MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLb

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002682	AAGGC	2	10	2232	2241	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_002682	GGAAA	2	10	4312	4321	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002682	GCGAG	2	10	17767	17776	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_002682	CGGTG	2	10	20410	20419	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_002682	TTTCG	2	10	30811	30820	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_002682	CAAGA	2	10	35341	35350	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_002682	GTTGA	2	10	35877	35886	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002682	AACCC	2	10	35899	35908	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_002682	CTGTC	2	10	39186	39195	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_002682	AACCA	2	10	40356	40365	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_002682	ACTTC	2	10	44501	44510	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_002682	AGTTT	2	10	45047	45056	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002682	TAGGA	2	10	45088	45097	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002682	AGCGC	2	10	47329	47338	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_002682	GAAGG	2	10	51253	51262	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002682	GACCG	2	10	55950	55959	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_002682	GCCTC	2	10	70133	70142	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_002682	CGTAG	2	10	81996	82005	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_002682	AGCGA	2	10	87391	87400	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_002682	GGCAG	2	10	87451	87460	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_002682	GCCTC	2	10	88660	88669	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_002682	TGGCT	2	10	96159	96168	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_002682	CCAGG	2	10	102456	102465	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_002682	AAGTG	2	10	102481	102490	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002682	CGCTC	2	10	103998	104007	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_002682	CCAGC	2	10	104054	104063	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_002682	TTCCC	2	10	109147	109156	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_002682	CGAGG	2	10	109812	109821	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_002682	GACCC	2	10	110860	110869	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_002682	CCCCT	2	10	121255	121264	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
31	NC_002682	CGGCC	2	10	132569	132578	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_002682	ATGAC	2	10	135984	135993	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_002682	GAGGT	2	10	137447	137456	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002682	CCTTG	2	10	141391	141400	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_002682	ATGCC	2	10	152822	152831	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_002682	CGGCT	2	10	154896	154905	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_002682	TACCT	2	10	154941	154950	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_002682	TGGTC	2	10	169395	169404	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_002682	GACGC	2	10	174580	174589	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_002682	GCGGA	2	10	174762	174771	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_002682	GGCAT	2	10	178474	178483	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_002682	GAAGG	2	10	190335	190344	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002682	CATGA	2	10	192893	192902	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_002682	GCCGC	2	10	193340	193349	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_002682	GAGCG	2	10	193524	193533	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_002682	GTGTC	2	10	194235	194244	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_002682	GGCCG	2	10	194453	194462	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_002682	CCGCG	2	10	195399	195408	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_002682	AAACG	2	10	204774	204783	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_002682	TTTCC	2	10	207543	207552	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.