MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. Sakai chromosome

Total Repeats: 607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002695	TCTTT	2	10	11885	11894	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_002695	TTAAT	2	10	24780	24789	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002695	ATTTA	2	10	33604	33613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002695	GATGC	2	10	39104	39113	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_002695	TGTTA	3	15	46551	46565	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002695	TAGTG	2	10	80433	80442	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002695	GTAAC	2	10	80574	80583	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_002695	ATTTT	2	10	83158	83167	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002695	GGGAG	2	10	83322	83331	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002695	CGCCA	2	10	83386	83395	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_002695	GGCAT	2	10	146368	146377	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_002695	GTAAG	2	10	147132	147141	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002695	TCCTC	2	10	148852	148861	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_002695	TAAGA	2	10	161546	161555	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002695	AAATA	2	10	161556	161565	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002695	TTATC	2	10	171740	171749	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_002695	TACGT	2	10	186616	186625	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_002695	TGGCC	2	10	188341	188350	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_002695	GTCTG	2	10	196177	196186	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_002695	CGGTT	2	10	226853	226862	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_002695	AAAAT	2	10	263528	263537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002695	CTAAT	2	10	263743	263752	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_002695	TTTGT	2	10	263770	263779	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002695	GGGCA	2	10	276079	276088	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_002695	CCTTT	2	10	285562	285571	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_002695	GGGCT	2	10	301872	301881	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_002695	TTTCG	2	10	315311	315320	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_002695	TCGCT	2	10	315471	315480	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_002695	TGGCA	2	10	317487	317496	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_002695	TGCAA	2	10	317868	317877	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_002695	ATCAA	2	10	323110	323119	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_002695	TGTGT	2	10	344087	344096	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002695	TGTTA	2	10	345196	345205	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002695	TTGAT	2	10	348534	348543	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002695	GTTAA	2	10	351009	351018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002695	CAAAA	2	10	362845	362854	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_002695	ATTAG	2	10	362878	362887	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002695	TTCCC	2	10	367348	367357	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_002695	GACAA	2	10	367452	367461	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_002695	AAAAT	2	10	368090	368099	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002695	GACAA	2	10	371065	371074	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_002695	ATTGA	2	10	371520	371529	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002695	TGTCA	2	10	379249	379258	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_002695	ATTTT	2	10	379313	379322	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002695	GGCTG	2	10	414436	414445	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_002695	AAGCG	2	10	417995	418004	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_002695	TTGCG	2	10	423193	423202	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_002695	TAGCG	2	10	426104	426113	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_002695	CGGCG	2	10	445973	445982	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_002695	ATGGA	2	10	446006	446015	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002695	CTTCT	2	10	459135	459144	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_002695	GTTTA	2	10	468787	468796	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002695	AATAA	2	10	469158	469167	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002695	GTTTC	2	10	496382	496391	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_002695	CTTTT	2	10	499858	499867	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_002695	GGAGT	2	10	504353	504362	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002695	GTTTT	2	10	520914	520923	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002695	GAAGA	2	10	527493	527502	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002695	TCAGG	2	10	534915	534924	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_002695	TGAGT	2	10	541264	541273	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002695	CAGGT	2	10	542553	542562	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_002695	TTTTC	2	10	562924	562933	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_002695	TCAGG	2	10	570685	570694	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_002695	ATTTT	2	10	616998	617007	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002695	GTCTG	2	10	631792	631801	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_002695	AAGCG	2	10	635674	635683	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_002695	GTTTC	2	10	650269	650278	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_002695	GTCAG	2	10	690526	690535	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_002695	GTCAG	2	10	691029	691038	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_002695	GCAGT	2	10	694254	694263	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_002695	GTTAA	2	10	711246	711255	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002695	TGCTA	2	10	737867	737876	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_002695	ATTTG	2	10	739308	739317	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002695	TCAAT	2	10	741613	741622	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_002695	GGAAC	2	10	742803	742812	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_002695	CGTAA	2	10	744011	744020	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_002695	GCATA	2	10	756207	756216	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_002695	AGCAA	2	10	756314	756323	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_002695	CGTTG	2	10	762096	762105	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_002695	CAGGG	2	10	782817	782826	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_002695	ATAAA	2	10	788046	788055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002695	TCGCG	2	10	788233	788242	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_002695	GTTTT	2	10	812214	812223	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002695	AATGT	2	10	812897	812906	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002695	GAAAA	2	10	813005	813014	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002695	TTAAT	2	10	813873	813882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002695	AAAAT	2	10	841903	841912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002695	ATAAC	2	10	855344	855353	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_002695	GTCGT	2	10	864850	864859	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_002695	AAGCG	2	10	865516	865525	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_002695	GATGC	2	10	889681	889690	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_002695	AAAAT	2	10	891184	891193	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002695	GTAAC	2	10	892038	892047	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_002695	AAAAC	2	10	892679	892688	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_002695	GTTGG	2	10	892792	892801	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002695	AATTC	2	10	897878	897887	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_002695	ATTTT	2	10	899049	899058	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002695	TGATT	2	10	901428	901437	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002695	TAACT	2	10	903245	903254	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_002695	ACATA	2	10	960767	960776	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_002695	GATGC	2	10	966044	966053	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_002695	CAAAA	2	10	972642	972651	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_002695	TATAT	2	10	977375	977384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002695	TGATG	2	10	983383	983392	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002695	CGGCG	2	10	986583	986592	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
