MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLb

Total Repeats: 316

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002682	GC	3	6	522	527	0 %	0 %	50 %	50 %	47060339
2	NC_002682	CA	3	6	927	932	50 %	0 %	0 %	50 %	47060340
3	NC_002682	CG	3	6	1063	1068	0 %	0 %	50 %	50 %	47060340
4	NC_002682	GC	3	6	3549	3554	0 %	0 %	50 %	50 %	13488376
5	NC_002682	GC	3	6	5295	5300	0 %	0 %	50 %	50 %	13488377
6	NC_002682	CG	3	6	5603	5608	0 %	0 %	50 %	50 %	13488377
7	NC_002682	CG	3	6	6059	6064	0 %	0 %	50 %	50 %	13488378
8	NC_002682	GC	3	6	6614	6619	0 %	0 %	50 %	50 %	13488378
9	NC_002682	CG	5	10	7032	7041	0 %	0 %	50 %	50 %	13488379
10	NC_002682	GC	3	6	7334	7339	0 %	0 %	50 %	50 %	13488379
11	NC_002682	CG	3	6	7619	7624	0 %	0 %	50 %	50 %	13488379
12	NC_002682	GT	3	6	7977	7982	0 %	50 %	50 %	0 %	13488379
13	NC_002682	CG	3	6	10583	10588	0 %	0 %	50 %	50 %	13488381
14	NC_002682	CG	3	6	10894	10899	0 %	0 %	50 %	50 %	13488381
15	NC_002682	AC	3	6	11493	11498	50 %	0 %	0 %	50 %	13488382
16	NC_002682	CG	3	6	12357	12362	0 %	0 %	50 %	50 %	13488383
17	NC_002682	GC	3	6	13553	13558	0 %	0 %	50 %	50 %	13488385
18	NC_002682	CT	3	6	13566	13571	0 %	50 %	0 %	50 %	13488385
19	NC_002682	TC	3	6	14952	14957	0 %	50 %	0 %	50 %	13488386
20	NC_002682	CG	3	6	19801	19806	0 %	0 %	50 %	50 %	13488391
21	NC_002682	GC	3	6	21706	21711	0 %	0 %	50 %	50 %	13488392
22	NC_002682	CG	3	6	21835	21840	0 %	0 %	50 %	50 %	13488393
23	NC_002682	GC	3	6	22357	22362	0 %	0 %	50 %	50 %	13488394
24	NC_002682	CG	3	6	23027	23032	0 %	0 %	50 %	50 %	13488396
25	NC_002682	CG	3	6	23153	23158	0 %	0 %	50 %	50 %	13488396
26	NC_002682	GC	3	6	24490	24495	0 %	0 %	50 %	50 %	13488398
27	NC_002682	GC	3	6	25044	25049	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
28	NC_002682	GC	3	6	25664	25669	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
29	NC_002682	CG	4	8	26107	26114	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
30	NC_002682	GC	4	8	26651	26658	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
31	NC_002682	GC	3	6	26849	26854	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
32	NC_002682	CG	4	8	26991	26998	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
33	NC_002682	GC	3	6	27438	27443	0 %	0 %	50 %	50 %	13488400
34	NC_002682	CG	3	6	27509	27514	0 %	0 %	50 %	50 %	13488400
35	NC_002682	GC	3	6	27550	27555	0 %	0 %	50 %	50 %	13488400
36	NC_002682	CG	3	6	27674	27679	0 %	0 %	50 %	50 %	13488400
37	NC_002682	GC	3	6	27698	27703	0 %	0 %	50 %	50 %	13488400
38	NC_002682	AT	3	6	28915	28920	50 %	50 %	0 %	0 %	13488401
39	NC_002682	GC	4	8	30153	30160	0 %	0 %	50 %	50 %	13488402
40	NC_002682	GC	4	8	30440	30447	0 %	0 %	50 %	50 %	13488402
41	NC_002682	CG	3	6	31484	31489	0 %	0 %	50 %	50 %	13488404
42	NC_002682	CT	3	6	31661	31666	0 %	50 %	0 %	50 %	13488404
43	NC_002682	GC	3	6	31712	31717	0 %	0 %	50 %	50 %	13488404
44	NC_002682	GC	3	6	32071	32076	0 %	0 %	50 %	50 %	13488405
45	NC_002682	GC	3	6	32422	32427	0 %	0 %	50 %	50 %	13488405
46	NC_002682	CA	3	6	34840	34845	50 %	0 %	0 %	50 %	13488408
