MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLb

Total Repeats: 400

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002682	ACAG	2	8	1490	1497	50 %	0 %	25 %	25 %	13488373
2	NC_002682	GATC	2	8	1572	1579	25 %	25 %	25 %	25 %	13488373
3	NC_002682	ATGG	2	8	1604	1611	25 %	25 %	50 %	0 %	13488373
4	NC_002682	CCGC	2	8	3587	3594	0 %	0 %	25 %	75 %	13488376
5	NC_002682	ACGG	2	8	6148	6155	25 %	0 %	50 %	25 %	13488378
6	NC_002682	CGGA	2	8	6279	6286	25 %	0 %	50 %	25 %	13488378
7	NC_002682	GAAC	2	8	6329	6336	50 %	0 %	25 %	25 %	13488378
8	NC_002682	GCCC	2	8	6419	6426	0 %	0 %	25 %	75 %	13488378
9	NC_002682	CCAT	2	8	7130	7137	25 %	25 %	0 %	50 %	13488379
10	NC_002682	CCGC	2	8	7325	7332	0 %	0 %	25 %	75 %	13488379
11	NC_002682	CGGC	2	8	7663	7670	0 %	0 %	50 %	50 %	13488379
12	NC_002682	GGCG	2	8	8007	8014	0 %	0 %	75 %	25 %	13488379
13	NC_002682	CAGC	2	8	8469	8476	25 %	0 %	25 %	50 %	13488379
14	NC_002682	GCCA	2	8	8623	8630	25 %	0 %	25 %	50 %	13488379
15	NC_002682	CTCG	2	8	8872	8879	0 %	25 %	25 %	50 %	13488379
16	NC_002682	GCAT	2	8	9063	9070	25 %	25 %	25 %	25 %	13488379
17	NC_002682	TGAA	2	8	9564	9571	50 %	25 %	25 %	0 %	13488380
18	NC_002682	ACCG	2	8	9603	9610	25 %	0 %	25 %	50 %	13488380
19	NC_002682	GCCA	2	8	9616	9623	25 %	0 %	25 %	50 %	13488380
20	NC_002682	GCCG	2	8	9937	9944	0 %	0 %	50 %	50 %	13488381
21	NC_002682	GCCT	2	8	10242	10249	0 %	25 %	25 %	50 %	13488381
22	NC_002682	GCTC	2	8	10291	10298	0 %	25 %	25 %	50 %	13488381
23	NC_002682	GACC	2	8	10450	10457	25 %	0 %	25 %	50 %	13488381
24	NC_002682	GGTT	2	8	11026	11033	0 %	50 %	50 %	0 %	13488381
25	NC_002682	TTGA	2	8	11685	11692	25 %	50 %	25 %	0 %	13488383
26	NC_002682	GCCT	2	8	12066	12073	0 %	25 %	25 %	50 %	13488383
27	NC_002682	TGAT	2	8	12148	12155	25 %	50 %	25 %	0 %	13488383
28	NC_002682	GCCG	2	8	12201	12208	0 %	0 %	50 %	50 %	13488383
29	NC_002682	TTGG	2	8	12906	12913	0 %	50 %	50 %	0 %	13488383
30	NC_002682	TCTG	2	8	13767	13774	0 %	50 %	25 %	25 %	13488385
31	NC_002682	CGAT	2	8	14732	14739	25 %	25 %	25 %	25 %	13488386
32	NC_002682	CGAT	2	8	14774	14781	25 %	25 %	25 %	25 %	13488386
33	NC_002682	CAGG	2	8	17158	17165	25 %	0 %	50 %	25 %	13488387
34	NC_002682	GGCG	2	8	17419	17426	0 %	0 %	75 %	25 %	13488387
35	NC_002682	AGTA	2	8	19214	19221	50 %	25 %	25 %	0 %	13488389
36	NC_002682	TGTT	2	8	21634	21641	0 %	75 %	25 %	0 %	13488392
37	NC_002682	TTGA	2	8	22042	22049	25 %	50 %	25 %	0 %	13488393
38	NC_002682	TGGT	2	8	22621	22628	0 %	50 %	50 %	0 %	13488394
39	NC_002682	CGGG	2	8	22752	22759	0 %	0 %	75 %	25 %	13488394
40	NC_002682	TCGC	2	8	22834	22841	0 %	25 %	25 %	50 %	13488395
41	NC_002682	CGGC	2	8	22894	22901	0 %	0 %	50 %	50 %	13488395
42	NC_002682	GCCG	2	8	23739	23746	0 %	0 %	50 %	50 %	13488397
43	NC_002682	CGGC	2	8	23831	23838	0 %	0 %	50 %	50 %	13488397
44	NC_002682	CGGT	2	8	24161	24168	0 %	25 %	50 %	25 %	13488397
45	NC_002682	AGGC	2	8	24170	24177	25 %	0 %	50 %	25 %	13488397
46	NC_002682	TCGA	2	8	24220	24227	25 %	25 %	25 %	25 %	13488398
47	NC_002682	TTGG	2	8	24796	24803	0 %	50 %	50 %	0 %	13488399