106	NC_002695	CGGTG	2	10	991183	991192	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_002695	CATGG	2	10	991301	991310	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_002695	CAGGG	2	10	1003355	1003364	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_002695	AGTAA	2	10	1015215	1015224	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002695	CAAAT	2	10	1025044	1025053	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_002695	GCTGT	2	10	1079885	1079894	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_002695	GCAAC	2	10	1087273	1087282	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_002695	TTCAC	2	10	1101242	1101251	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_002695	TTGTT	2	10	1127010	1127019	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002695	AATCG	2	10	1130913	1130922	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_002695	AACGT	2	10	1130944	1130953	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_002695	AGCGA	2	10	1135368	1135377	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_002695	TAGGG	2	10	1135404	1135413	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002695	ATGAC	2	10	1137108	1137117	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_002695	TATTT	2	10	1137171	1137180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002695	TTTTC	2	10	1145146	1145155	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_002695	TTATT	2	10	1145956	1145965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002695	TTCTT	2	10	1147889	1147898	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_002695	GTACA	2	10	1150425	1150434	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_002695	TTATG	2	10	1150582	1150591	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002695	CTTAT	2	10	1161085	1161094	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_002695	TGGCG	2	10	1169220	1169229	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_002695	GTTTT	2	10	1174927	1174936	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002695	TTATT	2	10	1183814	1183823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002695	GTTCT	2	10	1186711	1186720	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_002695	GTCAG	2	10	1209215	1209224	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_002695	ATTAT	2	10	1209239	1209248	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002695	AATGT	2	10	1224954	1224963	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002695	TAAAA	2	10	1229613	1229622	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002695	AAGGA	2	10	1243600	1243609	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002695	AAAAC	2	10	1248085	1248094	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_002695	GAAAA	2	10	1255558	1255567	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002695	CATTT	2	10	1274305	1274314	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_002695	TTTTC	2	10	1274334	1274343	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_002695	TCCTT	2	10	1307508	1307517	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_002695	GTTTA	2	10	1308199	1308208	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002695	TCGCA	2	10	1308491	1308500	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_002695	GATGC	2	10	1327638	1327647	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_002695	TGGAG	2	10	1341811	1341820	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002695	TGAGG	2	10	1377450	1377459	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002695	GGGCG	2	10	1378731	1378740	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
147	NC_002695	AAGAA	2	10	1389573	1389582	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002695	TTTTA	2	10	1389762	1389771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002695	AATAA	2	10	1396331	1396340	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002695	GAGTT	2	10	1397617	1397626	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002695	GGTTG	2	10	1398999	1399008	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002695	TTAAA	2	10	1412327	1412336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_002695	AGAAT	2	10	1421176	1421185	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_002695	GATTA	2	10	1422755	1422764	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_002695	GTTTC	2	10	1474587	1474596	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_002695	GTCAT	2	10	1479831	1479840	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
161	NC_002695	TAAAA	2	10	1480337	1480346	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_002695	TGCAG	2	10	1488534	1488543	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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164	NC_002695	GTTTT	2	10	1551410	1551419	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_002695	TTTTC	2	10	1559839	1559848	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_002695	TTTTG	2	10	1665596	1665605	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_002695	TTCTA	2	10	1672050	1672059	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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279	NC_002695	TGTTT	2	10	2462949	2462958	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_002695	TCGAT	2	10	2503801	2503810	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
285	NC_002695	AATAA	2	10	2507232	2507241	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_002695	TTGCC	2	10	2525029	2525038	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
287	NC_002695	GCTGT	2	10	2530822	2530831	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
288	NC_002695	AGGTA	2	10	2531666	2531675	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
289	NC_002695	TTTTG	2	10	2580443	2580452	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
290	NC_002695	CGCTA	2	10	2580482	2580491	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
291	NC_002695	TAGCG	2	10	2590664	2590673	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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293	NC_002695	AGCGC	2	10	2624319	2624328	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
294	NC_002695	TAAGT	2	10	2634332	2634341	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
295	NC_002695	TCCCC	2	10	2634550	2634559	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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297	NC_002695	TCCCC	2	10	2636508	2636517	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
298	NC_002695	TTTAC	2	10	2648342	2648351	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
299	NC_002695	TAAAA	2	10	2658492	2658501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_002695	CTATG	2	10	2668067	2668076	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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303	NC_002695	CTGAC	2	10	2670591	2670600	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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306	NC_002695	GTTCT	2	10	2675895	2675904	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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382	NC_002695	GCGTC	2	10	3258051	3258060	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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402	NC_002695	AATCA	2	10	3473602	3473611	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
403	NC_002695	TCCTC	2	10	3476968	3476977	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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405	NC_002695	TGTGG	2	10	3483368	3483377	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
406	NC_002695	AATGA	2	10	3499965	3499974	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_002695	TGCCT	2	10	3608447	3608456	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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