MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLb

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002682	CGTTAG	2	12	723	734	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_002682	CTCGCC	2	12	1347	1358	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	13488373
3	NC_002682	CATCGA	2	12	7749	7760	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	13488379
4	NC_002682	CATGGC	2	12	10811	10822	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13488381
5	NC_002682	CCGACA	2	12	14587	14598	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	13488386
6	NC_002682	CGGGCG	2	12	15242	15253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_002682	CGCCTT	2	12	16982	16993	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	13488387
8	NC_002682	CACGAC	2	12	17728	17739	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	13488387
9	NC_002682	ACCACG	2	12	23208	23219	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	13488396
10	NC_002682	AAGGCG	2	12	24521	24532	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	13488398
11	NC_002682	GGCGCC	2	12	25521	25532	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
12	NC_002682	ACGGCT	2	12	27586	27597	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13488400
13	NC_002682	CGCAGG	2	12	34287	34298	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13488407
14	NC_002682	CTCGGC	2	12	37194	37205	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13488410
15	NC_002682	GGTGAC	2	12	45850	45861	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13488424
16	NC_002682	CGACGG	2	12	46650	46661	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_002682	TGACGA	2	12	51237	51248	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_002682	GATCGA	2	12	51864	51875	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13488431
19	NC_002682	GTGCCA	2	12	55637	55648	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13488433
20	NC_002682	TGGACA	2	12	56142	56153	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_002682	TCAAGT	2	12	57199	57210	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_002682	ATGTCG	2	12	60794	60805	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	13488442
23	NC_002682	TCCCCC	2	12	62039	62050	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
24	NC_002682	CGTGGA	2	12	62474	62485	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_002682	GAGCGC	2	12	77344	77355	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13488456
26	NC_002682	AGCGCG	2	12	77425	77436	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13488456
27	NC_002682	GTCGGC	2	12	79345	79356	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13488457
28	NC_002682	CAGGAA	2	12	79915	79926	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	13488457
29	NC_002682	ACGGCG	2	12	81532	81543	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13488460
30	NC_002682	ATCGAT	2	12	90031	90042	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	13488469
31	NC_002682	CACCGC	2	12	93478	93489	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_002682	CTCTAT	2	12	94894	94905	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_002682	ATCGCC	2	12	97943	97954	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	13488474
34	NC_002682	CACCGA	2	12	99784	99795	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_002682	CTACGC	2	12	103519	103530	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	13488479
36	NC_002682	GCGCGG	2	12	103896	103907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_002682	CCTTGC	2	12	111645	111656	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	13488484
38	NC_002682	ATGGCG	2	12	116061	116072	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13488489
39	NC_002682	AGCGGC	2	12	117921	117932	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13488491
40	NC_002682	GCGAAG	2	12	119728	119739	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	13488492
41	NC_002682	ATGCGC	2	12	120173	120184	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13488493
42	NC_002682	GATCGA	2	12	124506	124517	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13488497
43	NC_002682	TGCCGC	2	12	125549	125560	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13488498
44	NC_002682	TGTCCG	2	12	127898	127909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488499
45	NC_002682	CCGGCG	2	12	138090	138101	0 %	0 %	50 %	50 %	13488512
46	NC_002682	CGTTTT	2	12	139128	139139	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_002682	CGCGTG	2	12	140686	140697	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13488516
48	NC_002682	GCCACC	2	12	143717	143728	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	13488518
49	NC_002682	CTGATA	2	12	146897	146908	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	13488522
50	NC_002682	GGTCTT	2	12	149560	149571	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	13488524
51	NC_002682	CTCGAT	2	12	149761	149772	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13488524
52	NC_002682	TGCGGC	2	12	152523	152534	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_002682	GAGAGG	2	12	160218	160229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488537
54	NC_002682	TCACCA	2	12	163310	163321	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	13488538
55	NC_002682	GCTGAC	2	12	165861	165872	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13488538
56	NC_002682	TCGAAC	2	12	168634	168645	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	13488540
57	NC_002682	GCCTTC	2	12	169581	169592	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	13488541
58	NC_002682	TCAAGA	2	12	171523	171534	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	13488544
59	NC_002682	CGAGGG	2	12	171626	171637	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	13488544
60	NC_002682	CTCGCG	2	12	172829	172840	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13488546
61	NC_002682	TCTTGC	2	12	173223	173234	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	13488546
62	NC_002682	CGTCCT	2	12	174435	174446	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	13488547
63	NC_002682	GCCGTC	2	12	177155	177166	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13488550
64	NC_002682	GCAGAC	2	12	178159	178170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488551
65	NC_002682	GTCGGG	2	12	185243	185254	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	13488556
66	NC_002682	TCCGGA	2	12	185808	185819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13488556
67	NC_002682	GACGTC	2	12	195827	195838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13488566
68	NC_002682	ATCGTC	2	12	201290	201301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13488573
69	NC_002682	ATCGCG	2	12	201512	201523	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13488573
70	NC_002682	CGCGAT	2	12	203947	203958	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13488575
71	NC_002682	TGAGTT	2	12	204671	204682	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.