MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. Sakai chromosome

Total Repeats: 2995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002695	CGCTG	2	10	710	719	0 %	20 %	40 %	40 %	15829256
2	NC_002695	ATTGC	2	10	3413	3422	20 %	40 %	20 %	20 %	15829257
3	NC_002695	CGCAG	2	10	8377	8386	20 %	0 %	40 %	40 %	15829262
4	NC_002695	CGTAC	2	10	9805	9814	20 %	20 %	20 %	40 %	15829263
5	NC_002695	CGCGC	2	10	10792	10801	0 %	0 %	40 %	60 %	15829265
6	NC_002695	CCGAT	2	10	16509	16518	20 %	20 %	20 %	40 %	15829271
7	NC_002695	AGCGA	2	10	16897	16906	40 %	0 %	40 %	20 %	15829271
8	NC_002695	GTTTT	2	10	19314	19323	0 %	80 %	20 %	0 %	15829276
9	NC_002695	TTTAT	2	10	20370	20379	20 %	80 %	0 %	0 %	15829276
10	NC_002695	AATGT	2	10	21846	21855	40 %	40 %	20 %	0 %	15829277
11	NC_002695	TGCAA	2	10	22059	22068	40 %	20 %	20 %	20 %	15829277
12	NC_002695	ATAAA	2	10	22130	22139	80 %	20 %	0 %	0 %	15829277
13	NC_002695	TAAAA	2	10	22403	22412	80 %	20 %	0 %	0 %	15829277
14	NC_002695	ATTGC	2	10	24145	24154	20 %	40 %	20 %	20 %	15829279
15	NC_002695	GCGAA	2	10	36842	36851	40 %	0 %	40 %	20 %	15829290
16	NC_002695	CCGTT	2	10	37736	37745	0 %	40 %	20 %	40 %	15829290
17	NC_002695	CACGG	2	10	38113	38122	20 %	0 %	40 %	40 %	15829290
18	NC_002695	CGAAT	2	10	40855	40864	40 %	20 %	20 %	20 %	15829294
19	NC_002695	CCATG	2	10	42393	42402	20 %	20 %	20 %	40 %	15829295
20	NC_002695	CCGTA	2	10	44039	44048	20 %	20 %	20 %	40 %	15829296
21	NC_002695	GTACA	2	10	44529	44538	40 %	20 %	20 %	20 %	15829296
22	NC_002695	TTAAA	2	10	44777	44786	60 %	40 %	0 %	0 %	15829296
23	NC_002695	ACCCA	2	10	45520	45529	40 %	0 %	0 %	60 %	15829297
24	NC_002695	TTTGA	2	10	47152	47161	20 %	60 %	20 %	0 %	162139820
25	NC_002695	CGGCG	2	10	47403	47412	0 %	0 %	60 %	40 %	162139820
26	NC_002695	AATCA	2	10	47685	47694	60 %	20 %	0 %	20 %	15829299
27	NC_002695	CGGTT	2	10	48640	48649	0 %	40 %	40 %	20 %	15829300
28	NC_002695	TGGCG	2	10	50331	50340	0 %	20 %	60 %	20 %	15829302
29	NC_002695	TGCAC	2	10	52093	52102	20 %	20 %	20 %	40 %	15829303
30	NC_002695	AGGGC	2	10	53178	53187	20 %	0 %	60 %	20 %	15829304
31	NC_002695	GGCGC	2	10	53212	53221	0 %	0 %	60 %	40 %	15829304
32	NC_002695	GAAAC	2	10	54025	54034	60 %	0 %	20 %	20 %	15829304
33	NC_002695	AACGT	2	10	56498	56507	40 %	20 %	20 %	20 %	15829309
34	NC_002695	GCGTC	2	10	59482	59491	0 %	20 %	40 %	40 %	15829312
35	NC_002695	ATGTT	2	10	60296	60305	20 %	60 %	20 %	0 %	15829313
36	NC_002695	CTTCG	2	10	60729	60738	0 %	40 %	20 %	40 %	15829313
37	NC_002695	TGCGT	2	10	61015	61024	0 %	40 %	40 %	20 %	15829313
38	NC_002695	AAAGT	2	10	68097	68106	60 %	20 %	20 %	0 %	15829317
39	NC_002695	GTGCT	2	10	69360	69369	0 %	40 %	40 %	20 %	15829318
40	NC_002695	GGTGA	2	10	70344	70353	20 %	20 %	60 %	0 %	15829318
41	NC_002695	CAGCG	2	10	71712	71721	20 %	0 %	40 %	40 %	15829320
42	NC_002695	GGATC	2	10	74207	74216	20 %	20 %	40 %	20 %	15829321
43	NC_002695	GGCAA	2	10	80859	80868	40 %	0 %	40 %	20 %	15829327
44	NC_002695	TTGCT	2	10	81594	81603	0 %	60 %	20 %	20 %	15829328
45	NC_002695	GATGG	2	10	82330	82339	20 %	20 %	60 %	0 %	15829328
46	NC_002695	GCTTC	2	10	83475	83484	0 %	40 %	20 %	40 %	15829329
