MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002679	TCCT	2	8	2594	2601	0 %	50 %	0 %	50 %	13488180
2	NC_002679	TCGC	2	8	3928	3935	0 %	25 %	25 %	50 %	13488323
3	NC_002679	CCGT	2	8	4793	4800	0 %	25 %	25 %	50 %	13488051
4	NC_002679	GGTT	2	8	4870	4877	0 %	50 %	50 %	0 %	13488051
5	NC_002679	ATGC	2	8	7305	7312	25 %	25 %	25 %	25 %	13488052
6	NC_002679	GAAC	2	8	7333	7340	50 %	0 %	25 %	25 %	13488052
7	NC_002679	TTCC	2	8	9791	9798	0 %	50 %	0 %	50 %	13488053
8	NC_002679	CTGG	2	8	9957	9964	0 %	25 %	50 %	25 %	13488053
9	NC_002679	ACCC	2	8	9969	9976	25 %	0 %	0 %	75 %	13488053
10	NC_002679	GTCG	2	8	10037	10044	0 %	25 %	50 %	25 %	13488053
11	NC_002679	AAGA	2	8	10077	10084	75 %	0 %	25 %	0 %	13488053
12	NC_002679	TCGT	2	8	10399	10406	0 %	50 %	25 %	25 %	13488053
13	NC_002679	CGTT	2	8	10749	10756	0 %	50 %	25 %	25 %	13488054
14	NC_002679	AAAT	2	8	11118	11125	75 %	25 %	0 %	0 %	13488054
15	NC_002679	GCCG	2	8	11657	11664	0 %	0 %	50 %	50 %	13488054
16	NC_002679	GGAA	2	8	12572	12579	50 %	0 %	50 %	0 %	13488181
17	NC_002679	GCTT	2	8	12734	12741	0 %	50 %	25 %	25 %	13488181
18	NC_002679	AAGG	2	8	13315	13322	50 %	0 %	50 %	0 %	13488181
19	NC_002679	GACA	2	8	13486	13493	50 %	0 %	25 %	25 %	13488182
20	NC_002679	TTCG	2	8	14187	14194	0 %	50 %	25 %	25 %	13488182
21	NC_002679	GTTT	2	8	15373	15380	0 %	75 %	25 %	0 %	13488183
22	NC_002679	GGTC	2	8	16829	16836	0 %	25 %	50 %	25 %	13488185
23	NC_002679	TGCT	2	8	16915	16922	0 %	50 %	25 %	25 %	13488185
24	NC_002679	CCGT	2	8	18159	18166	0 %	25 %	25 %	50 %	13488186
25	NC_002679	AGCC	2	8	18683	18690	25 %	0 %	25 %	50 %	13488186
26	NC_002679	CGGA	2	8	18829	18836	25 %	0 %	50 %	25 %	13488186
27	NC_002679	GGCG	2	8	19648	19655	0 %	0 %	75 %	25 %	13488187
28	NC_002679	GGCG	2	8	19957	19964	0 %	0 %	75 %	25 %	13488187
29	NC_002679	CTGT	2	8	20835	20842	0 %	50 %	25 %	25 %	13488188
30	NC_002679	GGGT	2	8	20895	20902	0 %	25 %	75 %	0 %	13488188
31	NC_002679	TTCC	2	8	21582	21589	0 %	50 %	0 %	50 %	13488188
32	NC_002679	TCGG	2	8	21596	21603	0 %	25 %	50 %	25 %	13488188
33	NC_002679	CAGT	2	8	21632	21639	25 %	25 %	25 %	25 %	13488188
34	NC_002679	CCGC	2	8	23090	23097	0 %	0 %	25 %	75 %	13488189
35	NC_002679	GCTG	2	8	23324	23331	0 %	25 %	50 %	25 %	13488189
36	NC_002679	AGCA	2	8	23355	23362	50 %	0 %	25 %	25 %	13488189
37	NC_002679	TCGA	2	8	23800	23807	25 %	25 %	25 %	25 %	13488189
38	NC_002679	AGAT	2	8	24050	24057	50 %	25 %	25 %	0 %	13488189
39	NC_002679	CGAT	2	8	24092	24099	25 %	25 %	25 %	25 %	13488189
40	NC_002679	GAGC	2	8	25359	25366	25 %	0 %	50 %	25 %	13488189
41	NC_002679	GGGC	2	8	25625	25632	0 %	0 %	75 %	25 %	13488189
42	NC_002679	GATT	2	8	25725	25732	25 %	50 %	25 %	0 %	13488189
43	NC_002679	GCTG	2	8	25972	25979	0 %	25 %	50 %	25 %	13488190
44	NC_002679	TCGT	2	8	25985	25992	0 %	50 %	25 %	25 %	13488190
45	NC_002679	GAAA	2	8	26318	26325	75 %	0 %	25 %	0 %	13488190
46	NC_002679	CGTT	2	8	26770	26777	0 %	50 %	25 %	25 %	13488056
47	NC_002679	GCCG	2	8	26890	26897	0 %	0 %	50 %	50 %	13488056
48	NC_002679	CTGG	2	8	27489	27496	0 %	25 %	50 %	25 %	13488056
