MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLb

Total Repeats: 437

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002682	GC	3	6	522	527	0 %	0 %	50 %	50 %	47060339
2	NC_002682	CA	3	6	927	932	50 %	0 %	0 %	50 %	47060340
3	NC_002682	CG	3	6	1063	1068	0 %	0 %	50 %	50 %	47060340
4	NC_002682	TC	3	6	2276	2281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_002682	CG	3	6	2353	2358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_002682	GC	3	6	3549	3554	0 %	0 %	50 %	50 %	13488376
7	NC_002682	GA	3	6	4669	4674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002682	CA	3	6	4765	4770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_002682	GC	3	6	5295	5300	0 %	0 %	50 %	50 %	13488377
10	NC_002682	CG	3	6	5603	5608	0 %	0 %	50 %	50 %	13488377
11	NC_002682	CG	3	6	6059	6064	0 %	0 %	50 %	50 %	13488378
12	NC_002682	GC	3	6	6614	6619	0 %	0 %	50 %	50 %	13488378
13	NC_002682	CG	5	10	7032	7041	0 %	0 %	50 %	50 %	13488379
14	NC_002682	GC	3	6	7334	7339	0 %	0 %	50 %	50 %	13488379
15	NC_002682	CG	3	6	7619	7624	0 %	0 %	50 %	50 %	13488379
16	NC_002682	GT	3	6	7977	7982	0 %	50 %	50 %	0 %	13488379
17	NC_002682	CG	3	6	10583	10588	0 %	0 %	50 %	50 %	13488381
18	NC_002682	CG	3	6	10894	10899	0 %	0 %	50 %	50 %	13488381
19	NC_002682	AC	3	6	11493	11498	50 %	0 %	0 %	50 %	13488382
20	NC_002682	CG	3	6	12357	12362	0 %	0 %	50 %	50 %	13488383
21	NC_002682	GC	3	6	13553	13558	0 %	0 %	50 %	50 %	13488385
22	NC_002682	CT	3	6	13566	13571	0 %	50 %	0 %	50 %	13488385
23	NC_002682	CG	3	6	13979	13984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_002682	AG	3	6	14200	14205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002682	TC	3	6	14952	14957	0 %	50 %	0 %	50 %	13488386
26	NC_002682	CG	3	6	15035	15040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_002682	GC	3	6	15198	15203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_002682	CA	3	6	15764	15769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_002682	AC	3	6	15914	15919	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_002682	AG	3	6	15929	15934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002682	GC	3	6	16027	16032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_002682	AT	3	6	16280	16285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002682	TC	3	6	18450	18455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_002682	CG	3	6	19801	19806	0 %	0 %	50 %	50 %	13488391
35	NC_002682	GA	3	6	20637	20642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002682	GC	3	6	21706	21711	0 %	0 %	50 %	50 %	13488392
37	NC_002682	CG	3	6	21835	21840	0 %	0 %	50 %	50 %	13488393
38	NC_002682	GC	3	6	22357	22362	0 %	0 %	50 %	50 %	13488394
39	NC_002682	CG	3	6	23027	23032	0 %	0 %	50 %	50 %	13488396
40	NC_002682	CG	3	6	23153	23158	0 %	0 %	50 %	50 %	13488396
41	NC_002682	TC	3	6	23282	23287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_002682	GC	3	6	24490	24495	0 %	0 %	50 %	50 %	13488398
43	NC_002682	GC	3	6	25044	25049	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
44	NC_002682	GC	3	6	25664	25669	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
45	NC_002682	CG	4	8	26107	26114	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
46	NC_002682	GC	4	8	26651	26658	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
47	NC_002682	GC	3	6	26849	26854	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
48	NC_002682	CG	4	8	26991	26998	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