47	NC_002695	CCTGG	2	10	84583	84592	0 %	20 %	40 %	40 %	15829330
48	NC_002695	GACCG	2	10	86850	86859	20 %	0 %	40 %	40 %	15829332
49	NC_002695	ATGTT	2	10	89397	89406	20 %	60 %	20 %	0 %	162139819
50	NC_002695	TGCAT	2	10	90339	90348	20 %	40 %	20 %	20 %	38703843
51	NC_002695	ATTCC	2	10	90509	90518	20 %	40 %	0 %	40 %	38703843
52	NC_002695	TTACG	2	10	91401	91410	20 %	40 %	20 %	20 %	38703843
53	NC_002695	AGTTC	2	10	95602	95611	20 %	40 %	20 %	20 %	15829340
54	NC_002695	CGTGG	2	10	96975	96984	0 %	20 %	60 %	20 %	15829342
55	NC_002695	GGGCT	2	10	101354	101363	0 %	20 %	60 %	20 %	15829345
56	NC_002695	GCCTG	2	10	101814	101823	0 %	20 %	40 %	40 %	15829346
57	NC_002695	ACCGT	2	10	103727	103736	20 %	20 %	20 %	40 %	15829347
58	NC_002695	ATCAG	2	10	105500	105509	40 %	20 %	20 %	20 %	15829349
59	NC_002695	TGACG	2	10	106972	106981	20 %	20 %	40 %	20 %	15829350
60	NC_002695	AGCCG	2	10	107268	107277	20 %	0 %	40 %	40 %	15829350
61	NC_002695	GCGCA	2	10	109596	109605	20 %	0 %	40 %	40 %	15829352
62	NC_002695	TGGCG	2	10	110590	110599	0 %	20 %	60 %	20 %	15829353
63	NC_002695	CCGGC	2	10	113560	113569	0 %	0 %	40 %	60 %	15829356
64	NC_002695	CGCGG	2	10	116769	116778	0 %	0 %	60 %	40 %	15829360
65	NC_002695	ATCCC	2	10	119013	119022	20 %	20 %	0 %	60 %	15829364
66	NC_002695	CATCG	2	10	119026	119035	20 %	20 %	20 %	40 %	15829364
67	NC_002695	TAACG	2	10	119720	119729	40 %	20 %	20 %	20 %	15829364
68	NC_002695	ATGCC	2	10	120179	120188	20 %	20 %	20 %	40 %	15829364
69	NC_002695	AATGC	2	10	121462	121471	40 %	20 %	20 %	20 %	15829365
70	NC_002695	TCTGT	2	10	122408	122417	0 %	60 %	20 %	20 %	15829367
71	NC_002695	GCATG	2	10	123501	123510	20 %	20 %	40 %	20 %	15829368
72	NC_002695	AGCAG	2	10	124839	124848	40 %	0 %	40 %	20 %	15829370
73	NC_002695	CGAAG	2	10	126754	126763	40 %	0 %	40 %	20 %	15829371
74	NC_002695	ACACG	2	10	126887	126896	40 %	0 %	20 %	40 %	15829371
75	NC_002695	TCGCG	2	10	127148	127157	0 %	20 %	40 %	40 %	15829371
76	NC_002695	GCATC	2	10	127238	127247	20 %	20 %	20 %	40 %	15829371
77	NC_002695	GACTG	2	10	128556	128565	20 %	20 %	40 %	20 %	15829372
78	NC_002695	AGAGC	2	10	128966	128975	40 %	0 %	40 %	20 %	15829372
79	NC_002695	AGGCG	2	10	134121	134130	20 %	0 %	60 %	20 %	15829375
80	NC_002695	GGTTG	2	10	134874	134883	0 %	40 %	60 %	0 %	15829375
81	NC_002695	TCTGG	2	10	137520	137529	0 %	40 %	40 %	20 %	15829376
82	NC_002695	GGGCA	2	10	138932	138941	20 %	0 %	60 %	20 %	162139817
83	NC_002695	CAGCG	2	10	139211	139220	20 %	0 %	40 %	40 %	15829378
84	NC_002695	ACGAC	2	10	140491	140500	40 %	0 %	20 %	40 %	15829379
85	NC_002695	CCGTC	2	10	146196	146205	0 %	20 %	20 %	60 %	38703846
86	NC_002695	GTGAA	2	10	146206	146215	40 %	20 %	40 %	0 %	38703846
87	NC_002695	GTTCA	2	10	146593	146602	20 %	40 %	20 %	20 %	15829384
88	NC_002695	ATCCA	2	10	146919	146928	40 %	20 %	0 %	40 %	15829384
89	NC_002695	CTTTA	2	10	148182	148191	20 %	60 %	0 %	20 %	15829386
90	NC_002695	TGGCG	2	10	148409	148418	0 %	20 %	60 %	20 %	15829386
91	NC_002695	TTTCA	2	10	150722	150731	20 %	60 %	0 %	20 %	15829389
92	NC_002695	CCGCA	2	10	153458	153467	20 %	0 %	20 %	60 %	15829392
93	NC_002695	CCTTT	2	10	155423	155432	0 %	60 %	0 %	40 %	15829393
