MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. Sakai chromosome

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002695	GAAAAT	2	12	10630	10641	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002695	TAAAAA	2	12	63352	63363	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002695	AAGGGA	2	12	88936	88947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002695	CGCCAT	2	12	152268	152279	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_002695	GTAGTG	2	12	203724	203735	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002695	AACAAA	2	12	241252	241263	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_002695	TTATAT	2	12	285943	285954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002695	CTGATA	2	12	304420	304431	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_002695	TGTAAC	2	12	308948	308959	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_002695	ATTATC	2	12	352080	352091	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_002695	TTTTCT	2	12	362821	362832	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_002695	CTATTT	2	12	363857	363868	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_002695	AATTTC	2	12	369546	369557	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_002695	TTTATT	2	12	400846	400857	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002695	ATGAAA	2	12	443701	443712	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002695	AACAAT	2	12	467046	467057	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_002695	AATAAA	2	12	468627	468638	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002695	ATTACG	2	12	469519	469530	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_002695	AAAATA	2	12	469777	469788	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002695	TATTGA	2	12	472199	472210	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002695	TTTTCA	2	12	538541	538552	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_002695	CAGGCG	2	12	557216	557227	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_002695	TGCAAA	2	12	694309	694320	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_002695	ATCATT	2	12	757902	757913	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_002695	ATTTTT	2	12	788296	788307	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002695	CGCTGG	2	12	788387	788398	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_002695	TTTACC	2	12	799208	799219	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_002695	AATCAG	2	12	846800	846811	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_002695	TTTTCT	2	12	878823	878834	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_002695	TTGTGT	2	12	892082	892093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002695	TTAAAT	2	12	899060	899071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002695	TCGCTG	2	12	899219	899230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_002695	TTGTAC	2	12	900095	900106	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_002695	GTGATG	2	12	901071	901082	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002695	CATTAT	2	12	901688	901699	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_002695	AATATT	2	12	943125	943136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002695	CAGAAA	2	12	957430	957441	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_002695	TTCGAT	2	12	985282	985293	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_002695	GCCAGC	2	12	986668	986679	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_002695	TAACCG	2	12	1053960	1053971	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_002695	AAATAA	2	12	1084255	1084266	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002695	CTGGAA	2	12	1093818	1093829	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_002695	AAAGAT	2	12	1116614	1116625	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002695	TGTCCA	2	12	1137247	1137258	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002695	TAAGGA	2	12	1159515	1159526	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002695	ATAATG	2	12	1160929	1160940	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002695	TCAAAA	2	12	1230574	1230585	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_002695	AATGAT	2	12	1242618	1242629	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002695	GATGGC	2	12	1243008	1243019	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_002695	CAAAGC	2	12	1349349	1349360	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_002695	TGTTAA	2	12	1387474	1387485	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002695	ACTTCA	2	12	1389705	1389716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_002695	ATTCAA	2	12	1417317	1417328	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_002695	ATTTGG	2	12	1417828	1417839	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002695	ATTTTT	2	12	1428513	1428524	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002695	CACTGA	2	12	1433323	1433334	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_002695	CAAAAA	2	12	1480364	1480375	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_002695	TGCAAA	4	24	1520733	1520756	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_002695	ACAGCA	2	12	1575048	1575059	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_002695	ATTTTA	2	12	1587623	1587634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002695	TTTCTG	2	12	1626362	1626373	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_002695	CTGTCA	2	12	1629393	1629404	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_002695	AATATG	2	12	1659440	1659451	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002695	GAAGTT	2	12	1662498	1662509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002695	ACGCTT	2	12	1681648	1681659	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_002695	ACTCGA	2	12	1681668	1681679	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_002695	CAGGCT	2	12	1681805	1681816	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_002695	CTTATT	2	12	1737470	1737481	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_002695	CAAAAG	2	12	1743364	1743375	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_002695	CTGATC	2	12	1753843	1753854	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_002695	TGGCAA	2	12	1766953	1766964	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_002695	GTTTTT	2	12	1769552	1769563	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002695	TTTATT	2	12	1779579	1779590	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002695	TTTGAT	2	12	1801055	1801066	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002695	CTTCAT	2	12	1813021	1813032	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_002695	AAAGTT	2	12	1816272	1816283	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002695	CTATAA	2	12	1865198	1865209	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_002695	ATTTAA	2	12	1927975	1927986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002695	TTTATT	2	12	1946877	1946888	