MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002679	CCAAC	2	10	8814	8823	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_002679	CAGAT	2	10	9019	9028	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_002679	GCGTC	2	10	20088	20097	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_002679	TTGCA	2	10	20621	20630	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_002679	CAACC	2	10	39321	39330	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_002679	ATCCT	2	10	39969	39978	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_002679	CGTGA	2	10	40075	40084	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_002679	TGAAC	2	10	40189	40198	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_002679	ACGCT	2	10	59734	59743	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_002679	TTGGC	2	10	61152	61161	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_002679	CCCGG	2	10	61253	61262	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_002679	TTTTG	2	10	61599	61608	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002679	TGCAG	2	10	65200	65209	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_002679	AGGGG	2	10	72022	72031	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002679	GTCGC	2	10	74497	74506	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_002679	CCTGT	2	10	80220	80229	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_002679	TTGGC	2	10	86044	86053	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_002679	GACCA	2	10	88676	88685	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_002679	GGCCG	2	10	89840	89849	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_002679	CGACG	2	10	95624	95633	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_002679	TCGGT	2	10	98589	98598	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_002679	TTCAT	2	10	107952	107961	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_002679	GCGCG	2	10	121658	121667	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_002679	CAAAA	2	10	165924	165933	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_002679	TGACG	2	10	168775	168784	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_002679	GAGAG	2	10	168838	168847	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002679	CGGCT	2	10	169575	169584	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_002679	GGCGA	2	10	169939	169948	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_002679	TCGGC	2	10	175720	175729	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_002679	CCCCA	2	10	175763	175772	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
31	NC_002679	TCGGC	2	10	176934	176943	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_002679	TAAGA	2	10	177650	177659	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002679	CTGAA	2	10	178436	178445	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_002679	TGCAT	2	10	178808	178817	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_002679	ACCGC	2	10	179448	179457	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_002679	GATAG	2	10	188422	188431	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002679	GGGCT	2	10	188516	188525	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_002679	TTTTC	2	10	199796	199805	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_002679	ACCGA	2	10	205692	205701	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_002679	CGAAC	2	10	213056	213065	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_002679	GCCAC	2	10	213067	213076	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_002679	ATAGA	2	10	223502	223511	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002679	CCATC	2	10	224674	224683	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_002679	GGCCG	2	10	241363	241372	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_002679	GGGAC	2	10	243777	243786	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_002679	AAGCG	2	10	265659	265668	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_002679	ACGCA	2	10	269946	269955	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_002679	CTTTC	2	10	274609	274618	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_002679	CGAGG	2	10	275105	275114	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_002679	AAAAC	2	10	277148	277157	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_002679	TTTCC	2	10	279213	279222	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_002679	CGCGG	2	10	279721	279730	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_002679	TACGA	2	10	293288	293297	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_002679	CCCCT	2	10	297724	297733	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
55	NC_002679	GCTTT	2	10	303046	303055	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_002679	TCATG	2	10	303163	303172	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_002679	CAGGG	2	10	312144	312153	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_002679	AAGCT	2	10	327022	327031	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_002679	GGGAG	2	10	327621	327630	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002679	GATTG	2	10	341367	341376	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002679	CTGCG	2	10	341418	341427	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_002679	TCGCC	2	10	347311	347320	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_002679	CGATC	2	10	348369	348378	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_002679	AGACG	2	10	351597	351606	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.