49	NC_002679	TGGC	2	8	27615	27622	0 %	25 %	50 %	25 %	13488056
50	NC_002679	CGAA	2	8	29576	29583	50 %	0 %	25 %	25 %	13488191
51	NC_002679	GTCT	2	8	29679	29686	0 %	50 %	25 %	25 %	13488191
52	NC_002679	GGGT	2	8	29891	29898	0 %	25 %	75 %	0 %	13488191
53	NC_002679	TCGA	2	8	30173	30180	25 %	25 %	25 %	25 %	13488191
54	NC_002679	CGCC	2	8	30994	31001	0 %	0 %	25 %	75 %	13488191
55	NC_002679	TTGG	2	8	31385	31392	0 %	50 %	50 %	0 %	13488192
56	NC_002679	TGGA	2	8	31604	31611	25 %	25 %	50 %	0 %	13488192
57	NC_002679	CGGG	2	8	31629	31636	0 %	0 %	75 %	25 %	13488192
58	NC_002679	TCGA	2	8	32606	32613	25 %	25 %	25 %	25 %	13488192
59	NC_002679	GTCG	2	8	33652	33659	0 %	25 %	50 %	25 %	13488193
60	NC_002679	GCAG	2	8	33681	33688	25 %	0 %	50 %	25 %	13488193
61	NC_002679	TCGA	2	8	34583	34590	25 %	25 %	25 %	25 %	13488194
62	NC_002679	CGGC	2	8	34926	34933	0 %	0 %	50 %	50 %	13488195
63	NC_002679	ACTG	2	8	34939	34946	25 %	25 %	25 %	25 %	13488195
64	NC_002679	TTCG	2	8	35206	35213	0 %	50 %	25 %	25 %	13488195
65	NC_002679	AGAA	2	8	35598	35605	75 %	0 %	25 %	0 %	13488195
66	NC_002679	TGAC	2	8	35814	35821	25 %	25 %	25 %	25 %	13488195
67	NC_002679	GCCC	2	8	37298	37305	0 %	0 %	25 %	75 %	13488197
68	NC_002679	TCCT	2	8	37311	37318	0 %	50 %	0 %	50 %	13488197
69	NC_002679	CAGC	2	8	37750	37757	25 %	0 %	25 %	50 %	13488197
70	NC_002679	TCAA	2	8	38161	38168	50 %	25 %	0 %	25 %	13488198
71	NC_002679	GCTG	2	8	38312	38319	0 %	25 %	50 %	25 %	13488198
72	NC_002679	GATA	2	8	38736	38743	50 %	25 %	25 %	0 %	13488199
73	NC_002679	CTTC	2	8	39415	39422	0 %	50 %	0 %	50 %	13488200
74	NC_002679	AGCA	2	8	40593	40600	50 %	0 %	25 %	25 %	13488201
75	NC_002679	TCCT	2	8	40648	40655	0 %	50 %	0 %	50 %	13488201
76	NC_002679	GCAA	2	8	41176	41183	50 %	0 %	25 %	25 %	13488201
77	NC_002679	AGGA	2	8	41272	41279	50 %	0 %	50 %	0 %	13488201
78	NC_002679	AGGC	2	8	41924	41931	25 %	0 %	50 %	25 %	13488343
79	NC_002679	CGGC	2	8	44203	44210	0 %	0 %	50 %	50 %	13488058
80	NC_002679	CGAC	2	8	44298	44305	25 %	0 %	25 %	50 %	13488058
81	NC_002679	GGCC	2	8	44700	44707	0 %	0 %	50 %	50 %	13488058
82	NC_002679	CAGC	2	8	44716	44723	25 %	0 %	25 %	50 %	13488058
83	NC_002679	TGAA	2	8	45533	45540	50 %	25 %	25 %	0 %	13488202
84	NC_002679	AGGC	2	8	45541	45548	25 %	0 %	50 %	25 %	13488202
85	NC_002679	TTCG	2	8	47066	47073	0 %	50 %	25 %	25 %	13488203
86	NC_002679	TCAA	2	8	47359	47366	50 %	25 %	0 %	25 %	13488203
87	NC_002679	TCGG	2	8	47446	47453	0 %	25 %	50 %	25 %	13488203
88	NC_002679	GCCT	2	8	47826	47833	0 %	25 %	25 %	50 %	13488203
89	NC_002679	AATC	2	8	47980	47987	50 %	25 %	0 %	25 %	13488203
90	NC_002679	AGCC	2	8	48040	48047	25 %	0 %	25 %	50 %	13488203
91	NC_002679	CCGT	2	8	48803	48810	0 %	25 %	25 %	50 %	13488204
92	NC_002679	AAGG	2	8	48898	48905	50 %	0 %	50 %	0 %	13488204
93	NC_002679	CCGT	2	8	49179	49186	0 %	25 %	25 %	50 %	13488204
94	NC_002679	GTTC	2	8	49739	49746	0 %	50 %	25 %	25 %	13488204
95	NC_002679	GCAC	2	8	49867	49874	25 %	0 %	25 %	50 %	13488204