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002695	CTTTTT	2	12	1956381	1956392	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_002695	TTTTAT	2	12	2050149	2050160	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002695	AAAAAC	2	12	2077004	2077015	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_002695	CCAGCG	2	12	2085876	2085887	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_002695	TTCATA	2	12	2088584	2088595	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_002695	ACCGTT	2	12	2091870	2091881	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_002695	TGGTTA	2	12	2100699	2100710	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002695	TACCAA	2	12	2111451	2111462	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_002695	CAAAAA	2	12	2155021	2155032	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_002695	TTAAAT	2	12	2156820	2156831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002695	CCGGAA	2	12	2188473	2188484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_002695	CAGCCA	2	12	2188887	2188898	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_002695	ATTTTG	2	12	2210066	2210077	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002695	TGACCG	2	12	2213902	2213913	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_002695	TTGATA	2	12	2214924	2214935	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002695	CTGCTC	2	12	2217031	2217042	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_002695	AATAAA	2	12	2234220	2234231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002695	CCGGAA	2	12	2239436	2239447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_002695	CTGTAA	2	12	2254661	2254672	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_002695	ATACTT	2	12	2340845	2340856	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_002695	AAAATA	2	12	2354502	2354513	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002695	TGTTTT	2	12	2355135	2355146	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002695	AAGACT	2	12	2355395	2355406	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_002695	TATTAC	2	12	2473516	2473527	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_002695	TTTCTT	2	12	2491755	2491766	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_002695	AGGATG	2	12	2531579	2531590	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002695	AACGGT	2	12	2563870	2563881	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_002695	AATTCA	2	12	2587795	2587806	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_002695	GCAGAA	2	12	2604974	2604985	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_002695	AAAAAG	2	12	2605200	2605211	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002695	TCTTAT	2	12	2622731	2622742	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_002695	ATATTT	2	12	2658400	2658411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002695	CTGATA	2	12	2673010	2673021	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_002695	TGTCAG	2	12	2673114	2673125	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_002695	CTGCTC	2	12	2676260	2676271	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_002695	ATTTTT	2	12	2727444	2727455	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002695	CTGATA	2	12	2738983	2738994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_002695	TTTTGT	2	12	2798312	2798323	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002695	GTTTAG	2	12	2819174	2819185	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002695	TCCCCC	2	12	2828435	2828446	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
120	NC_002695	AGAAAA	2	12	2873708	2873719	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002695	AAAATA	2	12	2877501	2877512	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002695	CCTTAC	2	12	2883262	2883273	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_002695	CCTTAC	2	12	2883871	2883882	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_002695	GCTGTG	2	12	2887027	2887038	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_002695	GCTGGC	2	12	2887336	2887347	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_002695	TGACCG	2	12	2899204	2899215	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_002695	TTGATA	2	12	2900224	2900235	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002695	CTGCTC	2	12	2902331	2902342	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
129	NC_002695	TATTGA	2	12	2932324	2932335	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002695	CCTGTT	2	12	2944558	2944569	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_002695	TCTTCC	2	12	2998766	2998777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_002695	TAAATG	2	12	3133071	3133082	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002695	TGTCAC	2	12	3146706	3146717	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_002695	AGAAAA	2	12	3156986	3156997	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002695	CAACGT	2	12	3198388	3198399	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_002695	GTTAAC	2	12	3204314	3204325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_002695	GTTAAC	2	12	3204378	3204389	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_002695	CTGATG	2	12	3223138	3223149	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_002695	GTTATG	2	12	3240978	3240989	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002695	CAAGTG	2	12	3255698	3255709	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_002695	TCCTTC	2	12	3355429	3355440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_002695	TGGACA	2	12	3409924	3409935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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145	NC_002695	TTTTTC	2	12	3476583	3476594	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_002695	ATAGAA	9	54	3490393	3490446	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002695	TTTTAC	2	12	3505278	3505289	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_002695	ATGGGT	2	12	3550770	3550781	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002695	TGCCGT	2	12	3550784	3550795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_002695	AATGAT	2	12	3624437	3624448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002695	GACAAT	2	12	3626843	3626854	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_002695	GGTTTT	2	12	3640428	3640439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_002695	ACAAGA	2	12	3644759	3644770	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_002695	TTTGTT	2	12	3669695	3669706	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_002695	ATTAGA	2	12	3717912	3717923	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_002695	ATTCTC	2	12	3734904	3734915	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_002695	GATCAT	2	12	3744175	3744186	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_002695	ATCGCG	2	12	3779303	3779314	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_002695	ACTGAG	2	12	3822449	3822460	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.