47	NC_002682	GC	3	6	38216	38221	0 %	0 %	50 %	50 %	13488412
48	NC_002682	TC	3	6	38543	38548	0 %	50 %	0 %	50 %	13488412
49	NC_002682	GC	3	6	39776	39781	0 %	0 %	50 %	50 %	13488415
50	NC_002682	CG	3	6	39952	39957	0 %	0 %	50 %	50 %	13488416
51	NC_002682	CA	3	6	42269	42274	50 %	0 %	0 %	50 %	13488418
52	NC_002682	GC	3	6	42284	42289	0 %	0 %	50 %	50 %	13488418
53	NC_002682	GC	3	6	42742	42747	0 %	0 %	50 %	50 %	13488418
54	NC_002682	AT	3	6	49159	49164	50 %	50 %	0 %	0 %	13488426
55	NC_002682	TG	3	6	50858	50863	0 %	50 %	50 %	0 %	13488429
56	NC_002682	GC	3	6	51950	51955	0 %	0 %	50 %	50 %	13488431
57	NC_002682	CT	3	6	52168	52173	0 %	50 %	0 %	50 %	13488431
58	NC_002682	CT	3	6	52274	52279	0 %	50 %	0 %	50 %	13488431
59	NC_002682	TC	3	6	52425	52430	0 %	50 %	0 %	50 %	13488431
60	NC_002682	AC	3	6	52886	52891	50 %	0 %	0 %	50 %	13488432
61	NC_002682	GC	3	6	56201	56206	0 %	0 %	50 %	50 %	13488434
62	NC_002682	GA	3	6	58658	58663	50 %	0 %	50 %	0 %	13488440
63	NC_002682	GC	3	6	59059	59064	0 %	0 %	50 %	50 %	13488440
64	NC_002682	GC	3	6	59089	59094	0 %	0 %	50 %	50 %	13488440
65	NC_002682	CG	3	6	59836	59841	0 %	0 %	50 %	50 %	13488441
66	NC_002682	GC	3	6	60038	60043	0 %	0 %	50 %	50 %	13488441
67	NC_002682	TC	3	6	60278	60283	0 %	50 %	0 %	50 %	13488441
68	NC_002682	CG	3	6	60703	60708	0 %	0 %	50 %	50 %	13488442
69	NC_002682	GT	3	6	62643	62648	0 %	50 %	50 %	0 %	13488443
70	NC_002682	GC	3	6	62928	62933	0 %	0 %	50 %	50 %	13488443
71	NC_002682	GC	3	6	63403	63408	0 %	0 %	50 %	50 %	13488444
72	NC_002682	CG	3	6	63502	63507	0 %	0 %	50 %	50 %	13488444
73	NC_002682	AT	3	6	63681	63686	50 %	50 %	0 %	0 %	13488444
74	NC_002682	TC	3	6	67572	67577	0 %	50 %	0 %	50 %	13488447
75	NC_002682	CG	3	6	67916	67921	0 %	0 %	50 %	50 %	13488447
76	NC_002682	CT	3	6	67939	67944	0 %	50 %	0 %	50 %	13488447
77	NC_002682	CT	3	6	68275	68280	0 %	50 %	0 %	50 %	13488447
78	NC_002682	GC	3	6	68641	68646	0 %	0 %	50 %	50 %	13488447
79	NC_002682	TC	3	6	71871	71876	0 %	50 %	0 %	50 %	13488450
80	NC_002682	GC	3	6	72692	72697	0 %	0 %	50 %	50 %	13488452
81	NC_002682	CG	3	6	73235	73240	0 %	0 %	50 %	50 %	13488452
82	NC_002682	CG	3	6	73406	73411	0 %	0 %	50 %	50 %	13488452
83	NC_002682	GC	3	6	73416	73421	0 %	0 %	50 %	50 %	13488452
84	NC_002682	GC	3	6	73508	73513	0 %	0 %	50 %	50 %	13488452
85	NC_002682	CG	3	6	73577	73582	0 %	0 %	50 %	50 %	13488452
86	NC_002682	CG	3	6	73900	73905	0 %	0 %	50 %	50 %	13488453
87	NC_002682	GC	3	6	74240	74245	0 %	0 %	50 %	50 %	13488453
88	NC_002682	CG	3	6	74407	74412	0 %	0 %	50 %	50 %	13488453
89	NC_002682	GC	3	6	75002	75007	0 %	0 %	50 %	50 %	13488454
90	NC_002682	GC	3	6	75251	75256	0 %	0 %	50 %	50 %	13488454
91	NC_002682	GC	3	6	75437	75442	0 %	0 %	50 %	50 %	13488455
92	NC_002682	GC	3	6	75462	75467	0 %	0 %	50 %	50 %	13488455
93	NC_002682	GA	3	6	75471	75476	50 %	0 %	50 %	0 %	13488455
94	NC_002682	GC	4	8	75716	75723	0 %	0 %	50 %	50 %	13488455
95	NC_002682	CG	3	6	75824	75829	0 %	0 %	50 %	50 %	13488455
96	NC_002682	GC	3	6	77618	77623	0 %	0 %	50 %	50 %	13488456