48	NC_002682	ATGC	2	8	25467	25474	25 %	25 %	25 %	25 %	13488399
49	NC_002682	GCAG	2	8	25891	25898	25 %	0 %	50 %	25 %	13488399
50	NC_002682	TGCT	2	8	26335	26342	0 %	50 %	25 %	25 %	13488399
51	NC_002682	GAGG	2	8	26399	26406	25 %	0 %	75 %	0 %	13488399
52	NC_002682	GCTG	2	8	26559	26566	0 %	25 %	50 %	25 %	13488399
53	NC_002682	CGAT	2	8	26609	26616	25 %	25 %	25 %	25 %	13488399
54	NC_002682	CTGG	2	8	26962	26969	0 %	25 %	50 %	25 %	13488399
55	NC_002682	CGGC	2	8	27103	27110	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
56	NC_002682	TCAG	2	8	27976	27983	25 %	25 %	25 %	25 %	13488400
57	NC_002682	CAAC	2	8	28540	28547	50 %	0 %	0 %	50 %	13488401
58	NC_002682	CTGG	2	8	29103	29110	0 %	25 %	50 %	25 %	13488401
59	NC_002682	CTTT	2	8	29182	29189	0 %	75 %	0 %	25 %	13488401
60	NC_002682	GCAG	2	8	29224	29231	25 %	0 %	50 %	25 %	13488401
61	NC_002682	GTTC	2	8	29344	29351	0 %	50 %	25 %	25 %	13488402
62	NC_002682	GCTG	2	8	29384	29391	0 %	25 %	50 %	25 %	13488402
63	NC_002682	CGAT	2	8	29611	29618	25 %	25 %	25 %	25 %	13488402
64	NC_002682	TCAC	2	8	29649	29656	25 %	25 %	0 %	50 %	13488402
65	NC_002682	AGGC	2	8	29720	29727	25 %	0 %	50 %	25 %	13488402
66	NC_002682	GCAA	2	8	30273	30280	50 %	0 %	25 %	25 %	13488402
67	NC_002682	AGCG	2	8	30351	30358	25 %	0 %	50 %	25 %	13488402
68	NC_002682	CGCA	2	8	32300	32307	25 %	0 %	25 %	50 %	13488405
69	NC_002682	GATC	2	8	32940	32947	25 %	25 %	25 %	25 %	13488406
70	NC_002682	AGCG	2	8	34605	34612	25 %	0 %	50 %	25 %	13488408
71	NC_002682	CGGC	2	8	34726	34733	0 %	0 %	50 %	50 %	13488408
72	NC_002682	TCGG	2	8	37245	37252	0 %	25 %	50 %	25 %	13488410
73	NC_002682	CATG	2	8	37619	37626	25 %	25 %	25 %	25 %	13488410
74	NC_002682	GGCG	2	8	39441	39448	0 %	0 %	75 %	25 %	13488414
75	NC_002682	CGCA	2	8	39550	39557	25 %	0 %	25 %	50 %	13488414
76	NC_002682	CGCC	2	8	39664	39671	0 %	0 %	25 %	75 %	13488414
77	NC_002682	GTGC	2	8	40460	40467	0 %	25 %	50 %	25 %	13488417
78	NC_002682	TCGA	2	8	40508	40515	25 %	25 %	25 %	25 %	13488417
79	NC_002682	CAGC	2	8	42686	42693	25 %	0 %	25 %	50 %	13488418
80	NC_002682	TAGG	2	8	42802	42809	25 %	25 %	50 %	0 %	13488418
81	NC_002682	GCTG	2	8	44122	44129	0 %	25 %	50 %	25 %	13488421
82	NC_002682	TGAC	2	8	44680	44687	25 %	25 %	25 %	25 %	13488423
83	NC_002682	AACC	2	8	46324	46331	50 %	0 %	0 %	50 %	13488425
84	NC_002682	CCGC	2	8	49102	49109	0 %	0 %	25 %	75 %	13488426
85	NC_002682	CTGG	2	8	49724	49731	0 %	25 %	50 %	25 %	13488427
86	NC_002682	TCGG	2	8	49768	49775	0 %	25 %	50 %	25 %	13488427
87	NC_002682	GGCT	2	8	49789	49796	0 %	25 %	50 %	25 %	13488427
88	NC_002682	GCTG	2	8	50247	50254	0 %	25 %	50 %	25 %	13488428
89	NC_002682	TGCG	2	8	50672	50679	0 %	25 %	50 %	25 %	13488429
90	NC_002682	GCTG	2	8	50783	50790	0 %	25 %	50 %	25 %	13488429
91	NC_002682	TCGG	2	8	50864	50871	0 %	25 %	50 %	25 %	13488429
92	NC_002682	GCAG	2	8	50987	50994	25 %	0 %	50 %	25 %	13488430
93	NC_002682	TGAA	2	8	51123	51130	50 %	25 %	25 %	0 %	13488430
94	NC_002682	GGCT	2	8	51827	51834	0 %	25 %	50 %	25 %	13488431
95	NC_002682	TGGT	2	8	52668	52675	0 %	50 %	50 %	0 %	13488431
