MICAS: Microsatellite Analysis Server

Di-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 705

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002679	CG	3	6	264537	264542	0 %	0 %	50 %	50 %	13488135
502	NC_002679	GC	3	6	264752	264757	0 %	0 %	50 %	50 %	13488135
503	NC_002679	AT	3	6	264792	264797	50 %	50 %	0 %	0 %	13488135
504	NC_002679	CG	3	6	264964	264969	0 %	0 %	50 %	50 %	13488135
505	NC_002679	CG	3	6	265151	265156	0 %	0 %	50 %	50 %	13488135
506	NC_002679	GC	3	6	265536	265541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_002679	GC	4	8	266892	266899	0 %	0 %	50 %	50 %	13488292
508	NC_002679	TC	3	6	267044	267049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_002679	CG	4	8	267151	267158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_002679	GC	3	6	267240	267245	0 %	0 %	50 %	50 %	13488293
511	NC_002679	GC	3	6	267387	267392	0 %	0 %	50 %	50 %	13488293
512	NC_002679	CG	3	6	267793	267798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
513	NC_002679	AT	3	6	268007	268012	50 %	50 %	0 %	0 %	13488294
514	NC_002679	CG	3	6	268158	268163	0 %	0 %	50 %	50 %	13488294
515	NC_002679	GC	3	6	268406	268411	0 %	0 %	50 %	50 %	13488294
516	NC_002679	CG	3	6	268886	268891	0 %	0 %	50 %	50 %	13488294
517	NC_002679	GA	3	6	269652	269657	50 %	0 %	50 %	0 %	13488137
518	NC_002679	TC	3	6	270207	270212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_002679	AT	3	6	270656	270661	50 %	50 %	0 %	0 %	13488295
520	NC_002679	GC	3	6	270918	270923	0 %	0 %	50 %	50 %	13488295
521	NC_002679	CG	3	6	271118	271123	0 %	0 %	50 %	50 %	13488295
522	NC_002679	CG	4	8	271187	271194	0 %	0 %	50 %	50 %	13488296
523	NC_002679	CG	3	6	271331	271336	0 %	0 %	50 %	50 %	13488296
524	NC_002679	GT	3	6	271433	271438	0 %	50 %	50 %	0 %	13488296
525	NC_002679	AC	3	6	271858	271863	50 %	0 %	0 %	50 %	13488297
526	NC_002679	GC	3	6	272614	272619	0 %	0 %	50 %	50 %	13488138
527	NC_002679	GT	3	6	272842	272847	0 %	50 %	50 %	0 %	13488138
528	NC_002679	CG	3	6	272990	272995	0 %	0 %	50 %	50 %	13488138
529	NC_002679	GA	3	6	272999	273004	50 %	0 %	50 %	0 %	13488138
530	NC_002679	GA	3	6	273469	273474	50 %	0 %	50 %	0 %	13488138
531	NC_002679	GT	3	6	274403	274408	0 %	50 %	50 %	0 %	13488139
532	NC_002679	GC	3	6	275446	275451	0 %	0 %	50 %	50 %	13488140
533	NC_002679	GA	3	6	275518	275523	50 %	0 %	50 %	0 %	13488140
534	NC_002679	GC	3	6	275741	275746	0 %	0 %	50 %	50 %	13488140
535	NC_002679	GC	3	6	276363	276368	0 %	0 %	50 %	50 %	13488141
536	NC_002679	GC	3	6	276400	276405	0 %	0 %	50 %	50 %	13488141
537	NC_002679	CG	3	6	276517	276522	0 %	0 %	50 %	50 %	13488141
538	NC_002679	GC	4	8	277207	277214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_002679	GC	3	6	277751	277756	0 %	0 %	50 %	50 %	13488143
540	NC_002679	GC	3	6	277881	277886	0 %	0 %	50 %	50 %	13488143
541	NC_002679	AC	3	6	278122	278127	50 %	0 %	0 %	50 %	13488143
542	NC_002679	CG	4	8	278341	278348	0 %	0 %	50 %	50 %	13488143
543	NC_002679	CG	3	6	278633	278638	0 %	0 %	50 %	50 %	13488143
544	NC_002679	CG	3	6	279500	279505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_002679	CG	3	6	280183	280188	0 %	0 %	50 %	50 %	13488144
546	NC_002679	GC	3	6	281357	281362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
547	NC_002679	GC	3	6	281864	281869	0 %	0 %	50 %	50 %	13488145
548	NC_002679	CG	3	6	282054	282059	0 %	0 %	50 %	50 %	13488145
549	NC_002679	GC	3	6	282247	282252	0 %	0 %	50 %	50 %	13488298
550	NC_002679	GC	3	6	283097	283102	0 %	0 %	50 %	50 %	13488146