97	NC_002682	CG	3	6	77691	77696	0 %	0 %	50 %	50 %	13488456
98	NC_002682	GC	3	6	77817	77822	0 %	0 %	50 %	50 %	13488456
99	NC_002682	CG	4	8	78169	78176	0 %	0 %	50 %	50 %	13488457
100	NC_002682	GC	3	6	78441	78446	0 %	0 %	50 %	50 %	13488457
101	NC_002682	GC	3	6	78725	78730	0 %	0 %	50 %	50 %	13488457
102	NC_002682	CG	3	6	79507	79512	0 %	0 %	50 %	50 %	13488457
103	NC_002682	GT	3	6	79743	79748	0 %	50 %	50 %	0 %	13488457
104	NC_002682	GC	3	6	79826	79831	0 %	0 %	50 %	50 %	13488457
105	NC_002682	GC	3	6	79889	79894	0 %	0 %	50 %	50 %	13488457
106	NC_002682	CG	3	6	80171	80176	0 %	0 %	50 %	50 %	13488457
107	NC_002682	CG	3	6	80485	80490	0 %	0 %	50 %	50 %	13488458
108	NC_002682	GC	3	6	80491	80496	0 %	0 %	50 %	50 %	13488458
109	NC_002682	GA	3	6	80651	80656	50 %	0 %	50 %	0 %	13488458
110	NC_002682	CG	3	6	81010	81015	0 %	0 %	50 %	50 %	13488460
111	NC_002682	GC	3	6	81119	81124	0 %	0 %	50 %	50 %	13488460
112	NC_002682	CG	3	6	81447	81452	0 %	0 %	50 %	50 %	13488460
113	NC_002682	GC	4	8	81858	81865	0 %	0 %	50 %	50 %	13488460
114	NC_002682	CT	3	6	82685	82690	0 %	50 %	0 %	50 %	13488461
115	NC_002682	TC	3	6	82794	82799	0 %	50 %	0 %	50 %	13488461
116	NC_002682	CG	3	6	83750	83755	0 %	0 %	50 %	50 %	13488463
117	NC_002682	GC	3	6	83900	83905	0 %	0 %	50 %	50 %	13488463
118	NC_002682	CG	3	6	84118	84123	0 %	0 %	50 %	50 %	13488463
119	NC_002682	TC	3	6	84348	84353	0 %	50 %	0 %	50 %	13488463
120	NC_002682	GC	3	6	86079	86084	0 %	0 %	50 %	50 %	13488465
121	NC_002682	GC	3	6	87002	87007	0 %	0 %	50 %	50 %	13488466
122	NC_002682	AG	3	6	87908	87913	50 %	0 %	50 %	0 %	13488467
123	NC_002682	CG	3	6	89731	89736	0 %	0 %	50 %	50 %	13488468
124	NC_002682	GA	3	6	89963	89968	50 %	0 %	50 %	0 %	13488469
125	NC_002682	GC	3	6	90204	90209	0 %	0 %	50 %	50 %	13488469
126	NC_002682	CG	3	6	90224	90229	0 %	0 %	50 %	50 %	13488469
127	NC_002682	GC	5	10	91163	91172	0 %	0 %	50 %	50 %	13488470
128	NC_002682	GC	3	6	91447	91452	0 %	0 %	50 %	50 %	13488470
129	NC_002682	GC	3	6	91843	91848	0 %	0 %	50 %	50 %	13488470
130	NC_002682	GC	3	6	92100	92105	0 %	0 %	50 %	50 %	13488470
131	NC_002682	GC	3	6	92380	92385	0 %	0 %	50 %	50 %	13488470
132	NC_002682	GA	3	6	93146	93151	50 %	0 %	50 %	0 %	13488470
133	NC_002682	CG	3	6	93157	93162	0 %	0 %	50 %	50 %	13488470
134	NC_002682	AG	3	6	94430	94435	50 %	0 %	50 %	0 %	13488471
135	NC_002682	GC	3	6	95413	95418	0 %	0 %	50 %	50 %	13488473
136	NC_002682	CG	3	6	96659	96664	0 %	0 %	50 %	50 %	13488474
137	NC_002682	TG	3	6	97394	97399	0 %	50 %	50 %	0 %	13488474
138	NC_002682	CG	3	6	98390	98395	0 %	0 %	50 %	50 %	13488475
139	NC_002682	GC	3	6	98569	98574	0 %	0 %	50 %	50 %	13488475
140	NC_002682	GC	3	6	98589	98594	0 %	0 %	50 %	50 %	13488475
141	NC_002682	CT	3	6	99669	99674	0 %	50 %	0 %	50 %	13488476
142	NC_002682	CG	3	6	100334	100339	0 %	0 %	50 %	50 %	13488477
143	NC_002682	GA	3	6	100520	100525	50 %	0 %	50 %	0 %	13488477
144	NC_002682	CG	3	6	100795	100800	0 %	0 %	50 %	50 %	13488477
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.