49	NC_002682	GA	3	6	27205	27210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002682	GC	3	6	27438	27443	0 %	0 %	50 %	50 %	13488400
51	NC_002682	CG	3	6	27509	27514	0 %	0 %	50 %	50 %	13488400
52	NC_002682	GC	3	6	27550	27555	0 %	0 %	50 %	50 %	13488400
53	NC_002682	CG	3	6	27674	27679	0 %	0 %	50 %	50 %	13488400
54	NC_002682	GC	3	6	27698	27703	0 %	0 %	50 %	50 %	13488400
55	NC_002682	AT	3	6	28915	28920	50 %	50 %	0 %	0 %	13488401
56	NC_002682	GC	4	8	30153	30160	0 %	0 %	50 %	50 %	13488402
57	NC_002682	GC	4	8	30440	30447	0 %	0 %	50 %	50 %	13488402
58	NC_002682	GT	3	6	30693	30698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002682	GA	3	6	30778	30783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002682	CT	3	6	30791	30796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_002682	CG	3	6	30828	30833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002682	CG	3	6	31484	31489	0 %	0 %	50 %	50 %	13488404
63	NC_002682	CT	3	6	31661	31666	0 %	50 %	0 %	50 %	13488404
64	NC_002682	GC	3	6	31712	31717	0 %	0 %	50 %	50 %	13488404
65	NC_002682	GC	3	6	32071	32076	0 %	0 %	50 %	50 %	13488405
66	NC_002682	GC	3	6	32422	32427	0 %	0 %	50 %	50 %	13488405
67	NC_002682	AT	3	6	32638	32643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002682	GC	3	6	33369	33374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_002682	AT	3	6	34106	34111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002682	CA	3	6	34840	34845	50 %	0 %	0 %	50 %	13488408
71	NC_002682	GA	3	6	35191	35196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002682	CG	3	6	35734	35739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_002682	TC	3	6	36159	36164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_002682	GC	3	6	36318	36323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_002682	GC	3	6	38216	38221	0 %	0 %	50 %	50 %	13488412
76	NC_002682	TC	3	6	38543	38548	0 %	50 %	0 %	50 %	13488412
77	NC_002682	TC	3	6	38892	38897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_002682	GC	3	6	39776	39781	0 %	0 %	50 %	50 %	13488415
79	NC_002682	CG	3	6	39952	39957	0 %	0 %	50 %	50 %	13488416
80	NC_002682	CA	3	6	42269	42274	50 %	0 %	0 %	50 %	13488418
81	NC_002682	GC	3	6	42284	42289	0 %	0 %	50 %	50 %	13488418
82	NC_002682	GC	3	6	42742	42747	0 %	0 %	50 %	50 %	13488418
83	NC_002682	TC	3	6	43212	43217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_002682	CT	3	6	43314	43319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_002682	CT	3	6	43434	43439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_002682	GC	3	6	45536	45541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_002682	GC	3	6	45587	45592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_002682	TG	3	6	46544	46549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002682	GC	3	6	46835	46840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_002682	GC	3	6	47002	47007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_002682	TG	3	6	48114	48119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002682	GC	3	6	48609	48614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_002682	AT	3	6	49159	49164	50 %	50 %	0 %	0 %	13488426
94	NC_002682	GC	3	6	50448	50453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_002682	CG	3	6	50496	50501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_002682	TG	3	6	50858	50863	0 %	50 %	50 %	0 %	13488429
97	NC_002682	GC	3	6	51950	51955	0 %	0 %	50 %	50 %	13488431
98	NC_002682	CT	3	6	52168	52173	0 %	50 %	0 %	50 %	13488431