551	NC_002679	AC	3	6	283269	283274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_002679	CG	3	6	283282	283287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_002679	CT	3	6	283432	283437	0 %	50 %	0 %	50 %	13488299
554	NC_002679	CG	3	6	284093	284098	0 %	0 %	50 %	50 %	13488299
555	NC_002679	CG	3	6	284310	284315	0 %	0 %	50 %	50 %	13488299
556	NC_002679	GC	3	6	285608	285613	0 %	0 %	50 %	50 %	13488301
557	NC_002679	TC	4	8	285920	285927	0 %	50 %	0 %	50 %	13488301
558	NC_002679	GC	3	6	286454	286459	0 %	0 %	50 %	50 %	13488301
559	NC_002679	CG	3	6	286981	286986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NC_002679	GC	4	8	287566	287573	0 %	0 %	50 %	50 %	13488148
561	NC_002679	CG	3	6	288231	288236	0 %	0 %	50 %	50 %	13488148
562	NC_002679	GC	3	6	288981	288986	0 %	0 %	50 %	50 %	13488149
563	NC_002679	AG	3	6	289778	289783	50 %	0 %	50 %	0 %	13488150
564	NC_002679	AT	3	6	290064	290069	50 %	50 %	0 %	0 %	13488150
565	NC_002679	GC	3	6	290508	290513	0 %	0 %	50 %	50 %	13488150
566	NC_002679	GA	3	6	290897	290902	50 %	0 %	50 %	0 %	13488151
567	NC_002679	TC	3	6	291039	291044	0 %	50 %	0 %	50 %	13488151
568	NC_002679	GC	3	6	292300	292305	0 %	0 %	50 %	50 %	13488152
569	NC_002679	GA	3	6	293436	293441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_002679	CG	3	6	294416	294421	0 %	0 %	50 %	50 %	13488153
571	NC_002679	GA	3	6	294545	294550	50 %	0 %	50 %	0 %	13488153
572	NC_002679	GC	3	6	295257	295262	0 %	0 %	50 %	50 %	13488153
573	NC_002679	TC	3	6	295350	295355	0 %	50 %	0 %	50 %	13488153
574	NC_002679	GC	3	6	295405	295410	0 %	0 %	50 %	50 %	13488153
575	NC_002679	GC	3	6	295624	295629	0 %	0 %	50 %	50 %	13488153
576	NC_002679	GC	3	6	295885	295890	0 %	0 %	50 %	50 %	13488153
577	NC_002679	GC	3	6	296080	296085	0 %	0 %	50 %	50 %	13488153
578	NC_002679	CG	3	6	296574	296579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
579	NC_002679	GC	3	6	296837	296842	0 %	0 %	50 %	50 %	13488154
580	NC_002679	CG	3	6	297260	297265	0 %	0 %	50 %	50 %	13488155
581	NC_002679	CG	3	6	297328	297333	0 %	0 %	50 %	50 %	13488155
582	NC_002679	CG	3	6	297883	297888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
583	NC_002679	CG	3	6	298410	298415	0 %	0 %	50 %	50 %	13488156
584	NC_002679	TC	3	6	298879	298884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_002679	CA	3	6	298928	298933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_002679	GA	3	6	299620	299625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_002679	GC	3	6	299786	299791	0 %	0 %	50 %	50 %	13488157
588	NC_002679	CA	3	6	300130	300135	50 %	0 %	0 %	50 %	13488157
589	NC_002679	GC	3	6	300358	300363	0 %	0 %	50 %	50 %	13488157
590	NC_002679	CG	3	6	300599	300604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_002679	GC	3	6	301335	301340	0 %	0 %	50 %	50 %	13488302
592	NC_002679	CG	3	6	302961	302966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
593	NC_002679	GC	3	6	303106	303111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
594	NC_002679	GC	4	8	303294	303301	0 %	0 %	50 %	50 %	13488303
595	NC_002679	GA	3	6	303412	303417	50 %	0 %	50 %	0 %	13488303
596	NC_002679	GC	3	6	303901	303906	0 %	0 %	50 %	50 %	13488158
597	NC_002679	CG	3	6	304286	304291	0 %	0 %	50 %	50 %	13488158
598	NC_002679	CG	3	6	304738	304743	0 %	0 %	50 %	50 %	13488159
599	NC_002679	GC	3	6	304865	304870	0 %	0 %	50 %	50 %	13488159
600	NC_002679	CT	3	6	305422	305427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_002679	CG	3	6	305563	305568	0 %	0 %	50 %	50 %	13488304
602	NC_002679	CG	3	6	306266	306271	0 %	0 %	50 %	50 %	13488304