96	NC_002679	CCGC	2	8	49970	49977	0 %	0 %	25 %	75 %	13488204
97	NC_002679	GCCC	2	8	50283	50290	0 %	0 %	25 %	75 %	13488204
98	NC_002679	ACCA	2	8	50565	50572	50 %	0 %	0 %	50 %	13488204
99	NC_002679	GACC	2	8	50814	50821	25 %	0 %	25 %	50 %	13488204
100	NC_002679	GAGC	2	8	51143	51150	25 %	0 %	50 %	25 %	13488204
101	NC_002679	ACAG	2	8	51306	51313	50 %	0 %	25 %	25 %	13488204
102	NC_002679	CTGC	2	8	52737	52744	0 %	25 %	25 %	50 %	13488204
103	NC_002679	CCTT	2	8	53207	53214	0 %	50 %	0 %	50 %	13488204
104	NC_002679	GCTG	2	8	53793	53800	0 %	25 %	50 %	25 %	13488204
105	NC_002679	CGAT	2	8	55455	55462	25 %	25 %	25 %	25 %	13488060
106	NC_002679	TCTA	2	8	55892	55899	25 %	50 %	0 %	25 %	13488060
107	NC_002679	GTCC	2	8	55967	55974	0 %	25 %	25 %	50 %	13488060
108	NC_002679	GCCG	2	8	56203	56210	0 %	0 %	50 %	50 %	13488060
109	NC_002679	TGCA	2	8	56552	56559	25 %	25 %	25 %	25 %	13488060
110	NC_002679	CTGA	2	8	57819	57826	25 %	25 %	25 %	25 %	13488206
111	NC_002679	GCTG	2	8	58492	58499	0 %	25 %	50 %	25 %	13488207
112	NC_002679	AAGC	2	8	58966	58973	50 %	0 %	25 %	25 %	13488208
113	NC_002679	TGGT	2	8	60871	60878	0 %	50 %	50 %	0 %	13488324
114	NC_002679	CGAC	2	8	62163	62170	25 %	0 %	25 %	50 %	13488209
115	NC_002679	CCAG	2	8	63724	63731	25 %	0 %	25 %	50 %	13488061
116	NC_002679	GGGA	2	8	63866	63873	25 %	0 %	75 %	0 %	13488061
117	NC_002679	GCAC	2	8	64277	64284	25 %	0 %	25 %	50 %	13488061
118	NC_002679	ACTC	2	8	64644	64651	25 %	25 %	0 %	50 %	13488325
119	NC_002679	TCGT	2	8	65796	65803	0 %	50 %	25 %	25 %	13488326
120	NC_002679	GCGG	2	8	65900	65907	0 %	0 %	75 %	25 %	13488326
121	NC_002679	CTTG	2	8	66308	66315	0 %	50 %	25 %	25 %	13488337
122	NC_002679	CCGG	2	8	67844	67851	0 %	0 %	50 %	50 %	13488211
123	NC_002679	CCCG	2	8	68782	68789	0 %	0 %	25 %	75 %	13488328
124	NC_002679	CACC	2	8	68810	68817	25 %	0 %	0 %	75 %	13488328
125	NC_002679	GAGC	2	8	69478	69485	25 %	0 %	50 %	25 %	13488212
126	NC_002679	ATCC	2	8	69924	69931	25 %	25 %	0 %	50 %	13488213
127	NC_002679	GAAC	2	8	70037	70044	50 %	0 %	25 %	25 %	13488213
128	NC_002679	CGGC	2	8	70060	70067	0 %	0 %	50 %	50 %	13488213
129	NC_002679	TTTC	2	8	71256	71263	0 %	75 %	0 %	25 %	13488062
130	NC_002679	GCCG	2	8	71355	71362	0 %	0 %	50 %	50 %	13488062
131	NC_002679	CGGC	2	8	72596	72603	0 %	0 %	50 %	50 %	13488063
132	NC_002679	CATC	2	8	73649	73656	25 %	25 %	0 %	50 %	13488329
133	NC_002679	GGCC	2	8	74294	74301	0 %	0 %	50 %	50 %	13488349
134	NC_002679	AGAT	2	8	74866	74873	50 %	25 %	25 %	0 %	13488064
135	NC_002679	CGAT	2	8	75433	75440	25 %	25 %	25 %	25 %	13488065
136	NC_002679	GCTC	2	8	75724	75731	0 %	25 %	25 %	50 %	13488065
137	NC_002679	GCAA	2	8	75940	75947	50 %	0 %	25 %	25 %	13488065
138	NC_002679	CGAA	2	8	76053	76060	50 %	0 %	25 %	25 %	13488065
139	NC_002679	CGTG	2	8	77209	77216	0 %	25 %	50 %	25 %	13488066
140	NC_002679	TCCG	2	8	77367	77374	0 %	25 %	25 %	50 %	13488066
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142	NC_002679	GAGC	2	8	77621	77628	25 %	0 %	50 %	25 %	13488067
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