94	NC_002695	TTTAA	2	10	156983	156992	40 %	60 %	0 %	0 %	15829396
95	NC_002695	TGGTT	2	10	157345	157354	0 %	60 %	40 %	0 %	15829397
96	NC_002695	GCGAG	2	10	162745	162754	20 %	0 %	60 %	20 %	162139816
97	NC_002695	GGCGT	2	10	163183	163192	0 %	20 %	60 %	20 %	162139816
98	NC_002695	ACCAC	2	10	166086	166095	40 %	0 %	0 %	60 %	38703847
99	NC_002695	GGCGT	2	10	167789	167798	0 %	20 %	60 %	20 %	15829406
100	NC_002695	CGACG	2	10	168828	168837	20 %	0 %	40 %	40 %	15829406
101	NC_002695	CTGCG	2	10	170964	170973	0 %	20 %	40 %	40 %	15829407
102	NC_002695	AAAAC	2	10	172815	172824	80 %	0 %	0 %	20 %	15829408
103	NC_002695	TGGTT	2	10	173072	173081	0 %	60 %	40 %	0 %	15829408
104	NC_002695	AACCT	2	10	175153	175162	40 %	20 %	0 %	40 %	15829410
105	NC_002695	TGGTC	2	10	175195	175204	0 %	40 %	40 %	20 %	15829410
106	NC_002695	TGGCG	2	10	176440	176449	0 %	20 %	60 %	20 %	15829411
107	NC_002695	GGTCC	2	10	182004	182013	0 %	20 %	40 %	40 %	15829416
108	NC_002695	ACGGG	2	10	183921	183930	20 %	0 %	60 %	20 %	15829418
109	NC_002695	GTGAT	2	10	186080	186089	20 %	40 %	40 %	0 %	15829419
110	NC_002695	GTGAT	2	10	186371	186380	20 %	40 %	40 %	0 %	15829419
111	NC_002695	GCCAG	2	10	190090	190099	20 %	0 %	40 %	40 %	15829423
112	NC_002695	GTTCT	2	10	191531	191540	0 %	60 %	20 %	20 %	15829423
113	NC_002695	CTGAA	2	10	193523	193532	40 %	20 %	20 %	20 %	15829425
114	NC_002695	AAGCG	2	10	193587	193596	40 %	0 %	40 %	20 %	15829425
115	NC_002695	TGGTG	2	10	195493	195502	0 %	40 %	60 %	0 %	15829427
116	NC_002695	TGCAC	2	10	195619	195628	20 %	20 %	20 %	40 %	15829427
117	NC_002695	TGCGC	2	10	196012	196021	0 %	20 %	40 %	40 %	15829427
118	NC_002695	CATGG	2	10	197713	197722	20 %	20 %	40 %	20 %	15829429
119	NC_002695	CAGAT	2	10	198752	198761	40 %	20 %	20 %	20 %	15829430
120	NC_002695	ACTTT	2	10	198885	198894	20 %	60 %	0 %	20 %	15829430
121	NC_002695	GACGT	2	10	202805	202814	20 %	20 %	40 %	20 %	15829433
122	NC_002695	CGACG	2	10	204631	204640	20 %	0 %	40 %	40 %	15829435
123	NC_002695	CCACG	2	10	206472	206481	20 %	0 %	20 %	60 %	15829437
124	NC_002695	ATGCC	2	10	207199	207208	20 %	20 %	20 %	40 %	15829438
125	NC_002695	TGGCC	2	10	208525	208534	0 %	20 %	40 %	40 %	15829440
126	NC_002695	ACCGC	2	10	208538	208547	20 %	0 %	20 %	60 %	15829440
127	NC_002695	GTAAC	2	10	209268	209277	40 %	20 %	20 %	20 %	15829440
128	NC_002695	AGCCG	2	10	209896	209905	20 %	0 %	40 %	40 %	15829440
129	NC_002695	GGTGG	2	10	210005	210014	0 %	20 %	80 %	0 %	15829440
130	NC_002695	TTAGT	2	10	216966	216975	20 %	60 %	20 %	0 %	15829444
131	NC_002695	ACGGT	2	10	221049	221058	20 %	20 %	40 %	20 %	15829450
132	NC_002695	TGATT	2	10	223890	223899	20 %	60 %	20 %	0 %	15829453
133	NC_002695	CGCAA	2	10	225340	225349	40 %	0 %	20 %	40 %	15829455
134	NC_002695	GTGAA	2	10	235720	235729	40 %	20 %	40 %	0 %	15829460
135	NC_002695	TAATT	2	10	235904	235913	40 %	60 %	0 %	0 %	15829460
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262	NC_002695	GTTGA	2	10	457546	457555	20 %	40 %	40 %	0 %	15829681
263	NC_002695	AAATC	2	10	458024	458033	60 %	20 %	0 %	20 %	15829682
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