603	NC_002679	CG	3	6	306387	306392	0 %	0 %	50 %	50 %	13488304
604	NC_002679	GA	3	6	308986	308991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_002679	GA	4	8	309139	309146	50 %	0 %	50 %	0 %	13488161
606	NC_002679	GT	3	6	309508	309513	0 %	50 %	50 %	0 %	13488161
607	NC_002679	CT	3	6	309537	309542	0 %	50 %	0 %	50 %	13488161
608	NC_002679	AG	3	6	309550	309555	50 %	0 %	50 %	0 %	13488161
609	NC_002679	CT	3	6	310904	310909	0 %	50 %	0 %	50 %	13488162
610	NC_002679	GC	3	6	311181	311186	0 %	0 %	50 %	50 %	13488162
611	NC_002679	CG	3	6	311200	311205	0 %	0 %	50 %	50 %	13488162
612	NC_002679	CG	3	6	311942	311947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_002679	GC	3	6	311959	311964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_002679	GC	3	6	312207	312212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
615	NC_002679	CG	3	6	312641	312646	0 %	0 %	50 %	50 %	13488163
616	NC_002679	GC	3	6	312777	312782	0 %	0 %	50 %	50 %	13488163
617	NC_002679	CG	3	6	312971	312976	0 %	0 %	50 %	50 %	13488163
618	NC_002679	GC	3	6	313396	313401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
619	NC_002679	GC	3	6	313447	313452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_002679	GC	3	6	313638	313643	0 %	0 %	50 %	50 %	13488164
621	NC_002679	CG	3	6	313715	313720	0 %	0 %	50 %	50 %	13488164
622	NC_002679	CG	3	6	314451	314456	0 %	0 %	50 %	50 %	13488164
623	NC_002679	GC	3	6	314920	314925	0 %	0 %	50 %	50 %	13488165
624	NC_002679	GC	3	6	314989	314994	0 %	0 %	50 %	50 %	13488165
625	NC_002679	AT	3	6	315335	315340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_002679	GC	3	6	315455	315460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_002679	GC	3	6	316186	316191	0 %	0 %	50 %	50 %	13488306
628	NC_002679	GC	3	6	316303	316308	0 %	0 %	50 %	50 %	13488306
629	NC_002679	GC	4	8	316773	316780	0 %	0 %	50 %	50 %	13488306
630	NC_002679	GC	3	6	316787	316792	0 %	0 %	50 %	50 %	13488306
631	NC_002679	CG	3	6	316821	316826	0 %	0 %	50 %	50 %	13488306
632	NC_002679	GC	3	6	317144	317149	0 %	0 %	50 %	50 %	13488307
633	NC_002679	CG	3	6	317387	317392	0 %	0 %	50 %	50 %	13488307
634	NC_002679	GC	3	6	317562	317567	0 %	0 %	50 %	50 %	13488307
635	NC_002679	GA	3	6	317802	317807	50 %	0 %	50 %	0 %	13488166
636	NC_002679	CT	3	6	317838	317843	0 %	50 %	0 %	50 %	13488166
637	NC_002679	TC	3	6	317945	317950	0 %	50 %	0 %	50 %	13488166
638	NC_002679	CG	4	8	318060	318067	0 %	0 %	50 %	50 %	13488166
639	NC_002679	CT	3	6	318259	318264	0 %	50 %	0 %	50 %	13488166
640	NC_002679	GC	3	6	318685	318690	0 %	0 %	50 %	50 %	13488166
641	NC_002679	GC	3	6	319207	319212	0 %	0 %	50 %	50 %	13488166
642	NC_002679	CG	3	6	319786	319791	0 %	0 %	50 %	50 %	13488167
643	NC_002679	GC	3	6	320782	320787	0 %	0 %	50 %	50 %	13488168
644	NC_002679	GC	3	6	321709	321714	0 %	0 %	50 %	50 %	13488168
645	NC_002679	GC	3	6	322033	322038	0 %	0 %	50 %	50 %	13488168
646	NC_002679	GC	3	6	322922	322927	0 %	0 %	50 %	50 %	13488308
647	NC_002679	GC	3	6	323091	323096	0 %	0 %	50 %	50 %	13488308
648	NC_002679	CG	3	6	323428	323433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
649	NC_002679	AT	3	6	323961	323966	50 %	50 %	0 %	0 %	13488169
650	NC_002679	GA	3	6	324142	324147	50 %	0 %	50 %	0 %	13488169
651	NC_002679	GA	3	6	324446	324451	50 %	0 %	50 %	0 %	13488169
652	NC_002679	AT	3	6	324795	324800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_002679	GC	3	6	325097	325102	0 %	0 %	50 %	50 %	13488309
654	NC_002679	CT	3	6	325333	325338	0 %	50 %	0 %	50 %	13488309
655	NC_002679	GT	3	6	325538	325543	0 %	50 %	50 %	0 %	13488309
