969	1269978	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
148	NC_002696	CTGGT	2	10	1295658	1295667	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_002696	GCCGC	2	10	1347763	1347772	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
150	NC_002696	CCAGG	2	10	1348096	1348105	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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153	NC_002696	TCGAC	2	10	1422689	1422698	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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155	NC_002696	AAATG	2	10	1444302	1444311	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_002696	TTTGA	2	10	1501588	1501597	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_002696	ATCGG	2	10	1514626	1514635	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_002696	CATTC	2	10	1515370	1515379	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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165	NC_002696	TTGGC	2	10	1532194	1532203	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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169	NC_002696	GGGCT	2	10	1599704	1599713	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
170	NC_002696	GTTTT	2	10	1609122	1609131	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_002696	CGCGA	2	10	1627502	1627511	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
174	NC_002696	GCGCG	2	10	1630713	1630722	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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179	NC_002696	CGCAG	2	10	1657410	1657419	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_002696	CGGGC	2	10	1669140	1669149	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
182	NC_002696	GAGGG	2	10	1669217	1669226	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_002696	TGGGG	2	10	1676369	1676378	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_002696	TGCGG	2	10	1803681	1803690	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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196	NC_002696	ACGCG	2	10	1840455	1840464	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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198	NC_002696	GGGCG	2	10	1872231	1872240	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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263	NC_002696	CGGCG	2	10	2593487	2593496	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_002696	CTACG	2	10	2738215	2738224	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
274	NC_002696	GTCAT	2	10	2750791	2750800	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
275	NC_002696	GTTCA	2	10	2756088	2756097	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
276	NC_002696	GTCGG	2	10	2761529	2761538	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
277	NC_002696	GGCCA	2	10	2766903	2766912	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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281	NC_002696	CCATG	2	10	2814442	2814451	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
282	NC_002696	TGCGT	2	10	2826483	2826492	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
283	NC_002696	CGCCA	2	10	2837326	2837335	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
284	NC_002696	TTACC	2	10	2838713	2838722	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
285	NC_002696	AGCGC	2	10	2840251	2840260	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
286	NC_002696	CACGA	2	10	2840617	2840626	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
287	NC_002696	TCGGA	2	10	2843010	2843019	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
288	NC_002696	AGGAG	2	10	2853919	2853928	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
289	NC_002696	CGGGA	2	10	2881319	2881328	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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292	NC_002696	CGTCG	2	10	2910362	2910371	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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322	NC_002696	TCGGA	2	10	3203780	3203789	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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326	NC_002696	TTAAG	2	10	3210242	3210251	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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380	NC_002696	GAACG	2	10	3893761	3893770	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
381	NC_002696	CCGCG	2	10	3924112	3924121	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.