99	NC_002682	CT	3	6	52274	52279	0 %	50 %	0 %	50 %	13488431
100	NC_002682	TC	3	6	52425	52430	0 %	50 %	0 %	50 %	13488431
101	NC_002682	AC	3	6	52886	52891	50 %	0 %	0 %	50 %	13488432
102	NC_002682	CG	3	6	54501	54506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_002682	GC	3	6	56201	56206	0 %	0 %	50 %	50 %	13488434
104	NC_002682	GA	3	6	56715	56720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002682	GA	3	6	58658	58663	50 %	0 %	50 %	0 %	13488440
106	NC_002682	GC	3	6	59059	59064	0 %	0 %	50 %	50 %	13488440
107	NC_002682	GC	3	6	59089	59094	0 %	0 %	50 %	50 %	13488440
108	NC_002682	CG	3	6	59836	59841	0 %	0 %	50 %	50 %	13488441
109	NC_002682	GC	3	6	60038	60043	0 %	0 %	50 %	50 %	13488441
110	NC_002682	TC	3	6	60278	60283	0 %	50 %	0 %	50 %	13488441
111	NC_002682	CG	3	6	60703	60708	0 %	0 %	50 %	50 %	13488442
112	NC_002682	CT	3	6	61008	61013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_002682	GA	3	6	62191	62196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002682	GT	3	6	62643	62648	0 %	50 %	50 %	0 %	13488443
115	NC_002682	GC	3	6	62928	62933	0 %	0 %	50 %	50 %	13488443
116	NC_002682	GC	3	6	63403	63408	0 %	0 %	50 %	50 %	13488444
117	NC_002682	CG	3	6	63502	63507	0 %	0 %	50 %	50 %	13488444
118	NC_002682	AT	3	6	63681	63686	50 %	50 %	0 %	0 %	13488444
119	NC_002682	CG	3	6	64381	64386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_002682	TG	3	6	65751	65756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002682	CT	3	6	67212	67217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_002682	TC	3	6	67572	67577	0 %	50 %	0 %	50 %	13488447
123	NC_002682	CG	3	6	67916	67921	0 %	0 %	50 %	50 %	13488447
124	NC_002682	CT	3	6	67939	67944	0 %	50 %	0 %	50 %	13488447
125	NC_002682	CT	3	6	68275	68280	0 %	50 %	0 %	50 %	13488447
126	NC_002682	GC	3	6	68641	68646	0 %	0 %	50 %	50 %	13488447
127	NC_002682	AG	3	6	69453	69458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002682	CG	3	6	70639	70644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_002682	TG	3	6	71086	71091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002682	GC	3	6	71644	71649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_002682	TC	3	6	71871	71876	0 %	50 %	0 %	50 %	13488450
132	NC_002682	GC	3	6	72692	72697	0 %	0 %	50 %	50 %	13488452
133	NC_002682	CG	3	6	73235	73240	0 %	0 %	50 %	50 %	13488452
134	NC_002682	CG	3	6	73406	73411	0 %	0 %	50 %	50 %	13488452
135	NC_002682	GC	3	6	73416	73421	0 %	0 %	50 %	50 %	13488452
136	NC_002682	GC	3	6	73508	73513	0 %	0 %	50 %	50 %	13488452
137	NC_002682	CG	3	6	73577	73582	0 %	0 %	50 %	50 %	13488452
138	NC_002682	CG	3	6	73900	73905	0 %	0 %	50 %	50 %	13488453
139	NC_002682	GC	3	6	74240	74245	0 %	0 %	50 %	50 %	13488453
140	NC_002682	CG	3	6	74407	74412	0 %	0 %	50 %	50 %	13488453
141	NC_002682	CG	3	6	74436	74441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_002682	GC	3	6	74458	74463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_002682	CG	3	6	74469	74474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_002682	GC	3	6	75002	75007	0 %	0 %	50 %	50 %	13488454
145	NC_002682	GC	3	6	75251	75256	0 %	0 %	50 %	50 %	13488454
146	NC_002682	GC	3	6	75437	75442	0 %	0 %	50 %	50 %	13488455
147	NC_002682	GC	3	6	75462	75467	0 %	0 %	50 %	50 %	13488455
148	NC_002682	GA	3	6	75471	75476	50 %	0 %	50 %	0 %	13488455
149	NC_002682	GC	4	8	75716	75723	0 %	0 %	50 %	50 %	13488455
150	NC_002682	CG	3	6	75824	75829	0 %	0 %	50 %	50 %	13488455
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.