656	NC_002679	CG	3	6	325668	325673	0 %	0 %	50 %	50 %	13488309
657	NC_002679	CG	3	6	326084	326089	0 %	0 %	50 %	50 %	13488309
658	NC_002679	GA	3	6	326464	326469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
659	NC_002679	TG	3	6	326609	326614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
660	NC_002679	CA	3	6	328474	328479	50 %	0 %	0 %	50 %	13488170
661	NC_002679	GC	3	6	329023	329028	0 %	0 %	50 %	50 %	13488170
662	NC_002679	GA	3	6	329233	329238	50 %	0 %	50 %	0 %	13488170
663	NC_002679	GC	3	6	330293	330298	0 %	0 %	50 %	50 %	13488171
664	NC_002679	TG	3	6	330300	330305	0 %	50 %	50 %	0 %	13488171
665	NC_002679	GC	3	6	330630	330635	0 %	0 %	50 %	50 %	13488172
666	NC_002679	GC	3	6	331710	331715	0 %	0 %	50 %	50 %	13488172
667	NC_002679	AG	3	6	331919	331924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
668	NC_002679	GC	3	6	332714	332719	0 %	0 %	50 %	50 %	13488310
669	NC_002679	AG	3	6	333216	333221	50 %	0 %	50 %	0 %	13488311
670	NC_002679	GA	3	6	334604	334609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
671	NC_002679	CG	3	6	335738	335743	0 %	0 %	50 %	50 %	13488312
672	NC_002679	GA	3	6	336121	336126	50 %	0 %	50 %	0 %	13488313
673	NC_002679	CG	3	6	336162	336167	0 %	0 %	50 %	50 %	13488313
674	NC_002679	CG	3	6	336237	336242	0 %	0 %	50 %	50 %	13488313
675	NC_002679	GC	3	6	336330	336335	0 %	0 %	50 %	50 %	13488313
676	NC_002679	GT	3	6	336563	336568	0 %	50 %	50 %	0 %	13488313
677	NC_002679	GC	3	6	336880	336885	0 %	0 %	50 %	50 %	13488313
678	NC_002679	CG	3	6	337258	337263	0 %	0 %	50 %	50 %	13488314
679	NC_002679	GC	3	6	338049	338054	0 %	0 %	50 %	50 %	13488315
680	NC_002679	GA	3	6	338608	338613	50 %	0 %	50 %	0 %	13488315
681	NC_002679	GC	3	6	338771	338776	0 %	0 %	50 %	50 %	13488315
682	NC_002679	CG	3	6	339919	339924	0 %	0 %	50 %	50 %	13488316
683	NC_002679	GC	3	6	341465	341470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
684	NC_002679	GC	3	6	341612	341617	0 %	0 %	50 %	50 %	13488173
685	NC_002679	GC	3	6	341656	341661	0 %	0 %	50 %	50 %	13488173
686	NC_002679	AT	3	6	342608	342613	50 %	50 %	0 %	0 %	13488173
687	NC_002679	CT	3	6	342942	342947	0 %	50 %	0 %	50 %	13488173
688	NC_002679	CT	3	6	343711	343716	0 %	50 %	0 %	50 %	13488174
689	NC_002679	CG	3	6	345803	345808	0 %	0 %	50 %	50 %	13488176
690	NC_002679	CG	3	6	346125	346130	0 %	0 %	50 %	50 %	13488177
691	NC_002679	GC	3	6	346431	346436	0 %	0 %	50 %	50 %	13488177
692	NC_002679	CG	3	6	346466	346471	0 %	0 %	50 %	50 %	13488177
693	NC_002679	GC	3	6	346919	346924	0 %	0 %	50 %	50 %	13488177
694	NC_002679	GC	3	6	347086	347091	0 %	0 %	50 %	50 %	13488177
695	NC_002679	AT	3	6	348056	348061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
696	NC_002679	GC	3	6	348601	348606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
697	NC_002679	GC	3	6	348622	348627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
698	NC_002679	AG	3	6	348847	348852	50 %	0 %	50 %	0 %	13488178
699	NC_002679	CT	3	6	349159	349164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
700	NC_002679	CG	3	6	349540	349545	0 %	0 %	50 %	50 %	161621456
701	NC_002679	GC	3	6	350493	350498	0 %	0 %	50 %	50 %	161621456
702	NC_002679	AC	3	6	351173	351178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
703	NC_002679	GC	3	6	351225	351230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
704	NC_002679	CG	3	6	351403	351408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
705	NC_002679	GA	3	6	351578	351583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

< Previous 12Next >