96	NC_002682	TCGT	2	8	53075	53082	0 %	50 %	25 %	25 %	13488432
97	NC_002682	CGTT	2	8	53108	53115	0 %	50 %	25 %	25 %	13488432
98	NC_002682	ATTG	2	8	53172	53179	25 %	50 %	25 %	0 %	13488432
99	NC_002682	GGCG	2	8	53624	53631	0 %	0 %	75 %	25 %	13488432
100	NC_002682	CGGG	2	8	54710	54717	0 %	0 %	75 %	25 %	13488433
101	NC_002682	CCCG	2	8	55391	55398	0 %	0 %	25 %	75 %	13488433
102	NC_002682	GATC	2	8	55518	55525	25 %	25 %	25 %	25 %	13488433
103	NC_002682	ATCG	2	8	57466	57473	25 %	25 %	25 %	25 %	13488438
104	NC_002682	CATC	2	8	59719	59726	25 %	25 %	0 %	50 %	13488441
105	NC_002682	CCGA	2	8	59730	59737	25 %	0 %	25 %	50 %	13488441
106	NC_002682	GCGG	2	8	59746	59753	0 %	0 %	75 %	25 %	13488441
107	NC_002682	CTGG	2	8	59939	59946	0 %	25 %	50 %	25 %	13488441
108	NC_002682	CAAC	2	8	60270	60277	50 %	0 %	0 %	50 %	13488441
109	NC_002682	CGAC	2	8	60693	60700	25 %	0 %	25 %	50 %	13488442
110	NC_002682	CCAT	2	8	60776	60783	25 %	25 %	0 %	50 %	13488442
111	NC_002682	CAAC	2	8	60942	60949	50 %	0 %	0 %	50 %	13488442
112	NC_002682	GACG	2	8	63132	63139	25 %	0 %	50 %	25 %	13488444
113	NC_002682	CGCA	2	8	63267	63274	25 %	0 %	25 %	50 %	13488444
114	NC_002682	GCTT	2	8	66535	66542	0 %	50 %	25 %	25 %	13488445
115	NC_002682	GCCT	2	8	67720	67727	0 %	25 %	25 %	50 %	13488447
116	NC_002682	TGGC	2	8	67757	67764	0 %	25 %	50 %	25 %	13488447
117	NC_002682	TTGG	2	8	68099	68106	0 %	50 %	50 %	0 %	13488447
118	NC_002682	AGCG	2	8	68438	68445	25 %	0 %	50 %	25 %	13488447
119	NC_002682	CGGC	2	8	68697	68704	0 %	0 %	50 %	50 %	13488447
120	NC_002682	CATG	2	8	69150	69157	25 %	25 %	25 %	25 %	13488447
121	NC_002682	GCTG	2	8	71576	71583	0 %	25 %	50 %	25 %	13488449
122	NC_002682	CCAC	2	8	71791	71798	25 %	0 %	0 %	75 %	13488450
123	NC_002682	TTGC	2	8	71861	71868	0 %	50 %	25 %	25 %	13488450
124	NC_002682	ACGA	2	8	72654	72661	50 %	0 %	25 %	25 %	13488452
125	NC_002682	AGGA	2	8	73117	73124	50 %	0 %	50 %	0 %	13488452
126	NC_002682	CGAG	2	8	73523	73530	25 %	0 %	50 %	25 %	13488452
127	NC_002682	CGTC	2	8	73926	73933	0 %	25 %	25 %	50 %	13488453
128	NC_002682	CCGC	2	8	74164	74171	0 %	0 %	25 %	75 %	13488453
129	NC_002682	GGTC	2	8	74982	74989	0 %	25 %	50 %	25 %	13488454
130	NC_002682	GTCG	2	8	75094	75101	0 %	25 %	50 %	25 %	13488454
131	NC_002682	GAGC	2	8	75232	75239	25 %	0 %	50 %	25 %	13488454
132	NC_002682	TGCC	2	8	75747	75754	0 %	25 %	25 %	50 %	13488455
133	NC_002682	GCCC	2	8	75957	75964	0 %	0 %	25 %	75 %	13488455
134	NC_002682	CAAG	2	8	76386	76393	50 %	0 %	25 %	25 %	13488455
135	NC_002682	CATC	2	8	76870	76877	25 %	25 %	0 %	50 %	13488455
136	NC_002682	GGCC	2	8	77110	77117	0 %	0 %	50 %	50 %	13488456
137	NC_002682	TGGC	2	8	77316	77323	0 %	25 %	50 %	25 %	13488456
138	NC_002682	AGCG	2	8	77465	77472	25 %	0 %	50 %	25 %	13488456
139	NC_002682	TGCG	2	8	77556	77563	0 %	25 %	50 %	25 %	13488456
140	NC_002682	AGGC	2	8	77600	77607	25 %	0 %	50 %	25 %	13488456
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142	NC_002682	AGCC	2	8	78347	78354	25 %	0 %	25 %	50 %	13488457
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.